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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at MCQH01000310:53758..55525- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >ATCC10864_011851-T1 ID=ATCC10864_011851-T1|Name=ATCC10864_011851-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=mRNA|length=1768bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000310:53758..55525- (Aspergillus niger ATCC 10864)
ATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCATGGTGTC
CGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCAAGTGTA
TGTGATGTTTGTCCGAGTTTCGTTGTACCACTCTAACAGAAGTAGGGGTT
GGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACCCT
GGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAGAA
ACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGACT
CCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTGAA
GTCGGTATGTTATCGCTCATGCCCCTGATATTGTTGGTCGTTGCAACACT
AACTGGTTACATAGACTGTCGAATTCGTTACCAACAGCGGTGCCTACGCT
GTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTGTAAGTGGATACAGTTGGATG
AGAAAGGTGGCATATGATGGCTAACAGCCTGCAGTGATGGAAGCATCATT
ACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAATT
TGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAGTGAGTAGACCTTTTACT
ATACCATTTATACAAAGAGATAACTAATGGAAACAGACAACGAGTACCAT
GACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCAGGCTGCTATCAACGG
TATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACATCTTCGTCGAGGGTAACG
CCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAACGACAACCTGTCTGGC
CTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGATGCACCAGTACCTTGA
CTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGCC
AGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCAG
GGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGGC
TGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTTG
GTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGAACCTACATGTACTCT
CTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTACCTGCCCATCCTCGA
GAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCT
CCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGAG
CAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTTC
CTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCA
AGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCCACCTCCAGCGCTGTCGCT
GCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCCGTCGCCCCTACTTC
CAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTTACGTTCCCACCACCACTGCTG
CCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGCTGCTAGCAGCAGCGGT
GTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCCCTCGGCTACCAACTCTGCTGG
TGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATCAACTGGACCGGCCCTA
CCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCAGAACGACTACTACTAC
CAGTGCGTTGCTGAGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at MCQH01000310:53758..55525- >ATCC10864_011851-T1 ID=ATCC10864_011851-T1|Name=ATCC10864_011851-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 10864|type=CDS|length=7755bp|location=Sequence derived from alignment at MCQH01000310:53758..55525- (Aspergillus niger ATCC 10864)
ACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCAG
GCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACATCTT
CGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAACG
ACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGATG
CACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCAG
CTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAGA
CCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTCC
GTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACTC
CGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGAA
CCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTAC
CTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCAG
CTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACCA
CTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGCC
TCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTCTCAG
CAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCCACCT
CCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCC
GTCGCCCCTACTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTTACGTTCC
CACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGCTG
CTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCCCTCGGCT
ACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATCAA
CTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCAGA
ACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGATGGAAGCATCATTAC
TTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAATTTG
CCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGTCGAATTCGTTACCAA
CAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTGGGTT
GGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACCCT
GGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAGAA
ACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGACT
CCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTGAA
GTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCATGG
TGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCAAG
TACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCA
GGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACATCT
TCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAAC
GACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGAT
GCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCA
GCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAG
ACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTC
CGTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACT
CCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGA
ACCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTA
CCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCA
GCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACC
ACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGC
CTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTCTCA
GCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCCACC
TCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGC
CGTCGCCCCTACTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTTACGTTC
CCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGCT
GCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCCCTCGGC
TACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATCA
ACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCAG
AACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGATGGAAGCATCATTA
CTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAATTT
GCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGTCGAATTCGTTACCA
ACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTGGGT
TGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACCC
TGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAGA
AACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGAC
TCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTGA
AGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCATG
GTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCAA
GTACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACC
AGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACATC
TTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAA
CGACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGA
TGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTC
AGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAA
GACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACT
CCGTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAAC
TCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGG
AACCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCACCT
ACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCC
AGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCAC
CACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTG
CCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTCTC
AGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCCAC
CTCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTG
CCGTCGCCCCTACTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTTACGTT
CCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGC
TGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCCCTCGG
CTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATC
AACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCA
GAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGATGGAAGCATCATT
ACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAATT
TGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGTCGAATTCGTTACC
AACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTGGG
TTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACC
CTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAG
AAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGA
CTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTG
AAGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCAT
GGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCA
AGTACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAAC
CAGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACAT
CTTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACA
ACGACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAG
ATGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGT
CAGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGA
AGACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAAC
TCCGTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAA
CTCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGG
GAACCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCACC
TACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTC
CAGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCA
CCACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATT
GCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTCT
CAGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCCA
CCTCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCT
GCCGTCGCCCCTACTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTTACGT
TCCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTG
CTGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCCCTCG
GCTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTAT
CAACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCC
AGAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGATGGAAGCATCAT
TACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAAT
TTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGTCGAATTCGTTAC
CAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTGG
GTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCAC
CCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGA
GAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTG
ACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCT
GAAGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCA
TGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTC
AAGTACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAA
CCAGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACA
TCTTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTAC
AACGACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGA
GATGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTG
TCAGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTG
AAGACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAA
CTCCGTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGA
ACTCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGG
GGAACCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCAC
CTACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCT
CCAGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACC
ACCACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGAT
TGCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTC
TCAGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCC
ACCTCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCC
TGCCGTCGCCCCTACTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTTACG
TTCCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCT
GCTGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCCCTC
GGCTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTA
TCAACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTC
CAGAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGATGGAAGCATCA
TTACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAA
TTTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGTCGAATTCGTTA
CCAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTG
GGTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCA
CCCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTG
AGAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTT
GACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACC
TGAAGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGC
ATGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTT
CAAGT back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0005576 | extracellular region |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0071704 | organic substance metabolic process |
| GO:0005975 | carbohydrate metabolic process |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0004553 | hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds |
| GO:0030248 | cellulose binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Cross References
External references for this mRNA
| Database | Accession |
|---|
| InterPro | IPR001547 |
| InterPro | IPR000254 |
| InterPro | IPR017853 |
| PFAM | PF00734 |
| InterPro | IPR035971 |
| PFAM | PF00150 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | CAZy:GH5 |
| Note | SECRETED:SignalP(1-18) |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| MCQH01000310 | supercontig | MCQH01000310:53758..55525 - |
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