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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000021.1:740737..742681- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_198750-T1 ID=ASPNIDRAFT_198750-T1|Name=ASPNIDRAFT_198750-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=1945bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000021.1:740737..742681- (Aspergillus niger ATCC 1015) ATAATTCCTTTTTTCCTCTCGATCGCTAGTGTCTAGAGATCCCCCCCGAC
TTGCTGTCCATCTCTTGTTGCCTTAACCCATTAAAGGCCTCTGGGTCTAC
ACGTCGACCCCATCTCGCGCCCTCTGCGGTCTACAGGGCTCCTGGTCTTA
GTGTGCTAGGTTTAGGAGTCACCTACACACTTTTATACACAGTTCTGGGC
CTTTCTTTGTCAGAAAGCTCAGTGTAATTAACCATGTCGGAATACCCTGT
CGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAG
ATCTTAACATCTACTACAGCGTATGTCTTCCCTAGATATGTGACGCAGGC
TATGACTGGGCTCATCCCCACTAACTGATTCCAGTCTGGAGATATCGCTT
GGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGG
TATGATACCACCTGTCAACCTCCAAGCCATTGAGCCCCTCCAACTGACGG
CAACAGCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGT
TAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTC
TTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGG
TGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTG
GCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTC
GCTGCTATTACGTGAGTGTCCCCAAATCCGAAGCAACCTTCATGATTGAT
AACTGATAACGGAGATAGGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAAC
GCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATT
ATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTA
CAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCT
CCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGA
CATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGT
CATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCT
CTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAAC
CTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACT
GGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTC
TCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTC
ATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAA
GTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCA
TTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCGTAAGGC
CCCCTGATCTCTAAAGAAAACAGACAACCTCAAACCGGTGGGCACTCAAC
TAACGCTTGCTCTGATAATAGTGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTA
CGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTAC
CAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTG
CATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCC
CCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTT
GCCGTAAGTGCCTTCCCATATCATCGAAGTAAACGACTCTCCCTCTAACA
AAAACTAGTACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACC
AGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGACTCCT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000021.1:740737..742681- >ASPNIDRAFT_198750-T1 ID=ASPNIDRAFT_198750-T1|Name=ASPNIDRAFT_198750-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=8370bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000021.1:740737..742681- (Aspergillus niger ATCC 1015) TACGACTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGA GAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGTGACTACATCGCCCACCTG GATGGTTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCA GCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCT TCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCAC CTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAAT TGGTGAATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGT CGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTA CGATCCAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAAC TGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGC TCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGG CACCCACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTG GTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCT CTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGC TGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGA GGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTT GCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTT TGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATG TGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGT GGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTC AGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAA TGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTG GCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGG AATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTG ATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAG ATATCGCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCT GGTGTCGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGG ACCGGTGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTACGA CTACGTGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACG GCGACGTGTCCTCCAAGCGCACCATGTGACTACATCGCCCACCTGGATGG TTCTACGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTG GCTACCAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGT AGCTGCATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCG TATCCCCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTG AATTTGCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCAT GCTGCCTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATC CAATTGCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGT GGACTTGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGC TGCACTGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCC ACGAGCTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACC GTCTTCCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAG CGCCAACCTGCGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCT CCGTGGGTGGTGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAG TGGTCGACCGTCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCAT CACGCCAGGCTCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAG TTGTCGGTGCCGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTT CGTGTGGACGACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCT CGTGGGCAACCTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTC TCGCCCGACGCAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCT GTCGGGGTGGTGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTT TTCTCATACCGCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGA AGGGTGTTTTGGCAGCTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATT CTCTTCGCTGTCTTCCAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATC GCTTGGGTTATCACCTCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGT CGGATGTCGGAATACCCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGG TGGTAACTCCCTGACAGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTACGACTACG TGGAAATCACCCGCGATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGAC GTGTCCTCCAAGCGCACCATGTGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTA CGGTCATCGACGGAGGCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTAC CAGCTGGCCGACTCCATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTG CATCATCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCC CCGAAGAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTT GCCGGTTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGC CTTGCATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATT GCCTGCTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACT TGACTTCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCAC TGGCATACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAG CTCAACTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTT CCTCTGGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCA 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TCCTCTTCGTCATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAA GAGGAAGAGATCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCGG TTGCCCTTGCTGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGC ATGGTCTTTAGCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTG CTGGACATGGAACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACT TCGCAGGTGGTACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCA TACTCTCTGATGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAA CTACCGCCCGCACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCT GGGTTGGTTGGTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTG CGGGCTGTCATGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGG TGTCACCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCG TCGGTTTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGC TCTGGTTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGC CGCTGCTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACG ACGCCCTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAAC CTGTTGACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACG CAAATCAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGG TGTCATTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACC GCTGGAACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTT 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CCTGGTGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGT TTCTGCTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGG TTTCGTGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTG CTTGCAACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCC CTGGATATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTT GACTGGTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAAT CAGCATTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCA TTCCAATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGG AACGTACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAG CTCCTTCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTC CAGGGAATGTTCGCTGCTATTACTCTGGAGATATCGCTTGGGTTATCACC TCTACGGCCCTGGTGTTGTTGATGATTCCTGGTGTCGGATGTCGGAATAC CCTGTCGCCTACAATGGCACAGACAATGGGACCGGTGGTAACTCCCTGAC AGAAGATCTTAACATCTACTACAGCTACGACTACGTGGAAATCACCCGCG ATGTCATTGGTGGCACCAGTCCCGAGAACGGCGACGTGTCCTCCAAGCGC ACCATGTGACTACATCGCCCACCTGGATGGTTCTACGGTCATCGACGGAG GCTGGATCAACCACCACTACATCCAGCTTGGCTACCAGCTGGCCGACTCC ATCTCCGGCATGGCCTACTCGTTCTTCGGTAGCTGCATCATCCTCTTCGT CATCAACCTGATCCCTGGTCTTCACCTGCGTATCCCCGAAGAGGAAGAGA TCCTCGGTGTCGATGACGCTGAAATTGGTGAATTTGCCGGTTGCCCTTGC TGTTGGTGCAGTCGCGGAACGCGGTCGCATGCTGCCTTGCATGGTCTTTA GCTTCGTTTGGTCCACCATTATCTACGATCCAATTGCCTGCTGGACATGG AACTCGTCCGGCTGGGTGTACAAACTGGGTGGACTTGACTTCGCAGGTGG TACTCCCGTCCACATTGCCTCCGGCTCGGCTGCACTGGCATACTCTCTGA TGCTCGGCAAGCGTCGCGGACATGGCACCCACGAGCTCAACTACCGCCCG CACAACGTCACACACGTCGTCATTGGTACCGTCTTCCTCTGGGTTGGTTG GTTCGGGTTCAATGCCGGCTCTGCTCTGAGCGCCAACCTGCGGGCTGTCA TGGCAGCCGTTGTCACGAACCTGGCTGCCTCCGTGGGTGGTGTCACCTGG TGCATCATGGATTACAGACTGGAGAGGAAGTGGTCGACCGTCGGTTTCTG CTCCGGTGTCATCGCAGGTCTCGTTGCCATCACGCCAGGCTCTGGTTTCG TGACACCTTGGGCTGCCTTCATCTTTGGAGTTGTCGGTGCCGCTGCTTGC AACTACGCCACGAAGCTCAAGTATGTGCTTCGTGTGGACGACGCCCTGGA TATCTTTGCAGTGCACGCCATTGGTGGTCTCGTGGGCAACCTGTTGACTG GTCTTTTTGCTGCCTTCTTCTACTCAGGTCTCGCCCGACGCAAATCAGCA TTGTCGTTAATATGGCTTTCAATAATGTCTGTCGGGGTGGTGTCATTCCA ATGGTTCTTCTGGGGATACTCGCTGGCCTTTTCTCATACCGCTGGAACGT ACATTGGTGACCTGAACAATTTTGGAATGAAGGGTGTTTTGGCAGCTCCT TCAGTTGGCAGCTCCAAGGTCCCTGATATTCTCTTCGCTGTCTTCCAGGG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0008519 | ammonium transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0072488 | ammonium transmembrane transport |
GO:0015696 | ammonium transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR018047 |
DBxref | InterPro:IPR001905 |
DBxref | InterPro:IPR029020 |
DBxref | InterPro:IPR024041 |
DBxref | InterPro:IPR002229 |
DBxref | PFAM:PF00909 |
Product | ammonium transporter Amt1 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ACJE01000021.1 | supercontig | ACJE01000021.1:740737..742681 - |
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