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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851906.1:277220..279147- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_368390-T1 ID=M747DRAFT_368390-T1|Name=M747DRAFT_368390-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=1928bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851906.1:277220..279147- (Aspergillus niger ATCC 13496)
GCTCTGGGAGGTGCAACAGTCACAATGAGCGGACGTGAGTCTTGCACGCG
ATCGCTGCCATCTCCGCGACAGCGTTCCATCCTTTACCTCAATGGATCAG
CAAATGCTGATACTCGATTCTAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCT
TCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTC
AACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGGTACGTGATACTTGTCCAGCTCGACA
TGAGCTTCTAAGCTAATGGATTACCCCTGCAGTTGACCCTATTGATCTTC
CTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTC
CGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCC
TGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAG
GTATGTAATGGGGAAATTGCAATCTGATCACGGATATCGGGCATTTGCTA
ATATGTGGCTTTTGTCTGATAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATG
TCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAG
CTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCAC
TGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGC
TGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAG
CTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGC
GACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCA
TCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTC
CACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTT
CTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCG
TTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTC
AAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTT
CTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACA
TCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTT
GTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCA
CGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGG
AGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTG
GTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGC
TCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTG
GTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACT
GCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGA
CCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACGT
AAGTCTTCACTTTGGTCTCAGATTTTCTGAAGTGGATACTAACATTCAAA
TGCAGGATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACAT
TGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGATAAGGCCCCCTT
TTTGATGAAAGCATGAGAAGAAGTTTGAGGGCTTATGTTTGTTCTTGCAA
CTTTCTGTTTCTTCTCAGGTAGTGTGCTGTTGTGGCTGGGATCTGGATTA
TTTAGTTTCTTGATGGATGTATGGCTAGTTTTAACAATTTGCAGGAGGGG
AAGATCTTCTCTACGGAGATACGTCCAC back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851906.1:277220..279147- >M747DRAFT_368390-T1 ID=M747DRAFT_368390-T1|Name=M747DRAFT_368390-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=7185bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851906.1:277220..279147- (Aspergillus niger ATCC 13496)
GATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGAT
CGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCAC
CTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGAC
CGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCT
ACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATC
TGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCT
GCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTC
TGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCT
CCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCAT
TGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCC
GCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCT
ACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGA
GATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTG
TTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTG
TGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGA
CAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTG
CCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTG
AACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCAC
CTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTT
CCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTC
GTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGT
CATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCG
TCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTT
GCCGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTG
TACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTAT
GATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCA
TCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGC
CCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCC
TTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGATTATATACGGA
TACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGG
CCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCA
ACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTC
TTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGG
TCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGA
TTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTG
CTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGAC
CAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCA
ACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCAC
CTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTA
CCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTT
TCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAG
TCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTA
CACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCT
TCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTC
AAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGC
CGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGG
CCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTT
GCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCC
CCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTC
ACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCT
GCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCT
GCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACTTGAC
CCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCT
CCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGT
AACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGG
CATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCT
CCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGT
TGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGATTATATACGGATACTTTGAAATTG
CCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGT
AACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAA
GACCGACCGTGAACTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCC
TGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAG
CCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGT
CGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCT
ATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAG
TCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGG
TCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCT
GGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTC
CCCAACATCATGAACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGAT
CTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGC
GTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATG
CCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCA
GATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTG
TTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATT
GCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCC
CATTCACACCGCCGTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCT
TCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCC
AAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAG
CATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTG
GTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTT
GGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGCCGTTACTTGACCCTATTGATCTTC
CTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTC
CGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCC
TGATGGAACTGGGTATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAG
TCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTG
GCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGG
GATGAGCGGACGATTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGG
CGACATTGGATCGGGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCG
CTGGTACCCACCTCATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAA
CTGTATCAGACCGCTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCA
GGCCTGCGTCTACGTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTG
GTGCCGGTATCTGTGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTG
GTTGTCATCCTGCTGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAG
CGGTATCTCTCTGTTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGA
AGGCTTTCTCTCCTACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAG
GGTGCCATCATTGCCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCA
GCGCGCTCTCCGCGAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGA
ACCTGCTGGCTACTCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGC
TTCCGTGTTGAGATCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGG
TTCCTACCCTGTTCGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTC
AGTCTGCTCTGTGCTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCT
CGCTTCTCTGACAACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCG
TGAGGGTTCTGCCCAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGT
CTCCTCCCCTGAACTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCC
GTTTACATCACCTTCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTG
GATTGAGGTTTCCGGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGG
ACCAGGGTCTCGTGATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAG
CTCAAGCGCGTCATCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGG
TGCCCTGTCCGTCGCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTG
GTATCCTCCTTGCCGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCC
AGATGCCCTTGTACGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTAC
TGGCTCCGTATGATGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGG
TATCACCCCCATCATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGA
TCTCATCAAGCCCTTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAA
CCAAGGTTCCCTTCAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGACGA
TTATATACGGATACTTTGAAATTGCCGCCCGTGAGGGCGACATTGGATCG
GGCCTCAAGGGCCTTGTTCCGGGTAACTAGCTTCTCGCTGGTACCCACCT
CATCGATGTCAACCTGGACCTGAAGACCGACCGTGAACTGTATCAGACCG
CTCAGAAGCTCTTCGCTATCATCCTGTCCTTCGGTCAGGCCTGCGTCTAC
GTCCTCACTGGTCTTTACGGCCAGCCCAGTGACCTTGGTGCCGGTATCTG
TGTTCTGCTGATTGTTCAGCTGGTCGTTGCTGGCTTGGTTGTCATCCTGC
TGGATGAGCTGCTCCAGAAGGGCTATGGTCTTGGTAGCGGTATCTCTCTG
TTCATCGCGACCAACATCTGCGAGTCGATCGTCTGGAAGGCTTTCTCTCC
TACGACCATCAACACTGGCCGTGGTCCCGAGTTTGAGGGTGCCATCATTG
CCCTCTTCCACCTTCTGTTGACCTGGTCCGACAAGCAGCGCGCTCTCCGC
GAGGCTTTCTACCGCCAGAACCTCCCCAACATCATGAACCTGCTGGCTAC
TCTCCTCGTTTTCGCCGCTGTGATCTACCTCCAGGGCTTCCGTGTTGAGA
TCCCTGTCAAGTCCTCCCGCCAGCGTGGCATGCGTGGTTCCTACCCTGTT
CGCCTGTTCTACACCTCCAACATGCCCATCATGCTTCAGTCTGCTCTGTG
CTCCAACATCTTCCTCATCAGTCAGATGCTGTACTCTCGCTTCTCTGACA
ACCTCCTTGTCAAGCTTCTCGGTGTTTGGGAGCCTCGTGAGGGTTCTGCC
CAGCTCCACGCCGCCTCCGGCATTGCCTACTACATGTCTCCTCCCCTGAA
CTTCAAGGAGGCCCTTCTTGACCCCATTCACACCGCCGTTTACATCACCT
TCATGCTGGTTGCTTGTGCTCTCTTCTCCAAGACCTGGATTGAGGTTTCC
GGCTCTGCTCCCCGCGATGTTGCCAAGCAGCTCAAGGACCAGGGTCTCGT
GATGGCTGGTCACCGTGAGCAGAGCATGTACAAGGAGCTCAAGCGCGTCA
TCCCTACTGCTGCTGCTTTCGGTGGTGCCTGCATTGGTGCCCTGTCCGTC
GCTTCTGACCTGCTTGGTGCTCTTGGCAGCGGTACTGGTATCCTCCTTGC
CGTTACTTGACCCTATTGATCTTCCTGGTCATGAGCCAGATGCCCTTGTA
CGGAATTGTCTCCTCTGACACCTCCGACCCTCTGTACTGGCTCCGTATGA
TGTTGGCCAGTAACCGGGGTACCCTGATGGAACTGGGTATCACCCCCATC
ATCTCCTCTGGCATGGTTTTCCAGTCCGGTTTCTCGATCTCATCAAGCCC
TTCACGCCCCTCCTCCCGGAGGTGGCCGCCCCGGAAACCAAGGTTCCCTT
CAACCAGAAGTTGATGTGGACGGGGATGAGCGGAC back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0015031 | protein transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | BUSCO:EOG092620E4 |
| DBxref | InterPro:IPR030659 |
| DBxref | InterPro:IPR019561 |
| DBxref | InterPro:IPR002208 |
| DBxref | InterPro:IPR023201 |
| DBxref | PFAM:PF00344 |
| DBxref | PFAM:PF10559 |
| Product | translocon subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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| KZ851906.1 | supercontig | KZ851906.1:277220..279147 - |
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