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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000002.1:86157..88075+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_53725-T1 ID=ASPNIDRAFT_53725-T1|Name=ASPNIDRAFT_53725-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=1919bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000002.1:86157..88075+ (Aspergillus niger ATCC 1015) CCCCCATCTTCTCCCGCATAACCTCACGTCGGAGGATTCTCTTGTTCTTG
TCACTCCCCTCTCCCCGACAAGACTTTTTTGATACCTCTCCTCTCCTTTC
ATCTAAATATCTCAGTCACCATGTTTAAGCTTGCCCGCAGCAAACCGGTT
ACGGCAGCTTTGAGGGCTGCGACGGTAAGCATCCCTGGGCCCCGTTGCCC
TTCACTCCTGTTAAATCTCCTAAAGGCGGATCGGCGTGCTAACATCACCG
TTGTTGACAGGAGTCTTCCGTTCAGTCCCGTGTTGCTCAGCAACAGAGAA
ACCTGTCGATTCACGAATACCTGTCTGCGAACCTGCTCAAGTCGGTGCGT
CGGGCATCCAAAAATCTCTTGTAAAACTTCGCCTTGCAACCTTCACTAAT
ACGATACTACAGTATGGCATCGGCATGCCCAAGGGTGAAGTCGCCCGCTC
CGCGGAGGAGGCTGAGGCCGTTGCCAAGTCCCTCGGTACGTTTTTGTGAT
CCGCCATCCAACCCCAAAGTTCGCGACGGCTACTAAGACGAGGACGTTTA
GGTAATGACGACATGGTCATCAAGGCCCAGGTTCTTGCTGGTGGTCGTGG
TAAGGGTACTTTCGACAATGGCCTTAAGGGTGGTGTGCGCGTGATCTACT
CGTGAGTGTGACCCGCGTTATTCCGAGTCTTCGCTTGCGCTGACATGTAT
AAAATTTTAGGCCTACCGAGGCCAAGATGTTCGCTAGCCAGATGATCGGA
CAGAAGCTCATCACCAAGCAGACTGGCGCTGCTGGTCGTCTTTGCAATTC
TGTCTACATCTGTGAGCGCAAGTTTGCTCGCCGCGAGTTCTACCTTGCTG
TCCTCATGGACCGCGCCTCTCAGAGCCCCGTCATTGTCGCCTCGTCGCAA
GGTGGTATGGACATTGAGGCCGTCGCTAAGGAGAACCCTGAGGCCATCAT
CACCACTCCCATTGACATCAAGGTCGGTGTGACCGATGCCATTGCTCACA
AGATCGTCACCGAGCTCGGCTTCTCCGAGCAGTGCGTCGAGGAGGCCAAG
GACACCATCCAGAAGCTCTACAAGGTCTTCATGGAGAAGGATGCTACCCA
GATTGAGATCAACCCTCTGTCTGAGACCTCCGACCACAAGGTCATGGCCA
TGGATGCCAAGCTTGGCTTCGATGACAACGCCGAATTCCGCCAGAAGGAG
GTCTTCTCCTGGAGAGACACCACTCAGGAAGATGCCGATGAGGTCAAGGC
CGCTGAGTAAGATCCTCCTGGTCCTTGCATCTATACAACGCTCGAAAGCA
TTCTAATCTACGGCATAGGCACGGTCTGAACTTCATCAAGCTTGACGGTG
ACATTGGATGCCTGGGTATGGATCCATCGAAATCGACTGATATGGTTTAT
GCTAACGGTCACCATAGTTAACGGTGCTGGTCTTGCCATGGCCACCATGG
ATATCATCAAGCTTAACGGCGGTGCCCCCGCCAACTTCCTCGATGTCGGT
GGTGGTGCCACCCCTGCCGCCATCAAGTCCGCTTTCGAGCTCATCACCAG
CGACCCCAAGGTGACTGCTATCTTCGTCAACATCTTCGGTGGTATCGTTC
GCTGCGATGCTATCGCCCAGGGTTTGATCAACGTCGTGCAGGAGATGGGT
CTGCGCACTCCCATCGTTGCCCGTCTGCAGGGTACCAACATGGAGCAGGC
TCACAAGCTGGTATGTTCTTACCGTCTATGCGAACCAGCATAATGAAATC
CACGCGAACACAAGTTAACTGACGTGAATTGCAGATCAACGAGTCTGGCC
TCAAGATCTTCTCCATTGAGGATCTCCAGAGCGCTGCTGAGAAGTCTGTT
CAGTTCTCCAAGGTCGTCAAGATGGCCCGCGAGATCGACGTTGGCGTTGA
GTTCACTCTTGGTATCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000002.1:86157..88075+ >ASPNIDRAFT_53725-T1 ID=ASPNIDRAFT_53725-T1|Name=ASPNIDRAFT_53725-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=10656bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000002.1:86157..88075+ (Aspergillus niger ATCC 1015) ATGTTTAAGCTTGCCCGCAGCAAACCGGTTACGGCAGCTTTGAGGGCTGC GACGGAGTCTTCCGTTCAGTCCCGTGTTGCTCAGCAACAGAGAAACCTGT CGATTCACGAATACCTGTCTGCGAACCTGCTCAAGTCGTATGGCATCGGC ATGCCCAAGGGTGAAGTCGCCCGCTCCGCGGAGGAGGCTGAGGCCGTTGC CAAGTCCCTCGGTAATGACGACATGGTCATCAAGGCCCAGGTTCTTGCTG GTGGTCGTGGTAAGGGTACTTTCGACAATGGCCTTAAGGGTGGTGTGCGC GTGATCTACTCGCCTACCGAGGCCAAGATGTTCGCTAGCCAGATGATCGG ACAGAAGCTCATCACCAAGCAGACTGGCGCTGCTGGTCGTCTTTGCAATT CTGTCTACATCTGTGAGCGCAAGTTTGCTCGCCGCGAGTTCTACCTTGCT GTCCTCATGGACCGCGCCTCTCAGAGCCCCGTCATTGTCGCCTCGTCGCA AGGTGGTATGGACATTGAGGCCGTCGCTAAGGAGAACCCTGAGGCCATCA TCACCACTCCCATTGACATCAAGGTCGGTGTGACCGATGCCATTGCTCAC AAGATCGTCACCGAGCTCGGCTTCTCCGAGCAGTGCGTCGAGGAGGCCAA GGACACCATCCAGAAGCTCTACAAGGTCTTCATGGAGAAGGATGCTACCC AGATTGAGATCAACCCTCTGTCTGAGACCTCCGACCACAAGGTCATGGCC ATGGATGCCAAGCTTGGCTTCGATGACAACGCCGAATTCCGCCAGAAGGA GGTCTTCTCCTGGAGAGACACCACTCAGGAAGATGCCGATGAGGTCAAGG CCGCTGAGCACGGTCTGAACTTCATCAAGCTTGACGGTGACATTGGATGC CTGGTTAACGGTGCTGGTCTTGCCATGGCCACCATGGATATCATCAAGCT TAACGGCGGTGCCCCCGCCAACTTCCTCGATGTCGGTGGTGGTGCCACCC CTGCCGCCATCAAGTCCGCTTTCGAGCTCATCACCAGCGACCCCAAGGTG ACTGCTATCTTCGTCAACATCTTCGGTGGTATCGTTCGCTGCGATGCTAT CGCCCAGGGTTTGATCAACGTCGTGCAGGAGATGGGTCTGCGCACTCCCA TCGTTGCCCGTCTGCAGGGTACCAACATGGAGCAGGCTCACAAGCTGATC AACGAGTCTGGCCTCAAGATCTTCTCCATTGAGGATCTCCAGAGCGCTGC TGAGAAGTCTGTTCAGTTCTCCAAGGTCGTCAAGATGGCCCGCGAGATCG ACGTTGGCGTTGAGTTCACTCTTGGTATCTAAATGTTTAAGCTTGCCCGC AGCAAACCGGTTACGGCAGCTTTGAGGGCTGCGACGGAGTCTTCCGTTCA GTCCCGTGTTGCTCAGCAACAGAGAAACCTGTCGATTCACGAATACCTGT CTGCGAACCTGCTCAAGTCGTATGGCATCGGCATGCCCAAGGGTGAAGTC GCCCGCTCCGCGGAGGAGGCTGAGGCCGTTGCCAAGTCCCTCGGTAATGA CGACATGGTCATCAAGGCCCAGGTTCTTGCTGGTGGTCGTGGTAAGGGTA 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ATCTTCTCCATTGAGGATCTCCAGAGCGCTGCTGAGAAGTCTGTTCAGTT CTCCAAGGTCGTCAAGATGGCCCGCGAGATCGACGTTGGCGTTGAGTTCA CTCTTGGTATCTAAATGTTTAAGCTTGCCCGCAGCAAACCGGTTACGGCA GCTTTGAGGGCTGCGACGGAGTCTTCCGTTCAGTCCCGTGTTGCTCAGCA ACAGAGAAACCTGTCGATTCACGAATACCTGTCTGCGAACCTGCTCAAGT CGTATGGCATCGGCATGCCCAAGGGTGAAGTCGCCCGCTCCGCGGAGGAG GCTGAGGCCGTTGCCAAGTCCCTCGGTAATGACGACATGGTCATCAAGGC CCAGGTTCTTGCTGGTGGTCGTGGTAAGGGTACTTTCGACAATGGCCTTA AGGGTGGTGTGCGCGTGATCTACTCGCCTACCGAGGCCAAGATGTTCGCT AGCCAGATGATCGGACAGAAGCTCATCACCAAGCAGACTGGCGCTGCTGG TCGTCTTTGCAATTCTGTCTACATCTGTGAGCGCAAGTTTGCTCGCCGCG AGTTCTACCTTGCTGTCCTCATGGACCGCGCCTCTCAGAGCCCCGTCATT GTCGCCTCGTCGCAAGGTGGTATGGACATTGAGGCCGTCGCTAAGGAGAA CCCTGAGGCCATCATCACCACTCCCATTGACATCAAGGTCGGTGTGACCG ATGCCATTGCTCACAAGATCGTCACCGAGCTCGGCTTCTCCGAGCAGTGC GTCGAGGAGGCCAAGGACACCATCCAGAAGCTCTACAAGGTCTTCATGGA GAAGGATGCTACCCAGATTGAGATCAACCCTCTGTCTGAGACCTCCGACC ACAAGGTCATGGCCATGGATGCCAAGCTTGGCTTCGATGACAACGCCGAA TTCCGCCAGAAGGAGGTCTTCTCCTGGAGAGACACCACTCAGGAAGATGC 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TCATGGACCGCGCCTCTCAGAGCCCCGTCATTGTCGCCTCGTCGCAAGGT GGTATGGACATTGAGGCCGTCGCTAAGGAGAACCCTGAGGCCATCATCAC CACTCCCATTGACATCAAGGTCGGTGTGACCGATGCCATTGCTCACAAGA TCGTCACCGAGCTCGGCTTCTCCGAGCAGTGCGTCGAGGAGGCCAAGGAC ACCATCCAGAAGCTCTACAAGGTCTTCATGGAGAAGGATGCTACCCAGAT TGAGATCAACCCTCTGTCTGAGACCTCCGACCACAAGGTCATGGCCATGG ATGCCAAGCTTGGCTTCGATGACAACGCCGAATTCCGCCAGAAGGAGGTC TTCTCCTGGAGAGACACCACTCAGGAAGATGCCGATGAGGTCAAGGCCGC TGAGCACGGTCTGAACTTCATCAAGCTTGACGGTGACATTGGATGCCTGG TTAACGGTGCTGGTCTTGCCATGGCCACCATGGATATCATCAAGCTTAAC GGCGGTGCCCCCGCCAACTTCCTCGATGTCGGTGGTGGTGCCACCCCTGC CGCCATCAAGTCCGCTTTCGAGCTCATCACCAGCGACCCCAAGGTGACTG CTATCTTCGTCAACATCTTCGGTGGTATCGTTCGCTGCGATGCTATCGCC CAGGGTTTGATCAACGTCGTGCAGGAGATGGGTCTGCGCACTCCCATCGT TGCCCGTCTGCAGGGTACCAACATGGAGCAGGCTCACAAGCTGATCAACG AGTCTGGCCTCAAGATCTTCTCCATTGAGGATCTCCAGAGCGCTGCTGAG AAGTCTGTTCAGTTCTCCAAGGTCGTCAAGATGGCCCGCGAGATCGACGT TGGCGTTGAGTTCACTCTTGGTATCTAAATGTTTAAGCTTGCCCGCAGCA AACCGGTTACGGCAGCTTTGAGGGCTGCGACGGAGTCTTCCGTTCAGTCC 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CGAGCTCATCACCAGCGACCCCAAGGTGACTGCTATCTTCGTCAACATCT TCGGTGGTATCGTTCGCTGCGATGCTATCGCCCAGGGTTTGATCAACGTC GTGCAGGAGATGGGTCTGCGCACTCCCATCGTTGCCCGTCTGCAGGGTAC CAACATGGAGCAGGCTCACAAGCTGATCAACGAGTCTGGCCTCAAGATCT TCTCCATTGAGGATCTCCAGAGCGCTGCTGAGAAGTCTGTTCAGTTCTCC AAGGTCGTCAAGATGGCCCGCGAGATCGACGTTGGCGTTGAGTTCACTCT TGGTATCTAAATGTTTAAGCTTGCCCGCAGCAAACCGGTTACGGCAGCTT TGAGGGCTGCGACGGAGTCTTCCGTTCAGTCCCGTGTTGCTCAGCAACAG AGAAACCTGTCGATTCACGAATACCTGTCTGCGAACCTGCTCAAGTCGTA TGGCATCGGCATGCCCAAGGGTGAAGTCGCCCGCTCCGCGGAGGAGGCTG AGGCCGTTGCCAAGTCCCTCGGTAATGACGACATGGTCATCAAGGCCCAG GTTCTTGCTGGTGGTCGTGGTAAGGGTACTTTCGACAATGGCCTTAAGGG TGGTGTGCGCGTGATCTACTCGCCTACCGAGGCCAAGATGTTCGCTAGCC AGATGATCGGACAGAAGCTCATCACCAAGCAGACTGGCGCTGCTGGTCGT CTTTGCAATTCTGTCTACATCTGTGAGCGCAAGTTTGCTCGCCGCGAGTT CTACCTTGCTGTCCTCATGGACCGCGCCTCTCAGAGCCCCGTCATTGTCG CCTCGTCGCAAGGTGGTATGGACATTGAGGCCGTCGCTAAGGAGAACCCT GAGGCCATCATCACCACTCCCATTGACATCAAGGTCGGTGTGACCGATGC CATTGCTCACAAGATCGTCACCGAGCTCGGCTTCTCCGAGCAGTGCGTCG 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AGGAAGATGCCGATGAGGTCAAGGCCGCTGAGCACGGTCTGAACTTCATC AAGCTTGACGGTGACATTGGATGCCTGGTTAACGGTGCTGGTCTTGCCAT GGCCACCATGGATATCATCAAGCTTAACGGCGGTGCCCCCGCCAACTTCC TCGATGTCGGTGGTGGTGCCACCCCTGCCGCCATCAAGTCCGCTTTCGAG CTCATCACCAGCGACCCCAAGGTGACTGCTATCTTCGTCAACATCTTCGG TGGTATCGTTCGCTGCGATGCTATCGCCCAGGGTTTGATCAACGTCGTGC AGGAGATGGGTCTGCGCACTCCCATCGTTGCCCGTCTGCAGGGTACCAAC ATGGAGCAGGCTCACAAGCTGATCAACGAGTCTGGCCTCAAGATCTTCTC CATTGAGGATCTCCAGAGCGCTGCTGAGAAGTCTGTTCAGTTCTCCAAGG TCGTCAAGATGGCCCGCGAGATCGACGTTGGCGTTGAGTTCACTCTTGGT ATCTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0046872 | metal ion binding |
GO:0003824 | catalytic activity |
GO:0005524 | ATP binding |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006099 | tricarboxylic acid cycle |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09262GXD |
DBxref | InterPro:IPR011761 |
DBxref | InterPro:IPR017866 |
DBxref | InterPro:IPR005811 |
DBxref | InterPro:IPR013815 |
DBxref | InterPro:IPR016102 |
DBxref | InterPro:IPR013650 |
DBxref | InterPro:IPR005809 |
DBxref | PFAM:PF00549 |
DBxref | PFAM:PF13549 |
DBxref | PFAM:PF08442 |
Product | mitochondrial |
Product | Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
ACJE01000002.1 | supercontig | ACJE01000002.1:86157..88075 + |
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