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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An02:2139415..2140910+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_001922-T1 ID=CBS51388_001922-T1|Name=CBS51388_001922-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1496bp|location=Sequence derived from alignment at An02:2139415..2140910+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGA
GCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGA
AGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGGTAAGCTACTCAAAAGAGT
GAGGCAATGGAATTGAATAGAGTACTGATACCAAGAGCAGTGTCTGGATC
ACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGC
TCAGTTCCGTAAGTTCTCCACGTGGTGGCTACAAATCAAGGTGACCATAT
CGCTAATTGTGCTCTCTGTTGCTAGGTTTCCGTACGTTCCTCATACCCTA
TCTCGATATTGTCCAACAGTCAAAACTAATGGCATTTAGCTATCATTCTC
ACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCG
CACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTG
TCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTG
ATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGAT
GCTCAAGGTCAGTCATTCCCTTTCGAGCGTGAGTTTTCCTTGCTCACTCC
CACTCAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGG
GCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTG
CTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGG
ATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCA
TGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTC
TCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGC
TCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTG
GTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTT
TCCGTTGTCTTCCTGGTAAGAAGCTCTTGTTCTTGACGTTGCTACATAGG
GATCAATTTACTAACGCACCCACACAGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGT
TATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCA
TGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCG
ATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAA
GGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACC
ACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTC
TTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGC
CAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An02:2139415..2140910+ >CBS51388_001922-T1 ID=CBS51388_001922-T1|Name=CBS51388_001922-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=5970bp|location=Sequence derived from alignment at An02:2139415..2140910+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGA
GCCTACCCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGA
AGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGT
TCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCC
TATCATTCTCACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGC
TTCTGGCGCGCACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATG
ACTGGCCGTGTCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAG
TCTGAGTTTGATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTT
TCATCCAGATGCTCAAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACT
TGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAG
CATTATCGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTG
TCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACT
CGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGA
CCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACG
GTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATC
TACAACGTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCT
CCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCTGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTA
TGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATG
ATGATCTGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGAT
TGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGG
AGTACACCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCAC
CCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTT
CCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCA
GCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAATGTCC
GAAGGCGAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTAC
CCTGCCCACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTG
CCTTCCACCCTGCTGTCTATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGT
GTTATCTTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCCTATCAT
TCTCACAACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGG
CGCGCACCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGC
CGTGTCTACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAG
TTTGATCTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCC
AGATGCTCAAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGT
ATGGGCATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTAT
CGTGCTTGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCA
TCGGATTCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTG
GTCATGGTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCT
TGTCTCCCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCA
CTGCTCTCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAAC
GTTGGTGTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAA
CGTTTCCGTTGTCTTCCTGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCC
TGTGCGGTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATC
TGGCAGACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCT
GGTCGGTCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACA
CCGGCCAGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCT
CAGCGCAAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCT
CATGGGCTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCA
AGGGCATGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAATGTCCGAAGGC
GAAAAAGCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCC
CACCGTCAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCC
ACCCTGCTGTCTATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATC
TTGTTCAACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCCTATCATTCTCAC
AACATGGCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCA
CCACCACTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTC
TACCTTCGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGAT
CTGCGGTAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGC
TCAAGGCTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGC
ATGGCTCCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCT
TGGTGTCATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGAT
TCCTCTTCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATG
GTTCAGCGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTC
CCTCTACTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTC
TCTTCCTCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGT
GTCTGGACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTC
CGTTGTCTTCCTGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCG
GTGTCCTTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAG
ACCCCCGTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGG
TCTCGTGTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCC
AGGCCAACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGC
AAGTTCATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGG
CTCCATGGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCA
TGCTCGGTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAATGTCCGAAGGCGAAAAA
GCCAGAACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGT
CAATCCCGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTG
CTGTCTATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTC
AACAAGCATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCCTATCATTCTCACAACATG
GCATTTGGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCA
CTCTGCTCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTT
CGTGCTATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGG
TAATGTTACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGG
CTACCACCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGCATGGCT
CCTGTCAACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCTTGGTGT
CATCATTGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGATTCCTCT
TCCAGCTCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATGGTTCAG
CGCCTGCTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTCCCTCTA
CTACTTCGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTCTCTTCC
TCGAGGTCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGTGTCTGG
ACATTGCTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTCCGTTGT
CTTCCTGATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCC
TTAAGGATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCC
GTCACCTTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGT
GTACTACAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCA
ACCGTGCCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTC
ATCGTTTTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCAT
GGCCCCCAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCG
GTGGCGCTACTGCTGGAAATGCCTAAATGTCCGAAGGCGAAAAAGCCAGA
ACCTCTGGAGAGGTCTCTCGTCCGGAGCCTACCCTGCCCACCGTCAATCC
CGCTGTCGATAAGGCAGAGCCTCCGAAGCCTGCCTTCCACCCTGCTGTCT
ATGTCGGTGTCTGGATCACTCTGAGTTCCAGTGTTATCTTGTTCAACAAG
CATATCCTTGATTATGCTCAGTTCCCTATCATTCTCACAACATGGCATTT
GGCATTTGCGACCTTCATGACCCAGCTTCTGGCGCGCACCACCACTCTGC
TCGATGGACGGAAAACCGTGAAGATGACTGGCCGTGTCTACCTTCGTGCT
ATTGTTCCGATCGGTCTTTTCTTCAGTCTGAGTTTGATCTGCGGTAATGT
TACTTATCTGTATCTGAGTGTTGCTTTCATCCAGATGCTCAAGGCTACCA
CCCCTGTTGCTGTTCTCTTCGCTACTTGGGGTATGGGCATGGCTCCTGTC
AACCTGAAGGTCCTGATGAACGTCAGCATTATCGTGCTTGGTGTCATCAT
TGCCTCTTTCGGTGAGATCCGCTTTGTCTTCATCGGATTCCTCTTCCAGC
TCGGTGGTATTGTCTTTGAGGCCACTCGTCTGGTCATGGTTCAGCGCCTG
CTCAGCTCCGCCGAGTACAAGATGGACCCTCTTGTCTCCCTCTACTACTT
CGCTCCTGTCTGTGCTGTCATGAACGGTGTCACTGCTCTCTTCCTCGAGG
TCCCCAACCTCACCATGGGCCACATCTACAACGTTGGTGTCTGGACATTG
CTGGCCAATGCCGTTGTTGCTTTCCTCCTCAACGTTTCCGTTGTCTTCCT
GATTGGCAAGACCTCCTCCCTCGTTATGACCCTGTGCGGTGTCCTTAAGG
ATATCCTTTTGGTCGCTGCTTCCATGATGATCTGGCAGACCCCCGTCACC
TTGACCCAGTTCTTCGGTTACTCGATTGCTCTGGTCGGTCTCGTGTACTA
CAAGCTTGGCGGTGACAAGATCAAGGAGTACACCGGCCAGGCCAACCGTG
CCTGGGCTGAGTATGGAGTTAACCACCCGGCTCAGCGCAAGTTCATCGTT
TTCGGCGCTATCCTCCTCATCTTCTTCCTGCTCATGGGCTCCATGGCCCC
CAGCTACGCCCCCGAACAAGTTGCCAGCGTCAAGGGCATGCTCGGTGGCG
CTACTGCTGGAAATGCCTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR004853 |
| DBxref | PFAM:PF03151 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An02 | supercontig | An02:2139415..2140910 + |
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