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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An08:2617857..2619620- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_005807-T1 ID=CBS51388_005807-T1|Name=CBS51388_005807-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1764bp|location=Sequence derived from alignment at An08:2617857..2619620- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGGCCGGCGGTAAGGTAGGCGTTAGATCCCGCTGTCATCAAGAATTATT
GTCCACTAGCTAGCTGTTGACTAACGTCGAGTTACTAGCGACCCGACGTG
CACCCTGTGATAGACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGA
TGACCCAACAAACCCGAGGTGAGAGATAATCGTTCACATCTGCCACCACG
AAAGATCGAGCATCTGACACGGAATAGGAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGT
GGTTTCTGATGATACTGGTCAGTACCATCACGTTCATCAGGTATGCTGAG
AGTTCTTCAAAATAAACAAATAATTGGCTCTTACTCACGACCTCTACAGT
CCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGCGGAAGAGGA
ATTTGATGTCACGTCGACGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCACAGGTTATC
TCATCGGTTATGTGGTATGTGTGGTTTCCGTGTTGTGCAAGAATATGACT
TGAGCTTACCGAACTTGCCATGTAGACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTCCGC
TGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAACACGTTT
TTCGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGCGTT
GATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTGTTTGACTA
CAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGAATC
GCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTGCTAGGACC
ACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGGTATGTC
AATTCCACCTGTCTTTTCATCCACATGACTGATATTGATACCCCTGGTAG
GTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCAT
GGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCG
AGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAA
CCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCCTCGGCAAGCG
GTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCGATCGTGTTTCCCG
TTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACC
ACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAG
TGGCCTCGCATATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGTGGCCAGATCG
TCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAAC
AACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATCTTTGC
CTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGA
AAACACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCACCCTTTGCGTTCGGC
ATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATTGACTGCTATCC
TCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGA
TGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACGCGACTTTGGGC
TACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATGATCCC
CGTGCCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTCGTCTC
AATTGGAGTTGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An08:2617857..2619620- >CBS51388_005807-T1 ID=CBS51388_005807-T1|Name=CBS51388_005807-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=8730bp|location=Sequence derived from alignment at An08:2617857..2619620- (Aspergillus niger CBS 513.88) GTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCAT GGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCG AGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAA CCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCCTCGGCAAGCG GTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCGATCGTGTTTCCCG TTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACC ACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAG TGGCCTCGCATATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGTGGCCAGATCG TCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAAC AACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATCTTTGC CTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGA AAACACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCACCCTTTGCGTTCGGC ATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATTGACTGCTATCC TCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGA TGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACGCGACTTTGGGC TACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATGATCCC CGTGCCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTCGTCTC AATTGGAGTTGTGAACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTCCGCTGAGTGAGATG TACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAACACGTTTTTCGTCGCCTT CCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGCGTTGATCGTCTTTC GTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTGTTTGACTACAGGCGGTGGT GTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGAATCGCAATGGCAGT TTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTGCTAGGACCACTTCTTGGAG GTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGTCCATTCGCGTCCTCGGT CTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGCGGAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGA CGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCACAGGTTATCTCATCGGTTATGTGGAA TTTCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTCAGTACCATCA CGTTCATCAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAGACTTGGAGAAGGATA TGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAACCCGAGATGGCCGGCG GTAAGGTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTGCTCTG GTCATGGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGCCGCAA GACCGAGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAGCTGCT ATGAACCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCCTCGGC AAGCGGTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCGATCGTGTT TCCCGTTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTTGCTCT TCACCACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCACGGAA ATCAGTGGCCTCGCATATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGTGGCCA GATCGTCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGGTTGAAGTTGC GCAACAACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCATGATC TTTGCCTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCTGCGCA GGAGAAAACACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCACCCTTTGCGT TCGGCATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATTGACTGC TATCCTCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACCCGGTC GCTGATGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACGCGACTT TGGGCTACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCACACTGGGCATG ATCCCCGTGCCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCGTCAGAAAGTC GTCTCAATTGGAGTTGTGAACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTCCGCTGAGTG AGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAACACGTTTTTCGTC GCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGCGTTGATCGT CTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTGTTTGACTACAGGCG GTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGAATCGCAATG GCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTGCTAGGACCACTTCT TGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGTCCATTCGCGTCC TCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGCGGAAGAGGAATTTGATGTCAC GTCGACGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCACAGGTTATCTCATCGGTTATG TGGAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTCAGTAC CATCACGTTCATCAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAGACTTGGAGAA GGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAACCCGAGATGGC CGGCGGTAAGGTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCTCTCTG CTCTGGTCATGGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCATCCGC CGCAAGACCGAGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTCTACAG CTGCTATGAACCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGGTACCC TCGGCAAGCGGTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGCCGATC GTGTTTCCCGTTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTCTACTT GCTCTTCACCACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTGGAGCA CGGAAATCAGTGGCCTCGCATATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTATCAGT GGCCAGATCGTCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGGTTGAA GTTGCGCAACAACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAATCACCA TGATCTTTGCCTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGATGGTCT GCGCAGGAGAAAACACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCACCCTT TGCGTTCGGCATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGTGATTG ACTGCTATCCTCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGGTTACC CGGTCGCTGATGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATGTACGC GACTTTGGGCTACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCACACTGG GCATGATCCCCGTGCCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCGTCAGA AAGTCGTCTCAATTGGAGTTGTGAACTGGTCCTCTCTTTTTCTCTCCGCT GAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAACACGTTTT TCGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTGCGTTG ATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTGTTTGACTAC AGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGGAATCG CAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTGCTAGGACCA CTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGTCCATTCG CGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGCGGAAGAGGAATTTGAT GTCACGTCGACGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCACAGGTTATCTCATCGG TTATGTGGAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATACTGGTC AGTACCATCACGTTCATCAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAGACTTG GAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAACCCGAG ATGGCCGGCGGTAAGGTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGCACGCT CTCTGCTCTGGTCATGGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGTAATCA TCCGCCGCAAGACCGAGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCGAGCTC TACAGCTGCTATGAACCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTATACCGG TACCCTCGGCAAGCGGTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCGTTCGC CGATCGTGTTTCCCGTTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGATGCCTC TACTTGCTCTTCACCACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTACGGCTG GAGCACGGAAATCAGTGGCCTCGCATATCTCGGTCTCGGTGTCGGCTTTA TCAGTGGCCAGATCGTCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCACCCGG TTGAAGTTGCGCAACAACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTGTCAAT CACCATGATCTTTGCCTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTACGGAT GGTCTGCGCAGGAGAAAACACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCCTGGCA CCCTTTGCGTTCGGCATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACCTATGT GATTGACTGCTATCCTCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGATGGTGG TTACCCGGTCGCTGATGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGCGCATG TACGCGACTTTGGGCTACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTCGTCAC ACTGGGCATGATCCCCGTGCCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGGCAGCG TCAGAAAGTCGTCTCAATTGGAGTTGTGAACTGGTCCTCTCTTTTTCTCT CCGCTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCCAACAC GTTTTTCGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATATATCTG CGTTGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTTGTTTG ACTACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAGCGTGG AATCGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGTGCTAG GACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACTGGTCC ATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGCGGAAGAGGAAT TTGATGTCACGTCGACGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCACAGGTTATCTC ATCGGTTATGTGGAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGATGATAC TGGTCAGTACCATCACGTTCATCAGCGACCCGACGTGCACCCTGTGATAG ACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAACAAAC CCGAGATGGCCGGCGGTAAGGTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGGGCGGC ACGCTCTCTGCTCTGGTCATGGTTTTCAACCGGGAGACCAACCACGTCGT AATCATCCGCCGCAAGACCGAGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCGTCCCG AGCTCTACAGCTGCTATGAACCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTTCTTAT ACCGGTACCCTCGGCAAGCGGTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTGGTCCG TTCGCCGATCGTGTTTCCCGTTGCGACCTATCTGGCCACACTGTACGGAT GCCTCTACTTGCTCTTCACCACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGTCCTAC GGCTGGAGCACGGAAATCAGTGGCCTCGCATATCTCGGTCTCGGTGTCGG CTTTATCAGTGGCCAGATCGTCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCATGATCA CCCGGTTGAAGTTGCGCAACAACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGCGCCTG TCAATCACCATGATCTTTGCCTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTTTGGTA CGGATGGTCTGCGCAGGAGAAAACACACTGGATTGTGCCCATCATCGGCC TGGCACCCTTTGCGTTCGGCATGGTGGGTATTTACAATACCCTGCAGACC TATGTGATTGACTGCTATCCTCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCCGCGAT GGTGGTTACCCGGTCGCTGATGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGGACCGC GCATGTACGCGACTTTGGGCTACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGGGATTC GTCACACTGGGCATGATCCCCGTGCCAATGCTCTTTTACAAATATGGTGG CAGCGTCAGAAAGTCGTCTCAATTGGAGTTGTGAACTGGTCCTCTCTTTT TCTCTCCGCTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTGCGGCC AACACGTTTTTCGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCCAATAT ATCTGCGTTGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTCGGCTT GTTTGACTACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTGAACAG CGTGGAATCGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGACCCGT GCTAGGACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTGGCACT GGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGCGGAAGA GGAATTTGATGTCACGTCGACGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCACAGGTT ATCTCATCGGTTATGTGGAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTTCTGAT GATACTGGTCAGTACCATCACGTTCATCAGCGACCCGACGTGCACCCTGT GATAGACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGACCCAA CAAACCCGAGATGGCCGGCGGTAAGGTGTTCTGGGTGCTGGTCATCGCGG GCGGCACGCTCTCTGCTCTGGTCATGGTTTTCAACCGGGAGACCAACCAC GTCGTAATCATCCGCCGCAAGACCGAGCGTCTTCGCAAGGAGCTCAATCG TCCCGAGCTCTACAGCTGCTATGAACCTGATGGAGCGGACGCCAAAGGTT CTTATACCGGTACCCTCGGCAAGCGGTTGATCATGCCCTTCTACCTCTTG GTCCGTTCGCCGATCGTGTTTCCCGTTGCGACCTATCTGGCCACACTGTA CGGATGCCTCTACTTGCTCTTCACCACCGTCACCGATGTCTTTAAGAAGT CCTACGGCTGGAGCACGGAAATCAGTGGCCTCGCATATCTCGGTCTCGGT GTCGGCTTTATCAGTGGCCAGATCGTCTTCGCCTTGGTCAGTGATCGCAT GATCACCCGGTTGAAGTTGCGCAACAACAACGTCTTTGAGCCGGAAATGC GCCTGTCAATCACCATGATCTTTGCCTTCTTCATCCCTGTCTCGTTCTTT TGGTACGGATGGTCTGCGCAGGAGAAAACACACTGGATTGTGCCCATCAT CGGCCTGGCACCCTTTGCGTTCGGCATGGTGGGTATTTACAATACCCTGC AGACCTATGTGATTGACTGCTATCCTCGGTACGCTGCCTCCGGTACCGCC GCGATGGTGGTTACCCGGTCGCTGATGGGTGCTCTGCTGCCGCTGGCGGG ACCGCGCATGTACGCGACTTTGGGCTACGGATGGGGTAATTCCCTGCTGG GATTCGTCACACTGGGCATGATCCCCGTGCCAATGCTCTTTTACAAATAT GGTGGCAGCGTCAGAAAGTCGTCTCAATTGGAGTTGTGAACTGGTCCTCT CTTTTTCTCTCCGCTGAGTGAGATGTACGGCCGACGGATCGTCCTCAGTG CGGCCAACACGTTTTTCGTCGCCTTCCAAATTGGCTGCGCGCTGGCCCCC AATATATCTGCGTTGATCGTCTTTCGTTTCCTGACGGGTGTTGGTGGCTC GGCTTGTTTGACTACAGGCGGTGGTGTGGTAGCGGATCTGTTTGTGGCTG AACAGCGTGGAATCGCAATGGCAGTTTATACTACGGGTATCTTGATCGGA CCCGTGCTAGGACCACTTCTTGGAGGTTTCATCGCTCAGCGAGCGGGTTG GCACTGGTCCATTCGCGTCCTCGGTCTTCTCTCCGGGCGTGGTATATGCG GAAGAGGAATTTGATGTCACGTCGACGATTTTGGGAACTCTCTCAGTCAC AGGTTATCTCATCGGTTATGTGGAATTTCCCTGTGTCCCAGAAGTGGTTT CTGATGATACTGGTCAGTACCATCACGTTCATCAGCGACCCGACGTGCAC CCTGTGATAGACTTGGAGAAGGATATGGTAGGATGGGACGGCGAGGATGA CCCAACAAACCCGAGATGGCCGGCGGTAAG back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR036259 |
| DBxref | InterPro:IPR020846 |
| DBxref | InterPro:IPR011701 |
| DBxref | PFAM:PF07690 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| An08 | supercontig | An08:2617857..2619620 - |
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