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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An08:1522526..1524306+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_005443-T1 ID=CBS51388_005443-T1|Name=CBS51388_005443-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1781bp|location=Sequence derived from alignment at An08:1522526..1524306+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGCTGACATGCCCATTGGTATGTTTATGCGTGTTCCCCCTCCTCTTCC
TTACCTTCATCTTCCCTTACCCCCTCCCCGAGTTCTCCTTGTCGGTGCCT
GTCCCTCCCGTGCTTCCCAGCTAACCAACCACGCCCCCCAGTGCTCGACG
GAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGGTCTGTCATCAC
CTCCCATCCCATTGCGTACTCTTACTTACCTCCTCTTCTTCCCCATGGAT
AGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTG
CGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGG
AGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTGTAC
GTCATTTACATTCGCGTGCCTTCGTTCTCCCCCCACCCCCGATCGCTCCA
TTGTCTCCCCGGAGGTGTGGCAGACGTGTTAACGTTGGGCCCGACTTGGT
ATACAGATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCT
ATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCA
AGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAA
ATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGC
TATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGGTAAGTCTTGCACGCTTC
ATATCCTCTCTCTTATCCCGCAGCTCTGATCGCCCGCTCTTTCGCAATCC
ACAGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCA
CATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGC
TTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTC
CGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCA
GATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGA
AGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGAT
GGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCT
CTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGC
TCTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTAC
AAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTC
CCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAG
GCAACCCGGAGAGGTTGAACGTACGTATTCTCATTCACTGGNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCA
GAAGAAATTAACAGCTAATTCCATGTTACAGAAGTTCAAGGTGCGCATCG
AGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTC
GCCAACCTGGTAAGCTTCTTCACTTCTTCCCTCCTTCCCCTGTACACCCG
TTTTCCTGTTCGCAAGTCACACCATAGCTAACATAATTACCTAGATTGCC
GACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGC
ACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An08:1522526..1524306+ >CBS51388_005443-T1 ID=CBS51388_005443-T1|Name=CBS51388_005443-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=8169bp|location=Sequence derived from alignment at An08:1522526..1524306+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGT
CGGATATGCTGCGCAGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGG
GGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAG
GATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAAT
CACCTACCCTATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAAC
ACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGC
CGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGA
GCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACG
TTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGT
GTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGA
ATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTG
ATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTG
AACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTG
CTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAA
CCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTC
GGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGT
GGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGG
GCGCTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGT
GGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCT
CAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGA
ACAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTC
TTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACAT
GTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCA
AACTCGGCCCTAGATAGATGGCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGA
ACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGAACTTCCCCGAGCACCA
GTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCG
GCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCC
AGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAATGGTATCGTGAAGAG
ATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGA
AGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAAT
CCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAA
CTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTC
AGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCAC
ATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCT
TGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCC
GTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAG
ATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAA
GCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATG
GTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTC
TTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCT
CTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACA
AGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCC
CGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGG
CAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGC
GACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGATT
GCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGG
TGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGATGGCTGACATGCCCA
TTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAG
AACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCG
AACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAG
ATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAG
AATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACAC
CTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGA
CCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTT
ATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGT
GCTTGCACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCG
GTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAAC
CACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCT
CATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATT
TCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGAT
CTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTC
CTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTG
AAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCC
GGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGT
GCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGT
ACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTC
ACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCG
CATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCG
TCCTCGCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAA
GAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATA
GATGGCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGG
TCGGATATGCTGCGCAGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTG
GGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAA
GGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAA
TCACCTACCCTATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAA
CACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGG
CCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGG
AGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATAC
GTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGG
TGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACG
AATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGT
GATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTT
GAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCT
GCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACA
ACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGT
CGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGG
TGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAG
GGCGCTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAG
TGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGC
TCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTG
AACAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGT
CTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACA
TGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCC
AAACTCGGCCCTAGATAGATGGCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGG
AACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCAGAACTTCCCCGAGCACC
AGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCC
GGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGC
CAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGAGAATGGTATCGTGAAGA
GATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATG
AAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAA
TCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACA
ACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCT
CAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCA
CATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGC
TTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTC
CGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCA
GATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGA
AGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGAT
GGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCT
CTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGC
TCTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTAC
AAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTC
CCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAG
GCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCG
CGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGAT
TGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGG
GTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGATAGATGGCTGACATGCCC
ATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAGGTCGGATATGCTGCGCA
GAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGTGGGGCGGCCCATATTGC
GAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCAAGGATATCATGTGCGGA
GATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAAATCACCTACCCTATGGA
GAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCAACACCTATGGAACTACA
CCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGGGCCGCAAGATCCTCTTG
ACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGGGAGCAAATGGCTGAGGT
TATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATACGTTGCTATTCAAGCTG
TGCTTGCACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTGGTGTGGTCGTTGACTCC
GGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTACGAATCCACAGTTCTTAA
CCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCGTGATGTCACCCGTAACC
TCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCTTGAACCGTACCGCCGAT
TTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTCTGCTATGTGTCCTACGA
TCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACACAACCGTCCTTGTCGAGT
CCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCGTCGGCAGCGAGCGCTTT
GAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTGGTGGATGTTGATCAGCC
CGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCAGGGCGCTGATGTCGATG
TGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCAGTGGAGGAAGCAGCATG
TACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAGCTCAAGCAATTGTGGCT
CACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTTGAACAAGTTCAAGGTGC
GCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGGTCTTCCTGGGAGGTGCC
GTCCTCGCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGACATGTGGGTTACCAAGCA
AGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGCCAAACTCGGCCCTAGAT
AGATGGCTGACATGCCCATTGTGCTCGACGGAGGAACTGGTTTCCTCAAG
GTCGGATATGCTGCGCAGAACTTCCCCGAGCACCAGTTCCCCTCGATAGT
GGGGCGGCCCATATTGCGAACGGAGGAGCAGGCCGGCGACATTGTCGTCA
AGGATATCATGTGCGGAGATGAAGCTGCTGCTGCCAGATCTATGCTGCAA
ATCACCTACCCTATGGAGAATGGTATCGTGAAGAGATGGGACGACATGCA
ACACCTATGGAACTACACCTTTTACGAGAAGATGAAGATCGATCCTACGG
GCCGCAAGATCCTCTTGACCGAACCCCCCATGAATCCCCTGAAGAACCGG
GAGCAAATGGCTGAGGTTATGCTGGAAGGCTACAACTTTGGAGGTGTATA
CGTTGCTATTCAAGCTGTGCTTGCACTATACGCTCAGGGTCTCAGCAGTG
GTGTGGTCGTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACATTATCCCCGTCTAC
GAATCCACAGTTCTTAACCACCACATTCGCCGGCTTGATGTCGCCGGTCG
TGATGTCACCCGTAACCTCATCGCCCTCCTGCTCCGTCGCGGTTATGCCT
TGAACCGTACCGCCGATTTCGAAACCGTGCGCCAGATCAAGGAGAAGCTC
TGCTATGTGTCCTACGATCTCGAGTTGGACAAGAAGCTCTCCGAAGACAC
AACCGTCCTTGTCGAGTCCTACACCCTTCCCGATGGTCGCGTCATCCGCG
TCGGCAGCGAGCGCTTTGAAGCCCCCGAATGCCTCTTCCAGCCGCACCTG
GTGGATGTTGATCAGCCCGGTATCGCCGAGTTGCTCTTCAACACCATCCA
GGGCGCTGATGTCGATGTGCGCTCCAGTCTCTACAAGGCTATTGTGCTCA
GTGGAGGAAGCAGCATGTACCCCGGTCTGCCTTCCCGGTTGGAGAAGGAG
CTCAAGCAATTGTGGCTCACACGGGTCCTGCAAGGCAACCCGGAGAGGTT
GAACAAGTTCAAGGTGCGCATCGAGGACCCCCCGCGACGAAGACACATGG
TCTTCCTGGGAGGTGCCGTCCTCGCCAACCTGATTGCCGACAAGGAGGAC
ATGTGGGTTACCAAGCAAGAGTGGCAGGAACAGGGTGCACGTGCCCTGGC
CAAACTCGGCCCTAGATAG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | BUSCO:EOG09262MEK |
| DBxref | InterPro:IPR043129 |
| DBxref | InterPro:IPR020902 |
| DBxref | InterPro:IPR004000 |
| DBxref | PFAM:PF00022 |
| Product | actin nucleation center |
| Product | Arp2/3 complex subunit |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An08 | supercontig | An08:1522526..1524306 + |
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