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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851899.1:718872..721223- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_291508-T1 ID=M747DRAFT_291508-T1|Name=M747DRAFT_291508-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2352bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851899.1:718872..721223- (Aspergillus niger ATCC 13496) TTGACCTTTTCTATACCCCATTTCGCTCTTCAACACCATCAAGATGTTCA
AGAGGTATGTGATGATGTTCTCCCGGATCCCTCCTCCAACCTTTTATACA
TTTAGATAATTTTTTATCTACCTTTTAACCTTTTAGAGGCTTCCAACTAA
CCATTTCTTTCCCCCTTGTTACAGCGGTCTTGCCCGGACCTTCGGGAGGG
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CCGAGCCTCGATTCCATCCACAATCTCATCAAATTCGACTCAATGGCCAT
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AAGCTCCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAA
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CTTCACAGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCG
GTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTT
AACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAA
GTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTG
AGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCC
TACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAA
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CCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACT
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GCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGC
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TTTCCGTTTCACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTA
TCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGT
ATGCAGGAGCGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCA
GGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCA
CCTTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAG
TTGGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCT
CGACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCACTACAACACCGCCACCCGTGTCC
AGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTG
GGTATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCG
TAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCA
CTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTC
AAGGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGGTAAGTTGAT
CTCTCCACTTTCTGTTTGGTGATCGGCATGGATGCTAATTTGTTTATCTA
CAGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGT
GAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAAATGTAATATTGTTT
TTAAGCGCCCTTTTCCTTTTTTGTTAGACATGGACTTCCTTTCTTCCATG
TGCCGTTTTCTACCGATCCGTGTACAGTACTCGAATTGAGAAAAGGGAGT
TGAAAGAAAGGCGAGGTCCCCCCTATATAAAAGGATGAGAGCGCTCTTAA
CG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851899.1:718872..721223- >M747DRAFT_291508-T1 ID=M747DRAFT_291508-T1|Name=M747DRAFT_291508-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=8658bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851899.1:718872..721223- (Aspergillus niger ATCC 13496) CTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAG AAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAAAACAACATCGCCAAGGC TCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGG GTAACGATCTGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAG GGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGG TGCCCGTGCCCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCC GTGACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGT TTCACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTC TGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGG AGCGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTC TACGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGC TCACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTA TCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACC CGTATCGTCGGTGAAGACCACTACAACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGAT GCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTGGGTATGG ACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTC CAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTAT CGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCA TCATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGGTACCGAGGGTCTGACC CGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGG TCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACG AGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCT CCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTAT CAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTC TCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATT CAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGTGAAGTT CGACGGTGACAAGCTCCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACG GTGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTATGGCCAGCACTGAGGCCTCT TCCGTTGGAAAGATTCACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGCTGCTTT CTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCT TGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAAAACAACATCGCCAAGGCTCACGGT GGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGA TCTGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACT CCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGT GCCCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGA GGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCC AGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTC GGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTAT TACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCC CTGCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTG GACGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCC TGCCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCG TCGGTGAAGACCACTACAACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAG GAGTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACT GTCTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTT TCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGT AAGCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAA CGGTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTG CTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGC ACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGG TCCCGTCAAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGT TCGTCGAGCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTC GTCGATCTGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGG TGGTGCCGGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTCAACACT TGGGTGAGAATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGTGAAGTTCGACGGT GACAAGCTCCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCA GAAGCTCGTCCTTGAGGTTTCTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTG GAAAGATTCACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGCTGCTTTCTACATG GTTGGTGACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGA GCTCGAGAACAAGGCCTAAAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACT CCGTCTTCTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTAC CACGAAATGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGT CGCCCTGGTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCCCGTG TCGCCCTTACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGT CAGGACGTGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCAGGCCGG TTCTGAGGTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACC AGCCCACTCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACC ACCACCAAGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGA CGATTTGACTGACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCA CCACTGTCTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTC GACCCTCTCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGA AGACCACTACAACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACA AGTCCCTCCAGGATATCATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAG GCTGACAAGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTC CCAGCCCTTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGG TCGACCTGAAGGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAA GGTGACGACCTTCCTGAGGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGC CCGTGACACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTG GCCGTATCCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTC AAGGCCGACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGA GCAGTCCACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATC TGCTTGCCCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCC GGTGTCGGTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTCAACACTTGGGTGA GAATGTCGTTCGTACCATTGCCATGGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGC TCCCTGCCATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTC GTCCTTGAGGTTTCTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGAT TCACCAGGTCATTGGTGCCGTCGTCGACGCTGCTTTCTACATGGTTGGTG ACTTCGAGTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAG AACAAGGCCTAAAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTT CTGTGGTGTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCACGAAA TGCAGGAGACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTG GTGTTCGGTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCCCGTGTCGCCCT TACCGGTCTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAGGACG TGCTGCTCTTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCAGGCCGGTTCTGAG GTGTCTGCCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCAC TCTGGCCGTCGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACCACCACCA AGGGTTCCATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTG ACTGACCCTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGT CTTGTCCCGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTC TCGACTCCAAGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCAC TACAACACCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCT CCAGGATATCATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACA AGCTTACCGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCC TTCACCGTCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCT GAAGGACACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACG ACCTTCCTGAGGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGAC ACCGGTGCTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTAT CCTTAACGTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCG ACAAGTTCCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCC ACTGAGGCCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGC CCCCTACGCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCG GTAAGACCGTCTTCATTCAGGAGCTGATTCAACACTTGGGTGAGAATGTC GTTCGTACCATTGCCATGGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCTCCCTGC CATTCTCAACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCGTCCTTG AGGTTTCTATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATTCACCAG GTCATTGGTGCCGTCGTCGACGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGA GTCTGCCCGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGG CCTAAAACAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGT GTCGGTGAGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCACGAAATGCAGGA GACTGGTGTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCG GTCAGATGAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCCCGTGTCGCCCTTACCGGT CTGACCATTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCT CTTCATTGACAACATTTTCCGTTTCACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTG CCCTTCTGGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCC GTCGACATGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACCACCACCAAGGGTTC CATTACCTCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACC CTGCCCCCGCCACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCC CGTGGTATCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTC CAAGTCCCGTATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCACTACAACA CCGCCACCCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGAT ATCATTGCCATTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTAC CGTCGAGCGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCG TCGCCCAGGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGAC ACCATCCGCAGTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCC TGAGGGTACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGGTG CTCCCATCACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTAAC GTCACTGGTGACCCCATTGACGAGCGTGGTCCCGTCAAGGCCGACAAGTT CCGTCCCATCCACACTGAGGCTCCCGAGTTCGTCGAGCAGTCCACTGAGG CCGAGATTCTCGTCACTGGTATCAAGGTCGTCGATCTGCTTGCCCCCTAC GCCCGTGGTGGTAAGATTGGTCTCTTCGGTGGTGCCGGTGTCGGTAAGAC CGTCTTCATTCAGGAGCTGATTCAACACTTGGGTGAGAATGTCGTTCGTA CCATTGCCATGGACGTGAAGTTCGACGGTGACAAGCTCCCTGCCATTCTC AACGCCATTGAGACCGAGAACGGTGGCCAGAAGCTCGTCCTTGAGGTTTC TATGGCCAGCACTGAGGCCTCTTCCGTTGGAAAGATTCACCAGGTCATTG GTGCCGTCGTCGACGCTGCTTTCTACATGGTTGGTGACTTCGAGTCTGCC CGCGCCAAGGGTGAGAAGATCTTGGCCGAGCTCGAGAACAAGGCCTAAAA CAACATCGCCAAGGCTCACGGTGGTTACTCCGTCTTCTGTGGTGTCGGTG AGCGTACTCGTGAGGGTAACGATCTGTACCACGAAATGCAGGAGACTGGT GTCATCCAGCTCGAGGGTGACTCCAAGGTCGCCCTGGTGTTCGGTCAGAT GAACGAGCCCCCGGGTGCCCGTGCCCGTGTCGCCCTTACCGGTCTGACCA TTGCCGAGTACTTCCGTGACGAGGAGGGTCAGGACGTGCTGCTCTTCATT GACAACATTTTCCGTTTCACCCAGGCCGGTTCTGAGGTGTCTGCCCTTCT GGGTCGTATCCCCTCTGCCGTCGGTTACCAGCCCACTCTGGCCGTCGACA TGGGTGGTATGCAGGAGCGTATTACCACCACCACCAAGGGTTCCATTACC TCCGTCCAGGCCGTCTACGTCCCTGCTGACGATTTGACTGACCCTGCCCC CGCCACCACCTTCGCTCACTTGGACGCCACCACTGTCTTGTCCCGTGGTA TCTCCGAGTTGGGTATCTACCCTGCCGTCGACCCTCTCGACTCCAAGTCC CGTATGCTCGACACCCGTATCGTCGGTGAAGACCACTACAACACCGCCAC CCGTGTCCAGCAGATGCTCCAGGAGTACAAGTCCCTCCAGGATATCATTG CCATTCTGGGTATGGACGAACTGTCTGAGGCTGACAAGCTTACCGTCGAG CGTGCTCGTAAGCTCCAGCGTTTCCTGTCCCAGCCCTTCACCGTCGCCCA GGTCTTCACTGGTATCGAGGGTAAGCTGGTCGACCTGAAGGACACCATCC GCAGTTTCAAGGCCATCATCAACGGTGAAGGTGACGACCTTCCTGAGGGT ACCGAGGGTCTGACCCGTGGTGCTGCCGCCCGTGACACCGGTGCTCCCAT CACCATCCCCGTCGGTCCCGGCACCCTTGGCCGTATCCTTAACGTCACTG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0045261 | proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0046034 | ATP metabolic process |
GO:1902600 | proton transmembrane transport |
GO:0015986 | ATP synthesis coupled proton transport |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0005524 | ATP binding |
GO:0046933 | proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | BUSCO:EOG09261T74 |
DBxref | InterPro:IPR036121 |
DBxref | InterPro:IPR027417 |
DBxref | InterPro:IPR020003 |
DBxref | InterPro:IPR000194 |
DBxref | InterPro:IPR024034 |
DBxref | InterPro:IPR004100 |
DBxref | InterPro:IPR005722 |
DBxref | InterPro:IPR003593 |
DBxref | PFAM:PF02874 |
DBxref | PFAM:PF00006 |
Product | beta subunit of the F1 sector of mitochondrial F1F0 ATP synthase |
Product | atp2 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851899.1 | supercontig | KZ851899.1:718872..721223 - |
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