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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000004.1:2411935..2414410- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_51820-T1 ID=ASPNIDRAFT_51820-T1|Name=ASPNIDRAFT_51820-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2476bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000004.1:2411935..2414410- (Aspergillus niger ATCC 1015) ATGTCTTTCCGTGGAGGCCGTGGCGGTTTCGGTGGCCGTGGAGGTGAGCT
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GGAAAAATTTGCTGGTTCTCTGTACGCAGAGGCTGTCGTGAATCTCAGCC
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TATCCAACGTACACCACTACTTCGACTGTTTGTCCTGCGAGGATCTTCTT
TCCGTCAAATACACCTGAGCATGTCTCGCAGGGTTTCTGCCATGCCGTCA
AATACTTCCACGACTAGCGGTGTCCCACCTGCGGGTGACGGTGGTGAGCC
TGCATCCCTGCAACAATATCCTCAGAGTCTGGGAAGCTAAGTGATAGCAG
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AAACGCTGCATATCCCTAAGCCTTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000004.1:2411935..2414410- >ASPNIDRAFT_51820-T1 ID=ASPNIDRAFT_51820-T1|Name=ASPNIDRAFT_51820-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=13134bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000004.1:2411935..2414410- (Aspergillus niger ATCC 1015) ATTTCCTTCGGAATGGCACCCGCTGCCGCAGCTTTTGCGCTCGGAATGCG CACCAGCCTCGACCATTTGCTCCTCTCCTTCTTTGTTCTGTGCGGCCTGA CACGCTTGGCACGGTTCAACGTGACTGTTGCTGTTCTGCCGAAAGACAAG TCTGGAAAGTCGAAGTACTTCGAGGGCACGCCCATCCCAACGACCTTGTC AATCACCTTTTTCCTGGCCTACTGCGTCTCTCAAGACTGGGTGCTGGACG ATCTACCCCTCGGCCTTGTAGCCCAGGGCACAGCGTTCGAGTTCCACCCG CTGGTACTGTTGTTTGTCTTGCACGGATGCCTCATGGTCAGCAAAACGCT GCATATCCCTAAGCCTTAATGATGTCCGTTTTTTCTTCGATGCGTTACTG TCTTGGTGACCCTCGTGATTTTGGTGCAATTTGGGCGGCTCTGATCTTCA TGCCCTTCGGGCTGTTTTTCGATTTCATGGATGGACGGATTGCTAGGTGG AGGAAAAAGTCGTCGCTCATGGGACAAGAGCTTGATTCACTGGCCGATTT GGATTCTGTGGAGGGCTCTGCATCTTGCTGATCTAGTAACTGAACTCAAT 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0016780 | phosphotransferase activity, for other substituted phosphate groups |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0001522 | pseudouridine synthesis |
GO:0042254 | ribosome biogenesis |
GO:0008654 | phospholipid biosynthetic process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09263MR4 |
DBxref | InterPro:IPR009000 |
DBxref | InterPro:IPR007504 |
DBxref | InterPro:IPR004533 |
DBxref | InterPro:IPR038664 |
DBxref | InterPro:IPR000462 |
DBxref | PFAM:PF04410 |
DBxref | PFAM:PF01066 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ACJE01000004.1 | supercontig | ACJE01000004.1:2411935..2414410 - |
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