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Sequences
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mRNA from alignment at ACJE01000001.1:1569453..1571577- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_202801-T1 ID=ASPNIDRAFT_202801-T1|Name=ASPNIDRAFT_202801-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2125bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000001.1:1569453..1571577- (Aspergillus niger ATCC 1015) TTTCTTTTCTCTACCGTGTCCTGATATACCCTCTTTCTCTCCTCTCCTTT
TCTTCTTCCAACCACTCAACTTACTGCAAGTTGTTCACATTCGCCATGGC
TTCCACCTTGAGACTGGGCACCTCTGCTCTCCGTTCCACCTCCATTGCCG
CTAAGCCGGTTGTTCAGTCCGCTGCCTTCAATGGCCTGCGCTGCTACTCT
ACCGGCAAGGCCAAGGTTCGTTCTACCTCGATAACAGTCATTCCTCGGAT
ATTTATACTGATGTCTCTCCCTTCTATAGTCCTTGAAGGAGACTTTCGCT
GAGAAGCTCCCTGCCGAGATCGAGAAGGTCAAGAAGCTCCGCAAGTACGC
ACAGCTCCCTATTCGACCCTTTTGTCTACAGCAGGTGTTGTTAACCAGTC
AATCAATGTGTGTAGGGAGCACGGCAGCAAGGTCATCGGCGAGGTCACCC
TTGACCAGGCCTATGGTGGTGCCCGTGGTGTCAAGTGCCTCGTGTGGGAG
GTATGATGAGGAACTTGGCCAATAATTTTTTTGAGGAGACTATCTAACTG
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GCCGTACCGTAAGTTGCATGTGACTAAAACACAATTTGAAATGTATACTG
ACAGTACTTTAGATCCCCGAGTGCCAGGAGCTCCTCCCCAAGGCTCCCGG
TGGTCAGGAGCCTCTTCCCGAGGGTCTCTTCTGGCTGCTCTTGACTGGCG
AGATCCCTACCGAGCAGCAGGTCCGCGATCTGTCTGCTGAGTGGGCTGCC
CGCTCCGACCTCCCCAAGTTCATTGAGGAGCTCATCGACCGCTGCCCCAG
CACTCTGCACCCCATGTCCCAGTTCTCTCTGGCCGTCACCGCTCTTGAGC
ACGAGTCTGCTTTCGCCAAGGCCTATGCCAAGGGTATCAACAAGAAGGAC
TACTGGAACTACACCTTCGAGGACTCCATGGACCTCATTGCCAAGCTGCC
CACCATCGCTGCCAAGATCTACCGCAACGTCTTCAAGGATGGCAAGGTCG
CTCCTATCCAGAAGGACAAGGATTACTCCTACAACTTGGCCAACCAGCTC
GGCTACGGCGACAACAACGACTTCGTTGAGCTCATGCGTCTTTACCTGAC
CATCCACTCCGACCACGAGGGTGGCAACGTCAGTGCTCACACCACCCACC
TTGTTGGTAGCGCTCTGAGCTCCCCCATGCTCTCTCTCGCTGCTGGTCTG
AACGGTCTGGCTGGACCTCTCCACGGATTGTGAGTTTTTCAATTCTTTTA
ATGTACGTCAGATTGAAGTGCTTTCGCTAATGTTTCTTTTTCCAATCGCA
TAGGGCCAACCAGGAAGTCCTTAACTGGCTCACCAAGATGAAGGCCGCCA
TTGGCAACGACCTCAGCGACGAGGCCATCAAGAACTACCTCTGGTCCACC
CTGAACGCCGGCCAGGTCGTTCCCGGATACGGTCACGCCGTCCTTCGTAA
GACCGACCCCCGCTACGTGTCTCAGCGCGAGTTCGCTCTTCGCAAGCTGC
CCGATGACCCCATGTTCAAGCTGGTCAGCCAGGTCTACAAGATCGCTCCT
GGTGTCCTGACCGAGCACGGCAAGACCAAGAACCCCTACCCCAACGTCGA
TGCTGTAAGTTGCCTCATGAATCTGCGCCCCCGTTGCATGCGCGACCAGT
ATACTGACCGGTATGTAGCACTCTGGTGTCCTCCTCCAGTACTATGGCCT
GACTGAGGCCAACTACTACACCGTCCTCTTCGGTGTTTCCCGTGCTCTGG
GTGTCCTTCCCCAGCTGATCATCGACCGTGCCCTTGGTGCCCCCATTGAG
CGCCCCAAGTCCTACAGCACCGAGGCCTTCGCCAAGCTTGTTGGTGCTAA
GCTGTAAATGAGTTTGGGATGACATGAAAAACCGGAGGTGATTCTTATTT
CTTTTTACGATAAACACAGCATCTTGTATTATGCCTACCCTGTTCTGGTT
TAGTATTTTTGTGACTGGGGATGTTTTAAAGTGTTGGGGTTTGTTCGATT
AATGTATGATAGGACACGGTTCGAGCGGGCCTTGTAACAAACAGCACTTG
AGAAATTCCAAGTCAATCGTCTTCT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000001.1:1569453..1571577- >ASPNIDRAFT_202801-T1 ID=ASPNIDRAFT_202801-T1|Name=ASPNIDRAFT_202801-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=9975bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000001.1:1569453..1571577- (Aspergillus niger ATCC 1015) CACTCTGGTGTCCTCCTCCAGTACTATGGCCTGACTGAGGCCAACTACTA CACCGTCCTCTTCGGTGTTTCCCGTGCTCTGGGTGTCCTTCCCCAGCTGA TCATCGACCGTGCCCTTGGTGCCCCCATTGAGCGCCCCAAGTCCTACAGC ACCGAGGCCTTCGCCAAGCTTGTTGGTGCTAAGCTGTAAGGCCAACCAGG AAGTCCTTAACTGGCTCACCAAGATGAAGGCCGCCATTGGCAACGACCTC AGCGACGAGGCCATCAAGAACTACCTCTGGTCCACCCTGAACGCCGGCCA GGTCGTTCCCGGATACGGTCACGCCGTCCTTCGTAAGACCGACCCCCGCT ACGTGTCTCAGCGCGAGTTCGCTCTTCGCAAGCTGCCCGATGACCCCATG TTCAAGCTGGTCAGCCAGGTCTACAAGATCGCTCCTGGTGTCCTGACCGA GCACGGCAAGACCAAGAACCCCTACCCCAACGTCGATGCTATCCCCGAGT GCCAGGAGCTCCTCCCCAAGGCTCCCGGTGGTCAGGAGCCTCTTCCCGAG GGTCTCTTCTGGCTGCTCTTGACTGGCGAGATCCCTACCGAGCAGCAGGT 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CATTGAGCGCCCCAAGTCCTACAGCACCGAGGCCTTCGCCAAGCTTGTTG GTGCTAAGCTGTAAGGCCAACCAGGAAGTCCTTAACTGGCTCACCAAGAT GAAGGCCGCCATTGGCAACGACCTCAGCGACGAGGCCATCAAGAACTACC TCTGGTCCACCCTGAACGCCGGCCAGGTCGTTCCCGGATACGGTCACGCC GTCCTTCGTAAGACCGACCCCCGCTACGTGTCTCAGCGCGAGTTCGCTCT TCGCAAGCTGCCCGATGACCCCATGTTCAAGCTGGTCAGCCAGGTCTACA AGATCGCTCCTGGTGTCCTGACCGAGCACGGCAAGACCAAGAACCCCTAC CCCAACGTCGATGCTATCCCCGAGTGCCAGGAGCTCCTCCCCAAGGCTCC CGGTGGTCAGGAGCCTCTTCCCGAGGGTCTCTTCTGGCTGCTCTTGACTG GCGAGATCCCTACCGAGCAGCAGGTCCGCGATCTGTCTGCTGAGTGGGCT GCCCGCTCCGACCTCCCCAAGTTCATTGAGGAGCTCATCGACCGCTGCCC CAGCACTCTGCACCCCATGTCCCAGTTCTCTCTGGCCGTCACCGCTCTTG AGCACGAGTCTGCTTTCGCCAAGGCCTATGCCAAGGGTATCAACAAGAAG GACTACTGGAACTACACCTTCGAGGACTCCATGGACCTCATTGCCAAGCT GCCCACCATCGCTGCCAAGATCTACCGCAACGTCTTCAAGGATGGCAAGG TCGCTCCTATCCAGAAGGACAAGGATTACTCCTACAACTTGGCCAACCAG CTCGGCTACGGCGACAACAACGACTTCGTTGAGCTCATGCGTCTTTACCT GACCATCCACTCCGACCACGAGGGTGGCAACGTCAGTGCTCACACCACCC ACCTTGTTGGTAGCGCTCTGAGCTCCCCCATGCTCTCTCTCGCTGCTGGT 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
GO:0006101 | citrate metabolic process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004108 | citrate (Si)-synthase activity |
GO:0046912 | transferase activity, transferring acyl groups, acyl groups converted into alkyl on transfer |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR036969 |
DBxref | InterPro:IPR019810 |
DBxref | InterPro:IPR016142 |
DBxref | InterPro:IPR010109 |
DBxref | InterPro:IPR016143 |
DBxref | InterPro:IPR002020 |
DBxref | PFAM:PF00285 |
Product | citrate (Si)-synthase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ACJE01000001.1 | supercontig | ACJE01000001.1:1569453..1571577 - |
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