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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000142:112744..113738- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_005368-T1 ID=ATCC10864_005368-T1|Name=ATCC10864_005368-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=995bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000142:112744..113738- (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGGTGAGTTAATCGGATCCTTCCCT
TTCGTGTTCATATCAGCTTGTATACACATGTTCGCGTGGCTAACTCTTTA
TTCTTCATTTTTGAGTAGCAAAACCTCGTAAGTTACTGACGATACATGTT
TCACTCGCGCGTCAAACCTGACAATATCCTCAGATCAACTACCGGATGAG
AGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCG
ATAAGGTATATATTTCTGGGTCTTTCAGTGGCCATCGGATAACACTTGTG
GTCGGCTGGTCGCTGATGCAGAATTATAGCACATGAACCTTGTCCTCGCC
GATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGG
TTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCC
TTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCT
CCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGC
TGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTG
GACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGC
CCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTT
CCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTG
GACCTCGTAAGTTTGCACTTTCGAGCTCGATGTTGAACTTGGTTACTGAC
TTAGGATATTAGCTGGCTTCGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGT
GCTCCTCGTAAGTATCCTTGAATGGCGTGTTATGGTTATAGAGCTAACTG
ATGCTGTTGTAGCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCT
GGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000142:112744..113738- >ATCC10864_005368-T1 ID=ATCC10864_005368-T1|Name=ATCC10864_005368-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=3270bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000142:112744..113738- (Aspergillus niger ATCC 10864)
CGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGC
GGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGACTGGCTTCGCTCCTCCC
CCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCACATGAACCTTGTCCTCGCCG
ATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGT
TCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCT
TACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTC
CTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCT
GCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGG
ACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCC
CTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTC
CCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGG
ACCTCATCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATG
ACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAA
GATGCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGG
ACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGACTGGCTTCGCTCC
TCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCACATGAACCTTGTCCTC
GCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGC
CGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGG
GCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGA
CCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGC
AGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCG
CTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGT
GGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAG
TTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTG
GTGGACCTCATCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACA
GATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGATGGCGGCTAATAAGCAGG
GCAAGATGCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGAC
AAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGACTGGCTTCG
CTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCACATGAACCTTGT
CCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCG
CCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACC
CTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGA
TGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTA
GCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAA
CCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGT
TGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTG
GTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCC
CCTGGTGGACCTCATCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCC
GACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGATGGCGGCTAATAAG
CAGGGCAAGATGCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCT
GGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGACTGGC
TTCGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCACATGAACC
TTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAG
CCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCG
CACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCG
TTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGT
CCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAG
CAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAG
GTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCT
GGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGG
TGCCCCTGGTGGACCTCATCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGAT
GGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGATGGCGGCTAA
TAAGCAGGGCAAGATGCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCC
CCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGAC
TGGCTTCGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCACATG
AACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTC
CAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAA
AGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGC
TCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGC
TGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAA
TTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCT
GCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCC
TCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTG
GTGGTGCCCCTGGTGGACCTCATCAACTACCGGATGAGAGTCACCCTCAA
TGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGATGGCGG
CTAATAAGCAGGGCAAGATG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| PFAM | PF01423 |
| InterPro | IPR001163 |
| InterPro | IPR010920 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| MCQH01000142 | supercontig | MCQH01000142:112744..113738 - |
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