|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851919.1:470469..472631+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_63319-T1 ID=M747DRAFT_63319-T1|Name=M747DRAFT_63319-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2163bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851919.1:470469..472631+ (Aspergillus niger ATCC 13496) GTCTCTCCGTGCTCGCACTTGATTTCAACCTGTCGCACGTCGCAGAGATA
TAGTTCCCCTTATTTGGTTTTCCCGTCTGTAATATAGAAGCTCCCCCCCC
TCATGTGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTA
GTCTCCGTTGCGAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACAT
GGACATGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCA
CAGAGGCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACAC
GGCACCGCGATTGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTT
CATTCTGCCGACAGGTATAGCTCCATTTTATCTAACCCTCACAAAGACAC
AGAAAACTAACACTTTGCAATAACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGT
CACGTTTCGCATTGCCGTCGCAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTG
GGATTGCTTATTGGAATCATCTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGA
GAACAACGCTCATCACAAGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCG
CGCAGGTCATCATGTCGTTGATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCG
GAGTCGACTTCGTATGAACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGA
GATGGAGAGCCCCCAGATGTACTCTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCT
GGTCGCGCGACAGTGGACAGGGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCAC
AGTCGTCCTGGGTCGCCATCTTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGG
TTTCGAAAAGCCCGAGGATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCG
GGTGGTTCCGCATCCCCTTCGCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCT
CGTCTGGTCTCCACCAGAGCGCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGT
TATCGACAGAATCATCTTGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTG
GTGTGACTTATGGTGGTCTCATGGTAAGTTTCTAGGCAATAGACCGTTCT
AATGAATTCTGCTAACGCGCATTGGCAGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACG
GCCTCGCCCACTTCATCAAAGGAGGTATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTG
ACTCTGGGACGCATGCTTGGCTGCTGGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAA
CGTGAAGCCATCCAGTCCCATTGTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCA
CGGGTGAATTCACTGAATCATTCGTGATCTTCCTCTACGGCGTTACCAAC
GTCTTCTTGGAGCACCTCACCGGTTGGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGA
CCTTGAGCATGTGTCCATCTCCATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTG
GTATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGTCAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTT
CTTCAATACCCCTCCCACATGAGCGCACACACCTCAGCAGATACCGCATG
GCAGCTCCCTGACACCCAGGGTGTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGG
TCATCCTTCTGTTGGGTATGATGATGGGTTCGCACCACCAGGATAGTATG
GTATCGACCATGGTGCACAAGCAGTGGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGC
ACTGGCTCGTGGCATGACCTATGTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCT
CCTACCTTCCATCTCGCCCGCCAACCGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTG
ATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGCTTAGTGTAAGTCCAGCAAAGGAACC
GCGATTCATCCACAGGACATCTTAGCTGACTCATAGGACAGACCCGGAGC
GTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGACGCGATGTTTGTGTTCAC
AGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTCGTGCGAAATTCTCGCCA
TTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGCGCCCTGCGCTGCCG
CCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGATTTTATTCATGGCTTCCGTTCTG
CCGGAGTCCGTCTGACTCGATACGAGTGCTCTGACGACATCGGACAGATA
CGCAAAACGAACA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851919.1:470469..472631+ >M747DRAFT_63319-T1 ID=M747DRAFT_63319-T1|Name=M747DRAFT_63319-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=7188bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851919.1:470469..472631+ (Aspergillus niger ATCC 13496) ATGTGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGT CTCCGTTGCGAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGG ACATGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACA GAGGCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGG CACCGCGATTGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCA TTCTGCCGACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTG CCGTCGCAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGG AATCATCTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGAACAACGCTCATC ACAAGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATG TCGTTGATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTA TGAACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCC AGATGTACTCTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGT GGACAGGGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTC GCCATCTTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCG AGGATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATC CCCTTCGCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCAC CAGAGCGCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTATCGACAGAATCA TCTTGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGT GGTCTCATGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAA AGGAGGTATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTG GCTGCTGGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCC ATTGTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATC ATTCGTGATCTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCA CCGGTTGGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATC TCCATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAA GCGCGTCAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACA TGAGCGCACACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAG GGTGTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTAT GATGATGGGTTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACA AGCAGTGGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACC TATGTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCC GCCAACCGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCT TCATGCTTAGTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTC GACGCGATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCAT GTCGTGCGAAATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGG AGTCGCGCCCTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGAATG TGGCAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTC CGTTGCGAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACA TGGGTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACAGAG GCAAATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCAC CGCGATTGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTC TGCCGACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTGCCG TCGCAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAAT CATCTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGAACAACGCTCATCACA AGATTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATGTCG TTGATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGA ACGGGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCCAGA TGTACTCTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGTGGA CAGGGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCC ATCTTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCGAGG ATCCGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATCCCC TTCGCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAG AGCGCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTATCGACAGAATCATCT TGCCGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGTGGT CTCATGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAAAGG AGGTATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCT GCTGGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCCATT GTCGGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATCATT CGTGATCTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCG GTTGGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATCTCC ATCATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAAGCG CGTCAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGA GCGCACACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAGGGT GTATCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTATGAT GATGGGTTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGC AGTGGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACCTAT GTCATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCCGCC AACCGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCA TGCTTAGTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGAC GCGATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTC GTGCGAAATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGT CGCGCCCTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGAATGTGG CAGCGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTCCGT TGCGAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACATGG GTATGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACAGAGGCA AATGACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCACCGC GATTGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTCTGC CGACAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTGCCGTCG CAATTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAATCAT CTACAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGAACAACGCTCATCACAAGA TTGGCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATGTCGTTG ATCTTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGAACG GGCAGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCCAGATGT ACTCTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGTGGACAG GGCACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCCATC TTGTGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCGAGGATC CGCTCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATCCCCTTC GCCGACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAGAGC GCTTCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTATCGACAGAATCATCTTGC CGTTTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGTGGTCTC ATGAGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAAAGGAGG TATCTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCTGCT GGGCCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCCATTGTC GGTAAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATCATTCGT GATCTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCGGTT GGGGTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATCTCCATC ATGTTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGT CAAAGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGAGCG CACACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAGGGTGTA TCACTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTATGATGAT GGGTTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGCAGT GGGGTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACCTATGTC ATCATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCCGCCAAC CGAGATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGC TTAGTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGACGCG ATGTTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTCGTG CGAAATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGC GCCCTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGAATGTGGCAG CGAGCTTCCCGTGCCGCGCTTGCGGCAGCTTTCCTTCTAGTCTCCGTTGC GAATGCGCTTCCCCACGGAGACGACGAAGCGATGGACATGGACATGGGTA TGGATATGAGCCACAGCGAGTCCACCCAGGAATCGTCCACAGAGGCAAAT GACGACTCCCCCATGAGCTACTTCGCGTATGGGAAACACGGCACCGCGAT TGCGGTTCACATCGGTCTCATGATTCTCGCCTGGTGCTTCATTCTGCCGA CAGCGGTCATGTTCAGCGTCGCACGGTCACGTTTCGCATTGCCGTCGCAA TTCCTTTTCTTGGTATGCAACGCGGTGGGATTGCTTATTGGAATCATCTA CAACAGCCAGACCCCCGATCTGTATGAGAACAACGCTCATCACAAGATTG GCTGGATCGCAACCTGGGTCATGAGCGCGCAGGTCATCATGTCGTTGATC TTTGCCTATGCTGGCAGAGGCGAGTCGGAGTCGACTTCGTATGAACGGGC AGCGTTCCTTCCCGTTTCTACCGATGAGATGGAGAGCCCCCAGATGTACT CTGGTGGTATTCGCCATTCGTACCGCTGGTCGCGCGACAGTGGACAGGGC ACGGAGAGAAATTCCTCTTCCCTCCACAGTCGTCCTGGGTCGCCATCTTG TGCGTCGCCTTCGGATGAGTATGACGGTTTCGAAAAGCCCGAGGATCCGC TCCCCGAACCCTCGTCCCAACCGCGCGGGTGGTTCCGCATCCCCTTCGCC GACCGATTCCTTGCCAGCCGTGTACCTCGTCTGGTCTCCACCAGAGCGCT TCGCATTATCTCGACCATCTATGCTGTTATCGACAGAATCATCTTGCCGT TTGGCTTCGTTGCTATTGCGACAGGTGGTGTGACTTATGGTGGTCTCATG AGAGGCAAGGAGGTCTTCAACGGCCTCGCCCACTTCATCAAAGGAGGTAT CTTTTTCTGGTATGGTCTTCTGACTCTGGGACGCATGCTTGGCTGCTGGG CCGACCTGGGTTGGGCCTGGAACGTGAAGCCATCCAGTCCCATTGTCGGT AAATGTAAGGCGAAGATCCCCACGGGTGAATTCACTGAATCATTCGTGAT CTTCCTCTACGGCGTTACCAACGTCTTCTTGGAGCACCTCACCGGTTGGG GTGGCGCGTGGACTGCCACCGACCTTGAGCATGTGTCCATCTCCATCATG TTCTTCGGTGGTGGTCTCTGTGGTATGCTCTTCGAGTCGAAGCGCGTCAA AGGCTGGTTGAACAGTACAGTTCTTCAATACCCCTCCCACATGAGCGCAC ACACCTCAGCAGATACCGCATGGCAGCTCCCTGACACCCAGGGTGTATCA CTGAACCCTATGCCTGCGCTGGTCATCCTTCTGTTGGGTATGATGATGGG TTCGCACCACCAGGATAGTATGGTATCGACCATGGTGCACAAGCAGTGGG GTAACCTCCTTGTCGGCTTTGCACTGGCTCGTGGCATGACCTATGTCATC ATGTACCTCAAGCCTCCGACCTCCTACCTTCCATCTCGCCCGCCAACCGA GATCGTCGCTGCTTTCTGCTTGATTTCGGGTGGTTTGGTCTTCATGCTTA GTACCCGGAGCGTGATCCAAACCCTGGAGTACTATGACCTCGACGCGATG TTTGTGTTCACAGTCACTATGGGACTGACCGCCTTCATCATGTCGTGCGA AATTCTCGCCATTGCCTTGAAGGCCTGGGCGGTGAAGCGGGAGTCGCGCC CTGCGCTGCCGCCTTTCCAATTCCCGGCCTCCGCCTGA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | EggNog:ENOG41 |
Note | SECRETED:SignalP(1-22) |
DBxref | InterPro:IPR018825 |
DBxref | InterPro:IPR018827 |
DBxref | PFAM:PF10355 |
DBxref | PFAM:PF10348 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851919.1 | supercontig | KZ851919.1:470469..472631 + |
|