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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An04:334413..336686- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_003052-T1 ID=CBS51388_003052-T1|Name=CBS51388_003052-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=2274bp|location=Sequence derived from alignment at An04:334413..336686- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGTGTGGTATCTTCGCGTGTCATCAGTATGTGGGCTAGTTTTGGAATCT
TTTCTCTCCCCTCTCTCTCTCTCTTTGACCTTTCTGCGGGCCCCGCGCCA
AAATCGCTCTCCATTTGAGTCACACCCTCTGATCTGAACTGCCATAGTCA
CCCCGATGTGCAAAAATTCAAGCTTACGGCCCTGCGCATGGCCAAGGCGT
AAGTATAATCCCTTCTCTTTTGGTGGTGAATTTGGTGCTGATTGCCGTTG
AACAGTTTGCGCCACCGTGGTCCCGATTGGAGTGAGTCATAATGCTCTTT
TTGGCCGGCATGCTGGTGGAGGACCTTTTTTCTGACTTGTGTTTAGGTGG
AAGCTGGATGTCTGACAAGACCAGTGAGTTGAGCAGCTTCGTGGCTGGAA
GAAGGTGGCGACTAACTGTCTGGCAGTCCTCGCGCACGAGCGACTGTGTA
TCGTCGGTGTTGGTATGTGATGTTTTACCCTGCCGCAGCTTTTTTTTCTT
AGAAACCCGTGCTAATTTGGTTCCCTTTCAGACTCCGGTGCCCAGCCCCT
TGTCAACGACGATGGCTCCCTTGCCTTGGCCGTCAACGGCGAGATCTATA
ACCACCGTATCCTCCGGAAGGGACTGAAGACCAAGTATCAGTTCAAGACG
CATTCCGACTGTGAGGTCGTCATTCCCTTGGTATGTGCAAAGGATCCTTG
ATGGCATGGCGTGTATCTGTATAGGGTTGCTGATGGTTTTAGTACATGGA
ACACGGACTCGATGCTCCCAAGCACCTGGATGGCATGTTCTCCTGGGTTC
TCTATGACAAGAACCAGGACAAGGTTGTCGCCGCTCGTGATCCCATCGGT
ATCACCAGCTTCTACATTGGCTGGTCCTCTGAGACCCCCGGAGCCGTCTA
CTTCGCTTCCGAGCTGAAGTCTCTCCACCCGGTTTGCGACAAGATCGAGG
CTTTCCCTCCCGGCCACATCTTCGACTCCAAGACCGGCTCTTTCACCCGC
TACTTCCAGCCTACCTGGTGGGATCCCGCCAACGTTCCCTCCGCCCCTGT
CGACTACAAGGTCATCCGCGCTTCCCTCGAGAAGTCTGTTCGCAAGCGTC
TGATGGCTGAGGTCCCCTATGGTGTCTTGCTTTCCGGTGGTCTCGATTCC
AGCTTGGTCGCCTCCATCGCTCAGCGGGAAACTCTGCGTATGCAGGAGGC
CGCCAGGGCTGCTCAGGCCCAGGGTGCTGAGCTGAACGAGTTGGTCGGCA
TTGACGACTCCAACGATCTGTCCACCGTCACCACCTTCCAGCAGCTGCAC
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GGTGGCCAAGTTCCTCGGAACCAAGCACCATGCTTTCACTTTCACCGTTG
AGGATGGTCTCAACGCCCTCTCCGACGTCATCTACCACCTGGAGACTTAC
GATGTCACCACCATCCGTGCTTCCACCCCCATGTACCTGCTCAGCCGCAA
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AGATCTTCGGTGGATACCTTTACTTCCACGCTGCTCCCGACCGTGAGGAG
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TTCTCTGGCGCCAGAAGGAGCAGTTCAGTGACGGTGTCGGCTACAGCTGG
ATCGATGCCCTCAAGGACCAGGCTGAGGCGCACGTCACCGACGAGATGAT
GAAGAACCCCAAGCCCGAGTGGGGTAGCGATATCCCCGACACCAAGGAAG
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TTCGATTAGCTACTGGTACCGCACGATGTTCGACGAACTTTTCCCAGCTT
CTTGTGCCGGCACTGTTGAGCGTTGGGTACCGACCTGGTCGAAGCAGACC
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GACAGCTGATATGTTTGACCTTTTTTTCCAGAGCTATTGCGACTCACAAC
GCCAAGTATGAAAACGCCGTTTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An04:334413..336686- >CBS51388_003052-T1 ID=CBS51388_003052-T1|Name=CBS51388_003052-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=15498bp|location=Sequence derived from alignment at An04:334413..336686- (Aspergillus niger CBS 513.88) AGCTATTGCGACTCACAACGCCAAGTATGAAAACGCCGTTTAACTACTGG TACCGCACGATGTTCGACGAACTTTTCCCAGCTTCTTGTGCCGGCACTGT TGAGCGTTGGGTACCGACCTGGTCGAAGCAGACCGACCCGAGTGGCAGTA CATGGAACACGGACTCGATGCTCCCAAGCACCTGGATGGCATGTTCTCCT GGGTTCTCTATGACAAGAACCAGGACAAGGTTGTCGCCGCTCGTGATCCC ATCGGTATCACCAGCTTCTACATTGGCTGGTCCTCTGAGACCCCCGGAGC CGTCTACTTCGCTTCCGAGCTGAAGTCTCTCCACCCGGTTTGCGACAAGA TCGAGGCTTTCCCTCCCGGCCACATCTTCGACTCCAAGACCGGCTCTTTC ACCCGCTACTTCCAGCCTACCTGGTGGGATCCCGCCAACGTTCCCTCCGC CCCTGTCGACTACAAGGTCATCCGCGCTTCCCTCGAGAAGTCTGTTCGCA AGCGTCTGATGGCTGAGGTCCCCTATGGTGTCTTGCTTTCCGGTGGTCTC GATTCCAGCTTGGTCGCCTCCATCGCTCAGCGGGAAACTCTGCGTATGCA GGAGGCCGCCAGGGCTGCTCAGGCCCAGGGTGCTGAGCTGAACGAGTTGG 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006529 | asparagine biosynthetic process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004066 | asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing) activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
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DBxref | InterPro:IPR001962 |
DBxref | InterPro:IPR014729 |
DBxref | InterPro:IPR029055 |
DBxref | InterPro:IPR006426 |
DBxref | InterPro:IPR017932 |
DBxref | PFAM:PF13537 |
DBxref | PFAM:PF13522 |
Product | asparagine synthetase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
An04 | supercontig | An04:334413..336686 - |
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