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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000021.1:1562718..1565717- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_207951-T1 ID=ASPNIDRAFT_207951-T1|Name=ASPNIDRAFT_207951-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=3000bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000021.1:1562718..1565717- (Aspergillus niger ATCC 1015) CTCGTGGTGGTCTTCCCATTTGTGTTGATTGTTTGTTGGATCATCCCGCT
CAGATCCCACTAGAAGTAAAAAACAAGAACTTGGTTGGATTTAAATAGTA
TGGCCCCTCCCCTCATTTCTTCCCCAACAACTTTCACTGCCCCCCATTCA
ACCTCCCTCTAACCTTTCAACTCCTTCTCTAGACACAGCAATCATGGGTT
ACAACGACGTGGACCAATTGGCCATCAACACCATCCGCACTCTCGCGGTA
TGCAACTCTTGCTCCCATTCTCTTTGCTTCTATTCCACTCCCATCCGATT
CCGGTGTGACGGAGAGCTTCTCTAGAGCTCCGGCACCGGAAGGCCATCCC
TGGTATCACGGGGACTCCGCGGAGCACAGTCTCCCACACTGAGGATCGGC
TTTTTGTAGCTGCTATCTCCTCGGAGCTCCTTGTTTTACTAGCTACGGAT
TGCGGAGTGGTCATATCTATCAGAACTATCACTCTTAGTCAACTTTGAAG
CTAATCCTCCTCTAGGTTGATGCCACCTTCAAGGCCAACTCCGGTCACCC
CGGTGCCCCTATGGGCATGGCCCCCGTGTCCCACGTCCTTTTCAACAAGT
TCATGAGCTTCAACCCCCAAAATCCCGACTGGGCTAACCGTGACCGCTTC
GTTCTCTCGTAAGCTTCAACTGGCAATCTTTGTGTCCAGGTGATCGTTTC
ACTAACTTTCCTCCCCAGCAACGGCCACGGCTGCATGCTCCAATATGCTC
TCCTTCACCTTTTCGGCTACCAGGTCTCCATGGATGACCTGAAGTCCTTC
AGAGTATGTATCCGCTGAGGGTTTCTGCGAGAGCCATTGTAGACATGTCC
TAACTATCATGCTCGTGTAGCAACTCGACAGCATCACCCCCGGTCACCCC
GAGGCTCACGACACCCCCGGTGTTGAGGTCACCACTGGTCCCCTGGGCCA
GGGTTTCGCCAACGCCGTTGGTCTTGCTATTGCCGAGCGTCACTCCGCTG
CTGTCTTCAACAAGCCCGGCTACACCCTCTTCAACAACTACACATACTGC
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CATGGCTGGTCACCTGAAGCTCGGTAACCTCATTGCTATCTACGACGACA
ACGGAATCTCCATCGGTAAGCTTCATTCATCACCCCTTTTTCCTCATTAT
CACAGCCATACTAACGAGGGCTTGTTTTGCAGACGGTGACACCAAGTGCG
CCTTCACTGAGGATGTTATGAAGCGTTTTGAGGCCTACGGCTGGCACACC
GAGTACGTCAAGGACGGTGACCACGACCTCGAGGGCATTGAGGCTGCTAT
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AACCCCCTGAAGGCTGACGACTGCGAGGGTGTCAAGCAGCTCTTCGGCTT
CGACCCCAAGCAGACCTTCGTCGTTCCCCAGCAGGTCTACGACCTCTACC
ACAAGCACGCCGCTGAGGGTGCTGCTAAGGAGCAGGAGTGGAACCAGCTC
CTCCAGAAGTACGCTTCTGAGTACCCCAAGGAGCACGCTGAGCTCACCCG
CCGTCTCTCCGGCAAGCTTGCCGAGGGCTGGGAGAAGAGCCTGCCCGTCT
ACAAGCCCACCGACGCTGCCGTTGCTACCCGTAAGCTCTCCGAGGCTGTC
CTCGAGAAGATCCACGATGTCGTCCCCGAGCTTCTGTCCGGCTCTGCCGA
CTTGACTGGCTCCAACAACACCCGCTGGAAGAACGCCGTTGACTTCCAGC
CCCCCGAGTACAACATCGGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCGCTACGGT
GTCCGTGAGCACGCCATGGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCCTACGG
CACCGTCATCCCCGCTGGTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTACGCCG
CCGGTGCTGTCCGTCTGTCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCTACGTT
GCCACCCACGACTCCATCGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCACCAGCC
CATTGAGACTCTGGCTCACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTGGC
GCCCTGCTGACGGCAACGAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGACC
TCCAAGCACACCCCCAGCATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTGCCCCA
GCTCGAGGCTTCCACCATCGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTACGTTGCCC
TCGAGGCCCCCGACGCTGCCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTCCGAGGTC
AGCATCTGTATCGAGGCTGCCACCTACCTCAAGGAGAAGCACGGCATCGC
TGCCCGCGTTGTCTCCGTTCCTTGCTTCGAGGTCTTCGATGCCCAGGACA
AGGCCTACAAGCTCCAGGTCCTCCCCGACAACATCCCCGTCCTCTCCGTC
GAGGCTCTCACCACCATGGGCTGGGAGCGCTACGCTCACGAGCAGTTCGG
TCTCAACCGCTTCGGTGCCTCTGGCCCCTACAAGGATGTCTACAAGGTAA
GCTACAAAATATGTCCACCTCTTTCAATAGCCGCATATGCTAATTCACTT
CACTGCAGAAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCGCGCTGTC
GCCACCATTGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCATCAACCG
TGCTTTCCAGCAGATTCTGTAAACGTCTTGCGGTAGCATCGTGATGGTTT
GTACTGATTCATGTTTATGAGTATCTGGGACGATGTTGATCCCTGTGGGC
AATGATACCCCCGGGAGAAGTCCTATTTTAACGACTTTTTCTTTGAAGAT
AAAAATATATGCAATCTGTTTCATTCAATCTCTTGGTCTATAATCGTTCT
AGTTTTCTTTGGGTAGATTTAGAGGGGAATTGGTCTATGACGAGAGAATA
back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000021.1:1562718..1565717- >ASPNIDRAFT_207951-T1 ID=ASPNIDRAFT_207951-T1|Name=ASPNIDRAFT_207951-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=11928bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000021.1:1562718..1565717- (Aspergillus niger ATCC 1015) AAATTCGAGTTCACTCCTGAGGGCATTAGCAAGCGCGCTGTCGCCACCAT TGACTTCTACAAGGGTCACACCGTGCGCTCCCCCATCAACCGTGCTTTCC AGCAGATTCTGTAAAACGCCGTTGACTTCCAGCCCCCCGAGTACAACATC GGTGACTGGTCCGGCCGCTACCTCCGCTACGGTGTCCGTGAGCACGCCAT GGCCGCTGTCATGAACGGTCTTGCCGCCTACGGCACCGTCATCCCCGCTG GTGGTACCTTCCTGAACTTCGTCTCCTACGCCGCCGGTGCTGTCCGTCTG TCGGCCCTCTCCCGTGTCCGCACCATCTACGTTGCCACCCACGACTCCAT CGGTCTGGGTGAGGACGGTCCTACTCACCAGCCCATTGAGACTCTGGCTC ACTTCCGTGCTCTGCCCAACTGCATGGTTTGGCGCCCTGCTGACGGCAAC GAGACCAGCGCTGCCTACTACTCTGCTCTGACCTCCAAGCACACCCCCAG CATTCTGGCCCTCACCCGTCAGAACCTGCCCCAGCTCGAGGCTTCCACCA TCGAGAAGGCCCTCAAGGGTGCCTACGTTGCCCTCGAGGCCCCCGACGCT GCCGTCACCCTCATCTCCACCGGTTCCGAGGTCAGCATCTGTATCGAGGC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0003824 | catalytic activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR029061 |
| DBxref | InterPro:IPR020826 |
| DBxref | InterPro:IPR005474 |
| DBxref | InterPro:IPR009014 |
| DBxref | InterPro:IPR033248 |
| DBxref | InterPro:IPR005475 |
| DBxref | PFAM:PF02779 |
| DBxref | PFAM:PF00456 |
| DBxref | PFAM:PF02780 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ACJE01000021.1 | supercontig | ACJE01000021.1:1562718..1565717 - |
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