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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000009:138802..140654+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_000473-T1 ID=ATCC10864_000473-T1|Name=ATCC10864_000473-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1853bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000009:138802..140654+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTGGC
TGTCGCCTCTGTTCCAGCCATCGTCATTAAGGTAGCTGACCATCGCCATC
ACATCGATTCCTCCCACTGACCCTTTCTAGGGATCCAAATTCTTCTACGA
GAACAACGGCACGGAATTGTAAGTCATCCCCTCTTATCACTTTAGGTCAG
CACTTGCTAATGTGTCTCAGCTTCATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCGTAA
GCAACAGCCCAACAAGCCCGCTGGCCCTGTCTTCCCAGACTAATAATCCA
TACAGCCCCCTCTGATGGCACTGGCACGACGACCTCCGCTGGCACGGTCG
ATTTCGTCGATCCCCTTGCCAACGAGACCATCTGCAAGCGGGATCTGCCC
TACCTGCAGGAACTCAACACCAACGTAGTCCGTGTTTACGACGTTGACCC
GAACGCGGACCACAGCACCTGCATGAACCTGCTGGCCGACGCCGGCATCT
ACGTGCTGGCGGACCTGTCCTCGTCGGACTACTCCATCGTCAGCAGCGAC
CCGGAGTGGAATTTGGAGCTGTACGACTACTACGCCAGCGTGGTCGACTC
GCTGGCCAACTACACCAACACTCTGGGTTTCTTCGCGGGTAACGAGAACT
CCAACAGTGTCAACACTACCGGTGCCAGTGCCTACGTCAAGGCCGCTGTG
CGTGACATGAAGGCCTACATCAAGTCCAAGAACTACCGCAGCATCGGTGT
CGGTTACTCCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGTACCGACCTCGTTGACT
ACTTCAACTGCGGTGACTCGGACGATTCCGTCGACTTCTTCGGTGACAAC
GTCTACGAGTGGTGCGGTGACTCCAGCTACACTGAGTCCGGCTACAATGT
CATGACCCAGGAGCTGAGCAACCTCTCCGTCCCTTACTTCTTCTCCGAGT
ACGGTTGTATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAGCAACGTCCCCGTCATG
TACGGTCCTAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTGGTATTGTCTACGAGTA
CTTCCAGGATGCCAACGACTACGGTATGCCTCCCCCCTACCCCCTTTCAT
TAACAACAACCCATGTGACAGTTTAACTAACACCGCCCAGGTCTGGTCAC
CATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACCCTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCCG
AGGAGATCAACAGCGTCAGCCCCACCGGAACCAACAGCGCCAGCTACACC
CCCACCAACACCGTCGCGCGGTCCTGCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGA
AGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCCCCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGCA
TGGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGTGAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAG
TACGCCGACCTGTACAGCACCGTCTGCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTAT
CACCGGCAACACCACCACCGGAGAGTACGGTGCTTACAGCATGTGCAACA
CCAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCTGAACGCGTACTACGAGGAGCAGAAG
TCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCTGTGACTTTGGTGGCTCGGCTACCAC
CACTTCGACTACTTCTCCTACCGGTACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTG
TTGGCACCGCTGGTACGGGTACTGTCTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACC
AGCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCGGTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGG
TGTGCCTGGGTACATGACCTACACTGCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGG
TTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTTGTCCGGTACTGGAATGATTCTTTTG
TAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000009:138802..140654+ >ATCC10864_000473-T1 ID=ATCC10864_000473-T1|Name=ATCC10864_000473-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=8130bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000009:138802..140654+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTGGC
TGTCGCCTCTGTTCCAGCCATCGTCATTAAGGGATCCAAATTCTTCTACG
AGAACAACGGCACGGAATTCTTCATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCCCCCC
TCTGATGGCACTGGCACGACGACCTCCGCTGGCACGGTCGATTTCGTCGA
TCCCCTTGCCAACGAGACCATCTGCAAGCGGGATCTGCCCTACCTGCAGG
AACTCAACACCAACGTAGTCCGTGTTTACGACGTTGACCCGAACGCGGAC
CACAGCACCTGCATGAACCTGCTGGCCGACGCCGGCATCTACGTGCTGGC
GGACCTGTCCTCGTCGGACTACTCCATCGTCAGCAGCGACCCGGAGTGGA
ATTTGGAGCTGTACGACTACTACGCCAGCGTGGTCGACTCGCTGGCCAAC
TACACCAACACTCTGGGTTTCTTCGCGGGTAACGAGAACTCCAACAGTGT
CAACACTACCGGTGCCAGTGCCTACGTCAAGGCCGCTGTGCGTGACATGA
AGGCCTACATCAAGTCCAAGAACTACCGCAGCATCGGTGTCGGTTACTCC
GCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGTACCGACCTCGTTGACTACTTCAACTG
CGGTGACTCGGACGATTCCGTCGACTTCTTCGGTGACAACGTCTACGAGT
GGTGCGGTGACTCCAGCTACACTGAGTCCGGCTACAATGTCATGACCCAG
GAGCTGAGCAACCTCTCCGTCCCTTACTTCTTCTCCGAGTACGGTTGTAT
CACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAGCAACGTCCCCGTCATGTACGGTCCTA
AGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTGGTATTGTCTACGAGTACTTCCAGGAT
GCCAACGACTACGGTCTGGTCACCATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACCCT
GACCGGCTTCTCCTCCTACTCCGAGGAGATCAACAGCGTCAGCCCCACCG
GAACCAACAGCGCCAGCTACACCCCCACCAACACCGTCGCGCGGTCCTGC
CCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGAAGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCCCC
CAACTCGGAACTCTGCTCCTGCATGGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGTGA
AGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAGTACGCCGACCTGTACAGCACCGTCTGC
GGATACGGCGTGTGCGCGGGTATCACCGGCAACACCACCACCGGAGAGTA
CGGTGCTTACAGCATGTGCAACACCAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCTGA
ACGCGTACTACGAGGAGCAGAAGTCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCTGT
GACTTTGGTGGCTCGGCTACCACCACTTCGACTACTTCTCCTACCGGTAC
TTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTGTTGGCACCGCTGGTACGGGTACTGTCT
CGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACCAGCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCGGT
AGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGGTGTGCCTGGGTACATGACCTACACTGC
TACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGGTTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTTGT
CCGGTACTGGAATGATTCTTTTGTAGATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTA
GCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTGGCTGTCGCCTCTGTTCCAGCCATCGT
CATTAAGGGATCCAAATTCTTCTACGAGAACAACGGCACGGAATTCTTCA
TCCGTGGTGTGGCCTACCAGCCCCCCTCTGATGGCACTGGCACGACGACC
TCCGCTGGCACGGTCGATTTCGTCGATCCCCTTGCCAACGAGACCATCTG
CAAGCGGGATCTGCCCTACCTGCAGGAACTCAACACCAACGTAGTCCGTG
TTTACGACGTTGACCCGAACGCGGACCACAGCACCTGCATGAACCTGCTG
GCCGACGCCGGCATCTACGTGCTGGCGGACCTGTCCTCGTCGGACTACTC
CATCGTCAGCAGCGACCCGGAGTGGAATTTGGAGCTGTACGACTACTACG
CCAGCGTGGTCGACTCGCTGGCCAACTACACCAACACTCTGGGTTTCTTC
GCGGGTAACGAGAACTCCAACAGTGTCAACACTACCGGTGCCAGTGCCTA
CGTCAAGGCCGCTGTGCGTGACATGAAGGCCTACATCAAGTCCAAGAACT
ACCGCAGCATCGGTGTCGGTTACTCCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGT
ACCGACCTCGTTGACTACTTCAACTGCGGTGACTCGGACGATTCCGTCGA
CTTCTTCGGTGACAACGTCTACGAGTGGTGCGGTGACTCCAGCTACACTG
AGTCCGGCTACAATGTCATGACCCAGGAGCTGAGCAACCTCTCCGTCCCT
TACTTCTTCTCCGAGTACGGTTGTATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAG
CAACGTCCCCGTCATGTACGGTCCTAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTG
GTATTGTCTACGAGTACTTCCAGGATGCCAACGACTACGGTCTGGTCACC
ATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACCCTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCCGA
GGAGATCAACAGCGTCAGCCCCACCGGAACCAACAGCGCCAGCTACACCC
CCACCAACACCGTCGCGCGGTCCTGCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGAA
GCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCCCCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGCAT
GGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGTGAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAGT
ACGCCGACCTGTACAGCACCGTCTGCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTATC
ACCGGCAACACCACCACCGGAGAGTACGGTGCTTACAGCATGTGCAACAC
CAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCTGAACGCGTACTACGAGGAGCAGAAGT
CGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCTGTGACTTTGGTGGCTCGGCTACCACC
ACTTCGACTACTTCTCCTACCGGTACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTGT
TGGCACCGCTGGTACGGGTACTGTCTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACCA
GCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCGGTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGGT
GTGCCTGGGTACATGACCTACACTGCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGGT
TGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTTGTCCGGTACTGGAATGATTCTTTTGT
AGATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTG
GCTGTCGCCTCTGTTCCAGCCATCGTCATTAAGGGATCCAAATTCTTCTA
CGAGAACAACGGCACGGAATTCTTCATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCCCC
CCTCTGATGGCACTGGCACGACGACCTCCGCTGGCACGGTCGATTTCGTC
GATCCCCTTGCCAACGAGACCATCTGCAAGCGGGATCTGCCCTACCTGCA
GGAACTCAACACCAACGTAGTCCGTGTTTACGACGTTGACCCGAACGCGG
ACCACAGCACCTGCATGAACCTGCTGGCCGACGCCGGCATCTACGTGCTG
GCGGACCTGTCCTCGTCGGACTACTCCATCGTCAGCAGCGACCCGGAGTG
GAATTTGGAGCTGTACGACTACTACGCCAGCGTGGTCGACTCGCTGGCCA
ACTACACCAACACTCTGGGTTTCTTCGCGGGTAACGAGAACTCCAACAGT
GTCAACACTACCGGTGCCAGTGCCTACGTCAAGGCCGCTGTGCGTGACAT
GAAGGCCTACATCAAGTCCAAGAACTACCGCAGCATCGGTGTCGGTTACT
CCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGTACCGACCTCGTTGACTACTTCAAC
TGCGGTGACTCGGACGATTCCGTCGACTTCTTCGGTGACAACGTCTACGA
GTGGTGCGGTGACTCCAGCTACACTGAGTCCGGCTACAATGTCATGACCC
AGGAGCTGAGCAACCTCTCCGTCCCTTACTTCTTCTCCGAGTACGGTTGT
ATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAGCAACGTCCCCGTCATGTACGGTCC
TAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTGGTATTGTCTACGAGTACTTCCAGG
ATGCCAACGACTACGGTCTGGTCACCATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACC
CTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCCGAGGAGATCAACAGCGTCAGCCCCAC
CGGAACCAACAGCGCCAGCTACACCCCCACCAACACCGTCGCGCGGTCCT
GCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGAAGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCC
CCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGCATGGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGT
GAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAGTACGCCGACCTGTACAGCACCGTCT
GCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTATCACCGGCAACACCACCACCGGAGAG
TACGGTGCTTACAGCATGTGCAACACCAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCT
GAACGCGTACTACGAGGAGCAGAAGTCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCT
GTGACTTTGGTGGCTCGGCTACCACCACTTCGACTACTTCTCCTACCGGT
ACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTGTTGGCACCGCTGGTACGGGTACTGT
CTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACCAGCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCG
GTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGGTGTGCCTGGGTACATGACCTACACT
GCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGGTTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTT
GTCCGGTACTGGAATGATTCTTTTGTAGATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTG
TAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTGGCTGTCGCCTCTGTTCCAGCCATC
GTCATTAAGGGATCCAAATTCTTCTACGAGAACAACGGCACGGAATTCTT
CATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCCCCCCTCTGATGGCACTGGCACGACGA
CCTCCGCTGGCACGGTCGATTTCGTCGATCCCCTTGCCAACGAGACCATC
TGCAAGCGGGATCTGCCCTACCTGCAGGAACTCAACACCAACGTAGTCCG
TGTTTACGACGTTGACCCGAACGCGGACCACAGCACCTGCATGAACCTGC
TGGCCGACGCCGGCATCTACGTGCTGGCGGACCTGTCCTCGTCGGACTAC
TCCATCGTCAGCAGCGACCCGGAGTGGAATTTGGAGCTGTACGACTACTA
CGCCAGCGTGGTCGACTCGCTGGCCAACTACACCAACACTCTGGGTTTCT
TCGCGGGTAACGAGAACTCCAACAGTGTCAACACTACCGGTGCCAGTGCC
TACGTCAAGGCCGCTGTGCGTGACATGAAGGCCTACATCAAGTCCAAGAA
CTACCGCAGCATCGGTGTCGGTTACTCCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCC
GTACCGACCTCGTTGACTACTTCAACTGCGGTGACTCGGACGATTCCGTC
GACTTCTTCGGTGACAACGTCTACGAGTGGTGCGGTGACTCCAGCTACAC
TGAGTCCGGCTACAATGTCATGACCCAGGAGCTGAGCAACCTCTCCGTCC
CTTACTTCTTCTCCGAGTACGGTTGTATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTC
AGCAACGTCCCCGTCATGTACGGTCCTAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGG
TGGTATTGTCTACGAGTACTTCCAGGATGCCAACGACTACGGTCTGGTCA
CCATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACCCTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCC
GAGGAGATCAACAGCGTCAGCCCCACCGGAACCAACAGCGCCAGCTACAC
CCCCACCAACACCGTCGCGCGGTCCTGCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGG
AAGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCCCCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGC
ATGGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGTGAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAA
GTACGCCGACCTGTACAGCACCGTCTGCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTA
TCACCGGCAACACCACCACCGGAGAGTACGGTGCTTACAGCATGTGCAAC
ACCAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCTGAACGCGTACTACGAGGAGCAGAA
GTCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCTGTGACTTTGGTGGCTCGGCTACCA
CCACTTCGACTACTTCTCCTACCGGTACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCT
GTTGGCACCGCTGGTACGGGTACTGTCTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCAC
CAGCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCGGTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTG
GTGTGCCTGGGTACATGACCTACACTGCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTG
GTTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTTGTCCGGTACTGGAATGATTCTTTT
GTAGATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACG
TGGCTGTCGCCTCTGTTCCAGCCATCGTCATTAAGGGATCCAAATTCTTC
TACGAGAACAACGGCACGGAATTCTTCATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCC
CCCCTCTGATGGCACTGGCACGACGACCTCCGCTGGCACGGTCGATTTCG
TCGATCCCCTTGCCAACGAGACCATCTGCAAGCGGGATCTGCCCTACCTG
CAGGAACTCAACACCAACGTAGTCCGTGTTTACGACGTTGACCCGAACGC
GGACCACAGCACCTGCATGAACCTGCTGGCCGACGCCGGCATCTACGTGC
TGGCGGACCTGTCCTCGTCGGACTACTCCATCGTCAGCAGCGACCCGGAG
TGGAATTTGGAGCTGTACGACTACTACGCCAGCGTGGTCGACTCGCTGGC
CAACTACACCAACACTCTGGGTTTCTTCGCGGGTAACGAGAACTCCAACA
GTGTCAACACTACCGGTGCCAGTGCCTACGTCAAGGCCGCTGTGCGTGAC
ATGAAGGCCTACATCAAGTCCAAGAACTACCGCAGCATCGGTGTCGGTTA
CTCCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGTACCGACCTCGTTGACTACTTCA
ACTGCGGTGACTCGGACGATTCCGTCGACTTCTTCGGTGACAACGTCTAC
GAGTGGTGCGGTGACTCCAGCTACACTGAGTCCGGCTACAATGTCATGAC
CCAGGAGCTGAGCAACCTCTCCGTCCCTTACTTCTTCTCCGAGTACGGTT
GTATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAGCAACGTCCCCGTCATGTACGGT
CCTAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTGGTATTGTCTACGAGTACTTCCA
GGATGCCAACGACTACGGTCTGGTCACCATCTCCGACGGCTCCGTCAGCA
CCCTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCCGAGGAGATCAACAGCGTCAGCCCC
ACCGGAACCAACAGCGCCAGCTACACCCCCACCAACACCGTCGCGCGGTC
CTGCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGAAGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGG
CCCCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGCATGGAAGAGACCCTCACCTGCGTC
GTGAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAGTACGCCGACCTGTACAGCACCGT
CTGCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTATCACCGGCAACACCACCACCGGAG
AGTACGGTGCTTACAGCATGTGCAACACCAAGCAGATGCTCAACTGGGCC
CTGAACGCGTACTACGAGGAGCAGAAGTCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGC
CTGTGACTTTGGTGGCTCGGCTACCACCACTTCGACTACTTCTCCTACCG
GTACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTGTTGGCACCGCTGGTACGGGTACT
GTCTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACCAGCACTGGCGACTCCAGCAGCAG
CGGTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGGTGTGCCTGGGTACATGACCTACA
CTGCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGGTTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTG
TTGTCCGGTACTGGAATGATTCTTTTGTAG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-19) |
| Note | CAZy:GH72 |
| Note | CAZy:CBM43 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| MCQH01000009 | supercontig | MCQH01000009:138802..140654 + |
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