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ATCC10864_006782-T1, ATCC10864_006782-T1 (mRNA) Aspergillus niger ATCC 10864

Overview
NameATCC10864_006782-T1
Unique NameATCC10864_006782-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger ATCC 10864
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at MCQH01000169:672428..674140+

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>ATCC10864_006782-T1 ID=ATCC10864_006782-T1|Name=ATCC10864_006782-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1713bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000169:672428..674140+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGAGCGGACGTGAGTCTTGCACGCGATCGCTGCCATCTCCGCGACAGCG
TTCCATCCTTTACCTCAATGGATCAGCAAATGCTGATACTCGATTCTAGT
CCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGG
CCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGG
GTACGTGATACTTGTCCAGCTCGACATGAGCTTCTAAGCTAATGGATTAC
CCCTGCAGTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTG
TACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTAT
GATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCA
TCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGGTATGTAATGGGGAAATTGCAATC
TGATCACGGATATCGGGCATTTGCTAATATGTGGCTTTTGTCTGATAGCT
TCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACC
GTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTC
GGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGA
CCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTG
GCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTT
GGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGT
CTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGT
TTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGAC
AAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACAT
CATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCC
AGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATG
CGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCAT
GCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGT
ACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAG
CCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTA
CATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACA
CCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAG
ACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCT
CAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACA
AGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGC
ATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGG
TACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACGTAAGTCTTCACTTTGGTCTCAGATT
TTCTGAAGTGGATACTAACATTCAAATGCAGGATTATATACGGATACTTT
GAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGT
TCCGGGTAACTAG
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Coding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000169:672428..674140+

>ATCC10864_006782-T1 ID=ATCC10864_006782-T1|Name=ATCC10864_006782-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=7185bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000169:672428..674140+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGAGCGGACTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCT
CCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGA
TGTGGACGGGGTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCC
TTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCG
TATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCC
CCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTC
ATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGC
TCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACG
TCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGT
GTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCT
GGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGT
TCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCT
ACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGC
CCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCG
AGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACT
CTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGAT
CCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTC
GCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGC
TCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAA
CCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCC
AGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAAC
TTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCTT
CATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCG
GCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTG
ATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCAT
CCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCG
CTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCC
GTTACGATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACAT
TGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGATGAGCGGACTCC
GGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCC
GCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGTT
GACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTG
TCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCC
AGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTC
TGGCATGGTTTTCCAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACC
TGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTC
GCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCT
TTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTG
TTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTC
CAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAA
CATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACA
CTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTT
CTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCG
CCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCG
CCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCC
TCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACAC
CTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCC
TCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAG
CTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGC
CTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCC
TTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCT
TGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCG
CGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACC
GTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCT
GCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCT
TGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACGATTATAT
ACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTC
AAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGATGAGCGGACTCCGGTTTCTCGATCT
CATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCA
AGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGTTGACCCTATTGATC
TTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACAC
CTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTA
CCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTC
CAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGAC
CGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGT
CCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCC
AGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGT
TGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATG
GTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCG
ATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCC
CGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGT
CCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCC
AACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTA
CCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTG
GCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCC
ATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGAT
GCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTT
GGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCC
TACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCAT
TCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCT
CCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAG
CAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCAT
GTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTG
CCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGC
AGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACGATTATATACGGATACTTTGA
AATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTC
CGGGTAACTAGATGAGCGGACTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTC
ACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAA
CCAGAAGTTGATGTGGACGGGGTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGA
GCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTG
TACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACT
GGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGCTTCTCGCTG
GTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTG
TATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGC
CTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTG
CCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTT
GTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGG
TATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGG
CTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGT
GCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCG
CGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACC
TGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTC
CGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTC
CTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGT
CTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGC
TTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGA
GGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTC
CTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTT
TACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGAT
TGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACC
AGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTC
AAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGC
CCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTA
TCCTCCTTGCCGTTACGATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGT
GAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGAT
GAGCGGACTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCC
CGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATG
TGGACGGGGTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTT
GTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTA
TGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCC
ATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCAT
CGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTC
AGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTC
CTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGT
TCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGG
ATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTC
ATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTAC
GACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCC
TCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAG
GCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCT
CCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCC
CTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGC
CTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTC
CAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACC
TCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAG
CTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTT
CAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCA
TGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGC
TCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGAT
GGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCC
CTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCT
TCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGT
TACGATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTG
GATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAG
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016020membrane
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0015031protein transport
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
SEC61ATCC10864_006782Aspergillus niger ATCC 10864gene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_006782-T1ATCC10864_006782-T1-proteinAspergillus niger ATCC 10864polypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_006782-T1.exon1ATCC10864_006782-T1.exon1Aspergillus niger ATCC 10864exon
ATCC10864_006782-T1.exon2ATCC10864_006782-T1.exon2Aspergillus niger ATCC 10864exon
ATCC10864_006782-T1.exon3ATCC10864_006782-T1.exon3Aspergillus niger ATCC 10864exon
ATCC10864_006782-T1.exon4ATCC10864_006782-T1.exon4Aspergillus niger ATCC 10864exon
ATCC10864_006782-T1.exon5ATCC10864_006782-T1.exon5Aspergillus niger ATCC 10864exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_006782-T1.cdsATCC10864_006782-T1.cdsAspergillus niger ATCC 10864CDS


Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
PFAMPF10559
InterProIPR002208
InterProIPR030659
InterProIPR019561
PFAMPF00344
InterProIPR023201
Properties
Property NameValue
NoteBUSCO:EOG092620E4
Producttranslocon subunit
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger ATCC 10864 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
MCQH01000169supercontigMCQH01000169:672428..674140 +
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