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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851921.1:161071..163290+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_332546-T1 ID=M747DRAFT_332546-T1|Name=M747DRAFT_332546-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2220bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851921.1:161071..163290+ (Aspergillus niger ATCC 13496)
GTACGGCTCACTATGGGTCTGCGTAGCTTAGTGGAGCTCTCCCTCCTCCT
CCTTCTCCTCCTCCTCTCCAGTTAGTTCAGTTCGGGGGATAAGAGATTGT
CGGCCAACATGCATGCTTGCCACAACCGACAGGCCTGTCGTTCTTCGAGA
AAGTAGATAACCCCCCTTCTTCCCCCCGTCTTCTCCGCGTTGGCTCCAGT
CTTGTTTTTTATTTTTCTCTCTTGTGTCACATCACAACTCCTCCTCCTTT
CGACCAAGACAACAACAAAAGGAGCAACGCGACAGGAGTCCCTTTTCTTG
GAGAGAAGTGAGCGAGTCAACTTAAGTGTTCGATCGCTCCCCAGATTCAT
TGACCATTGTTCTCATCCATTGGTCATTTTATATATCAACAATACTCTTT
TCTATTTCAGCCTACCGTCTCGGTATAGCATCTTTTCACAATGGCGCCGA
CCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCCCTGGCCGTCTCGACGATT
GCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGATCGTGAGCCTCCCTCGCC
GCTATCCCCGATCTAGTCATCGGAATCACATGCTAATTTGAACGTCCAGA
GGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCTTCA
CCGCGACCAAGAACAATTCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTTTAT
GAGTTAGGTTCGTTGCAACGCCCCTCCTGAGTTACAATGCGCGCGCCCCC
CCAATTCTAACGCGTCTCGTCGCATAGGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTC
GCTCTCTTCTTCGGTGACAAGACTGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGG
TGCCATTGTCATGATTATTGGTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCG
GACACATCCCGCTTCTGCAGTTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATC
GGTAACGGCATGAACACCTCGACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTC
CAAGACCAGCAACCGTGGTCTGCTCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCG
CCATCGGAACTGCGATTGCCTACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGT
AACAAGGACCTGGTGTGGCGTTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGG
TCTCATCATCATCGTCGGCATGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACC
TCATCTCCAAGGACCGCGTCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTG
GGTGGCTGGGAGATCCATGACCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGT
CATTGATTCCATTAGAGCGTAAGTTTGCCGGATAATACCTGGATAACGCG
TGGCACCAGATGCTAACAGTTCTGTGCAGTTCGAACGCCGCTGGCAAGGA
TGTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTC
GTATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGC
AACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGA
GACTGAGAACTTCTCCCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACG
CTATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGC
AAGCTCTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCAC
CTTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACCGCCAAGGGTGCTGTCT
TCGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTG
CCCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGC
CAACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCA
TGATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTC
TTCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCC
CGAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGG
GTTACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAG
CTCACCGACGACGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGG
TGCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACA
GCGCCCGCGAGTCGGAGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851921.1:161071..163290+ >M747DRAFT_332546-T1 ID=M747DRAFT_332546-T1|Name=M747DRAFT_332546-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=6336bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851921.1:161071..163290+ (Aspergillus niger ATCC 13496)
ATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCCCTGGCCGT
CTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGATCAGGGTG
TCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCTTCACCGCG
ACCAAGAACAATTCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTTTATGAGTT
AGGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGACAAGACTG
GACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATTATTGGTGTC
GTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGCAGTTCTT
CATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACCTCGACTA
TCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGGTCTGCTC
ATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTGCGATTGCCTACTG
GATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGGCGTTTCC
CCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGGCATGTGG
TTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCGTCCAGGA
GGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCATGACCACG
AGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGATTCCATTAGAGCTTCGAAC
GCCGCTGGCAAGGATGTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTC
CCAGCACTTCCGTCGTATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGC
AACTCGGTGGTTGCAACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAG
GACTCCCTTCACGAGACTGAGAACTTCTCCCTGGTCATTGGTGGTGTCAA
CATGATTGTCTACGCTATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAA
AGATCGGTCGTCGCAAGCTCTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATT
GCCATGGTTATCACCTTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACCGC
CAAGGGTGCTGTCTTCGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCG
CTTGGTTGCCTCTGCCCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAG
ACCCGTGCCAAGGCCAACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAA
CTTCCTGATTGTCATGATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGG
GTACTTACCTGTTCTTCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATC
TGGTTCTTCTACCCCGAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATAT
CATCTTCGCCAAGGGTTACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCC
ACGAGCTGCCCAAGCTCACCGACGACGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAG
TACGGCTTCGGAGGTGCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGT
CTCGGGCTCCAACAGCGCCCGCGAGTCGGAGTAAATGGCGCCGACCTACG
CTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCCCTGGCCGTCTCGACGATTGCGACG
ATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGATCAGGGTGTCATGTCCGGTATTAT
CAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCTTCACCGCGACCAAGAACAATTCAA
CCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTTTATGAGTTAGGTTGTCTTGTGGGT
GCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGACAAGACTGGACGTAAATGGATGAT
CTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATTATTGGTGTCGTCATCCAGGTTACCT
CGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGCAGTTCTTCATTGGTCGTGTCATC
ACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACCTCGACTATCCCGACCTACCAGGC
CGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGGTCTGCTCATCTGTATTGAGGGTG
GTATCATCGCCATCGGAACTGCGATTGCCTACTGGATTGACTATGGTGCC
CACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGGCGTTTCCCCATTGCCTTCCAGAT
CTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGGCATGTGGTTCCTTCCCGACTCTC
CCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCGTCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTT
GCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCATGACCACGAGACCCAGCTCCAGAA
GCAGCTGGTCATTGATTCCATTAGAGCTTCGAACGCCGCTGGCAAGGATG
TCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGT
ATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAA
CGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAGA
CTGAGAACTTCTCCCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACGCT
ATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAA
GCTCTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCACCT
TTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACCGCCAAGGGTGCTGTCTTC
GGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCC
CTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCCA
ACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCATG
ATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCTT
CGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCCG
AGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGGGT
TACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCT
CACCGACGACGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGTG
CCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGC
GCCCGCGAGTCGGAGTAAATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAG
GAAACTGTCCCTGGCCGTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGT
TCGGTTATGATCAGGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTC
GAAGACCTCTTCACCGCGACCAAGAACAATTCAACCATGCAAGCCTTGGT
TACATCCGTTTATGAGTTAGGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCT
TCTTCGGTGACAAGACTGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTGCCATT
GTCATGATTATTGGTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACAT
CCCGCTTCTGCAGTTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACG
GCATGAACACCTCGACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACC
AGCAACCGTGGTCTGCTCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCCATCGG
AACTGCGATTGCCTACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGG
ACCTGGTGTGGCGTTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATC
ATCATCGTCGGCATGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTC
CAAGGACCGCGTCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCT
GGGAGATCCATGACCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGAT
TCCATTAGAGCTTCGAACGCCGCTGGCAAGGATGTCGGATACCGTGACCT
TCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGTATGGTTATCGGTTCCT
CCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAACGCTGTCATCTACTAT
CTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAGACTGAGAACTTCTCCCT
GGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACGCTATCTTTGCCACTTTCT
CCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAAGCTCTTCCTGGGTGGA
TCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCACCTTTGCCTGTTTGATCCC
TGGTGACCAGGAGACCGCCAAGGGTGCTGTCTTCGGTCTGTTCCTCTACA
TGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCCCTGGTTGTACCCTGCT
GAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCCAACGCTGTCTCGACCTG
CAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCATGATCACCCCCGTCATGG
TCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCTTCGCCGTCCTCAACGGC
CTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCCGAGACCGCCAACCGCAG
TCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGGGTTACACCGAGAACATCA
GCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCTCACCGACGACGAAGTC
GAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGTGCCAGCGACGAGGAGAA
GGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGCGCCCGCGAGTCGGAGT
AAATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCCCTGGCC
GTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGATCAGGG
TGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCTTCACCG
CGACCAAGAACAATTCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTTTATGAG
TTAGGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGACAAGAC
TGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATTATTGGTG
TCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGCAGTTC
TTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACCTCGAC
TATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGGTCTGC
TCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTGCGATTGCCTAC
TGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGGCGTTT
CCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGGCATGT
GGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCGTCCAG
GAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCATGACCA
CGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGATTCCATTAGAGCTTCGA
ACGCCGCTGGCAAGGATGTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGC
TCCCAGCACTTCCGTCGTATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCA
GCAACTCGGTGGTTGCAACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCC
AGGACTCCCTTCACGAGACTGAGAACTTCTCCCTGGTCATTGGTGGTGTC
AACATGATTGTCTACGCTATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGA
AAAGATCGGTCGTCGCAAGCTCTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCA
TTGCCATGGTTATCACCTTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACC
GCCAAGGGTGCTGTCTTCGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGC
CGCTTGGTTGCCTCTGCCCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCA
AGACCCGTGCCAAGGCCAACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTC
AACTTCCTGATTGTCATGATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTG
GGGTACTTACCTGTTCTTCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCA
TCTGGTTCTTCTACCCCGAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGAT
ATCATCTTCGCCAAGGGTTACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGC
CCACGAGCTGCCCAAGCTCACCGACGACGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGG
AGTACGGCTTCGGAGGTGCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAG
GTCTCGGGCTCCAACAGCGCCCGCGAGTCGGAGTAA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016021 | integral component of membrane |
| GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | EggNog:ENOG41 |
| DBxref | InterPro:IPR036259 |
| DBxref | InterPro:IPR020846 |
| DBxref | InterPro:IPR005829 |
| DBxref | InterPro:IPR005828 |
| DBxref | InterPro:IPR003663 |
| DBxref | PFAM:PF00083 |
| DBxref | PFAM:PF07690 |
| Product | general substrate transporter |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| KZ851921.1 | supercontig | KZ851921.1:161071..163290 + |
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