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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851927.1:156123..158443- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_297578-T1 ID=M747DRAFT_297578-T1|Name=M747DRAFT_297578-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2321bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851927.1:156123..158443- (Aspergillus niger ATCC 13496) AACCCCCGTACAGATCGCCCTTGGGTATTTTAATTTTTCCCTCTGTCCAC
ATTCCACGCCCACTCCGTGTCCCTCCATCAATCCATATCTGAAACTTATC
AATTCGACTCGCCAAAATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGGTGTGTGCC
CAGTCCCTCCCTCGCCGCCGCTTGATTTTTCGCGTGGTCACTAATGTTTG
TGTTTTCCCCTCACAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTG
CTGGGAGGTATGTTTAGACACGGGGGAATCGACCCCTCCTTTCCTGAAAC
AGTCATCAGAAAATCAAACAACATCGGCATATGCCATATATTCTTGGGAT
AAACAGTGGACTAACGGTGTTGTTTAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTAT
CCAGGTATGTGAAAACAAACGCCTAGGCACGCCTCTGTCGAGAGTTGCCA
CTCCACACCGATGAGCAATCCCACTGATCTTTGTTTGTTGATGCCAGGCC
GACGGTTACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATT
CAGCACCTTCTTTTCCGAGACTGGTACGTTCCCATAGCCTTTCCCCCCGT
GTATCCCGCTCCTCCGTTTGCCCGCAGCACACCCTAACATGAAATTGGGC
TATAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGGAAC
CCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTCCAC
CCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGCCCG
TGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACAAGG
TCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTCTTC
CACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGATGGA
GCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCGTTT
ACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCTATC
CTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGTTGA
CAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGCGCC
CTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCCATC
ACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGAGTT
CCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGGCCT
ACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCCGTC
AGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAAGTG
TGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTGGTG
ATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACTAAG
CGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGGTAT
CTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACCTCA
AGCGCGCTGTGTAAGTTCTTCTCCATCTGATATGCGACGTTTTCAAGACA
TAAGAAAGCTAACGGAAGGTCAAATGTAGCTGCATGCTGTCCAACACCAC
CGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGT
ACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAG
GGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTA
CGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACT
AGATCTGACCGAATTTTGGACCGGAGTCGCGCGGGGGGTCCGGCCGGGCC
GTCCGGGTGGAAGCCGTGGCTCGCCCTGAAGCAATGGGAATTGTTCCGTT
GGGGACAGGCGTTGGCCAAGGTTGTATACCCAAATGAGCAGCGGGACTCT
GGCTGCATGCAAATAGGAAGGAGAAGCTTGGCTCCGTAGTACAGACTATG
TTTTCTTTTTGTCTGAGTATATTTTTCTAATATCCCTGAAGCAGCGATGA
AATTTACCCGCTCGTTCGAAACTCATATGCAAAATTTTTTTGGGCGCCTA
AGAGAATTGTAATCTACATTTTGCAAGTTTCGAGCGATTTGATGATTATC
CCTGTAGTGGTAAAACAAACAGGAATTGACGATGAGCGGGGATGAACAGG
CTGTTACTAGTACTCCCCCAT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851927.1:156123..158443- >M747DRAFT_297578-T1 ID=M747DRAFT_297578-T1|Name=M747DRAFT_297578-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=8082bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851927.1:156123..158443- (Aspergillus niger ATCC 13496) CTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCG ACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTAC GTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCT GGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGG AGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCA TTTACTGCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACC TACCGCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGC CTCGAACAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCG ACCAGGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTC CAGGGTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTT CGGTGCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCA AGCTGGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTT GAGCCCTACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGA CTGCAGCTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCA ACCTCGGCATCGAGCGCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCC CAGGTTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAA CGTCGATCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTC ACTTCCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCC CACGAGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAA TAACCAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTT GCCTGCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTG GCCACCCTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTAC TGGTTTCAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACG GCGACCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGG AGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTTTCCGAG ACTGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCA GATTGCCAACTCCTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTG CATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACC ACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTT GGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGC TGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGG AGGTTGAGGCCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTT ACTGCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTAC CGCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTC GAACAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACC AGGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAG GGTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGG TGCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGC TGGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAG CCCTACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTG CAGCTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACC TCGGCATCGAGCGCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAG GTTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGT CGATCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACT TCCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCAC GAGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAA CCAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCC TGCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCC ACCCTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGG TTTCAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCG ACCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGC 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TCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCC CTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAG TCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCA GATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGC TGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACC CTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTT CAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACC TTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGCGCA AGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTTTCCGAGACTGCT CTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGC CAACTCCTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTGCATGCT GTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGT TCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAG GGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCT TGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTG AGGCCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCG ATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGT CTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAA CTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCC TCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTC CTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCT CCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAAT TCTGCGTTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTAC AACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTT CATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCA TCGAGCGCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTC TCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCT CAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTC TGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCC AACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGAT GGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGT ACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTG AAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAA GATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTG CCAACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGCGCAAGA AGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTTTCCGAGACTGCTCTA CTGCCTTGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAA CTCCTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTGCATGCTGTC CAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCG ACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGT ATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGA GCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGG CCGAGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATC TGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTT TTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTA TGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCG ACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTG GTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCT GATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCT GCGTTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAAC TCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCAT GGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCG AGCGCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCT TCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAA CGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGG TGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAAC TCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGT CAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACC GTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAG ACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGAT CGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCA ACCTCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGG ATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTTTCCGAGACTGCTCTACTG CCTTGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTC CTGCTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGCTGCATGCTGTCCAA CACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACC TCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATG GAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCG CGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCG AGTACTAGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGG AACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTC CACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGC CCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACA AGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTC TTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGAT GGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCG TTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCT ATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGT TGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGC GCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCC ATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGA GTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGG CCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCC GTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAA GTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTG GTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACT AAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGG TATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACC TCAAGCGCGCTGTGCCGACGGTTACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATG ACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTTTCCGAGACTGCTCTACTGCCT TGAGCACGGTATCCAGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTG CTGGGAGATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0005874 | microtubule |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003924 | GTPase activity |
GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton |
GO:0005525 | GTP binding |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0007017 | microtubule-based process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR008280 |
DBxref | InterPro:IPR017975 |
DBxref | InterPro:IPR037103 |
DBxref | InterPro:IPR023123 |
DBxref | InterPro:IPR036525 |
DBxref | InterPro:IPR018316 |
DBxref | InterPro:IPR003008 |
DBxref | InterPro:IPR002452 |
DBxref | InterPro:IPR000217 |
DBxref | PFAM:PF03953 |
DBxref | PFAM:PF00091 |
Product | tubulin alpha-1 subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851927.1 | supercontig | KZ851927.1:156123..158443 - |
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