|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An04:567731..568725+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_003128-T1 ID=CBS51388_003128-T1|Name=CBS51388_003128-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=995bp|location=Sequence derived from alignment at An04:567731..568725+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGGTGAGTTAATCGGATCCTTCCCT
TTCGTGTTCATATCAGCTTGTATACACATGTTCGCGTGGCTAACTCTTTA
TTCTTCATTTTTGAGTAGCAAAACCTCGTAAGTTACTGACGATACATGTT
TCACTCGCGCGTCAAACCTGACAATATCCTCAGATCAACTACCGGATGAG
AGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCG
ATAAGGTATATATTTCTGGGTCTTTCAGTGGCCATCGGATAACACTTGTG
GTCGGCTGGTCGCTGATGCAGAATTATAGCACATGAACCTTGTCCTCGCC
GATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGG
TTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCC
TTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCT
CCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGC
TGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTG
GACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGC
CCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTT
CCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTG
GACCTCGTAAGTTTGCACTTTCGAGCTCGATGTTGAACTTGGTTACTGAC
TTAGGATATTAGCTGGCTTCGCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGT
GCTCCTCGTAAGTATCCTTGAATGGCGTGTTATGGTTATAGAGCTAACTG
ATGCTGTTGTAGCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCT
GGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACGGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An04:567731..568725+ >CBS51388_003128-T1 ID=CBS51388_003128-T1|Name=CBS51388_003128-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=3270bp|location=Sequence derived from alignment at An04:567731..568725+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGATCAACTACCGGATGAGAGTCAC
CCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGATAAGC
ACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAAGCGC
AAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGGCCGA
AGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTCGTCT
CTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACTCGGT
GCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTGGCCC
TGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGAGGCC
CTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCCCGGT
TTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCGCTGG
TCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTCGCTCCTCCCCCGGGAT
TCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGGATTC
CAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTGGACG
GTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGATCAACTACCGGATGAGAG
TCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTTCGAT
AAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCGTCAA
GCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTTGAGG
CCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACATGTC
GTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCCGACT
CGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCTGCTG
GCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCTGGGA
GGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTTTTCC
CGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGCTTCG
CTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTCGCTCCTCCCCCG
GGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCACCGGG
ATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTTGGTG
GACGGTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGATCAACTACCGGATG
AGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCGCTTT
CGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGTCGCG
TCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCTTGTT
GAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTACACA
TGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCTGCCC
GACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCTCGCT
GCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCGGCCT
GGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGCGGTT
TTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCCGGGC
TTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTCGCTCCTCC
CCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCCCCAC
CGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGGCTTT
GGTGGACGGTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGATCAACTACCG
GATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATGCTCG
CTTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATTCCGT
CGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCACCTCT
TGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGCGGTA
CACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCCCTCT
GCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCACTCT
CGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCGGTCG
GCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCCCGGC
GGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGCCTCC
GGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTCGCTC
CTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCAACCC
CCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCACCCGG
CTTTGGTGGACGGTGAATGGCGGCTAATAAGCAGGGCAAGATGATCAACT
ACCGGATGAGAGTCACCCTCAATGATGGCCGACAGATGACGGGACAGATG
CTCGCTTTCGATAAGCACATGAACCTTGTCCTCGCCGATACAGAAGAATT
CCGTCGCGTCAAGCGCAAGTCCAAGCCCGCCGCCGGTTCGACCAACGCAC
CTCTTGTTGAGGCCGAAGAAAAGCGCACCCTGGGCCTTACCATTGTTCGC
GGTACACATGTCGTCTCTTGCTCCGTTGATGGACCTCCTCCTGCCGACCC
CTCTGCCCGACTCGGTGCTGCTGGTCCTAGCGCAGCTGCCGCAGCTGCCA
CTCTCGCTGCTGGCCCTGGAATTAGCAAACCCGCTGGACGTGGTCTGCCG
GTCGGCCTGGGAGGCCCTGCTGCAGGTGTTGGTGGCCCTCCCCCGCCGCC
CGGCGGTTTTCCCGGTTTCCCTCCTGGTGGTAGTTTCCCTGGAGTGCCGC
CTCCGGGCTTCGCTGGTCGTGGTGGTGCCCCTGGTGGACCTCCTGGCTTC
GCTCCTCCCCCGGGATTCGCTCCTCAGGGTGCTCCTCCGGGTGCCTTCCA
ACCCCCACCGGGATTCCAGCCCCCTGGACAAGGACGCGGATTCCCTCCAC
CCGGCTTTGGTGGACGGTGA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR010920 |
| DBxref | InterPro:IPR001163 |
| DBxref | PFAM:PF01423 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An04 | supercontig | An04:567731..568725 + |
|
