You are here

ATCC10864_008493-T1, ATCC10864_008493-T1 (mRNA) Aspergillus niger ATCC 10864

Overview
NameATCC10864_008493-T1
Unique NameATCC10864_008493-T1
TypemRNA
OrganismAspergillus niger ATCC 10864
Sequences
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at MCQH01000199:840723..843938+

Legend: exonpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>ATCC10864_008493-T1 ID=ATCC10864_008493-T1|Name=ATCC10864_008493-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=3216bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000199:840723..843938+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGCGTTCCGACAAGCTTCTCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCT CGCTCTCCCCACGAAGGACTTGGACCCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCG AGATCCTCACTGACCTTGGTGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTC CTTGGCGGCGGTGTCAAGAGCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGC TCAGGCAGCTGCTGTCCTTGAAGGTGGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCA AGATCGAGGCCTCCGCTCGTGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCAT GCCAGCTTCGATGCCTCCCTCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGG TGAGGACTCTGCCACCTTGTCCGTCGATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGT TCATTCCCACCTGCGCCGAGGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACT GTCGACGGTATCTTCTCCGTTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAG CTCTTCTTTCCAGTCTACTCTGTCTACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTG TCGAATTGGATGCCGACATCAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGT GGTGTCGTCGCCGACCTTGCTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTG GCTTTCCGGCTCTGAGTGCTCTCTGAGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCC TTGCTTGGTTGGAGGGCAAGGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGC ACTGTGCCCACTGCTGGTCTCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAA CGCCCTTGTCGAAACCTCCGGTGCCCTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACC TCTCTGCCTTCCTCAAGTCCTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTT AAGGTCGTTCTGGAGGCCTGTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAG CGCCGATGCCCGTGCTGCCCTGGCAGTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCC AGCTGGGCGTTGAGCTGAAGGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCC CTGAGCGGCGACGTCACCGTCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACT CGAGACTTTCATCACCGGTACCATCGACACTCTCATCGGTGTCAACATTA GCGGCGTGCTCTCCCTTCTGCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCC CTGGAGTCTCGTGCTGAGCTGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGT TGATATCAGCTCCTCCATTGAGATCATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCT GCAGCATCCCCGGCGGTCCTTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCC GGATCTTCGTCTAAGCTCATCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGC TTCGACCCCCGCTGTCAGCGTTCCTGCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCA CTGGCGGTTCTAGCCCCAGCAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTC CCCTCCGGTGGTGTTGTTCCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGGATC CCCCAACGGTGTCAGCCCTACCGACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCCCTG CCCAGTCTGGTGCTCCTGGCTCTCCCTCTGGCGGCGTCCCCGCTCCCAGC GGTGGCGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGCCCC TAGCGGCGGTGTTGTCCCCACTGCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTGCCG GTGCCTCCACTACTCCCTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTTCCC GTTGCTACTATGACCGAGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCAGTC TGGTGCTCCTAGCGTTACCCCCATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCTCTA CTGGTGGTTCTACTGGCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCTGGC TCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTC CGGCTCTGGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTG GCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCCGGCTCCTGGTCCGGCTCTGGC TCTGGAGGTGCTGCTCCCTCTGGTAGCGTTGTTCCCGCCGGTCCCTCCGG CTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAGCGTCCCCGAGGGCGCCAGCGCTG GTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCATCACCGGCCAGACTGTTGTTCCC GTTGCTACTATGACCGAGGGCGGCTCTGCCCCCAGTGTCCCTGCTCAGTC TGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGCTCAGTCCGGTGCTCCTGGTGCTC CCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTGGTGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCT CAGTCTGGTGCCCCCGGTGCTCCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGT CCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGTGCCAGCGCTGGTGCCTCTACCACCC CCTGTGACACTCTCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACC GAGGGTGGCTCTGCCCCTAGTGCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCTGCTCC CTCCGGTGGCGCTCCTGCCCCCAGCGGCGGTGTCGTTCCCTCCGGTGGTG CTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCT GGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCCTCACCGGCCAGACTGTTGTTCC CGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTCTGCCCCCAGTGCCCCTGCTGAGT CTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTGTCAGCCCCTCCGAGACCCCTGCC GCTCCCGCTCAGTCTGGCTCTGGCAACGCTCCCAGCGGTGGCTCTCCCGC CCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGGCGCTGCTAGCGTCCCTGCTGTTC CCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGTTTCCACCACTCCC TGCGACACCATCACCGGCCAGACTGTCGTCCCTGTCGCTACCGAGACCGT GACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGCTACTGAGGGCGGTTCCTCTCCTC AGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTCTGGC TCTGAGACTGAGGTGGTTACTGTCACCGTCACTGCTACTGTGAGCGTTTC GGCTTGCGACTGGTAA
back to top

Coding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000199:840723..843938+

>ATCC10864_008493-T1 ID=ATCC10864_008493-T1|Name=ATCC10864_008493-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=3216bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000199:840723..843938+ (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGCGTTCCGACAAGCTTCTCGTGCTCGCCGGTCTGGCGAGCTATGCTCT
CGCTCTCCCCACGAAGGACTTGGACCCCCGTACCTTCGGCCTCGTCGCCG
AGATCCTCACTGACCTTGGTGAGGACCTGACCGGTTTCATCGAGGCCCTC
CTTGGCGGCGGTGTCAAGAGCTCCGCAAGCCTCCTCACTGGTATCAGCGC
TCAGGCAGCTGCTGTCCTTGAAGGTGGTGCCCTGGGTTGCACTGCTGGCA
AGATCGAGGCCTCCGCTCGTGCGGAGCTGGCTGCGTGGATCCGGGCTCAT
GCCAGCTTCGATGCCTCCCTCAAGTCGTCTCTGTTGGCCTGGTGTGAGGG
TGAGGACTCTGCCACCTTGTCCGTCGATGTCCGTGCTGGTCTCGCTCTGT
TCATTCCCACCTGCGCCGAGGTCGCTGCCAAGGGCGACATTTACGTGACT
GTCGACGGTATCTTCTCCGTTTCCGAACTCGAGGCCGCTGTTGTCCTCAG
CTCTTCTTTCCAGTCTACTCTGTCTACTTTCCTGTCCGGATCCGTTGGTG
TCGAATTGGATGCCGACATCAAGGCTGGTCTTTCCCTCTGTGCTGGTGGT
GGTGTCGTCGCCGACCTTGCTTCGGACATCGAGGCCTCCCTGAAGGTCTG
GCTTTCCGGCTCTGAGTGCTCTCTGAGTGCCTCCCTCAAGGCTGCTGTCC
TTGCTTGGTTGGAGGGCAAGGCTAGTGTGTCTGGCGTTGTTACCATCGGC
ACTGTGCCCACTGCTGGTCTCACCACTGTCTCCGTCGGTGCCGCCATTAA
CGCCCTTGTCGAAACCTCCGGTGCCCTCACCGCTAGCGCCCAGGCCTACC
TCTCTGCCTTCCTCAAGTCCTCCCTCGCCGCCGACATTGAGGCCGATGTT
AAGGTCGTTCTGGAGGCCTGTATCTCGGGCAAGCTTGCCACTTCCGTCAG
CGCCGATGCCCGTGCTGCCCTGGCAGTCTGGCTCTCTGGCGATAGCTGCC
AGCTGGGCGTTGAGCTGAAGGCCGTTCTCTACTTCTGGCTTTCCTTTGCC
CTGAGCGGCGACGTCACCGTCGACTTGTCCACCGACATCATTACCGAACT
CGAGACTTTCATCACCGGTACCATCGACACTCTCATCGGTGTCAACATTA
GCGGCGTGCTCTCCCTTCTGCTGTCTGGCGAGAGTCTGGCCTCCCTTTCC
CTGGAGTCTCGTGCTGAGCTGTCTGCTGTCATCGGTGGCTGCGCTGGTGT
TGATATCAGCTCCTCCATTGAGATCATCGTCATTGAATGGCTTACCGGCT
GCAGCATCCCCGGCGGTCCTTCCATCGGCTCCGGCTCCGGCTCCAGCTCC
GGATCTTCGTCTAAGCTCATCCCCAGCGCCTCCAGCATTCCTGCCGTCGC
TTCGACCCCCGCTGTCAGCGTTCCTGCTGTTCCCACCGTCTCGGTTCCCA
CTGGCGGTTCTAGCCCCAGCAAGCCTGCTCAGTCCGGTGCCCCTGGTGTC
CCCTCCGGTGGTGTTGTTCCCTCTCCCGCTCAGTCCGGCGCTCCCGGATC
CCCCAACGGTGTCAGCCCTACCGACACTCCTTCGGTTCCCTCCTCCCCTG
CCCAGTCTGGTGCTCCTGGCTCTCCCTCTGGCGGCGTCCCCGCTCCCAGC
GGTGGCGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCCGGCGCCCC
TAGCGGCGGTGTTGTCCCCACTGCCTCTGTTCCGGAAGGCGCCAGTGCCG
GTGCCTCCACTACTCCCTGCGACACTATCACCGGCGAGACTGTTGTTCCC
GTTGCTACTATGACCGAGGGCGGTTCTGCTCCTAGTGCCCCCGCTCAGTC
TGGTGCTCCTAGCGTTACCCCCATCGTCGGTGGTGGTGCTGGCGGCTCTA
CTGGTGGTTCTACTGGCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCTGGC
TCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTC
CGGCTCTGGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTG
GCTCTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTTCCGGCTCCTGGTCCGGCTCTGGC
TCTGGAGGTGCTGCTCCCTCTGGTAGCGTTGTTCCCGCCGGTCCCTCCGG
CTCTGTCCCTGCTGTTCCTACCGCTAGCGTCCCCGAGGGCGCCAGCGCTG
GTGCCTCCACCACCCCCTGTGACACCATCACCGGCCAGACTGTTGTTCCC
GTTGCTACTATGACCGAGGGCGGCTCTGCCCCCAGTGTCCCTGCTCAGTC
TGGCGGTGTTGTTCCCTCTGCTCCCGCTCAGTCCGGTGCTCCTGGTGCTC
CCTCCGGTGCTCCTGCTCCCAGCGGTGGTGTCGTTCCCTCGTCTCCTGCT
CAGTCTGGTGCCCCCGGTGCTCCCTCCGGTGGTGCTAGCGTCCCTGCTGT
CCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGTGCCAGCGCTGGTGCCTCTACCACCC
CCTGTGACACTCTCACCGGCCAGACTGTTGTTCCCGTTGCTACTATGACC
GAGGGTGGCTCTGCCCCTAGTGCTCCTGCCCAGTCTGGTGCTCCTGCTCC
CTCCGGTGGCGCTCCTGCCCCCAGCGGCGGTGTCGTTCCCTCCGGTGGTG
CTAGCGTCCCTGCTGTTCCCACTGCTAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCT
GGTGCTTCCACCACTCCCTGCGACACCCTCACCGGCCAGACTGTTGTTCC
CGTTGCTACCATGACCGAGGGCGGTTCTGCCCCCAGTGCCCCTGCTGAGT
CTGGCGCCCCTGGTGCCCCCAGCGGTGTCAGCCCCTCCGAGACCCCTGCC
GCTCCCGCTCAGTCTGGCTCTGGCAACGCTCCCAGCGGTGGCTCTCCCGC
CCCCAGCGGTGGTGTCGTCCCCTCCGGCGCTGCTAGCGTCCCTGCTGTTC
CCACTGCCAGCGTCCCTGAGGGCGCCAGCGCTGGTGTTTCCACCACTCCC
TGCGACACCATCACCGGCCAGACTGTCGTCCCTGTCGCTACCGAGACCGT
GACTCCTGTCCCCGTTGCCACCTCGGCTACTGAGGGCGGTTCCTCTCCTC
AGATCACCACCGCTCCCGTCGCTGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTCTGGC
TCTGAGACTGAGGTGGTTACTGTCACCGTCACTGCTACTGTGAGCGTTTC
GGCTTGCGACTGGTAA
back to top
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_008493ATCC10864_008493Aspergillus niger ATCC 10864gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_008493-T1.exon1ATCC10864_008493-T1.exon1Aspergillus niger ATCC 10864exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_008493-T1.cdsATCC10864_008493-T1.cdsAspergillus niger ATCC 10864CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
ATCC10864_008493-T1ATCC10864_008493-T1-proteinAspergillus niger ATCC 10864polypeptide


Properties
Property NameValue
NoteSECRETED:SignalP(1-18)
Producthypothetical protein
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
Aspergillus niger ATCC 10864 whole genome analysis2021-11-01
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
MCQH01000199supercontigMCQH01000199:840723..843938 +