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ASPNIDRAFT_203924-T1, ASPNIDRAFT_203924-T1 (mRNA) Aspergillus niger ATCC 1015

Overview
NameASPNIDRAFT_203924-T1
Unique NameASPNIDRAFT_203924-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger ATCC 1015
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at ACJE01000015.1:946670..948637-

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>ASPNIDRAFT_203924-T1 ID=ASPNIDRAFT_203924-T1|Name=ASPNIDRAFT_203924-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=1968bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000015.1:946670..948637- (Aspergillus niger ATCC 1015)
CTCCAGCTTTCCTTTCTTTCTTTCCCTCCCCTTTTATTCGAGTAATCCTG
CAGCTCTGGGAGGTGCAACAGTCACAATGAGCGGACGTGAGTCTTGCACG
CGATCGCTGCCATCTCCGCGACAGCGTTCCATCCTTTACCTCAATGGATC
AGCAAATGCTGATACTCGATTCTAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCC
CTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCT
TCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGGTACGTGATACTTGTCCAGCTCGA
CATGAGCTTCTAAGCTAATGGATTACCCCTGCAGTTGACCCTATTGATCT
TCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACC
TCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTAC
CCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCC
AGGTATGTAATGGGGAAATTGCAATCTGATCACGGATATCGGGCATTAGC
TAATATGTGGCTTTTGTCTGATAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGA
TGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGA
AGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTC
ACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCT
GCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATG
AGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATC
GCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGAC
CATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCT
TCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCT
TTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCT
CGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTG
TCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTG
TTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAA
CATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCC
TTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTC
CACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAA
GGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGC
TGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCT
GCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGC
TGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTA
CTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCT
GACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTAC
GTAAGTCTTCACTTTGGTCTCAGATTTTCTGAAGTGGATACTAACATTCA
AATGCAGGATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGAC
ATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGATAAGGCCCCC
TTTTTGATGAAAGCATGAGAAGAAGTTTGAGGGCTTATGTTTGTTCTTGC
AACTTTCTGTTTCTTCTCAGGTAGTGTGCTGTTGTGGCTGGGATCTGGAT
TATTTAGTTTCTTGATGGATGTATGGCTAGTTTTAACAATTTGCAGGAGG
GGAAGATCTTCTCTACGG
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Coding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000015.1:946670..948637-

>ASPNIDRAFT_203924-T1 ID=ASPNIDRAFT_203924-T1|Name=ASPNIDRAFT_203924-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=7185bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000015.1:946670..948637- (Aspergillus niger ATCC 1015)
GATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGAT
CGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCAC
CTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGAC
CGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCT
ACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATC
TGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCT
GCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTC
TGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCT
CCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCAT
TGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCC
GCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCT
ACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGA
GATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTG
TTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTG
TGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGA
CAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTG
CCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTG
AACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCAC
CTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTT
CCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTC
GTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGT
CATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCG
TCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTT
GCCGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTG
TACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTAT
GATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCA
TCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGC
CCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCC
TTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGATTATATACGGA
TACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGG
CCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCA
ACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTC
TTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGG
TCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGA
TTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTG
CTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGAC
CAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCA
ACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCAC
CTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTA
CCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTT
TCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAG
TCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTA
CACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCT
TCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTC
AAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGC
CGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGG
CCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTT
GCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCC
CCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTC
ACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCT
GCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCT
GCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACTTGAC
CCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCT
CCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGT
AACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGG
CATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCT
CCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGT
TGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGATTATATACGGATACTTTGAAATTG
CCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGT
AACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAA
GACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCC
TGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAG
CCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGT
CGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCT
ATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAG
TCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGG
TCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCT
GGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTC
CCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGAT
CTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGC
GTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATG
CCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCA
GATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTG
TTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATT
GCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCC
CATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCT
TCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCC
AAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAG
CATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTG
GTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTT
GGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACTTGACCCTATTGATCTTC
CTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTC
CGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCC
TGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAG
TCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTG
GCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGG
GATGAGCGGACGATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGG
CGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCG
CTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAA
CTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCA
GGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTG
GTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTG
GTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAG
CGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGA
AGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAG
GGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCA
GCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGA
ACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGC
TTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGG
TTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTC
AGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCT
CGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCG
TGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGT
CTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCC
GTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTG
GATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGG
ACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAG
CTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGG
TGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTG
GTATCCTCCTTGCCGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCC
AGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTAC
TGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGG
TATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGA
TCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAA
CCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGA
TTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCG
GGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCT
CATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCG
CTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTAC
GTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTG
TGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGC
TGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTG
TTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCC
TACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTG
CCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGC
GAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTAC
TCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGA
TCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTT
CGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTG
CTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACA
ACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCC
CAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAA
CTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCT
TCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCC
GGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGT
GATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCA
TCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTC
GCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGC
CGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTA
CGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGA
TGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATC
ATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCC
TTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTT
CAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGAC
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016020membrane
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0015031protein transport
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
SEC61ASPNIDRAFT_203924Aspergillus niger ATCC 1015gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_203924-T1ASPNIDRAFT_203924-T1-proteinAspergillus niger ATCC 1015polypeptide


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_203924-T1.cdsASPNIDRAFT_203924-T1.cdsAspergillus niger ATCC 1015CDS


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_203924-T1.utr3p1ASPNIDRAFT_203924-T1.utr3p1Aspergillus niger ATCC 1015three_prime_UTR


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_203924-T1.exon5ASPNIDRAFT_203924-T1.exon5Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_203924-T1.exon4ASPNIDRAFT_203924-T1.exon4Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_203924-T1.exon3ASPNIDRAFT_203924-T1.exon3Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_203924-T1.exon2ASPNIDRAFT_203924-T1.exon2Aspergillus niger ATCC 1015exon
ASPNIDRAFT_203924-T1.exon1ASPNIDRAFT_203924-T1.exon1Aspergillus niger ATCC 1015exon


The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ASPNIDRAFT_203924-T1.utr5p1ASPNIDRAFT_203924-T1.utr5p1Aspergillus niger ATCC 1015five_prime_UTR


Properties
Property NameValue
NoteBUSCO:EOG092620E4
DBxrefInterPro:IPR030659
DBxrefInterPro:IPR019561
DBxrefInterPro:IPR002208
DBxrefInterPro:IPR023201
DBxrefPFAM:PF00344
DBxrefPFAM:PF10559
Producttranslocon subunit
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger ATCC 1015 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
ACJE01000015.1supercontigACJE01000015.1:946670..948637 -
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