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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at KZ851921.1:256665..259593+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >M747DRAFT_69140-T1 ID=M747DRAFT_69140-T1|Name=M747DRAFT_69140-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=mRNA|length=2929bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851921.1:256665..259593+ (Aspergillus niger ATCC 13496) TTGACTTGACCAGCCGCGGGTAGATTAAGCTTCCCCGCATGAGGTTGGAC
ATACCCCTTTGATCCATAGCTTCCCTTAGCTCCATATTACCCCTCTCCCT
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ACCTAATCCTAGATGACCCGGGGGAAGAAACCCTATTGACCCGAGATTAG
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GCCAACGGGCCGATCACACGTGCTGATAATCTGCCGATTAGTCTTGGACG
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GGGCGGGGGGCCAGTATCATTGGGTAGCCGGTATGTTTTCCCGCAGTAAC
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CCAGCCTCGTTCGTATCCACTAACATGTCCCAGTATCCTGGCCAAAATGG
GTGCCTATCCTATCCTGGGTAACCGGATGGATTAATGTGGCGGGATGGGT
ATGTCTCCGAAGAAATGGCTCGATTATCGCTGACCCGCCAGGTTGCCCTT
GTCGCCACCAATGCGCTTCTTTCCTGCGAATTGATCGCTGGGATAGTGTC
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TTGATGCAATGCTGCTAGGACTTTGTTTGGCAGCGCTGGCAAGAGTTCCT
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ATTCAGTCCTGCCTATCATTTATCGTGGAGCATGTAAGTTACTGTGCGGC
AGCCATCTCACTCCGATCGGGTCATTAATTGAGACAGTCACCTGGTCCAT
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ATTACAATTCTGCTTAGTATGTCTGCCTCTGTGTCTTGGCTACACACCAT
GCTGACCATGCATATAGCTTTGTATTCTGCGACTTTGTCAATCAAACTGG
CTGTAAGTTGACTGGTGGAAACCTGTGGATATCGCAAGTCAAGCTAACAA
GCGACAGGGCCCGATGGAGTGGCTTGGTTACTGGGGGTTAGCCACATCTC
TTATACCGAAGTCTATCACGACGCTAACAGACGCAGCTGCTTCAAGGGGG
ACTTGGAGTTACCGCATTTGTAAGAATCCAGAATGCCAGTACTGATCCCA
GTCTAACATGAATAGGACGCGGTGGCTCATATGATCGAAGGTATCTTCTC
TAGTATGCAGCCTAAATAGTACATTACTAAACTCTCGAACAGAGATCCCC
CAACCCTCAATCAAAGGACCCAAGATCATGGTCGTCTGCGTCGGCATTGG
CACATTCACCGGGGCCGTCTTCCTTATTGTTCTGCTCTTCGTCGCGGGCA
ACATGGATGAGGTAGTCAATTCCAGCGCGGGCCCTCTCCTGGAAATTCTC
ATCCATGCTACCAACAACCGCGTGGGCGGCATCTGTCTGCTCATGTATAT
TCCACCCCCTCTATTCCATGGGACCAGCACTAACGATGCAATACAGGCTC
CCCCTCGTGTGTCTTTTATTTGCAACCCTCAGCGTCATGACAACAAGTAG
TCGAATGATCTTTGCATTCGCCAGGCATCTCACCCCCTCCCCCAAGTTCA
GAAAGGCACGAAGACTAACATCAAACAGAGATGGCGGCCTCCCCGCCTCC
AAGTTCTTCGCACGCGTGCACCCCAGACTCGGCCTTCCCTTGAACGCGCT
AATGTTGACTGCCTTTGTGGTGATTATTTTCGGCTGCATTTACCTCGGAT
CGAGCAGGTACTGCGTTTCCCCCAGCATCATTCCACGTTAAAAAGATACA
CACATAACTAAGATAAATCAGTGCCTTCAACGCAATCATCTCCGCCTCCG
TCGTCGCGCTGGATCTCTCCTACGCTATGCCGATCGCAGTCAATTGTCTG
CGCGGACGGAGAACGCTCCCTGATCGCAAGTGGAAGGTTCCTAATGCTAT
TGGATGGGTGATTGATACTGTATGTCATGTGACCCATGAATTGGGACAAT
ATGGAGGGGATAGGTGATGTGCTGACCGAGTATATCTAGATCTCGCTATC
GTATATTGCACTTACGACGGTGCTGTTCCTATTCCCGCCTGATAGGCCGG
TTACGGGGAGTAGTATGAGTAAGTCTACCCTTTCTACAGGAAGGTTGACT
GGGAGAGGTTGTGTTCATTGCTGATATCCGCTGTTAGATTACTGCATTGT
TGCTTTCGCCATTATCGTCATCGTTTCAGTGATACAGTGGGTGGTTGACG
GGAGGAAGAATTTTACGGGGCCGAGGGTGGATTTATCTTGATTTATACCC
CTGGTACAGGTGGCTATGGTGATGGACGATACCTGTTTGAAGACGCTCTA
GATGTGATGTAGGATGGGGACATCTATAAAGTAATTCTAGTGACGTATAC
GTTCGAGTAGTGTGATGATAGATCAAATATCCTGAGGACACTGCAAACAT
TCATTGTCGAGAGTGAGTATTTGTTTCAT back to topCoding sequence (CDS) from alignment at KZ851921.1:256665..259593+ >M747DRAFT_69140-T1 ID=M747DRAFT_69140-T1|Name=M747DRAFT_69140-T1|organism=Aspergillus niger ATCC 13496|type=CDS|length=30000bp|location=Sequence derived from alignment at KZ851921.1:256665..259593+ (Aspergillus niger ATCC 13496) ATGGAAGAAATGAAAGTCGCCCGCGATGGGCCCGAGGATGATGTCCAACT GGCCGAAATGGGTCATAAACCCGAGCTGCAACGGAACTTTTCGACCTTGT CTATGCTTGGACTGGCCTTTGCGGTGCTTAATTCTTGGACGGCTCTATCC GCGAGCTTATCCCTCAGCTTACCCTCAGGGGGAAGTACTAGTGTCGTCTG GGGTTTGGTCACGGCCGGATTCTGCAACCTCTGTATTGCAGTGTCGCTAG CTGAGTTCTTGTCCGCATATCCAACGGCGGGGGGCCAGTATCATTGGGTA GCCGTTATATCCTGGCCAAAATGGGTGCCTATCCTATCCTGGGTAACCGG ATGGATTAATGTGGCGGGATGGGTTGCCCTTGTCGCCACCAATGCGCTTC TTTCCTGCGAATTGATCGCTGGGATAGTGTCATCTGTGTACCCGGACTTT GTTTGGCAGCGCTGGCAAGAGTTCCTGATCTATGTGGGATACACATTGCT TGCATTTGTCATCAATGCGTTCATGAATTCAGTCCTGCCTATCATTTATC GTGGAGCATTCACCTGGTCCATCGGTGGTTTTGTCCTTATCTGCATCACG GTGCTGGCTTGTGCATCCCCGGATTACAATTCTGCTTACTTTGTATTCTG 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TGCATTTGTCATCAATGCGTTCATGAATTCAGTCCTGCCTATCATTTATC GTGGAGCATTCACCTGGTCCATCGGTGGTTTTGTCCTTATCTGCATCACG GTGCTGGCTTGTGCATCCCCGGATTACAATTCTGCTTACTTTGTATTCTG CGACTTTGTCAATCAAACTGGCTGGCCCGATGGAGTGGCTTGGTTACTGG GGCTGCTTCAAGGGGGACTTGGAGTTACCGCATTTGACGCGGTGGCTCAT ATGATCGAAGAGATCCCCCAACCCTCAATCAAAGGACCCAAGATCATGGT CGTCTGCGTCGGCATTGGCACATTCACCGGGGCCGTCTTCCTTATTGTTC TGCTCTTCGTCGCGGGCAACATGGATGAGGTAGTCAATTCCAGCGCGGGC CCTCTCCTGGAAATTCTCATCCATGCTACCAACAACCGCGTGGGCGGCAT CTGTCTGCTCATGCTCCCCCTCGTGTGTCTTTTATTTGCAACCCTCAGCG TCATGACAACAAGTAGTCGAATGATCTTTGCATTCGCCAGAGATGGCGGC CTCCCCGCCTCCAAGTTCTTCGCACGCGTGCACCCCAGACTCGGCCTTCC CTTGAACGCGCTAATGTTGACTGCCTTTGTGGTGATTATTTTCGGCTGCA TTTACCTCGGATCGAGCAGTGCCTTCAACGCAATCATCTCCGCCTCCGTC GTCGCGCTGGATCTCTCCTACGCTATGCCGATCGCAGTCAATTGTCTGCG CGGACGGAGAACGCTCCCTGATCGCAAGTGGAAGGTTCCTAATGCTATTG GATGGGTGATTGATACTATCTCGCTATCGTATATTGCACTTACGACGGTG CTGTTCCTATTCCCGCCTGATAGGCCGGTTACGGGGAGTAGTATGAATTA CTGCATTGTTGCTTTCGCCATTATCGTCATCGTTTCAGTGATACAGTGGG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
Term | Definition |
GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following five_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | antiSMASH:Cluster_8519211.1 |
Note | EggNog:ENOG41 |
DBxref | InterPro:IPR002293 |
DBxref | PFAM:PF13520 |
DBxref | PFAM:PF00324 |
Product | amino acid permease |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
KZ851921.1 | supercontig | KZ851921.1:256665..259593 + |
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