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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000012.1:733008..734873- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_214063-T1 ID=ASPNIDRAFT_214063-T1|Name=ASPNIDRAFT_214063-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=1866bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000012.1:733008..734873- (Aspergillus niger ATCC 1015) CTCTCTCTCCCTCCCCTCTTCTTCTTCACTCTTTCTCTCCTCGCAAAAGG
GTGAAGTTGATCATGGCGATACTAAGTCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCT
GGCAGTCCTGCTGCTTGCTTCCCCCACCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGA
GTGTCCCCGAGGGTGCCGCCATCTCCGAGGATCCGATTGTATGTTGTCGC
ACCCACGGCTGACCTGTCTGCGATTGCTGCGGCCTCAACATTATACTGAC
TAGTCGCCTAGGACACAACACTATGGATACATATGATCCTTATGGGGTTT
GCCTTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGGTAAGCTGGCC
CGGTTACATCCTATCTCCGACCTTCCGCGGTCGGGGATACTCGATTACTC
GATCAAATGAGACGCATATCTGACATTTCCGCTTTACCATCATAGATTAT
ACGCTCGCGCTGGCACGTCCCTCTCCAGATTGTCGGAACGATTATCGCTG
TGCTCGCATACTTCCTCGGACATGCTCACAAAGGCCGCCAGTTCTCGAAG
AACGTCCACGCGTCCTTTGCGAACACACTGATGCTCATGATGGTGGTGCA
GATCGTCCTCGGCGTCTATCTCAAGCTGCACCTTACCAAGGGAATTCATG
GCCGGATCCGCCGGGTTATTGTGATTGCGCACGGAGTGGTTGGAAAGGCG
ATGCCTGTGGCGAGCTGGGTCCAGATGCTCTTCGGAGGAATCACTGCCAT
GGGATTCTGTCGGGATGATCACTTGGGACAGTGTCTGGCTCATTTCATCA
TGGGCAGCGCTTTCATCGCCTACGGTATCCTGCTGACCATCCTACTCCTC
GTTGGCCAGTACTGGCTGCGCCGCACTGGCCGCAGCCAGGAGTTCTTCGA
CTCGTTGATCATCGCTGCATGGGGATGTGTCAACACCTTCACGGAACACC
GTTGGGGAGGTCCCTGGGTCCACAATGATTTGCAGCACACTACTATGGGT
GTTGTCTGGTGGTGCGCCGGTCTACTGGGTATTTGGATGAGCCGGAAGCG
CAACGGCCGGCCCAAGCGGAACTTGATCCCAGCCATAGTCATTCTCCTCA
CTGGTTATGCCATGTCTGCCCACCCGCAGACTCTGATGATCAGCACTATG
ATCCACTCCATCTTCGGCTACACGTTAATGGCTGCCGGTTTCACCAGAAT
CATTGAGATCTCCTTCGTGCTTCGGGACAAGGGCTCTGTCAGCCCGGACG
GATCTGACCCTAACAGCTTCCAATATCTCACGCCTTTCGTAAGTCTTCCA
CAGCCCTTCCGGCTGAAGTGTGTCGTCATTTCTAACTTATCGCAGCTTCT
GTACGCCTCGGGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCAAC
TCCTGAACGATGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCTAC
AGCATCGCCTTCATTCTCTTCCTATGTAAGACCACCTCCCTTCCCCCCAA
AAACCAGAGAACCACACTAACCCCACCCCCAACACAGTCGTCAACGTGCT
CCTGCACATCTACGCCGTCCATGCATGGCCCGAATCCGCACAAGCGCCTT
CCCATTCGCGCTCTTCCAGCGCTGCAGATGCCGGCGAGGGCTCATCCCGC
TATAGACCGACCGCCAACGGCCGCCTCATGAACGGCCATGCCCGCTCACC
CTCAGAAGCACAGCACCTGCACGATGCGGAGGAATTCGAACTCCAAGGTC
TCATCTCCGACGAGGAAGATGACGCGAAAGACACCCACGCCATGGGTCCG
CGGAAGACTGAAGACGAGGAGAGCTCTCCTTTGGTTGCTAATGGGACAGC
AGCTACGACGCATTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000012.1:733008..734873- >ASPNIDRAFT_214063-T1 ID=ASPNIDRAFT_214063-T1|Name=ASPNIDRAFT_214063-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=7530bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000012.1:733008..734873- (Aspergillus niger ATCC 1015) TCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTACGCCGTCCATGCATGGCCCGAATCC GCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTCTTCCAGCGCTGCAGATGCCGGCGA GGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCGCCAACGGCCGCCTCATGAACGGCC ATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAGCACCTGCACGATGCGGAGGAATTC GAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGAGGAAGATGACGCGAAAGACACCCA CGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAGACGAGGAGAGCTCTCCTTTGGTTG CTAATGGGACAGCAGCTACGACGCATTAACTTCTGTACGCCTCGGGCTTC CTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCAACTCCTGAACGATGCAGG AATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCTACAGCATCGCCTTCATTC TCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTGGCACGTCCCTCTCCAGATTGTCGG AACGATTATCGCTGTGCTCGCATACTTCCTCGGACATGCTCACAAAGGCC GCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCGTCCTTTGCGAACACACTGATGCTC ATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGGCGTCTATCTCAAGCTGCACCTTAC CAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCCGGGTTATTGTGATTGCGCACGGAG TGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCGAGCTGGGTCCAGATGCTCTTCGGA GGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCGGGATGATCACTTGGGACAGTGTCT GGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTTTCATCGCCTACGGTATCCTGCTGA CCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTACTGGCTGCGCCGCACTGGCCGCAGC CAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCATCGCTGCATGGGGATGTGTCAACAC CTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTCCCTGGGTCCACAATGATTTGCAGC ACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGGTGCGCCGGTCTACTGGGTATTTGG ATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCCCAAGCGGAACTTGATCCCAGCCAT AGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCATGTCTGCCCACCCGCAGACTCTGA TGATCAGCACTATGATCCACTCCATCTTCGGCTACACGTTAATGGCTGCC GGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTCCTTCGTGCTTCGGGACAAGGGCTC TGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTAACAGCTTCCAATATCTCACGCCTT TCGACACAACACTATGGATACATATGATCCTTATGGGGTTTGCCTTTGGC GTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGATGGCGATACTAAGTCGACT TGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCTGCTTGCTTCCCCCACCCTGG CCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGGGTGCCGCCATCTCCGAGGAT CCGATTTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTACGCCGTCCATGCATGGCCC GAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTCTTCCAGCGCTGCAGATGC CGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCGCCAACGGCCGCCTCATGA ACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAGCACCTGCACGATGCGGAG GAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGAGGAAGATGACGCGAAAGA CACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAGACGAGGAGAGCTCTCCTT TGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCATTAACTTCTGTACGCCTCG GGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCAACTCCTGAACGA TGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCTACAGCATCGCCT TCATTCTCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTGGCACGTCCCTCTCCAGAT TGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACTTCCTCGGACATGCTCACA AAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCGTCCTTTGCGAACACACTG ATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGGCGTCTATCTCAAGCTGCA CCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCCGGGTTATTGTGATTGCGC ACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCGAGCTGGGTCCAGATGCTC TTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCGGGATGATCACTTGGGACA GTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTTTCATCGCCTACGGTATCC TGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTACTGGCTGCGCCGCACTGGC CGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCATCGCTGCATGGGGATGTGT CAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTCCCTGGGTCCACAATGATT TGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGGTGCGCCGGTCTACTGGGT ATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCCCAAGCGGAACTTGATCCC AGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCATGTCTGCCCACCCGCAGA CTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATCTTCGGCTACACGTTAATG GCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTCCTTCGTGCTTCGGGACAA GGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTAACAGCTTCCAATATCTCA CGCCTTTCGACACAACACTATGGATACATATGATCCTTATGGGGTTTGCC TTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGATGGCGATACTAAG TCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCTGCTTGCTTCCCCCA CCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGGGTGCCGCCATCTCC GAGGATCCGATTTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTACGCCGTCCATGCA TGGCCCGAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTCTTCCAGCGCTGC AGATGCCGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCGCCAACGGCCGCC TCATGAACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAGCACCTGCACGAT GCGGAGGAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGAGGAAGATGACGC GAAAGACACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAGACGAGGAGAGCT CTCCTTTGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCATTAACTTCTGTAC GCCTCGGGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCAACTCCT GAACGATGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCTACAGCA TCGCCTTCATTCTCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTGGCACGTCCCTCT CCAGATTGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACTTCCTCGGACATG CTCACAAAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCGTCCTTTGCGAAC ACACTGATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGGCGTCTATCTCAA GCTGCACCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCCGGGTTATTGTGA TTGCGCACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCGAGCTGGGTCCAG ATGCTCTTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCGGGATGATCACTT GGGACAGTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTTTCATCGCCTACG GTATCCTGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTACTGGCTGCGCCGC ACTGGCCGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCATCGCTGCATGGGG ATGTGTCAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTCCCTGGGTCCACA ATGATTTGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGGTGCGCCGGTCTA CTGGGTATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCCCAAGCGGAACTT GATCCCAGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCATGTCTGCCCACC CGCAGACTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATCTTCGGCTACACG TTAATGGCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTCCTTCGTGCTTCG GGACAAGGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTAACAGCTTCCAAT ATCTCACGCCTTTCGACACAACACTATGGATACATATGATCCTTATGGGG TTTGCCTTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGATGGCGAT ACTAAGTCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCTGCTTGCTT CCCCCACCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGGGTGCCGCC ATCTCCGAGGATCCGATTTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTACGCCGTC CATGCATGGCCCGAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTCTTCCAG CGCTGCAGATGCCGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCGCCAACG GCCGCCTCATGAACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAGCACCTG CACGATGCGGAGGAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGAGGAAGA TGACGCGAAAGACACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAGACGAGG AGAGCTCTCCTTTGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCATTAACTT CTGTACGCCTCGGGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCAGATGCA ACTCCTGAACGATGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGATTCTCT ACAGCATCGCCTTCATTCTCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTGGCACGT CCCTCTCCAGATTGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACTTCCTCG GACATGCTCACAAAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCGTCCTTT GCGAACACACTGATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGGCGTCTA TCTCAAGCTGCACCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCCGGGTTA TTGTGATTGCGCACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCGAGCTGG GTCCAGATGCTCTTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCGGGATGA TCACTTGGGACAGTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTTTCATCG CCTACGGTATCCTGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTACTGGCTG CGCCGCACTGGCCGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCATCGCTGC ATGGGGATGTGTCAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTCCCTGGG TCCACAATGATTTGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGGTGCGCC GGTCTACTGGGTATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCCCAAGCG GAACTTGATCCCAGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCATGTCTG CCCACCCGCAGACTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATCTTCGGC TACACGTTAATGGCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTCCTTCGT GCTTCGGGACAAGGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTAACAGCT TCCAATATCTCACGCCTTTCGACACAACACTATGGATACATATGATCCTT ATGGGGTTTGCCTTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCTTGGGAT GGCGATACTAAGTCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCCTGCTGC TTGCTTCCCCCACCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCCGAGGGT GCCGCCATCTCCGAGGATCCGATTTCGTCAACGTGCTCCTGCACATCTAC GCCGTCCATGCATGGCCCGAATCCGCACAAGCGCCTTCCCATTCGCGCTC TTCCAGCGCTGCAGATGCCGGCGAGGGCTCATCCCGCTATAGACCGACCG CCAACGGCCGCCTCATGAACGGCCATGCCCGCTCACCCTCAGAAGCACAG CACCTGCACGATGCGGAGGAATTCGAACTCCAAGGTCTCATCTCCGACGA GGAAGATGACGCGAAAGACACCCACGCCATGGGTCCGCGGAAGACTGAAG ACGAGGAGAGCTCTCCTTTGGTTGCTAATGGGACAGCAGCTACGACGCAT TAACTTCTGTACGCCTCGGGCTTCCTCTTCATGGGCGCCACCGAAGAGCA GATGCAACTCCTGAACGATGCAGGAATTACTCACGTCTCCTACGTCCTGA TTCTCTACAGCATCGCCTTCATTCTCTTCCTATATTATACGCTCGCGCTG GCACGTCCCTCTCCAGATTGTCGGAACGATTATCGCTGTGCTCGCATACT TCCTCGGACATGCTCACAAAGGCCGCCAGTTCTCGAAGAACGTCCACGCG TCCTTTGCGAACACACTGATGCTCATGATGGTGGTGCAGATCGTCCTCGG CGTCTATCTCAAGCTGCACCTTACCAAGGGAATTCATGGCCGGATCCGCC GGGTTATTGTGATTGCGCACGGAGTGGTTGGAAAGGCGATGCCTGTGGCG AGCTGGGTCCAGATGCTCTTCGGAGGAATCACTGCCATGGGATTCTGTCG GGATGATCACTTGGGACAGTGTCTGGCTCATTTCATCATGGGCAGCGCTT TCATCGCCTACGGTATCCTGCTGACCATCCTACTCCTCGTTGGCCAGTAC TGGCTGCGCCGCACTGGCCGCAGCCAGGAGTTCTTCGACTCGTTGATCAT CGCTGCATGGGGATGTGTCAACACCTTCACGGAACACCGTTGGGGAGGTC CCTGGGTCCACAATGATTTGCAGCACACTACTATGGGTGTTGTCTGGTGG TGCGCCGGTCTACTGGGTATTTGGATGAGCCGGAAGCGCAACGGCCGGCC CAAGCGGAACTTGATCCCAGCCATAGTCATTCTCCTCACTGGTTATGCCA TGTCTGCCCACCCGCAGACTCTGATGATCAGCACTATGATCCACTCCATC TTCGGCTACACGTTAATGGCTGCCGGTTTCACCAGAATCATTGAGATCTC CTTCGTGCTTCGGGACAAGGGCTCTGTCAGCCCGGACGGATCTGACCCTA ACAGCTTCCAATATCTCACGCCTTTCGACACAACACTATGGATACATATG ATCCTTATGGGGTTTGCCTTTGGCGTTATCTTTCCCTTGGGCATGGTTCT TGGGATGGCGATACTAAGTCGACTTGGGCCCCAAGGGTTGCTGGCAGTCC TGCTGCTTGCTTCCCCCACCCTGGCCCACGGGGGTCATGAGAGTGTCCCC GAGGGTGCCGCCATCTCCGAGGATCCGATT back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
Note | SECRETED:SignalP(1-26) |
DBxref | InterPro:IPR018827 |
DBxref | InterPro:IPR018825 |
DBxref | PFAM:PF10355 |
DBxref | PFAM:PF10348 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ACJE01000012.1 | supercontig | ACJE01000012.1:733008..734873 - |
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