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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000019:277620..281371- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_000891-T1 ID=ATCC10864_000891-T1|Name=ATCC10864_000891-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=3752bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000019:277620..281371- (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGGTTCTCGCTACTCGTTGCGGGCAGGCTACGTCCGCCCTCCTGCGTCA
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AGGCCCTGAAGGAGGCCGGTGTCCAGTCCGTCCTGATCAACCCCAACATT
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CGACATTGGCAGTGCCATGAAGTCTGTCGGTGAAGTCATGGCTATTGGCC
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AGCTTGGTTTCTCCGACAAGCAGATCTCTCAGCTCGTTGGCGCCTCTGAG
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ACACCACCTACAACGCTACCTCCCACGATGTTAGCTTCGACGACCACGGT
GTCATCATTCTGGGAAGCGGTGTCTACCGTATTGGAAGCTCCGTCGAGTT
CGACTGGTGTGCTGTCAACGCTACTCTCTCCCTGCGCAACATGGGCAAGA
AGACTGTCATGATCAACTACAACCCTGAGACCTACTCCACTGACTTCGAT
ACTGCTGACAAGCTCTACTTCGAAGAACTCAGCTACGAGCGTGTCATGGA
TATCTACGAGCTTGAGAGCGCCAGCGGTGTTGTCGTCTCTGTCGGTGGTC
AGCTTCCTCAGAACATTGCTCTCCGTCTCCAGGAGACTGGTGGCGCTCAC
GTTCTCGGAACTGACCCCAAGGATATTGACCGCGCTGAGGACCGTCACAA
GTTCTCTCAGATCTTGGACAGCATTGGTGTTGACCAGCCCGCCTGGAAGG
AGCTTACCTCCGTCGCCGAGGCTGAGCGCTTCGCCGAGACTGTTGGCTAC
CCCGTCCTGGTTCGTCCCAGTTACGTCCTGTCTGGTGCTGCCATGAACGT
CATCTACAGCGTCGACGAGCTCAAGGAGAAGCTCCTCAACGCTAGCGCCG
TCTCCCCCGACCACCCCGTCGTCATCACCAAGTTCATTGAGGGTGCCCAG
GAGATTGACGTTGACGCTGTCGCTTCCAACGGCAAGCTTCTGCTCCACGC
CGTCAGTGAGCACGTTGAGCCTGCTGGTGTGCACTCCGGTGATGCCACTC
TCGTCCTCCCCCCTGCCAACCTCGAGGAGTCTGTCATGAGCCGCGTTAAG
GAGATTGCTGAGAAGGTTGCCAAGGCCTGGAACATCACCGGTCCCTTCAA
CATGCAGATCATCAAGGCTGACCTCGAGGGTGCTGAGCCTGAGCTGAAGG
TCATTGAGTGCAACCTTCGTGCCTCCCGCTCCTTCCCCTTCGTCAGTAAG
GTCCTGGGTACCAACTTCATCGATGTTGCTACCAAGGCTCTGGTCGGCCG
TGACGTCCCTGAGCCCGTCGATCTCATGAGTGTCAAGCGCGACTACCTTG
CCACTAAGGTTCCCCAGTTCAGCTGGACCCGTCTTGCTGGTGCCGATCCT
TTCCTCGGTGTCGAGATGGCCAGTACTGGCGAGATTGCCTGCTTCGGTAA
GGATGTTGTTGAGGCCTACTGGGCTTCCCTGCAGGCTACCATGAACTTCC
GTTGCCCTGAGGCTGGTGAAGGTATCCTGCTCGGCGGTGATATCACCAAC
CCTGCCCTGGCCCAGATTGTCGAGTACCTCAAGCCCCTCGACTTCAAGTT
CTTCGCTGCTAGCCCCGCTGTCAAGGAGCACCTCGAGGCTGCTACCAAGG
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GAAGTCTTCCAGAAGTACAACATCCGTGGTACCTTCAACCTTGCCAAGAC
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TCCTTCCGAGGTCCGCACCTGGTCCGACTTCACCGGCGGCAAGCTGCTGT
AA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000019:277620..281371- >ATCC10864_000891-T1 ID=ATCC10864_000891-T1|Name=ATCC10864_000891-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=10557bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000019:277620..281371- (Aspergillus niger ATCC 10864) ACTGCTCTCCTCTTCGCCCAGGCCATGAGCGAGAAGATGCCCCGTGCCGA TGGCATTCCTTCCGAGGTCCGCACCTGGTCCGACTTCACCGGCGGCAAGC TGCTGTAAGTTCTCAGGCTCTGAAGGCCCTGAAGGAGGCCGGTGTCCAGT CCGTCCTGATCAACCCCAACATTGCGACAATTCAGACCGATCACAAGCTT GCGGATGAAGTGTACTACCTCCCGGTTACCCCCGAGTATGTCACCTATGT CATTGAGCGGGAGAGACCCGATGGTATCTTCCTCTCTTTCGGTGGTCAGA CCGCCCTGAACTTGGGTGTGCAGATGAACCGCATGGGTATCTTCGAGCGC TACGGTGTCCGCGTTCTGGGAACCAGCATCAAGACCCTGGAGACCAGTGA GGACCGTGATCTTTTCTCCAAGGCCCTCAACGAGATCAACATCCCCATCG CCGAATCCATTGCGGTCAGCACCGTCGACGAGGCCCTGAAGGCTGCTGAG ACCGTTGGATACCCTATCATCGTCCGTTCTGCCTACGCCCTGGGTGGTCT GGGTTCCGGTTTCGCTGCCAACCCCGAGGAGCTGAAGAACTTGTCCTCCC GCTCTCTGACCCTTTCTCCCCAGATTCTGGTCGAGAAGTCTCTCCGTGGC 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0005524 | ATP binding |
| GO:0046872 | metal ion binding |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0006807 | nitrogen compound metabolic process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
| InterPro | IPR006275 |
| InterPro | IPR005483 |
| PFAM | PF02222 |
| PFAM | PF02787 |
| PFAM | PF02786 |
| InterPro | IPR005480 |
| InterPro | IPR011761 |
| InterPro | IPR036914 |
| InterPro | IPR013815 |
| InterPro | IPR011607 |
| InterPro | IPR016185 |
| InterPro | IPR005479 |
| PFAM | PF07478 |
| InterPro | IPR036897 |
Properties
| Property Name | Value |
| Product | argininosuccinate lyase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| MCQH01000019 | supercontig | MCQH01000019:277620..281371 - |
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