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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000217:187603..190140+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_009698-T1 ID=ATCC10864_009698-T1|Name=ATCC10864_009698-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=2538bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000217:187603..190140+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCGGTA
AGCTATCCCTTTGCAATCAGAGCACTGGTCTAGATGGATTGCTGGAGCGC
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CTTCAACCCATCTAGTCCTATCAGCTCTTCTCAACACTGCGTCGTGAATC
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CGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGGTTACTCCAACGGTG
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GCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCGTAAGAA
GCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCGAGACCT
TCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAGGCCCAG
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GCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCGTGAATT
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GACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCGTCTGAT
TGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGTCACCTACCTCG
TTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCCCAGATC
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GATCAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGCCAACAAGTGCCTTA
TCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATTACTCGCTTCCTCCGC
CAGGACGGATGGCCGGCACTTTGTAAGCTTCCTAGGATCCCAACACTGAA
GCAGCTATTTGCTAACCTGCGTTCCAGCTATTCACGGTGATAAGCAACAG
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CCCGAGTCACCCTCCATATTGAGGTTGTGTGACCATGGCACGGTGCTTAA
CTCTCTTCCACCAATTGTTGGTGTGTATGACTCTTCCAGGCTTTGTCGGG
TCTCCTGAAATGGTTCTCAAGCCAGGAGAGCCTTGGACTCACAGTGCAGT
GTAGCAGACGTATTACTCTTCTGTTTTGATTCACCATATCTACCTTTTGA
AACTTGGCCGGTAGAGGGAGGGAAAGTTCCTCTCTTACCGACTTGTTGAA
GCTGCATTCCAAGGTTGCTCTAGGACCACGATATCTGCCACCCTCGGACT
CGTCTGTCACGGATCTTTTGATGATTTAAGTCCGAGCGAGAGAGAGAGAT
GCATCAAGTCTCACGACTGAGAAAGGGCTCCTAAGCCACGTTGCTCATTT
GACTAATGCTCTGTATGCTAACGTTACATGTGTTTGAAGATGTGCGCGAC
ATCACACACGTTCTCAACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGT
TCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCA
CCTTCTTTACCACTGACAGTAAGTGATTTTTTTCCCTATGAAACGCCTTT
TCAGTACTAACATGTCCCTCTTGCAGACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGG
TCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAG
ATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTGGTCATGGCCACGGTGGCTATGGCCG
CTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGCCGCGGCAACCACTTCACTGCTT
CCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAACCGTCGCTGGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000217:187603..190140+ >ATCC10864_009698-T1 ID=ATCC10864_009698-T1|Name=ATCC10864_009698-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=8385bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000217:187603..190140+ (Aspergillus niger ATCC 10864) ATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCCTACCGCTC CAGAAACGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGGTTACTCCA ACGGTGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTGGTGGCTAT GGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGTGGTGCCGG CGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCTGAAGAAGC AGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCTTCTACAAG GAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGACGAGTTCCG TAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCGCCCTGTCG AGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCGAGGTCAAG GCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGTTGGCCCAT GGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGGTTCCGGAA AGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCATCGTTCACATCAACGCCCAGCCC CTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCCCCCACCCG TGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGGAAAGTCTT CCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGGGTCCTCAG ATTCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACTCCCGGTCG TCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCGTGTCACCT ACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTTTCGAGCCC CAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAGACCTGCAT GTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTCTGACTTCC TCAACGACTACATCCAGGTTAATATTGGTTCCATGGATCTGTCGGCCAAC CACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAGAAGCGCGA CAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGCCAACAAGT GCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATTACTCGCTTC CTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACTTTCTATTCACGGTGATAAGCAACA GCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAA TCATGGTGGCTACTGATGTAGCTTCCCGTGGTATCGATGTGCGCGACATC ACACACGTTCTCAACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCA CCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCT TCTTTACCACTGACAACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTC ACTGAGGCCAAGCAGCAGATTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTA 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TTGAACGAGTTCAAGACGGGCAAGAGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGT AGCTTCCCGTGGTATCGATGTGCGCGACATCACACACGTTCTCAACTATG ACTACCCCAACAACTCGGAGGACTACGTTCACCGTATTGGTAGAACTGGT CGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGCCATCACCTTCTTTACCACTGACAACTC CAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCACCATTCTCACTGAGGCCAAGCAGCAGA TTGACCCCCGTCTCGCCGAGATGGTCCGCTACAGTGGCGGCGGTGGTCAT GGCCACGGTGGCTATGGCCGCTGGGGTGGCCGTGGTGGTGGCCGTGGCCG CGGCAACCACTTCACTGCTTCCAATGCTGCTCCTCTTGGTGGCAACCGTC GCTGGTAAATGTCTTCCTACGGCGGCGGCGGCGGCTACCAGCGCGACTCC TACCGCTCCAGAAACGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGCTACGGTAACGG TTACTCCAACGGTGGAGGCTACGGTGGTGGTGGTGGTGGTTACGGCGGTG GTGGCTATGGCGGCGGCGGCTACGGCGGCGGCTATGGTGGCAGAGGTGGT GGTGCCGGCGGTGCTGGCGGAGACCGCATGTCCAACCTGGGCGCCGGTCT GAAGAAGCAGGAATGGGATCTTGACTCCCTGCCCAAGTTCGAGAAGTCCT TCTACAAGGAACACGCCGATGTCGCCGAGCGCTCTCAGCGTGATGTTGAC GAGTTCCGTAAGAAGCACGAGATGGCTGTTCAGGGAAGAAACGTCCCTCG CCCTGTCGAGACCTTCGACGAGGCCGGTTTCCCTCAATACGTTCTCAGCG AGGTCAAGGCCCAGGGCTTCGACCGCCCTACCGCTATTCAGTCTCAGGGT TGGCCCATGGCCCTCTCTGGTCGCGACGTTGTCGGTATCGCTGAGACGGG TTCCGGAAAGACCCTGACCTACTGTCTTCCTGCCATCGTTCACATCAACG CCCAGCCCCTCCTCGCCCCCGGTGACGGCCCCATTGTCCTTATCCTCGCC CCCACCCGTGAATTGGCCGTTCAGATTCAAGCCGAAATCTCCAAGTTCGG AAAGTCTTCCCGTATCCGCAACACCTGTGTCTACGGTGGTGTCCCCAAGG GTCCTCAGATTCGTGACCTGAGCCGTGGTGTGGAAGTCTGCATTGCGACT CCCGGTCGTCTGATTGACATGCTCGAGGCTGGTCGCACCAACCTTCGTCG TGTCACCTACCTCGTTCTGGATGAGGCCGATCGCATGCTGGACATGGGTT TCGAGCCCCAGATCCGCAAGATCATCTCCCAGATTCGCCCTGACCGTCAG ACCTGCATGTGGTCCGCTACATGGCCCAAGGAGGTCCGTCAGCTTGCGTC TGACTTCCTCAACGACTACATCCAGGTTAATATTGGTTCCATGGATCTGT CGGCCAACCACCGTATCACTCAGATCGTCGAGGTCGTCTCGGACTTCGAG AAGCGCGACAAGATGATCAAGCACCTCGAGAAGATCATGGAGAACCGTGC CAACAAGTGCCTTATCTTCACCGGCACCAAGCGCATCGCTGACGAAATTA CTCGCTTCCTCCGCCAGGACGGATGGCCGGCACTTTCTATTCACGGTGAT AAGCAACAGCAAGAAAGAGATTGGGTCTTGAACGAGTTCAAGACGGGCAA GAGCCCAATCATGGTGGCTACTGATGTAGCTTCCCGTGGTATCGATGTGC GCGACATCACACACGTTCTCAACTATGACTACCCCAACAACTCGGAGGAC TACGTTCACCGTATTGGTAGAACTGGTCGTGCCGGTGCTAAGGGTACCGC CATCACCTTCTTTACCACTGACAACTCCAAGCAGGCTCGTGACTTGGTCA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0005524 | ATP binding |
| GO:0003676 | nucleic acid binding |
| GO:0003724 | RNA helicase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
| PFAM | PF00270 |
| InterPro | IPR027417 |
| InterPro | IPR000629 |
| PFAM | PF00271 |
| InterPro | IPR014014 |
| InterPro | IPR001650 |
| InterPro | IPR011545 |
| InterPro | IPR014001 |
Properties
| Property Name | Value |
| Product | ATP-dependent RNA helicase dbp2 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| MCQH01000217 | supercontig | MCQH01000217:187603..190140 + |
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