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The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851899.1:1493974..1497298- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_226919-T1 ID=M747DRAFT_226919-T1|Name=M747DRAFT_226919-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=3325bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851899.1:1493974..1497298- (Aspergillus niger ATCC 13496) ATGTCGGCCGCAGGATCAAGTAGTGATGCCGCGGTGAAGAAGGCTTTCCC
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GATTAATCCCCCGATAATGCCTCAATGTCTCTGTTTCAGCCATGCAGAGG
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CATTCAAGCAGACCTCCGGTGGTGGAGGCGGCGAATATGACTACACTCGC
TCCGGAAACCCGACCCGGACACACTTGGAGCGACACCTCGCCAAGATCAT
GTCCGCCCAGCGGGCTCTCGTCGTGTCCTCTGGTATGGCTGCGTTGGATG
TGATTTCTCGCCTGCTTCGTCCTGGTGACGAGGTGGTGACTGGTGATGAC
CTCTACGGTGGCACCAACCGCCTTCTGAAGTACCTGTCCACGAACGGCGG
CATCATCGTCCACCATGTTGATACTACGGTGCCGGAGAAAGTGCGCGAGG
TTCTGACCTCGAAGACGGCGATGGTCCTGCTGGAGACGCCGACCAACCCG
CTCATCAAGGTCGTGGATATTCCTCAGATTGCTGCCGCCGCCCACGAAGC
GAACCCTAACTGCGTTGTCTCGGTCGACAACACCATGATGTCGCCTCTTT
TGCTGAACCCTCTCGAACTTGGTGCCGATATTGTGTACGAGAGCGGTACC
AAGTACCTTTCCGGTCACCACGACCTTATGGCAGGTGTGCTCGCGGTCAA
CGACCTGTCTCTCGGCGAACGCCTCTACTTCACAATCAACGCTTCCGGCT
GCGGTCTGTCACCCTTCGACTCGTGGCTGTTGCTGCGTGGAGTGAAGACG
CTCAAGGTCCGGATGGATCAGCAGCAGAGCAACGCCCAGCGCATTGCCGA
GTTCCTCGAAACCCATGGCTTCAAGGTGCGGTACCCTGGTCTGCGGTCGC
ACCCGCAGTATGAGCTGCACCACTCGATGGCCCGGGGATCGGGAGCCGTG
CTCTCGTTCGAGACGGGTGATGTGGGTGTCAGTGAGCGGATTGTTGAGAG
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CGGGAGCGCGCCATGCCCGAGGATCTGATCCGACTGTGTGTGGGTATTGA
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TTTAAATTCTCCATTCTGGGTGTGATTGATCAGTTTGAGCTAATATTGGA
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GCGAACTCGTCCAACTAAGCTACGTATGCATAACACGCGCGCGACTGATG
GATTGTGCGGGTTCTTTCTGTAATTGAGGCATTGATTCGAGTGCTACGGT
CACGATTTTTTTTTAAGAGACGATCATTTGGGCGTTCAGGAGCATTAATT
AATGAGTGTAGTAAAATATTTTGGGAATGAAACAACCATATTATCTGAAC
ATCTATAATGTGTCGGTGGATTGTTTATCCCGGGGATGGCTGAGAACCGT
TTATCCGGGGGGGATTCGCGATGGCCTCAAAAACCAGGGATCCGTCGGCA
GTTTGGCGGAAAGATCGGCCGGCATCGGAGGCAAACCCGAGGACGTTGCA
AAAGCTGGTCCAATCATTGGCCGGCCACTTCTCGTCCGCCTGCAAGTCCG
ATTAAATAATGAGTCGCTGTCGCGATGGATCTGATTTCTCGCTCGCTCTT
AGTACTTATGTATGTCGGGCGCGAGGCTAACAAACTCCGAACCCTTTTCT
TCTTTGCAATGGACCTGTAATCCCGTCGGGCTCCCGTGCCTTAATCCCTC
GTTTTGGACTGCGAACCTGTTCGCCATCCCCCAAACCCCCGAACATCTGT
CTCACTCATCCGTCCTCCCCGGCAATTGTCTTCTCCTGCGCTGGTCTGGA
TGACGTTGTTCGAGCAGTCGCTGTAACCTCCTTCTCTTCACCTCGGGCGA
TCCTATCTCAGCCCTAGACTTGCTCATTCTTTTTGTCTCTTTTTTTTTTC
CCTCTCTCTCTCTCTCTTTCACTTCTCGCCTGATCGCCATCCCGACCGGT
GAAACAATACCATGCCTCGGAACGCGCTCTCCTCCGAAGCGCCTCTCCCC
ATGTCCGCCATCACAGAGCAGTCCATATCGTCGGATTGGAATACCAACCG
TTTAGGTGCGCGACTGGGAGTCGATATCGCCAGTGCCGCAACTGCGGGTG
CCTTGACATGTCCTGTCATCACCGTTATTGATCGGTATGCTAGTTACAAC
CTACCCCGATACATCATCCTCCTATCGTCGAGAGAGATAGCGAGAGAAAG
AGCTATAAGCTAATGAAATCAATTCCTTGAACCAGCGCGATCATCGAAAA
AGCAGCCAAGGGTGTCCCCATCCGCCAGACCATCACATCCTGCTTCCGAT
CCATGTTCACAAAACCGGGGAGCTTCTTCCTCAGCACCCCATTCCTCCTT
ATCTACACCCTGTACACGTCCACCTACCTCACTGCGAACACCATTGACAC
CTTCACCTCCACCGTGCGCGACAAGCCCTTCTCAACCGTCTTCCCCGGTA
CCGCCAAATTCCTCACCACCACCGCAGTGAACATGGGTATTTGCGTATAC
AAGGACGCCAGGTTCGCGCGCATCTTCGGTGCAAAACCCTCTCCTGCTGC
TACACCTGGATCTACATCTGCGCCCCAGCCCGCTTCCAGATCTACATCCG
CATCCACCCCAGCCTCCTGCCACCCCTCCGGCGCCGCCAAAGTCCCCAAG
ATCTCCTACGGCCTCTTCTGTCTCCGCGACAGCATCACCATCTTCGCCTC
CTTCAACATCCCCGCCCTCGTCGCCCCCTCCATCCCCGATTCTATCGCCG
CCACGCCCGGAATGAAGGCTGCGCTCGCGCAATTCTCCTGTCCGGCTCTG
ATGCAGTTCGCTAGCACGCCTATGCACCTGCTCGGATTGGATCTGTATAA
CCGGCAACCGCCAGGCGGATTGGGATGGCGTGAGCGCGCTTCGCGCATCA
GACGCGACTACATCCCCAGTTGCTTTGCGCGCATGGGCAAGATCGTTCCG
GCGTATGGTGTGGGTGGTGTGGTGAATGTGCGGATGAGAGCTTCGCTAAT
GGAGTATCTGGAAGGCGGGAAGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851899.1:1493974..1497298- >M747DRAFT_226919-T1 ID=M747DRAFT_226919-T1|Name=M747DRAFT_226919-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=11160bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851899.1:1493974..1497298- (Aspergillus niger ATCC 13496) CGCGATCATCGAAAAAGCAGCCAAGGGTGTCCCCATCCGCCAGACCATCA CATCCTGCTTCCGATCCATGTTCACAAAACCGGGGAGCTTCTTCCTCAGC ACCCCATTCCTCCTTATCTACACCCTGTACACGTCCACCTACCTCACTGC GAACACCATTGACACCTTCACCTCCACCGTGCGCGACAAGCCCTTCTCAA CCGTCTTCCCCGGTACCGCCAAATTCCTCACCACCACCGCAGTGAACATG GGTATTTGCGTATACAAGGACGCCAGGTTCGCGCGCATCTTCGGTGCAAA ACCCTCTCCTGCTGCTACACCTGGATCTACATCTGCGCCCCAGCCCGCTT CCAGATCTACATCCGCATCCACCCCAGCCTCCTGCCACCCCTCCGGCGCC GCCAAAGTCCCCAAGATCTCCTACGGCCTCTTCTGTCTCCGCGACAGCAT CACCATCTTCGCCTCCTTCAACATCCCCGCCCTCGTCGCCCCCTCCATCC CCGATTCTATCGCCGCCACGCCCGGAATGAAGGCTGCGCTCGCGCAATTC TCCTGTCCGGCTCTGATGCAGTTCGCTAGCACGCCTATGCACCTGCTCGG ATTGGATCTGTATAACCGGCAACCGCCAGGCGGATTGGGATGGCGTGAGC GCGCTTCGCGCATCAGACGCGACTACATCCCCAGTTGCTTTGCGCGCATG GGCAAGATCGTTCCGGCGTATGGTGTGGGTGGTGTGGTGAATGTGCGGAT GAGAGCTTCGCTAATGGAGTATCTGGAAGGCGGGAAGTAACGCCTCTCCC CATGTCCGCCATCACAGAGCAGTCCATATCGTCGGATTGGAATACCAACC GTTTAGGTGCGCGACTGGGAGTCGATATCGCCAGTGCCGCAACTGCGGGT GCCTTGACATGTCCTGTCATCACCGTTATTGATCGGACGTTGCAAAAGCT GGTCCAATCATTGGCCGGCCACTTCTCGTCCGCCTGCAAAGCGCTACATT CAAGCAGACCTCCGGTGGTGGAGGCGGCGAATATGACTACACTCGCTCCG GAAACCCGACCCGGACACACTTGGAGCGACACCTCGCCAAGATCATGTCC GCCCAGCGGGCTCTCGTCGTGTCCTCTGGTATGGCTGCGTTGGATGTGAT TTCTCGCCTGCTTCGTCCTGGTGACGAGGTGGTGACTGGTGATGACCTCT ACGGTGGCACCAACCGCCTTCTGAAGTACCTGTCCACGAACGGCGGCATC ATCGTCCACCATGTTGATACTACGGTGCCGGAGAAAGTGCGCGAGGTTCT GACCTCGAAGACGGCGATGGTCCTGCTGGAGACGCCGACCAACCCGCTCA TCAAGGTCGTGGATATTCCTCAGATTGCTGCCGCCGCCCACGAAGCGAAC CCTAACTGCGTTGTCTCGGTCGACAACACCATGATGTCGCCTCTTTTGCT GAACCCTCTCGAACTTGGTGCCGATATTGTGTACGAGAGCGGTACCAAGT ACCTTTCCGGTCACCACGACCTTATGGCAGGTGTGCTCGCGGTCAACGAC 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TACGGAGCTTGTATATACGGAGGGAAATGATCAGTACAATGCTAGCAGCG TTCCGATCTACCAGCGCGATCATCGAAAAAGCAGCCAAGGGTGTCCCCAT CCGCCAGACCATCACATCCTGCTTCCGATCCATGTTCACAAAACCGGGGA GCTTCTTCCTCAGCACCCCATTCCTCCTTATCTACACCCTGTACACGTCC ACCTACCTCACTGCGAACACCATTGACACCTTCACCTCCACCGTGCGCGA CAAGCCCTTCTCAACCGTCTTCCCCGGTACCGCCAAATTCCTCACCACCA CCGCAGTGAACATGGGTATTTGCGTATACAAGGACGCCAGGTTCGCGCGC ATCTTCGGTGCAAAACCCTCTCCTGCTGCTACACCTGGATCTACATCTGC GCCCCAGCCCGCTTCCAGATCTACATCCGCATCCACCCCAGCCTCCTGCC ACCCCTCCGGCGCCGCCAAAGTCCCCAAGATCTCCTACGGCCTCTTCTGT CTCCGCGACAGCATCACCATCTTCGCCTCCTTCAACATCCCCGCCCTCGT CGCCCCCTCCATCCCCGATTCTATCGCCGCCACGCCCGGAATGAAGGCTG CGCTCGCGCAATTCTCCTGTCCGGCTCTGATGCAGTTCGCTAGCACGCCT ATGCACCTGCTCGGATTGGATCTGTATAACCGGCAACCGCCAGGCGGATT GGGATGGCGTGAGCGCGCTTCGCGCATCAGACGCGACTACATCCCCAGTT GCTTTGCGCGCATGGGCAAGATCGTTCCGGCGTATGGTGTGGGTGGTGTG GTGAATGTGCGGATGAGAGCTTCGCTAATGGAGTATCTGGAAGGCGGGAA GTAACGCCTCTCCCCATGTCCGCCATCACAGAGCAGTCCATATCGTCGGA TTGGAATACCAACCGTTTAGGTGCGCGACTGGGAGTCGATATCGCCAGTG 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TTCCGGTCACCACGACCTTATGGCAGGTGTGCTCGCGGTCAACGACCTGT CTCTCGGCGAACGCCTCTACTTCACAATCAACGCTTCCGGCTGCGGTCTG TCACCCTTCGACTCGTGGCTGTTGCTGCGTGGAGTGAAGACGCTCAAGGT CCGGATGGATCAGCAGCAGAGCAACGCCCAGCGCATTGCCGAGTTCCTCG AAACCCATGGCTTCAAGGTGCGGTACCCTGGTCTGCGGTCGCACCCGCAG TATGAGCTGCACCACTCGATGGCCCGGGGATCGGGAGCCGTGCTCTCGTT CGAGACGGGTGATGTGGGTGTCAGTGAGCGGATTGTTGAGAGCGCCAAGC TGTGGGCCATCAGTGTCAGCTTTGGCTGTGTCAACAGTTTGATCAGTATG CCGTGCCGCATGAGCCACGCCAGTATCGACGAGAAGACGCGACGGGAGCG CGCCATGCCCGAGGATCTGATCCGACTGTGTGTGGGTATTGAAGATGCAG ATGATCTCATTGATGACTTGCGACGGGCGGTAAATGTCGGCCGCAGGATC AAGTAGTGATGCCGCGGTGAAGAAGGCTTTCCCTCGGGTTGACCTCGAGG GTCACGACCTTCCTCCCTCCCCCGCTCCTTCGAGCCCCCACGGTGGCCGT CGCTATAACATTGCTACGGAGCTTGTATATACGGAGGGAAATGATCAGTA CAATGCTAGCAGCGTTCCGATCTACCAGCGCGATCATCGAAAAAGCAGCC AAGGGTGTCCCCATCCGCCAGACCATCACATCCTGCTTCCGATCCATGTT CACAAAACCGGGGAGCTTCTTCCTCAGCACCCCATTCCTCCTTATCTACA CCCTGTACACGTCCACCTACCTCACTGCGAACACCATTGACACCTTCACC TCCACCGTGCGCGACAAGCCCTTCTCAACCGTCTTCCCCGGTACCGCCAA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0019346 | transsulfuration |
GO:0071266 | 'de novo' L-methionine biosynthetic process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0030170 | pyridoxal phosphate binding |
GO:0004121 | cystathionine beta-lyase activity |
GO:0003824 | catalytic activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR015424 |
DBxref | InterPro:IPR015421 |
DBxref | InterPro:IPR000277 |
DBxref | InterPro:IPR006238 |
DBxref | InterPro:IPR015422 |
DBxref | PFAM:PF01053 |
Product | cystathionine beta-l |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851899.1 | supercontig | KZ851899.1:1493974..1497298 - |
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