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Sequences
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mRNA from alignment at MCQH01000158:21788..23625+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_005780-T1 ID=ATCC10864_005780-T1|Name=ATCC10864_005780-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1838bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000158:21788..23625+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGG
TGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCG
ATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGAT
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CGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCA
TCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATC
TGGTATGTATCTGACACCGCTGCACCGTTATCTCTGCTAACAATGCATGG
CTGTACAGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCC
CATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCT
CCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTGTATGTCGGTCCCATAAT
GCCTGCTGCTGCATGCGGTGCTAATCATTTAGGCTCCTCCAACCAAGCGT
GGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGAT
CATGTTCTAGTAAGTCCTTATCCATCATCAGCTACCATGTCACATCTCAC
ACGTGATGTAGCGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGC
CTTCCGGATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCC
TGGGTATGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGAC
CGATGGGAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGA
CCCGAGCTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGT
GCGAGTTTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAG
CCCAACATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTC
TCAGTTGACTGGAATGAACGTCATGAGTAAGTTTCTTTCGAGCCTGTATA
GGTAGTCAGCAATGCTAACCGGTTCACTTCTAGTGTACTACATCACCTAC
GTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCCTCCAG
TATCCAGTACGTGATCAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGTGTGGG
GTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCCCTCTTCATG
ATGATCTGGATGTACATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGTCATCC
CGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTCATCC
ACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCC
TCATACGCCATCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACT
CTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCA
ACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTC
AACATCCAGTGGAAGGTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCAT
GTTCTTGCACATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGG
AAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGT
ACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGA
GGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCC
ACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000158:21788..23625+ >ATCC10864_005780-T1 ID=ATCC10864_005780-T1|Name=ATCC10864_005780-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=8115bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000158:21788..23625+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGG TGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCG ATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGAT GGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGTATCAC CGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCA TCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATC TGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCCCATGCT GATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTC AGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTGCTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGT GTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGATCATGTT CTACGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGA TTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTATG ATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGACCGATGGGA GGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGACCCGAGCT CTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGTGCGAGTTT GAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAGCCCAACAT GCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGA CTGGAATGAACGTCATGATGTACTACATCACCTACGTCTTTGCCATGGCC GGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCCTCCAGTATCCAGTACGTGAT CAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGTGTGGGGTGATCAGTGGGGCC GTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCCCTCTTCATGATGATCTGGATGTAC ATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGTCATCCCGCGCCGCCCGGCGG TCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTCATCCACGGCGCGCCCAGCA AGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCCTCATACGCCATCTCC TTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGT GCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCAACTGGGCCTTCAACT TCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTCAACATCCAGTGGAAG GTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCATGTTCTTGCACATTTT CTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCA TCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGTACTCCCGCCTGGAAG ACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGAGGAGGTTGGCTTTGA AGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCCACCAGGAGGTCACGG CTACTCCGGATAAGATTGCTTGAATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATT GCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTC GATGTCGGCCATCATCGAGACCGATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGG CTCCTGTCACTTACGATGATGATGGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGC GCGAGTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTT GGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTG CCATTCAGATCGGTTCCATCATCTGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGT GCCTCCCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCT GAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTG CTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATT ACCTGGGGTATCCTGATCATGTTCTACGTCTCCTATGGATGCAGCTTCAT CAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTG CCGTGCTATTGTTCCTGGGTATGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGG CTGGCACGCAAGGACCGATGGGAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGT CCACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAG AGATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTAC CTCGAGCTGTTCAAGCCCAACATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTT CGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGACTGGAATGAACGTCATGATGTACTACA 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TGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCCTCATACGCCATCTCCTTCG GCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGC GGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCAACTGGGCCTTCAACTTCGC CCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTCAACATCCAGTGGAAGGTCT ACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCATGTTCTTGCACATTTTCTTC TTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTT CACTGATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGTACTCCCGCCTGGAAGACAA AGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGAT GAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCCACCAGGAGGTCACGGCTAC TCCGGATAAGATTGCTTGAATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGG CCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATG TCGGCCATCATCGAGACCGATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCC TGTCACTTACGATGATGATGGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGA GTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGC TCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCAT TCAGATCGGTTCCATCATCTGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCT CCCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGT GTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTGCTCC TCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCT 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CTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACAT CGGTACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACA TTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACT ATCCACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTGAATGGCTAT CGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGT TCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCGATGCCTAT CTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGATGGCAAGAG GGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCA TGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGAC AGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATCTGGTGCAT TGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCG GTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCA GTGTATATTTCGGAGATTGCTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGG TCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGATCATGTTCTACGTCT CCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGATTCCCTGG GGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTATGATGCTCCT GCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGACCGATGGGAGGAGTGCC ACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCCCTTT GTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGCGCCA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016021 | integral component of membrane |
GO:0016020 | membrane |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
Database | Accession |
PFAM | PF07690 |
InterPro | IPR036259 |
PFAM | PF00083 |
InterPro | IPR020846 |
InterPro | IPR005828 |
InterPro | IPR003663 |
InterPro | IPR005829 |
Properties
Property Name | Value |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
MCQH01000158 | supercontig | MCQH01000158:21788..23625 + |
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