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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000008.1:170372..173085+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_200483-T1 ID=ASPNIDRAFT_200483-T1|Name=ASPNIDRAFT_200483-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2714bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000008.1:170372..173085+ (Aspergillus niger ATCC 1015) CCCGTTCAGTCACTCCCCTCCCCCTTAAGCAAGTCAGTGTGTATTTGGCG
TAAAAAAGGGACCTTCCAGACTGGTTGGAAGAACGCTGACTGGTGTGTAT
TGCCTCCCCTTTCAGGCTTCTCTCTTTTCCCCCCCTCCCATCTTGTGACT
CCGTATTTGTAGAAGGAGTTACTTGGAAGGTGGTGCCTGCTGGAGACTTC
ATTAATTAAAATTGGACTTCTTGCCCCCTAATTGATTGATCATATATAGT
ACTATCTAGAGACTGAGCAGCAAGTTCGTATGTGCTGACTATCGCTTTCA
CCAAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCTCCTCCTCCCCCTACAGCCAATCT
GACCAGAACCAAAACCAGACCAGACAAAACCAAACCAGACCAGACCAAAC
CCAACGTGAACCAAACCCAACCAGGCCAACCCGCACCCACTCTTGCTTTC
CACCACCACCGACTCCCTACTAACCCGACGGCCTCCATCACTTTCCACTC
CTCCCCCCGTTTCCTCCCTCTCCAACCTACTTACCTCAACTCATCCCATC
TCTCTCTTGACTTTACTACTTCCCTCTCCTCCCTCCCCATCTCTATCCCC
ATCAACTCACTCTTCTCTTTCTTCATCTTCTCTCTCTTTCGTCTCTTTTT
CTTATTCTCCGTAGTCCGATTCTTAATCCCACACAGTCACCATGGAAGGT
AAGGGCTTCCTGCCACCTTGCGTCTTGCTCGCTTCCCAAGCTTCTCACTC
CCCCTCCCCCCTCCGTTACCCCCCTCAACGCCCACCTTCACAACTTGGCT
AACATCTTATTTTTCCATCATCTAGAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGA
CAATGGGTATGTTACTTTGGGTTCTCGATGATTTTGGCGATGGATTCGTC
CTGCTTGTTGTGGTTTCTCGCCAGCTCCAGGGGAGATGGTGCAAAACATA
CGTCCCCTTTTGGGGCTTGGTCGCGATGATGAACTTGAATGGGATTCTCG
CGGGCGTTGCTCTATTACTCCCTCTGGCGCTTATGGAAAGAAACTAGGAC
AGCTCGATCGATTGGCACGCGAGGCTGTAGTCTGCTCGATTATACTGACT
TCTGTGTTCTCAGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGAT
GCTCCCCGTGCCGTCTTCCGTAAGTCAACCCCCTCCTCATATCCGCTGTG
CTGGATATCCTTCCTCCTGGCTTGATGGGTTCTTCCCACTCTTCATAGCA
ATTGCCACCCATTGCGTCCTTGCGCTGGGTTGCTAGCTTATGTGGGGGCG
GTGAATTACCCGTCATGTTAGCACCGGTTCGAATAGTCAACTAACTTGCG
GTACAGCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGGTAAAGCTCCCCT
TTGTTTCCCCCAAGTTGGCCTGTTAGGCTGGGTGATCGGTTTTATCTAAT
GCCGCCCGCAGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGG
TGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTG
AGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCAC
ACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTT
GACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGA
TCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCC
GTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTC
TGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTC
CCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTAC
CTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGA
GCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCG
ACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAG
TCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTT
CCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCG
GTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGAT
GTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGGTATGTTTTTTCCTCGG
CCCCTTGATGAACACGGAGTGGCCTGATCACTAACCCACCTCTAGTCTGG
TGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCA
CTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAG
CGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCCAC
CTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCT
CGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAGGTATGTGCTTATCATCCAGAGAT
CACGTCGTATCTTGCTAACGGGGTTTCTATCTAGCTCTTGCGCGTGATCC
GTTTCGTACTCTCGTATTCCCCCATGTATTAAAAAGCCCGGAGACACTGG
TGACTTGCGGGCCTCTCTGACTCGCACTAGGAGGAAGATCGCCTGAAAAA
GGAACTTTTATTTT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000008.1:170372..173085+ >ASPNIDRAFT_200483-T1 ID=ASPNIDRAFT_200483-T1|Name=ASPNIDRAFT_200483-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=6768bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000008.1:170372..173085+ (Aspergillus niger ATCC 1015) ATGGAAGAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGTTCGGGTATGTG CAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCCCTCCA TTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAG GACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCT CAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGA AGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAG CACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGA GAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACG TCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGT ATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGA GGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTG ACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTC TCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTG CTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCT CCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATC GGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCT GGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGA AGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGTCT GGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGAT CACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCG AGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCC ACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCC CTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAATGGAAGAGGAAGTTGCTGCTC TCGTCATTGACAATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGAC GATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCA TGGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGG CACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGT GTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTA CAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAG CCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTC GAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTC CCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACG GTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCC ATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAA GATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAA TTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAG CAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGA GCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTC CTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATC CACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAA GGATCTGTACGGCAACATTGTCATGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCG GTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCC ATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGAT CGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCT CCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGC TTCTAAATGGAAGAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGTTCGGG TATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCC CCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTATCATGATTGGTATGGGT CAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCT CACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACA TGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCT GAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAA CCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCT TCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACC ACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCAT CTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTG GTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTAC ACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAA GCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCC AGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATC ACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAG CGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCA TCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTC ATGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAA GGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTC CTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCC CTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAG CGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAATGGAAGAGGAAGTTG CTGCTCTCGTCATTGACAATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCC GGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCG TCACCATGGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTG ATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAG CACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACAC CTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGA CCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATC GTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGT CCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTG GTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCC CACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCT CATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGC GTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGAC TTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTC CTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCC GTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGT GGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGT CCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGTCTGGTGGTACTACCATGT ACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCT TCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGT CTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCCACCTTCCAGCAGATGT GGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGC AAGTGCTTCTAAATGGAAGAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGG TTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCG TCTTCCCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTATCATGATTGGT ATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGG TATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGG ATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTC GCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAA GTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCC CCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGT CGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGT CCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACA TGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGT GGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAA GGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCG CTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAG GTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGC TCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCA ACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAAC ATTGTCATGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTAT GCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCA TTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTG GCCTCCCTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGA CGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAATGGAAGAGG AAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGT TTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCCCTCCATTGTCGGTCG TCCCCGTCACCATGGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACG TCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCC ATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCA CCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCC TCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACC CAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCA GGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGG ACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCC CTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGA TTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCG CTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCT CTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGA GAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGC GTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAG AGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGT TGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGTCTGGTGGTACTA CCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTT GCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTA CTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCCACCTTCCAGC AGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTC CACCGCAAGTGCTTCTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | BUSCO:EOG09262MEK |
| DBxref | InterPro:IPR020902 |
| DBxref | InterPro:IPR004001 |
| DBxref | InterPro:IPR004000 |
| DBxref | PFAM:PF00022 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ACJE01000008.1 | supercontig | ACJE01000008.1:170372..173085 + |
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