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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000019.1:186992..189525- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_208547-T1 ID=ASPNIDRAFT_208547-T1|Name=ASPNIDRAFT_208547-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2534bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000019.1:186992..189525- (Aspergillus niger ATCC 1015) GTTGCCTCGCTCTTCCAGCTCCCTCCTCTTCTCTTCTCCCTCTTGTTCCT
CTTACCATCCTAAACCACTTCCAACTTCCTTTGTGTTCAGGTCGCAGTCT
TACGAAGCGGCTTGTCACTTCCTCACCTATCTATATCTCCCTTACTATCT
AATAATATCCTCCTTTAATCCTTTCTCCTATTCCCAACTCTGTTGACAGG
TATGTGTGCTGTCCGATAGTATATTGCTACCACGGCGGATACATTTCCCC
TCCCACGGATTCTTCCCACACAGCACCCGCTTTATGAAAACCTTCTTGAT
CTCTTGACACTGACATCTTGCTCGATTCACAGAGTATTCAGCCAACATGC
CTACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGAC
AACATCACCCGCTTCGACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAA
CGCCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATAGTAAGTGGCGGCCT
GTAGCCGTGCTCAATTGTTCTGGCTGACAATCTGCCACAGTGGTATGCAG
CCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTC
CACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGA
GCAAGATGTATGGTAAACCAGATCCCTTCTCTTGAATTGAGATACTGATA
CAATTATAGGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGG
ACGTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGTCAAC
TTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCATGGAGCTGATGGAGTG
CCCCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGAGAG
TAAGTTCTGCTTCTGAGACACACCATGCTGCTCTCCGCTAACAGCAGAAC
AGCGCGCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATC
ATCGGACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGATTGG
TAACACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCA
AGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTC
AACAACATCATCTCTCAGACCACCGACGGTGTCTACGAGGGTGTTGCCAT
TGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTCCGCT
ACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGT
GGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCCGTCAAGAACGGCACCATCAC
CAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTCAAGA
CTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAG
ACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGTGAGGCCGGTATCTTCGTTCC
CGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGACGACC
AGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAG
ATCCCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTAAGCC
CGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTTCTCT
ACGCCGGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGT
GGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGCCGCCTCCCTGCCTACGCCAG
CAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCG
TGTCTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTG
ATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCATCGGTTCTCGTTTCGGTGG
TGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCA
TGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGAGT
AAGTGAACCCTCATTTGTACCTGAAAAGTTGAACAGCTTTAACTGACTAT
GCACAGTCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCCCGAT
CTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAGCAC
CAAGCTGCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCAAGA
AGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCCGTCTGCTTCGTT
GACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGACTA
CATGAAGATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCATTG
GTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGCACTGGTCTGTAC
AGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGAAGGG
TGGCTCCGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000019.1:186992..189525- >ASPNIDRAFT_208547-T1 ID=ASPNIDRAFT_208547-T1|Name=ASPNIDRAFT_208547-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=9855bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000019.1:186992..189525- (Aspergillus niger ATCC 1015) TCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCCCGATCTCCGT GTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAGCACCAAGCT GCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCAAGAAGGACA ACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCCGTCTGCTTCGTTGACCTG ATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGACTACATGAA GATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCATTGGTCTCA TTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGCACTGGTCTGTACAGACAC CCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGAAGGGTGGCTC CGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAACGCGCACGTGAGATCATGGTCA AGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATCGGACCTGCTACCGTTGGTGGT ATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAA CATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCAAGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCA AGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTCAACAACATCATCTCTCAGACCACC GACGGTGTCTACGAGGGTGTTGCCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCAC CACTTTCATCGACCACCTGCTCCGCTACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGA TCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATC GAGGCCGTCAAGAACGGCACCATCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCAT CGGTACCTGCGCTAGCATGTTCAAGACTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTG GTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCC ATGCGTGAGGCCGGTATCTTCGTTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCA GACCCTCAAGGAGGTCTACGACGACCAGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGC CCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCT CAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTAAGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTC CGACGACCGTGGCCAGGAGCTTCTCTACGCCGGTATGCCCATCTCTGATG TCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTC CGCCGCCGCCTCCCTGCCTACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCAT GCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCA TCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTC CTGACCATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGA GTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACA CCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGAGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCC TCCCCGTCTACCAGGACGTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTT GACACCGTTGTCAACTTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCAT GGAGCTGATGGAGTGCCCCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGG GTGTCCCCGAGAGATGGTATGCAGCCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGA CTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTCCACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATCT ACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGAGCAAGATATGCCTACCTCTGCTCCCC TCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGACAACATCACCCGCTTC GACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAACGCCCTCTTCCACAA CAAGACGAGATGCTTCGTATATCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCC CGCAACAACCCCGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAA GCACTTCCCCAGCACCAAGCTGCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTG TGACCACCTCCAAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTT GCCGTCTGCTTCGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGA GGAGGTTGAGGACTACATGAAGATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCC TTGGTCGTTCCATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTC CGCACTGGTCTGTACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCC CGCCCTCCAGAAGGGTGGCTCCGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAAC GCGCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATC GGACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAA CACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCAAGG GTTCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTCAAC AACATCATCTCTCAGACCACCGACGGTGTCTACGAGGGTGTTGCCATTGG TGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTCCGCTACC AGGCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGTGGT GTTGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCCGTCAAGAACGGCACCATCACCAA GCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTCAAGACTG AGGTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAGACC GCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGTGAGGCCGGTATCTTCGTTCCCGA GACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGACGACCAGG TCAAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAGATC CCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTAAGCCCGC TGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTTCTCTACG CCGGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGTGGT GTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGCCGCCTCCCTGCCTACGCCAGCAA GTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCGTGT CTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATC AGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGC CCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCATGA 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ATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCT CGTCTCTGGTCTCCTGACCATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATG GCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCATGAGCCCCCGT GACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGAGTACTGGGGTACC AGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGGACGTCTCCAAGGCCATGGCCAA GCACCCTGACGTTGACACCGTTGTCAACTTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCT ACAGCTCCACCATGGAGCTGATGGAGTGCCCCCAGATCCGTTCCATTGCC ATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGAGATGGTATGCAGCCCCGGGCTGTCC AGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTCCACTCCCTCCGTC GCCGGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGAGCAAGATATGCCT ACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGACAA CATCACCCGCTTCGACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAACG CCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATATCCCCGGTATCGGTCA CCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCCCGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGG AGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAGCACCAAGCTGCTCGACTACGCCATT GCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCAAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGT CGACGGTTGTGTTGCCGTCTGCTTCGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTG CCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGACTACATGAAGATGGGTGTCCTCAAC GGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGA 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CCTACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCAC GGTCCTGCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGG CAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCATCGGTTCTC GTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTC GACAAGGGCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAA CAAGCTGAGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTACCAGGA CGTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGTCAACT TCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCATGGAGCTGATGGAGTGC CCCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAGAGATG GTATGCAGCCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGC AAGCGTTCCACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCA GTTCGTGAGCAAGATATGCCTACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAA TGGCGCCTCCGCCAACGACAACATCACCCGCTTCGACCCCCCCAGCCGTG TGCGCTCTCCTCTCAGCAACGCCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTC GTATA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0003824 | catalytic activity |
| GO:0046912 | transferase activity, transferring acyl groups, acyl groups converted into alkyl on transfer |
| GO:0048037 | obsolete cofactor binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR036291 |
| DBxref | InterPro:IPR036969 |
| DBxref | InterPro:IPR033847 |
| DBxref | InterPro:IPR017440 |
| DBxref | InterPro:IPR017866 |
| DBxref | InterPro:IPR016142 |
| DBxref | InterPro:IPR016143 |
| DBxref | InterPro:IPR016102 |
| DBxref | InterPro:IPR005811 |
| DBxref | InterPro:IPR002020 |
| DBxref | InterPro:IPR003781 |
| DBxref | PFAM:PF00549 |
| DBxref | PFAM:PF02629 |
| DBxref | PFAM:PF00285 |
| Product | ATP-citrate synthase subunit 1 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ACJE01000019.1 | supercontig | ACJE01000019.1:186992..189525 - |
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