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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851920.1:14816..16994- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_323895-T1 ID=M747DRAFT_323895-T1|Name=M747DRAFT_323895-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2179bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851920.1:14816..16994- (Aspergillus niger ATCC 13496)
CGGCACTGAACTGCCTGAACTGAACTTACTCCGTAGTTACTACTAACTGC
TTCCCAACCCCGTCCAGCCTACCGCTCTCTGGACGTCATCTCCCATGCTC
CTTTTGTTTTTACCCCTCCGGAATTGATTAATCTCTTGCAAACTCTCTCA
ATCTACATCCCTTCACCATGGCTGACATGCCCATTGGTATGTTTATGCGT
GTTCCCCCTCCTCTTCCTTACCTTCATCTTCCCTTACCCCCTCCCCGAGT
TCTCCTTGTCGGTGCCTGTCCCTCCCGTGCTTCCCAGCTAACCAACCACG
CCCCCCAGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTG
CGCAGGTCTGTCATCACCTCCCATCCCATTGCGTACTCTTACTTACCTCC
TCTTCTTCCCCATGGATAGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAG
TGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTC
AAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCA
AATCACCTACCCTGTACGTCATTTACATTCGCGTGCCTTCGTTCTCCCCC
CACCCCCGATCGCTCCATTGTCTCCCCGGAGGTGTGGCAGACGTGTTAAC
GTTGGGCCCGACTTGGTATACAGATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGG
GACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGAT
CGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCC
TGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTT
GGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGG
TAAGTCTTGCACGCTTCATATCCTCTCTCTTATCCCGCAGCTCTGATCGC
CCGCTCTTTCGCAATCCACAGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCC
GGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAA
CCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACC
TCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGAT
TTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGA
TCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGT
CCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTT
GAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCC
CGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATG
TGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATG
TACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCT
CACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACGTACGTATTCTCA
TTCACTGGCGGACCATACCGCCCCCCCCCCAGAAGAAATTAACAGCTAAT
TCCATGTTACAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAG
ACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTAAGCTTCT
TCACTTCTTCCCTCCTTCCCCTGTACACCCGTTTTCCTGTTCGCAAGTCA
CACCATAGCTAACATAATTACCTAGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGG
TTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTC
GGCCCTAGATAGTTTTTCTCTTTCATTCAGTACATACGTTGTATATTTCA
TTTCAACCTGACCTACCACCTATTACTACCTACCATCTATCGGGAGTTCT
TCGCCCTCCTTGCGAGTTGAACCAAAACGCCTCCATCTTACGCATTCCCC
GAGCAGCCTCTGTCCCCACCCCCTCCTTCCTTACCCAGATGCTCTATTCT
CATAGCTCCCGTCTTTTGTTCAAATACTACGTACATACTATTACAGGTTT
TTCTGGTGTGTCGGGGAGATCAAGTGAAGTAAGGTCCGGCTTGAAGTCAT
GTCATCTAGTATGTAAACAAAGAAGGGAT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851920.1:14816..16994- >M747DRAFT_323895-T1 ID=M747DRAFT_323895-T1|Name=M747DRAFT_323895-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=8169bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851920.1:14816..16994- (Aspergillus niger ATCC 13496)
ATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACA
GGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGC
GCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCC
GTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGAC
GGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCA
CATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCG
CCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAA
ACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGA
GTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACA
CCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCC
CCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTAT
CGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGTGCGCT
CCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCC
GGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACG
GGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGA
AGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAG
ATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCAT
GAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCT
ACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATAC
GCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCA
TATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATG
TGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCC
TTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGAT
GGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAG
CAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAG
ATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGG
TCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGG
TCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCC
ACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGT
CACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACC
GTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTAT
GTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGT
CCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCA
GCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGAT
GTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGC
TGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAG
GAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAG
CAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAT
GGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACT
ACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTC
TTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGA
GGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAG
CTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTC
GATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTG
TCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATG
CTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTC
GGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGG
ACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTG
GCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCC
GCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGG
TCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTA
TCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGAT
GTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCG
CGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCA
AGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTC
TCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCG
CGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCC
AGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTC
AACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGC
TATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGT
TGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAAC
CCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACAT
GCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTA
CGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAAC
CGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGT
ATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCC
GAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGA
GCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTG
CTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAA
CTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATT
GATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAAC
AGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTG
CGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGC
CGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGA
CGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACC
ACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATC
GCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGA
AACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCG
AGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTAC
ACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGC
CCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTA
TCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGTGCGC
TCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCC
CGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACAC
GGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTG
AAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAA
GATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCA
TGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGC
TACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATA
CGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCC
ATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCAT
GTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACC
CTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGA
TGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAA
GCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTA
GATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATG
GTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTG
GTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATC
CACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATG
TCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAAC
CGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTA
TGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCG
TCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGC
AGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGA
TGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCG
CTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGA
GGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAA
GCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACA
TGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAAC
TACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCT
CTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTG
AGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAA
GCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCT
CGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATT
GTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTAT
GCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGT
CGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCATTGATTGCCGACAAGGAG
GACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCT
GGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCC
CGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTG
GTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATT
ATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGA
TGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTC
GCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATC
AAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCT
CTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTC
GCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTC
CAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTT
CAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGG
CTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGG
TTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAA
CCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACA
TGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCT
ACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAA
CCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTG
TATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGAACTTCCC
CGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGG
AGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCT
GCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTTGCTCGACGGAGGA
ACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGATGGCTGACATGCCCAT
TGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAA
CAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGAAGTTCAAGGT
GCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTG
CCGTCCTCGCCAACCTGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTG
ACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCAC
CACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCAT
CGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCG
AAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTC
GAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTA
CACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAG
CCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGT
ATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGTGCG
CTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACC
CCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACA
CGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACATGGAGAATGGTATCGT
GAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGA
AGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCC
ATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGG
CTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTAT
ACGCTCAGGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCC
CATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCA
TGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTAC
CCTTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAG
ATGGCTGACATGCCCATTG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | BUSCO:EOG09262MEK |
| DBxref | InterPro:IPR020902 |
| DBxref | InterPro:IPR004000 |
| DBxref | PFAM:PF00022 |
| Product | actin nucleation center |
| Product | Arp2/3 complex subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| KZ851920.1 | supercontig | KZ851920.1:14816..16994 - |
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