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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851900.1:860139..862149- Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_54283-T1 ID=M747DRAFT_54283-T1|Name=M747DRAFT_54283-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2011bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851900.1:860139..862149- (Aspergillus niger ATCC 13496) CTCCCCCGGGTCTGTCAGCCCTTTGGATGTCTTTCTCTCCCATCAATCTT
CTCTTTTTCCCATCTTCCCATCCCTGGCAGAGGATTCCGCGTTGTATGAA
TCCACCGGCAACATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCA
GGCGGACCACTCTGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACTCCTGCTCGCTCCA
ACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAG
TACTTGACCTGGCGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGG
TTTCATCTTCGGTTACTCTACTGGTATGGTGACATCGATTCTCTGCAGCT
AGTCCCCTCGGTTGCTAACCTTTTCCACCACCAGGTCAAATCTCTGGTTT
CGAGACTATGGATGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATG
GATCCTATGCTTTCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGGTA
AGTGGCATACATCATGGACTGTCCCTAGAGACCAACCCGACTGACAATCT
CTTCAGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTAT
CGCAGACCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCC
ACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCAG
GTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAG
CATTGTCCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTG
CCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTCC
TACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCG
TATCACCATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCT
CTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTATC
GATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCA
CCGCGTCATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGG
AGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCGC
ATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCT
GACCGGTGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCA
CTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAAC
TTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCG
TAACAGTCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCT
GGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCACT
CCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGG
TTTCGCCACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGT
ACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAAC
TGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTC
CATTGACTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCA
TCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGAG
GAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAG
CTGGGTTCCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCCTTCCT
CTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAGATGGCTGAGCACACCGAGCCCACT
GAGCTCCGCGAGTAAGCCACTCGCACTCGCGCGAACTCATTTTGCTAGTT
GCTCTTGTACATTGAACCTGCATCTTAAGCTTTGATTTATTTAATTGCAT
GATTGCTCTTT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851900.1:860139..862149- >M747DRAFT_54283-T1 ID=M747DRAFT_54283-T1|Name=M747DRAFT_54283-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=5049bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851900.1:860139..862149- (Aspergillus niger ATCC 13496) CTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGA CCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCCACATCG TCGGTATCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCT ATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGT CCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGG TCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTCCTACATC ATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCGTATCAC CATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCT TCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTATCGATGAG GCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGT CATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGG CCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTC TACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGG TGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCACTGGTC TGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGT ATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAG TCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCTGGGCTT CCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCC GCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGC CACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGTACCCCG CCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAACTGGACC TGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGA CTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCG TTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTT GACACCATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGT TCCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGCCCCCCTTCCTCTTCCA AGCAGGAGGGTCAGGCTGAGATGGCTGAGCACACCGAGCCCACTGAGCTC CGCGAGTAAGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACTATGGATGACTTCCTCCAA CGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTCCG TAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGT TCAAGCCTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACTCCT GCTCGCTCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAG TCCCGTCAAGTACTTGACCTGGCGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGT CCATGGGTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTACTGCTGTGTATCGGTACTAT GATCGGTGCCCTGGTTGCTGCTCCTATCGCAGACCGCATGGGCCGCAAGC TCTCCATCTGTCTCTGGTCTGTCATCCACATCGTCGGTATCATCATTCAG ATTGCCACCGACTCCAACTGGGTCCAGGTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGC CGGTCTGGGTGTTGGTGCCCTCTCCAGCATTGTCCCCATGTACCAGAGTG AATCTGCTCCCCGTCAGGTCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTG TTCGTTGCCTTCGGTATCTTCATCTCCTACATCATCAACTTCGGTACCGA GAGAATCCAGTCGACTGCTTCCTGGCGTATCACCATGGGCATTGGCTTCG CCTGGCCCTTGATTCTGGCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCT CGTTTCGCCTACCGTCAGGGTCGTATCGATGAGGCCCGTGAGGTTATGTG CAAGCTGTACGGTGTCAGCCCGAACCACCGCGTCATCGCCCAGGAGATGA AGGACATGAAGGACAAGCTCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCC TGGCACGAGCTGTTCACCGGCCCTCGCATGCTCTACCGTACCCTGCTCGG TATTGCTCTGCAGTCCCTCCAGCAGCTGACCGGTGCCAACTTTATCTTCT ACTACGGAAACAGTATCTTCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTC ACTCAGATCATTCTGGGTGCTGTCAACTTCGGTATGACCCTGCCCGGTCT GTACGTCGTCGAGCACTTCGGTCGTCGTAACAGTCTGATGGTTGGTGCTG CCTGGATGTTCATTTGCTTCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCT CTGGATCTTGCCGACCCTCAGGCCACTCCTGCCGCTGGTAAGGCCATGAT CATCTTCACTTGCTTCTTCATTGTCGGTTTCGCCACCACCTGGGGTCCTA TCGTCTGGGCCATCTGTGGTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTC TGCATTGGTATTGCCACCGCTGCCAACTGGACCTGGAACTTCCTCATCTC CTTCTTCACCCCCTTCATCTCTAGCTCCATTGACTTCGCCTACGGCTACG TCTTTGCTGGATGCTGTTTCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTC AATGAGACCCAGGGTCGCACTCTTGAGGAGGTTGACACCATGTACGTGCT CCACGTCAAGCCCTGGCAGAGTGCCAGCTGGGTTCCCCCGGAGGGCATTG TCCAGGACATGCACCGCCCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCT GAGATGGCTGAGCACACCGAGCCCACTGAGCTCCGCGAGTAAGTCAAATC TCTGGTTTCGAGACTATGGATGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACA GGCGGATGGATCCTATGCTTTCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCATTGTCG GTCTGATGGGTGTCTCTAATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGAC CACTCTGAGTCCTCCACTGAGGCTCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGC CGTCGAGAAGGACAATGTCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGA CCTGGCGCTCCTTCATCCTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATC TTCGGTTACTCTACTGCTGTGTATCGGTACTATGATCGGTGCCCTGGTTG CTGCTCCTATCGCAGACCGCATGGGCCGCAAGCTCTCCATCTGTCTCTGG TCTGTCATCCACATCGTCGGTATCATCATTCAGATTGCCACCGACTCCAA CTGGGTCCAGGTCGCTATGGGTCGTTGGGTTGCCGGTCTGGGTGTTGGTG CCCTCTCCAGCATTGTCCCCATGTACCAGAGTGAATCTGCTCCCCGTCAG GTCCGTGGTGCCATGGTCAGTGCCTTCCAGCTGTTCGTTGCCTTCGGTAT CTTCATCTCCTACATCATCAACTTCGGTACCGAGAGAATCCAGTCGACTG CTTCCTGGCGTATCACCATGGGCATTGGCTTCGCCTGGCCCTTGATTCTG GCTGTTGGCTCTCTCTTCCTGCCCGAGTCTCCTCGTTTCGCCTACCGTCA GGGTCGTATCGATGAGGCCCGTGAGGTTATGTGCAAGCTGTACGGTGTCA GCCCGAACCACCGCGTCATCGCCCAGGAGATGAAGGACATGAAGGACAAG CTCGACGAGGAGAAGGCCGCCGGTCAGGCTGCCTGGCACGAGCTGTTCAC CGGCCCTCGCATGCTCTACCGTACCCTGCTCGGTATTGCTCTGCAGTCCC TCCAGCAGCTGACCGGTGCCAACTTTATCTTCTACTACGGAAACAGTATC TTCACCTCCACTGGTCTGAGCAACAGCTACGTCACTCAGATCATTCTGGG TGCTGTCAACTTCGGTATGACCCTGCCCGGTCTGTACGTCGTCGAGCACT TCGGTCGTCGTAACAGTCTGATGGTTGGTGCTGCCTGGATGTTCATTTGC TTCATGATCTGGGCTTCCGTTGGTCACTTCGCTCTGGATCTTGCCGACCC TCAGGCCACTCCTGCCGCTGGTAAGGCCATGATCATCTTCACTTGCTTCT TCATTGTCGGTTTCGCCACCACCTGGGGTCCTATCGTCTGGGCCATCTGT GGTGAGATGTACCCCGCCCGCTACCGTGCTCTCTGCATTGGTATTGCCAC CGCTGCCAACTGGACCTGGAACTTCCTCATCTCCTTCTTCACCCCCTTCA TCTCTAGCTCCATTGACTTCGCCTACGGCTACGTCTTTGCTGGATGCTGT TTCGCCGCCATCTTCGTTGTCTTCTTCTTCGTCAATGAGACCCAGGGTCG CACTCTTGAGGAGGTTGACACCATGTACGTGCTCCACGTCAAGCCCTGGC AGAGTGCCAGCTGGGTTCCCCCGGAGGGCATTGTCCAGGACATGCACCGC CCCCCTTCCTCTTCCAAGCAGGAGGGTCAGGCTGAGATGGCTGAGCACAC CGAGCCCACTGAGCTCCGCGAGTAAGTCAAATCTCTGGTTTCGAGACTAT GGATGACTTCCTCCAACGTTTCGGTCAGGAACAGGCGGATGGATCCTATG CTTTCAGCAACGTCCGTAGTGGTCTCATTGTCGGTCTGATGGGTGTCTCT AATATGATGTCCCGGTTCAAGCCTCAGGCGGACCACTCTGAGTCCTCCAC TGAGGCTCCTACTCCTGCTCGCTCCAACTCCGCCGTCGAGAAGGACAATG TCTTGCTCGATGACAGTCCCGTCAAGTACTTGACCTGGCGCTCCTTCATC CTGGGTATCGTCGTGTCCATGGGTGGTTTCATCTTCGGTTACTCTACTG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016021 | integral component of membrane |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR036259 |
DBxref | InterPro:IPR020846 |
DBxref | InterPro:IPR005829 |
DBxref | InterPro:IPR005828 |
DBxref | InterPro:IPR003663 |
DBxref | PFAM:PF00083 |
DBxref | PFAM:PF07690 |
Product | general substrate transporter |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851900.1 | supercontig | KZ851900.1:860139..862149 - |
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