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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000021.1:737298..739324+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_208263-T1 ID=ASPNIDRAFT_208263-T1|Name=ASPNIDRAFT_208263-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2027bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000021.1:737298..739324+ (Aspergillus niger ATCC 1015) CCCCAGTCTCCTCCCAACAACTTCCCGCCCATCTACTCCCTCCGGCCTCG
CCGTCTCTCATACCCCTTCGACCCTTTTCAATACCTTCAACCCCTTCAAT
CTACCCGGCACAATGCGTGAGATCGTATGTTTGCCCTCCCCGTCCCTCGT
CCGTCAGGAGACGCGTCGTTGGTTGGCATCTCTTTTGCTCGGGACCCCAC
CGGTTCTTCGACCAACTCATTCTTGTGCTAACTGCATGTCTTCTTCGCTT
CATAGGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGTAAGTGCCAATATATGCTTC
GGATGATTGCCCCCAAGGGTCTTGATTGGTGTTTGGTGGACTAAACAATA
TATCATGGTGGTTAGGGTAACCAAATTGGTGCTGCTTTCTGGTACGTATA
CAACTGCCATTGGATTGGGGATGGAACATCGTCTCTTAGGCTATCTCAGC
TTGAGTTCAGATGTTGTCCATTAGGTACATGCTATCGGTCTAAGAACACG
TCTAACAATTCAACAGGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGC
TCCGGTGTGTAAGTGCAACTTTTTCACACCTCTCAATTGGTCAACAATGG
GCAAAGGGTTGGGTCTTCTGACACGCAGGATAGTTACAATGGCACCTCCG
ACCTCCAGCTGGAGCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGTGAGATCCATC
GGACCTTGGCTTTTTCACGACAATATCATCAATGTCCTAATCACTTCAGC
AGGCTAGCGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAG
CCCGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCG
CCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCA
AGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGACGTT
GTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCAC
CCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCT
CCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTT
GTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCAC
TCTCTCCGTCCACCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCG
ACAACGAGGTATGATTCCAGACCCAGCACAAGTGAGAAGAAGATTGGTGC
TCGAGAACTAACGAATTGGCCAATCTAGGCTCTGTACGACATCTGCATGC
GCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTC
TCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCT
CAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTC
TCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTAC
TCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCC
CAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCT
GCTCCGCCATCTTGTGAGTTTTCCTACTGCATCGATTGCACAATATGCCA
GCTAACAGGTATCTAGCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGAT
CAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGAT
CCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCA
AGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTC
AAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTT
GCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTG
AGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCC
TCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000021.1:737298..739324+ >ASPNIDRAFT_208263-T1 ID=ASPNIDRAFT_208263-T1|Name=ASPNIDRAFT_208263-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=10488bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000021.1:737298..739324+ (Aspergillus niger ATCC 1015) ATGCGTGAGATCGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGGTAACCAAATTGG TGCTGCTTTCTGGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCCG GTGTTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGGAGCGCATGAACGTCTAC TTCAACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGA CCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGC TCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAAC TGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGT CGACGTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCC AGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTC CTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTT CTCCGTTGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACA ACGCCACTCTCTCCGTCCACCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTC TGTATCGACAACGAGGCTCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGCT CTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATGT CCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCTT CGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCAT GGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCCG TCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGATG GCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCTT CCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATCC AGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCAG ACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCTT CATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGATC AGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGT GAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACGA CCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAGGGTG AGGAGGAATAGATGCGTGAGATCGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGGT AACCAAATTGGTGCTGCTTTCTGGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCT TGACGGCTCCGGTGTTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGGAGCGCA TGAACGTCTACTTCAACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCC GTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCCGGTCC TTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCCGGTG CTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTC GACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGACTGCCT CCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCCGGTA TGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACCGTATG ATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGT TGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCACCAGCTCGTTGAGCACTCCG ACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGCTCTGTACGACATCTGCATGCGC ACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTC TGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCA ACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTC CACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTC CTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCA AGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGC TCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGATCAGAT GCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCA ACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATG TCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCG TGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACT GGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGC AACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCCTCGAT CTCCGAGGGTGAGGAGGAATAGATGCGTGAGATCGTTCACCTCCAAACCG GCCAGTGTGGTAACCAAATTGGTGCTGCTTTCTGGCAGACCATCTCTGGC GAGCACGGCCTTGACGGCTCCGGTGTTTACAATGGCACCTCCGACCTCCA GCTGGAGCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATG TTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTC CGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGG CCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTG CCGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCT TGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTAC CGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCC CCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCC GACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCACCAGCTCGT TGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGCTCTGTACGACA TCTGCATGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAAC CACCTGGTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCC TGGTCAGCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCT TCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGC 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TGAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCC CCAAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTC CACCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGC TCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACG GTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGC CTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAA CATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTC TGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTG ACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCG CAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCTCCA TGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACC TACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCAT TCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCT CCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTC CGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGAT GGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACC AGCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATAGATGCGT GAGATCGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGGTAACCAAATTGGTGCTGC TTTCTGGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCCGGTGTTT 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CATGTCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCG ACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTC TTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCG TGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACA TGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCC ATCTTCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAA CATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACA TCCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCC ACCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGG TGATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACA CTGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATG AACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGA GGGTGAGGAGGAATAGATGCGTGAGATCGTTCACCTCCAAACCGGCCAGT GTGGTAACCAAATTGGTGCTGCTTTCTGGCAGACCATCTCTGGCGAGCAC GGCCTTGACGGCTCCGGTGTTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGGA GCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATGTTCCTC GTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCC GGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTC CGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGT TGGTCGACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGAC TGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGC CGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACC GTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACC GTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCACCAGCTCGTTGAGCA CTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGCTCTGTACGACATCTGCA TGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTG GTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCA GCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTC GTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCC TACTCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGA TCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCA CCTGCTCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGAT CAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGAT CCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCA AGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTC AAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTT GCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTG AGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCC 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CCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGG AGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTC GTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCC CCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCC AGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGC AAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTT CACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGT ACCAGGACGCCTCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATAG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
| GO:0005874 | microtubule |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0003924 | GTPase activity |
| GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton |
| GO:0005525 | GTP binding |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0007017 | microtubule-based process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR008280 |
| DBxref | InterPro:IPR017975 |
| DBxref | InterPro:IPR013838 |
| DBxref | InterPro:IPR037103 |
| DBxref | InterPro:IPR023123 |
| DBxref | InterPro:IPR036525 |
| DBxref | InterPro:IPR018316 |
| DBxref | InterPro:IPR003008 |
| DBxref | InterPro:IPR002453 |
| DBxref | InterPro:IPR000217 |
| DBxref | PFAM:PF03953 |
| DBxref | PFAM:PF00091 |
| Product | Tubulin beta chain |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ACJE01000021.1 | supercontig | ACJE01000021.1:737298..739324 + |
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