|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An01:1337696..1339481+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_000449-T1 ID=CBS51388_000449-T1|Name=CBS51388_000449-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1786bp|location=Sequence derived from alignment at An01:1337696..1339481+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGGTGTGTGCCCAGTCCCTCCCTCGCC
GCCGCTTGATTTTTCGCGTGGTCACTAATGTTTGTGTTTTCCCCTCACAG
TTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTGCTGGGAGGTATGTTTA
GACACGGGGGAATCGACCCCTCCTTTCCTGAAACAGTCATCAGAAAATCA
AACAACATCGGCATATGCCATATATTCTTGGGATAAACAGTGGACTAACG
GTGTTGTTTAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGTATGTGAAAAC
AAACGCCTAGGCACGCCTCTGTCGAGAGTTGCCACTCCACACCGATGAGC
AATCCCACTGATCTTTGTTTGTTGATGCCAGGCCGACGGTTACTTGACCG
AGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTTTCC
GAGACTGGTACGTTCCCATAGCCTTTCCCCCCGTGTATCCCGCTCCTCCG
TTTGCCCGCAGCACACCCTAACATGAAATTGGGCTATAGGTCAGGGCAAG
TATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGA
GGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCA
CTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTC
GGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGA
CAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTG
GTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGAC
TACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCCTCAGAA
CGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCTATCCTCACCACCCACACCA
CCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTAC
GACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGCGCCCTAGCTACGAGAACCT
CAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTT
TCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTC
CCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTC
CGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGA
GCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGC
AAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGA
GACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCG
TCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCC
CAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTGTAAGT
TCTTCTCCATCTGATATGCGACGTTTTCAAGACATAAGAAAGCTAACGGA
AGGTCAAATGTAGCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCC
TGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTT
CGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGG
CCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGC
GACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An01:1337696..1339481+ >CBS51388_000449-T1 ID=CBS51388_000449-T1|Name=CBS51388_000449-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=8082bp|location=Sequence derived from alignment at An01:1337696..1339481+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGAGAGAAGTTATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGC
CAACTCCTGCTGGGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACG
GTTACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGC
ACCTTCTTTTCCGAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTA
CTGCGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACC
GCAGTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCG
AACAACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCA
GGTCCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGG
GTTTCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGT
GCTCTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCT
GGAATTCTGCGTTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGC
CCTACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGC
AGCTTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCT
CGGCATCGAGCGCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGG
TTGTCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTC
GATCTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTT
CCCTCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACG
AGTCCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAAC
CAGATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCT
GCTGTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCA
CCCTGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGT
TTCAAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGA
CCTTGCCAACCTCAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCA
TCTCCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCC
AAGCGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGA
ATTCTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGG
AGGTTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATG
AGAGAAGTTATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAA
CTCCTGCTGGGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTT
ACTTGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACC
TTCTTTTCCGAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTG
CGATCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCA
GTCTTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAAC
AACTATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGT
CCTCGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTT
TCCTGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCT
CTCCTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGA
ATTCTGCGTTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCT
ACAACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGC
TTCATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGG
CATCGAGCGCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTG
TCTCTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGAT
CTCAACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCC
TCTGGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGT
CCAACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAG
ATGGTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCT
GTACCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCC
TGAAGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTC
AAGATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCT
TGCCAACCTCAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCT
CCGAGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAG
CGTGCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATT
CTCCGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGG
TTGCCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATGAGA
GAAGTTATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTC
CTGCTGGGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTTACT
TGACCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTC
TTTTCCGAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGA
TCTGGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTC
TTTTCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAAC
TATGCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCT
CGACAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCC
TGGTCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTC
CTGATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATT
CTGCGTTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACA
ACTCTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTC
ATGGTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCAT
CGAGCGCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCT
CTTCCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTC
AACGAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCT
GGTGGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCA
ACTCCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATG
GTCAAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTA
CCGTGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGA
AGACTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAG
ATCGGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGC
CAACCTCAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCG
AGGCCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGT
GCTTTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTC
CGAGGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTG
CCAGCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATGAGAGAA
GTTATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTG
CTGGGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTTACTTGA
CCGAGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTT
TCCGAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCT
GGAACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTT
TCCACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTAT
GCCCGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGA
CAAGGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGG
TCTTCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTG
ATGGAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTG
CGTTTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACT
CTATCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATG
GTTGACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGA
GCGCCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTT
CCATCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAAC
GAGTTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGT
GGCCTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACT
CCGTCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTC
AAGTGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCG
TGGTGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGA
CTAAGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATC
GGTATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAA
CCTCAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGG
CCTGGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCT
TTCGTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGA
GGCCCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCA
GCGACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATGAGAGAAGTT
ATTTCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTGCTG
GGAGCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTTACTTGACCG
AGGAGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTTTCC
GAGACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGGA
ACCCAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTCC
ACCCCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGCC
CGTGGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACAA
GGTCCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTCT
TCCACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGATG
GAGCGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCGT
TTACCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCTA
TCCTCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGTT
GACAACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGCG
CCCTAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCCA
TCACCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGAG
TTCCAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGGC
CTACGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCCG
TCAGCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAAG
TGTGATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTGG
TGATGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACTA
AGCGCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGGT
ATCTGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACCT
CAAGCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCT
GGTCCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTC
GTCCACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGC
CCGTGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCG
ACTCCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAGATGAGAGAAGTTATT
TCTTTGAACGTTGGTCAGGCTGGTTGCCAGATTGCCAACTCCTGCTGGGA
GCTCTACTGCCTTGAGCACGGTATCCAGGCCGACGGTTACTTGACCGAGG
AGCGCAAGAAGGATGACCCCGACCACGGATTCAGCACCTTCTTTTCCGAG
ACTGGTCAGGGCAAGTATGTCCCTCGTACCATTTACTGCGATCTGGAACC
CAATGTTGTGGATGAGGTCCGCACCGGTACCTACCGCAGTCTTTTCCACC
CCGAGAACATGATCACTGGCAAGGAGGATGCCTCGAACAACTATGCCCGT
GGTCACTACACCGTCGGCAAGGAGATGATCGACCAGGTCCTCGACAAGGT
CCGCCGTGTTGCCGACAACTGCGCTGGTCTCCAGGGTTTCCTGGTCTTCC
ACTCCTTCGGTGGTGGTACTGGTTCCGGTTTCGGTGCTCTCCTGATGGAG
CGTCTGTCCGTTGACTACGGCAAGAAGTCCAAGCTGGAATTCTGCGTTTA
CCCTGCTCCTCAGAACGCCACCTCCGTTGTTGAGCCCTACAACTCTATCC
TCACCACCCACACCACCCTTGAGCACTCCGACTGCAGCTTCATGGTTGAC
AACGAGGCCATCTACGACATCTGCCGCCGCAACCTCGGCATCGAGCGCCC
TAGCTACGAGAACCTCAACCGCCTGATCGCCCAGGTTGTCTCTTCCATCA
CCGCTTCCCTCCGTTTCGACGGTTCCCTCAACGTCGATCTCAACGAGTTC
CAGACCAACCTGGTCCCCTACCCCCGTATTCACTTCCCTCTGGTGGCCTA
CGCCCCCGTCATCTCCGCGGACAAGGCCTCCCACGAGTCCAACTCCGTCA
GCGAGATCACCATGAGCTGCTTTGAGCCCAATAACCAGATGGTCAAGTGT
GATCCCCGCAACGGCAAGTACATGGCCACTTGCCTGCTGTACCGTGGTGA
TGTCGTCCCCAAGGAGACCCACGCTGCCGTGGCCACCCTGAAGACTAAGC
GCACCATCCAGTTCGTCGACTGGTGCCCTACTGGTTTCAAGATCGGTATC
TGCTACCAGCCTCCCCAGCAGGTCCCCAACGGCGACCTTGCCAACCTCAA
GCGCGCTGTCTGCATGCTGTCCAACACCACCGCCATCTCCGAGGCCTGGT
CCGCTCTCGACCACAAGTTCGACCTCATGTACTCCAAGCGTGCTTTCGTC
CACTGGTACGTTGGTGAGGGTATGGAGGAGGGTGAATTCTCCGAGGCCCG
TGAGGACCTGGCTGCCCTTGAGCGCGACTACGAGGAGGTTGCCAGCGACT
CCCTGGAGGAGGAGGTTGAGGCCGAGTACTAG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0005874 | microtubule |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0003924 | GTPase activity |
| GO:0005525 | GTP binding |
| GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0007017 | microtubule-based process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR008280 |
| DBxref | InterPro:IPR017975 |
| DBxref | InterPro:IPR036525 |
| DBxref | InterPro:IPR023123 |
| DBxref | InterPro:IPR037103 |
| DBxref | InterPro:IPR018316 |
| DBxref | InterPro:IPR003008 |
| DBxref | InterPro:IPR002452 |
| DBxref | InterPro:IPR000217 |
| DBxref | PFAM:PF03953 |
| DBxref | PFAM:PF00091 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An01 | supercontig | An01:1337696..1339481 + |
|
