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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851900.1:1377213..1380515- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_292164-T1 ID=M747DRAFT_292164-T1|Name=M747DRAFT_292164-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=3303bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851900.1:1377213..1380515- (Aspergillus niger ATCC 13496) TTCTTCCTTTTATTTTCTTTTTTTACGAAACCCCGCCTCTACGGCAGTTG
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ACGATGTTCTTTATAGCTTCACTATCGAAGAGGTCCGTTCTATATTCCCC
GCATCAACCTGCCTCGGGCTGCTCCTCAACACCTAGGAGGGCAACACCGG
CCCAGAATCGGGAAAAGCAATCAGTGAATGAAGATGGAAGTGTACTAATG
CTGGAAATAGATCCGCGGCCTGATGGACCGCCCGGCCAACATCCGTAACA
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ATGGCCAGGTGTATCTTGAATGAATCTTGCTGACTCGCAACGATAGTCGA
TCACGGAAAGTCCACCCTTTCCGACTCCCTGGTCCAGCGTGCCGGTATTA
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GAGCAGGACCGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGCCATCTCCCTCTACGC
CAAGTTCCCCGATGAGGAGGATCTCAAGGAGATCCCCCAGAAGGTCGATG
GCTCTGAGTTCCTGATCAACCTGATCGATTCCCCCGGTCACGTTGATTTC
TCCTCTGAGGTCACTGCTGCTCTGCGTGTCACTGACGGTGCCCTGGTCGT
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CGTGCTCTGCTCGAACTCCAGGTCTCCAAGGAGGACCTGTACCAGTCCTT
CTCTCGTACCATCGAGTCCGTCAACGTCATCATCGCCACCTACTTCGACA
AGGCTCTTGGTGATGTCCAGGTCTACGCCGAGAAGGGTACCGTTGCCTTC
GGTTCCGGTCTCCACGGCTGGGCTTTCACTGTCCGCCAGTTCGCCGTCAA
GTTCGCCAAGAAGTTCGGTGTTGACCGCAAGAAGATGCTTGAGCGTCTCT
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CGTTCTGGACCCCATCTTCAAGATCTTCCAGACCATCAACAACGACAAGA
AGGACCAGATCCCCACTCTCCTTGAGAAGCTTGAGGTCAAGCTTTCCAAC
GACGAGAAGGACCTTGCTGGCAAGCAGCTCCTCAAGGCTGTCATGCGCAA
GTTCCTCCCCGCTGCTGATGCCATGTTGGAGATGATCTGTATCCACCTTC
CCTCCCCCGTTACTGCCCAGAAGTACCGTGGTGAGACTCTCTACGAGGGT
CCTTCCGACGACGACTGCGCCGTCGGTATCCGCGACTGTGACCCCAAGGC
TCCTCTGATGCTTTACGTCTCCAAGATGGTTCCCACCTCCGACAAGGGTC
GTTTCTACGCTTTCGGTCGTGTCTACTCCGGTACCGTCCGCTCCGGTCTT
AAGGTCCGTATCCAGGGTCCCAACTACGTCCCTGGCAAGAAGGAGGACCT
GTTCGTCAAGAACATCCAACGTACTATCCTGATGATGGGTCGTTTTGTCG
AGCCCATTGAGGATGTTCCCGCCGGTAACATCGTCGGTCTGGTCGGTGTT
GACCAGTTCCTGCTCAAGTCTGGTACCCTCACCACCTCCGAGACTGCCCA
CAACATGAAGGTCATGAAGTTCTCCGTCTCCCCCGTCGTCCAGCGTTCCG
TTGAGGTCAAGAACGCCCAGGATCTGCCCAAGCTGGTCGAAGGTCTCAAG
CGTCTGTCCAAGTCTGACCCTTGTGTCCTGACCATGATCAACGAGTCCGG
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AGGATCTCGAGGAGGACCACGCTGGTGTTCCCCTTCGTATCTCCGACCCT
GTCGTCTCCTACCGTGAGACCGTCAGCGGCACTTCCAGCATGACTGCTCT
GTCCAAGTCCCCCAACAAGCACAACCGTCTGTACCTCACTGCCCAGCCCC
TTGACGAGGAGGTCTCCCTGGCCATTGAGGCTGGCAAGATCACCCCCCGT
GACGATTTCAAGGCTCGTGCCCGTCTCCTTGCTGACGAGTACGGCTGGGA
TGTCACCGATGCCCGTAAGATTTGGTGCTTCGGTCCCGACACCACCGGTG
CCAACTTGCTGGTTGACCAGACCAAGGCCGTCCAGTACCTCAACGAAATC
AAGGATTCCTTCGTCTCTGGTTTCCAGTGGGCTACTCGTGAGGGTCCTAT
TGCTGAGGAGCCCATGCGCTCTATCCGCTTCAACATCCTTGATGTTACTC
TGCACGCTGATGCTATTCACCGTGGTGGTGGTCAGATCATCCCCACTGCT
CGTCGTGTCCTGTATGCTGCTACCATGCTTGCCGACCCCGGCATCCTGGA
GCCCATCTTCAACGTCGAGATCCAGGTCCCCGAGCAGGCCATGGGTGGTA
TCTACGGTGTCCTTACCCGTCGTCGTGGTCACGTCTACACCGAGGAGCAG
CGCCCTGGTACTCCTCTCTTCAACGTCAAGGCCTACCTGCCCGTCAACGA
GTCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGCTTCGTCAGGCCACCGGTGGACAGGCCT
TCCCCCAGTCTGTCTTCGACCACTGGGCCGTCCTTCCTGGTGGATCTCCT
CTTGACACCACCAGCAAGCCTGGTCAGATCGTTGCTGAGATGCGTAAGCG
CAAGGGTCTCAAGGAGCAGGTTCCTGGCTACGAGAACGTAAGTTGAAAAC
CATATTCGATGCTGTATTAAAGAGTATCTGAAGCTAACATGTGTGAACAG
TACTACGACAAGCTGTAAAAACCTTCCATACAAGCCGACTAAAATTCGAC
CTTGTGATGGATGGAATCCTCTGTTTATGAGATTGACGAATGCAATACCC
TGTCTATATTGAGGGGGAGGATATAAAAGAAAAAACAGCTTAATGTCGTA
TGTGGATTTTCGACCGCTTAGAGAAGTAGAATCGAGCTGTGCACGAGCAT
ATGCGATGGCTTTATTTTTACGTTAACGACCGCGAGGGATTTTCCATAGC
TCC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851900.1:1377213..1380515- >M747DRAFT_292164-T1 ID=M747DRAFT_292164-T1|Name=M747DRAFT_292164-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=15210bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851900.1:1377213..1380515- (Aspergillus niger ATCC 13496) TACTACGACAAGCTGTAAGGTGACAACTACTTCAACCCCGCCACCAAGAA GTGGACCAAGACCCAGCCCGAGGTCAACGGCAAGCCCGTCGAGCGTGCCT TCAACATGTTCGTTCTGGACCCCATCTTCAAGATCTTCCAGACCATCAAC AACGACAAGAAGGACCAGATCCCCACTCTCCTTGAGAAGCTTGAGGTCAA GCTTTCCAACGACGAGAAGGACCTTGCTGGCAAGCAGCTCCTCAAGGCTG TCATGCGCAAGTTCCTCCCCGCTGCTGATGCCATGTTGGAGATGATCTGT ATCCACCTTCCCTCCCCCGTTACTGCCCAGAAGTACCGTGGTGAGACTCT CTACGAGGGTCCTTCCGACGACGACTGCGCCGTCGGTATCCGCGACTGTG ACCCCAAGGCTCCTCTGATGCTTTACGTCTCCAAGATGGTTCCCACCTCC GACAAGGGTCGTTTCTACGCTTTCGGTCGTGTCTACTCCGGTACCGTCCG CTCCGGTCTTAAGGTCCGTATCCAGGGTCCCAACTACGTCCCTGGCAAGA AGGAGGACCTGTTCGTCAAGAACATCCAACGTACTATCCTGATGATGGGT CGTTTTGTCGAGCCCATTGAGGATGTTCCCGCCGGTAACATCGTCGGTCT GGTCGGTGTTGACCAGTTCCTGCTCAAGTCTGGTACCCTCACCACCTCCG AGACTGCCCACAACATGAAGGTCATGAAGTTCTCCGTCTCCCCCGTCGTC CAGCGTTCCGTTGAGGTCAAGAACGCCCAGGATCTGCCCAAGCTGGTCGA AGGTCTCAAGCGTCTGTCCAAGTCTGACCCTTGTGTCCTGACCATGATCA ACGAGTCCGGTGAGCACGTCGTTGCCGGTGCTGGTGAGCTTCACCTGGAA ATTTGCCTGAAGGATCTCGAGGAGGACCACGCTGGTGTTCCCCTTCGTAT CTCCGACCCTGTCGTCTCCTACCGTGAGACCGTCAGCGGCACTTCCAGCA TGACTGCTCTGTCCAAGTCCCCCAACAAGCACAACCGTCTGTACCTCACT GCCCAGCCCCTTGACGAGGAGGTCTCCCTGGCCATTGAGGCTGGCAAGAT CACCCCCCGTGACGATTTCAAGGCTCGTGCCCGTCTCCTTGCTGACGAGT ACGGCTGGGATGTCACCGATGCCCGTAAGATTTGGTGCTTCGGTCCCGAC ACCACCGGTGCCAACTTGCTGGTTGACCAGACCAAGGCCGTCCAGTACCT CAACGAAATCAAGGATTCCTTCGTCTCTGGTTTCCAGTGGGCTACTCGTG AGGGTCCTATTGCTGAGGAGCCCATGCGCTCTATCCGCTTCAACATCCTT GATGTTACTCTGCACGCTGATGCTATTCACCGTGGTGGTGGTCAGATCAT CCCCACTGCTCGTCGTGTCCTGTATGCTGCTACCATGCTTGCCGACCCCG GCATCCTGGAGCCCATCTTCAACGTCGAGATCCAGGTCCCCGAGCAGGCC ATGGGTGGTATCTACGGTGTCCTTACCCGTCGTCGTGGTCACGTCTACAC CGAGGAGCAGCGCCCTGGTACTCCTCTCTTCAACGTCAAGGCCTACCTGC CCGTCAACGAGTCCTTCGGTTTCCCCGGCGAGCTTCGTCAGGCCACCGGT GGACAGGCCTTCCCCCAGTCTGTCTTCGACCACTGGGCCGTCCTTCCTGG TGGATCTCCTCTTGACACCACCAGCAAGCCTGGTCAGATCGTTGCTGAGA TGCGTAAGCGCAAGGGTCTCAAGGAGCAGGTTCCTGGCTACGAGAACTCG ATCACGGAAAGTCCACCCTTTCCGACTCCCTGGTCCAGCGTGCCGGTATT ATCTCGGCTGCTAAGGCTGGTGAGGGTCGTTACATGGACACCCGTCCCGA TGAGCAGGACCGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGCCATCTCCCTCTACG CCAAGTTCCCCGATGAGGAGGATCTCAAGGAGATCCCCCAGAAGGTCGAT GGCTCTGAGTTCCTGATCAACCTGATCGATTCCCCCGGTCACGTTGATTT CTCCTCTGAGGTCACTGCTGCTCTGCGTGTCACTGACGGTGCCCTGGTCG TCGTCGACTGTGTCTCCGGTGTCTGTGTCCAGACCGAGACTGTCCTTCGT CAGGCCCTGACCGAGCGTATCAAGCCCGTCCTGATCATCAACAAGGTCGA CCGTGCTCTGCTCGAACTCCAGGTCTCCAAGGAGGACCTGTACCAGTCCT TCTCTCGTACCATCGAGTCCGTCAACGTCATCATCGCCACCTACTTCGAC AAGGCTCTTGGTGATGTCCAGGTCTACGCCGAGAAGGGTACCGTTGCCTT CGGTTCCGGTCTCCACGGCTGGGCTTTCACTGTCCGCCAGTTCGCCGTCA AGTTCGCCAAGAAGTTCGGTGTTGACCGCAAGAAGATGCTTGAGCGTCTC TGGATCCGCGGCCTGATGGACCGCCCGGCCAACATCCGTAACATGTCCGT CATTGCTCACGCTTCACTATCGAAGAGATGGTTAATACTACGACAAGCTG 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CTCCTACCGTGAGACCGTCAGCGGCACTTCCAGCATGACTGCTCTGTCCA AGTCCCCCAACAAGCACAACCGTCTGTACCTCACTGCCCAGCCCCTTGAC GAGGAGGTCTCCCTGGCCATTGAGGCTGGCAAGATCACCCCCCGTGACGA TTTCAAGGCTCGTGCCCGTCTCCTTGCTGACGAGTACGGCTGGGATGTCA CCGATGCCCGTAAGATTTGGTGCTTCGGTCCCGACACCACCGGTGCCAAC TTGCTGGTTGACCAGACCAAGGCCGTCCAGTACCTCAACGAAATCAAGGA TTCCTTCGTCTCTGGTTTCCAGTGGGCTACTCGTGAGGGTCCTATTGCTG AGGAGCCCATGCGCTCTATCCGCTTCAACATCCTTGATGTTACTCTGCAC GCTGATGCTATTCACCGTGGTGGTGGTCAGATCATCCCCACTGCTCGTCG TGTCCTGTATGCTGCTACCATGCTTGCCGACCCCGGCATCCTGGAGCCCA TCTTCAACGTCGAGATCCAGGTCCCCGAGCAGGCCATGGGTGGTATCTAC GGTGTCCTTACCCGTCGTCGTGGTCACGTCTACACCGAGGAGCAGCGCCC TGGTACTCCTCTCTTCAACGTCAAGGCCTACCTGCCCGTCAACGAGTCCT TCGGTTTCCCCGGCGAGCTTCGTCAGGCCACCGGTGGACAGGCCTTCCCC CAGTCTGTCTTCGACCACTGGGCCGTCCTTCCTGGTGGATCTCCTCTTGA CACCACCAGCAAGCCTGGTCAGATCGTTGCTGAGATGCGTAAGCGCAAGG GTCTCAAGGAGCAGGTTCCTGGCTACGAGAACTCGATCACGGAAAGTCCA CCCTTTCCGACTCCCTGGTCCAGCGTGCCGGTATTATCTCGGCTGCTAAG GCTGGTGAGGGTCGTTACATGGACACCCGTCCCGATGAGCAGGACCGTGG TATCACCATCAAGTCCACTGCCATCTCCCTCTACGCCAAGTTCCCCGATG AGGAGGATCTCAAGGAGATCCCCCAGAAGGTCGATGGCTCTGAGTTCCTG ATCAACCTGATCGATTCCCCCGGTCACGTTGATTTCTCCTCTGAGGTCAC TGCTGCTCTGCGTGTCACTGACGGTGCCCTGGTCGTCGTCGACTGTGTCT CCGGTGTCTGTGTCCAGACCGAGACTGTCCTTCGTCAGGCCCTGACCGAG CGTATCAAGCCCGTCCTGATCATCAACAAGGTCGACCGTGCTCTGCTCGA ACTCCAGGTCTCCAAGGAGGACCTGTACCAGTCCTTCTCTCGTACCATCG AGTCCGTCAACGTCATCATCGCCACCTACTTCGACAAGGCTCTTGGTGAT GTCCAGGTCTACGCCGAGAAGGGTACCGTTGCCTTCGGTTCCGGTCTCCA CGGCTGGGCTTTCACTGTCCGCCAGTTCGCCGTCAAGTTCGCCAAGAAGT TCGGTGTTGACCGCAAGAAGATGCTTGAGCGTCTCTGGATCCGCGGCCTG ATGGACCGCCCGGCCAACATCCGTAACATGTCCGTCATTGCTCACGCTTC ACTATCGAAGAGATGGTTAATACTACGACAAGCTGTAAGGTGACAACTAC TTCAACCCCGCCACCAAGAAGTGGACCAAGACCCAGCCCGAGGTCAACGG CAAGCCCGTCGAGCGTGCCTTCAACATGTTCGTTCTGGACCCCATCTTCA AGATCTTCCAGACCATCAACAACGACAAGAAGGACCAGATCCCCACTCTC CTTGAGAAGCTTGAGGTCAAGCTTTCCAACGACGAGAAGGACCTTGCTGG CAAGCAGCTCCTCAAGGCTGTCATGCGCAAGTTCCTCCCCGCTGCTGATG CCATGTTGGAGATGATCTGTATCCACCTTCCCTCCCCCGTTACTGCCCAG AAGTACCGTGGTGAGACTCTCTACGAGGGTCCTTCCGACGACGACTGCGC CGTCGGTATCCGCGACTGTGACCCCAAGGCTCCTCTGATGCTTTACGTCT CCAAGATGGTTCCCACCTCCGACAAGGGTCGTTTCTACGCTTTCGGTCGT GTCTACTCCGGTACCGTCCGCTCCGGTCTTAAGGTCCGTATCCAGGGTCC CAACTACGTCCCTGGCAAGAAGGAGGACCTGTTCGTCAAGAACATCCAAC GTACTATCCTGATGATGGGTCGTTTTGTCGAGCCCATTGAGGATGTTCCC GCCGGTAACATCGTCGGTCTGGTCGGTGTTGACCAGTTCCTGCTCAAGTC TGGTACCCTCACCACCTCCGAGACTGCCCACAACATGAAGGTCATGAAGT TCTCCGTCTCCCCCGTCGTCCAGCGTTCCGTTGAGGTCAAGAACGCCCAG GATCTGCCCAAGCTGGTCGAAGGTCTCAAGCGTCTGTCCAAGTCTGACCC TTGTGTCCTGACCATGATCAACGAGTCCGGTGAGCACGTCGTTGCCGGTG CTGGTGAGCTTCACCTGGAAATTTGCCTGAAGGATCTCGAGGAGGACCAC GCTGGTGTTCCCCTTCGTATCTCCGACCCTGTCGTCTCCTACCGTGAGAC CGTCAGCGGCACTTCCAGCATGACTGCTCTGTCCAAGTCCCCCAACAAGC ACAACCGTCTGTACCTCACTGCCCAGCCCCTTGACGAGGAGGTCTCCCTG GCCATTGAGGCTGGCAAGATCACCCCCCGTGACGATTTCAAGGCTCGTGC CCGTCTCCTTGCTGACGAGTACGGCTGGGATGTCACCGATGCCCGTAAGA TTTGGTGCTTCGGTCCCGACACCACCGGTGCCAACTTGCTGGTTGACCAG ACCAAGGCCGTCCAGTACCTCAACGAAATCAAGGATTCCTTCGTCTCTGG TTTCCAGTGGGCTACTCGTGAGGGTCCTATTGCTGAGGAGCCCATGCGCT CTATCCGCTTCAACATCCTTGATGTTACTCTGCACGCTGATGCTATTCAC CGTGGTGGTGGTCAGATCATCCCCACTGCTCGTCGTGTCCTGTATGCTGC TACCATGCTTGCCGACCCCGGCATCCTGGAGCCCATCTTCAACGTCGAGA TCCAGGTCCCCGAGCAGGCCATGGGTGGTATCTACGGTGTCCTTACCCGT CGTCGTGGTCACGTCTACACCGAGGAGCAGCGCCCTGGTACTCCTCTCTT CAACGTCAAGGCCTACCTGCCCGTCAACGAGTCCTTCGGTTTCCCCGGCG AGCTTCGTCAGGCCACCGGTGGACAGGCCTTCCCCCAGTCTGTCTTCGAC CACTGGGCCGTCCTTCCTGGTGGATCTCCTCTTGACACCACCAGCAAGCC TGGTCAGATCGTTGCTGAGATGCGTAAGCGCAAGGGTCTCAAGGAGCAGG TTCCTGGCTACGAGAACTCGATCACGGAAAGTCCACCCTTTCCGACTCCC TGGTCCAGCGTGCCGGTATTATCTCGGCTGCTAAGGCTGGTGAGGGTCGT TACATGGACACCCGTCCCGATGAGCAGGACCGTGGTATCACCATCAAGTC CACTGCCATCTCCCTCTACGCCAAGTTCCCCGATGAGGAGGATCTCAAGG AGATCCCCCAGAAGGTCGATGGCTCTGAGTTCCTGATCAACCTGATCGAT TCCCCCGGTCACGTTGATTTCTCCTCTGAGGTCACTGCTGCTCTGCGTGT CACTGACGGTGCCCTGGTCGTCGTCGACTGTGTCTCCGGTGTCTGTGTCC AGACCGAGACTGTCCTTCGTCAGGCCCTGACCGAGCGTATCAAGCCCGTC CTGATCATCAACAAGGTCGACCGTGCTCTGCTCGAACTCCAGGTCTCCAA 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CGTGGTATCACCATCAAGTCCACTGCCATCTCCCTCTACGCCAAGTTCCC CGATGAGGAGGATCTCAAGGAGATCCCCCAGAAGGTCGATGGCTCTGAGT TCCTGATCAACCTGATCGATTCCCCCGGTCACGTTGATTTCTCCTCTGAG GTCACTGCTGCTCTGCGTGTCACTGACGGTGCCCTGGTCGTCGTCGACTG TGTCTCCGGTGTCTGTGTCCAGACCGAGACTGTCCTTCGTCAGGCCCTGA CCGAGCGTATCAAGCCCGTCCTGATCATCAACAAGGTCGACCGTGCTCTG CTCGAACTCCAGGTCTCCAAGGAGGACCTGTACCAGTCCTTCTCTCGTAC CATCGAGTCCGTCAACGTCATCATCGCCACCTACTTCGACAAGGCTCTTG GTGATGTCCAGGTCTACGCCGAGAAGGGTACCGTTGCCTTCGGTTCCGGT CTCCACGGCTGGGCTTTCACTGTCCGCCAGTTCGCCGTCAAGTTCGCCAA GAAGTTCGGTGTTGACCGCAAGAAGATGCTTGAGCGTCTCTGGATCCGCG GCCTGATGGACCGCCCGGCCAACATCCGTAACATGTCCGTCATTGCTCAC GCTTCACTATCGAAGAGATGGTTAATACTACGACAAGCTGTAAGGTGACA ACTACTTCAACCCCGCCACCAAGAAGTGGACCAAGACCCAGCCCGAGGTC AACGGCAAGCCCGTCGAGCGTGCCTTCAACATGTTCGTTCTGGACCCCAT CTTCAAGATCTTCCAGACCATCAACAACGACAAGAAGGACCAGATCCCCA CTCTCCTTGAGAAGCTTGAGGTCAAGCTTTCCAACGACGAGAAGGACCTT GCTGGCAAGCAGCTCCTCAAGGCTGTCATGCGCAAGTTCCTCCCCGCTGC TGATGCCATGTTGGAGATGATCTGTATCCACCTTCCCTCCCCCGTTACTG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0005525 | GTP binding |
GO:0003924 | GTPase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR035647 |
DBxref | InterPro:IPR020568 |
DBxref | InterPro:IPR009000 |
DBxref | InterPro:IPR027417 |
DBxref | InterPro:IPR031157 |
DBxref | InterPro:IPR014721 |
DBxref | InterPro:IPR005225 |
DBxref | InterPro:IPR041095 |
DBxref | InterPro:IPR004161 |
DBxref | InterPro:IPR005517 |
DBxref | InterPro:IPR000640 |
DBxref | InterPro:IPR000795 |
DBxref | PFAM:PF03144 |
DBxref | PFAM:PF00009 |
DBxref | PFAM:PF03764 |
DBxref | PFAM:PF14492 |
DBxref | PFAM:PF00679 |
Product | Elongation factor 2 |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851900.1 | supercontig | KZ851900.1:1377213..1380515 - |
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