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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at ACJE01000011.1:91872..93929+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ASPNIDRAFT_55212-T1 ID=ASPNIDRAFT_55212-T1|Name=ASPNIDRAFT_55212-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=mRNA|length=2058bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000011.1:91872..93929+ (Aspergillus niger ATCC 1015) ACTAGTAGTCTAATCGCTACAAAGTGCATCAGGGGAGCCAGCCATGGGAA
CAAAGCTCGATGCAATCTGACTTAATCAGTCTCCACATCGAGCTGGGCGT
GAAACTGATGGACACTCCGCCATCTACTCGAAACCATCTCTAATTAAGCA
CTCACGGCTCCACTTCTTCTCTGGGCTTCCTCCGTGCCGCTCGGACAGCT
CACTGGATGCTCCCAGTGGAGTCGTTTCACCGGATCCCCTCAACGCTGAC
GATCGCATTCCCAAGGCATCCACTAGCTCTCTCAAGCAGACCAGGGCAGT
GAGGTGATCGGCGGTGGCCTCACGAGTCACGACATTACTGTCGCCGGGAC
CCAGATGTTTATTCTCCCTCCCTGTCGACCTAATGGCCCACACCACATCC
ACCGTCATAACGCCGATATTGGTCGAGATTGCGCTGGAGTCGCAGAGGGA
GTCTTCGGCATACCCACCGGCTCCGTAAACCTCCATCAGGAGAATTGTTC
CAAACTTCCATGAGCCATGGCTTCGAGGACCACCAGCCCTCTATATAAGG
GACGAGCCCGTCGACCGTCTCGGATCCTTTCCTCTCTGGCTCAACACACA
CAACTTTGTCATTCTTTCTCTTGTTTCTCTTTTGTTTCTAATTGTAACCT
TTGTCACTCTTTTCTAAACCGACTTGCAAAACTTCCAGGATGAAGTACGC
TGCTGCTCTCACGGCTATTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCG
GTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGT
GATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCT
CGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGACGTGAGTTTTGA
ATCCAAAGCAATGAACGAATCGATTCCCGGCTGACCAGTGTCCGAATTTG
CCAGTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGC
GCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGA
CTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTAGT
AAGTTGCCTTCTGAGGTATCCTCGAGTATCAAGGAAGAGGAAATGCTGAC
AAGAGGATAGCAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAAC
AAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCT
CCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGTATGCATCGTCCA
GGACTACATACATTACTCCCATCGCAAACTAACCATGGAATTCCCACAGG
AACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGGTGGTGACGC
CATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACGTTACTGTAA
GTCGCCATCCAGCATCATGATTTTCATCCTTCCACCACTAATGAATGCTT
CAGACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCCGA
CAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTACT
CTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCTCT
AGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGCCG
TGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTACAACAACTACT
GGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACGTC
CTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACCGA
CACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTGCG
AGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACCTC
ACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTCCC
CTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGGTA
ACCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at ACJE01000011.1:91872..93929+ >ASPNIDRAFT_55212-T1 ID=ASPNIDRAFT_55212-T1|Name=ASPNIDRAFT_55212-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 1015|type=CDS|length=5610bp|location=Sequence derived from alignment at ACJE01000011.1:91872..93929+ (Aspergillus niger ATCC 1015) ATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTATTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGC CGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCA CTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTG GTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGAC TTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTC CCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGG TGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACAC TGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTG AGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGT GTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGA GTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCT GGATTGACCACGTTACTACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTC GGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGG CGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGT ACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTAC AAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACAT CTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCT CCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACC GTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGC CTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCA ACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGC GGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAA CGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTA TTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCC GTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTA CCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCC GTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACT ACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCT GGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCA CCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAAC TCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCG TGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTG CTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACC CTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACGTTACTACTGCCCGCAT TGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCA TCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGAC GGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCAC CTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCC AGGACAACACCTACCTCCACATCTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCG GGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAA CTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTG CTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGC CGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCAC CACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTG CCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAG TACGCTGCTGCTCTCACGGCTATTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGC TGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTG GTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCT TACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGA CTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGG GTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACC AACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGG TGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTA CCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCC AACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGT CTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTG ACCACGTTACTACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACC GACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTC TGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTG ACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACC TCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTACAA CAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTG GCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTC GAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTC CACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCG GTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGAC ACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGG TCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTATTGCCG CCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGT TTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTAC CACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCA TTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACG ACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCAT CAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCA CCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAAC AAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCT CCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCA CCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGAC GAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACGTTACTACTGCCCGCATTGGTCG CCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCA ACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCAC CACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAG TGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACA ACACCTACCTCCACATCTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCAC GCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTT CTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCT TCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCC TGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGT CCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCA CCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCT GCTGCTCTCACGGCTATTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGG TGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTG ATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTC GGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCAC TGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTG CCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTAC GAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACT CGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCG GTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATC ATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGG TGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACG TTACTACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCC GACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTA CTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCT CTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGC CGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTACAACAACTA CTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACG TCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACC GACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTG CGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACC TCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTC CCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGG TAACCTGTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | SECRETED:SignalP(1-19) |
| Note | CAZy:PL1 |
| Note | CAZy:PL1_4 |
| DBxref | InterPro:IPR011050 |
| DBxref | InterPro:IPR012334 |
| DBxref | InterPro:IPR002022 |
| DBxref | PFAM:PF00544 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| ACJE01000011.1 | supercontig | ACJE01000011.1:91872..93929 + |
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