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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An09:139204..141056+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_005926-T1 ID=CBS51388_005926-T1|Name=CBS51388_005926-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1853bp|location=Sequence derived from alignment at An09:139204..141056+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTGGC
TGTCGCCTCTGTCCCAGCCATCGTCATTAAGGTAGCTAACCATCGCCATC
ACATCGATTCCTCCCACTGACCCTTTCTAGGGATCCAAATTCTTCTACGA
GAACAACGGCACGGAATTGTAAGTCATCCTCTCTTATCAGTTTAGATCAG
CACTTGCTAATGTGCCTCAGCTTCATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCGTAA
GCAACAATCTAACATGCCCGCTGGCCCTGTCTCCCCAAACTAATAATCCA
TCCAGCCCCCTATGATGGCACTGGCACGACGACCTCCGCTGGCACGGTCG
ATTTCGTCGATCCCCTTGCCAACGAGACCATCTGCAAGCGGGATCTGCCC
TACCTGCAGGAGCTCAACACCAACGTGGTCCGTGTTTACGATGTTGACCC
GGACGCGGACCACAGCACCTGCATGAACCTGCTGGCCGACGCCGGCATCT
ACGTGCTGGCGGACCTGTCCTCAGCGGACTACTCCATCGACAGCAGCGAC
CCGGAGTGGAACCTGGAGTTGTACGACTACTACGCCAGTGTGGTCGACTC
GCTGGCCAACTACACCAACACTCTGGGTTTCTTCGCGGGTAACGAGAACT
CCAACAGTGTCAACACCACCGGTGCCAGTGCCTACGTCAAGGCCGCCGTG
CGTGACATGAAGGCCTACATAAAGTCCAAGAACTACCGCAGCATCGGTGT
CGGTTACTCCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGTACCGACCTCGTTGACT
ACTTCAACTGCGGTGACTCGGACGATTCCGTCGACTTCTTCGGTGACAAC
GTCTACGAGTGGTGCGGTGACTCCAGCTACACTGAGTCCGGTTACAATGT
CATGACCGAGGATCTGAGCAACCTGTCCATCCCTTACTTCTTCTCCGAGT
ACGGTTGTATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAGCAACGTCCCCGTCATG
TACGGTCCTAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTGGTATTGTCTACGAGTA
CTTCCAGGATGCCAACGACTACGGTATGCCTCCCCCCTACCCCCTTTCAT
TAACAACAACCCATGTGACAGTTTAACTAACACCGCCCAGGTCTGGTCAC
CATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACCCTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCCG
AGGAGATCAACAGCGTCAGCCCCACCGGAACCAACAGCGCCAGCTACACC
CCCACCAACACCGTCGCGCGGTCCTGCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGA
AGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCCCCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGCA
TGGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGTGAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAG
TACGCCGACCTGTACAGCACCGTCTGCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTAT
CACCGGCAACACCACCACGGGAGAGTACGGTGCGTACAGCATGTGCAACA
CCAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCTGAACGCCTACTACGAGGAGCAGAAG
TCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCTGTGACTTTGCTGGCTCGGCTACCAC
CACTTCGACGACTTCTCCTACCGGTACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTG
TTGGCACCGCTGGTACGGGTACTGTCTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACC
AGCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCGGTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGG
TGTGCCTGGGTACATGACCTACACTGCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGG
TTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTTGTCCGGTACTGGAATGATTCTTTTG
TAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An09:139204..141056+ >CBS51388_005926-T1 ID=CBS51388_005926-T1|Name=CBS51388_005926-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=8130bp|location=Sequence derived from alignment at An09:139204..141056+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTGGC
TGTCGCCTCTGTCCCAGCCATCGTCATTAAGGGATCCAAATTCTTCTACG
AGAACAACGGCACGGAATTCTTCATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCCCCCC
TATGATGGCACTGGCACGACGACCTCCGCTGGCACGGTCGATTTCGTCGA
TCCCCTTGCCAACGAGACCATCTGCAAGCGGGATCTGCCCTACCTGCAGG
AGCTCAACACCAACGTGGTCCGTGTTTACGATGTTGACCCGGACGCGGAC
CACAGCACCTGCATGAACCTGCTGGCCGACGCCGGCATCTACGTGCTGGC
GGACCTGTCCTCAGCGGACTACTCCATCGACAGCAGCGACCCGGAGTGGA
ACCTGGAGTTGTACGACTACTACGCCAGTGTGGTCGACTCGCTGGCCAAC
TACACCAACACTCTGGGTTTCTTCGCGGGTAACGAGAACTCCAACAGTGT
CAACACCACCGGTGCCAGTGCCTACGTCAAGGCCGCCGTGCGTGACATGA
AGGCCTACATAAAGTCCAAGAACTACCGCAGCATCGGTGTCGGTTACTCC
GCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGTACCGACCTCGTTGACTACTTCAACTG
CGGTGACTCGGACGATTCCGTCGACTTCTTCGGTGACAACGTCTACGAGT
GGTGCGGTGACTCCAGCTACACTGAGTCCGGTTACAATGTCATGACCGAG
GATCTGAGCAACCTGTCCATCCCTTACTTCTTCTCCGAGTACGGTTGTAT
CACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAGCAACGTCCCCGTCATGTACGGTCCTA
AGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTGGTATTGTCTACGAGTACTTCCAGGAT
GCCAACGACTACGGTCTGGTCACCATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACCCT
GACCGGCTTCTCCTCCTACTCCGAGGAGATCAACAGCGTCAGCCCCACCG
GAACCAACAGCGCCAGCTACACCCCCACCAACACCGTCGCGCGGTCCTGC
CCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGAAGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCCCC
CAACTCGGAACTCTGCTCCTGCATGGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGTGA
AGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAGTACGCCGACCTGTACAGCACCGTCTGC
GGATACGGCGTGTGCGCGGGTATCACCGGCAACACCACCACGGGAGAGTA
CGGTGCGTACAGCATGTGCAACACCAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCTGA
ACGCCTACTACGAGGAGCAGAAGTCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCTGT
GACTTTGCTGGCTCGGCTACCACCACTTCGACGACTTCTCCTACCGGTAC
TTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTGTTGGCACCGCTGGTACGGGTACTGTCT
CGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACCAGCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCGGT
AGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGGTGTGCCTGGGTACATGACCTACACTGC
TACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGGTTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTTGT
CCGGTACTGGAATGATTCTTTTGTAGATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTA
GCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTGGCTGTCGCCTCTGTCCCAGCCATCGT
CATTAAGGGATCCAAATTCTTCTACGAGAACAACGGCACGGAATTCTTCA
TCCGTGGTGTGGCCTACCAGCCCCCCTATGATGGCACTGGCACGACGACC
TCCGCTGGCACGGTCGATTTCGTCGATCCCCTTGCCAACGAGACCATCTG
CAAGCGGGATCTGCCCTACCTGCAGGAGCTCAACACCAACGTGGTCCGTG
TTTACGATGTTGACCCGGACGCGGACCACAGCACCTGCATGAACCTGCTG
GCCGACGCCGGCATCTACGTGCTGGCGGACCTGTCCTCAGCGGACTACTC
CATCGACAGCAGCGACCCGGAGTGGAACCTGGAGTTGTACGACTACTACG
CCAGTGTGGTCGACTCGCTGGCCAACTACACCAACACTCTGGGTTTCTTC
GCGGGTAACGAGAACTCCAACAGTGTCAACACCACCGGTGCCAGTGCCTA
CGTCAAGGCCGCCGTGCGTGACATGAAGGCCTACATAAAGTCCAAGAACT
ACCGCAGCATCGGTGTCGGTTACTCCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGT
ACCGACCTCGTTGACTACTTCAACTGCGGTGACTCGGACGATTCCGTCGA
CTTCTTCGGTGACAACGTCTACGAGTGGTGCGGTGACTCCAGCTACACTG
AGTCCGGTTACAATGTCATGACCGAGGATCTGAGCAACCTGTCCATCCCT
TACTTCTTCTCCGAGTACGGTTGTATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAG
CAACGTCCCCGTCATGTACGGTCCTAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTG
GTATTGTCTACGAGTACTTCCAGGATGCCAACGACTACGGTCTGGTCACC
ATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACCCTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCCGA
GGAGATCAACAGCGTCAGCCCCACCGGAACCAACAGCGCCAGCTACACCC
CCACCAACACCGTCGCGCGGTCCTGCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGAA
GCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCCCCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGCAT
GGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGTGAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAGT
ACGCCGACCTGTACAGCACCGTCTGCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTATC
ACCGGCAACACCACCACGGGAGAGTACGGTGCGTACAGCATGTGCAACAC
CAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCTGAACGCCTACTACGAGGAGCAGAAGT
CGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCTGTGACTTTGCTGGCTCGGCTACCACC
ACTTCGACGACTTCTCCTACCGGTACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTGT
TGGCACCGCTGGTACGGGTACTGTCTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACCA
GCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCGGTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGGT
GTGCCTGGGTACATGACCTACACTGCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGGT
TGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTTGTCCGGTACTGGAATGATTCTTTTGT
AGATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTG
GCTGTCGCCTCTGTCCCAGCCATCGTCATTAAGGGATCCAAATTCTTCTA
CGAGAACAACGGCACGGAATTCTTCATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCCCC
CCTATGATGGCACTGGCACGACGACCTCCGCTGGCACGGTCGATTTCGTC
GATCCCCTTGCCAACGAGACCATCTGCAAGCGGGATCTGCCCTACCTGCA
GGAGCTCAACACCAACGTGGTCCGTGTTTACGATGTTGACCCGGACGCGG
ACCACAGCACCTGCATGAACCTGCTGGCCGACGCCGGCATCTACGTGCTG
GCGGACCTGTCCTCAGCGGACTACTCCATCGACAGCAGCGACCCGGAGTG
GAACCTGGAGTTGTACGACTACTACGCCAGTGTGGTCGACTCGCTGGCCA
ACTACACCAACACTCTGGGTTTCTTCGCGGGTAACGAGAACTCCAACAGT
GTCAACACCACCGGTGCCAGTGCCTACGTCAAGGCCGCCGTGCGTGACAT
GAAGGCCTACATAAAGTCCAAGAACTACCGCAGCATCGGTGTCGGTTACT
CCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGTACCGACCTCGTTGACTACTTCAAC
TGCGGTGACTCGGACGATTCCGTCGACTTCTTCGGTGACAACGTCTACGA
GTGGTGCGGTGACTCCAGCTACACTGAGTCCGGTTACAATGTCATGACCG
AGGATCTGAGCAACCTGTCCATCCCTTACTTCTTCTCCGAGTACGGTTGT
ATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAGCAACGTCCCCGTCATGTACGGTCC
TAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTGGTATTGTCTACGAGTACTTCCAGG
ATGCCAACGACTACGGTCTGGTCACCATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACC
CTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCCGAGGAGATCAACAGCGTCAGCCCCAC
CGGAACCAACAGCGCCAGCTACACCCCCACCAACACCGTCGCGCGGTCCT
GCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGAAGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCC
CCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGCATGGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGT
GAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAGTACGCCGACCTGTACAGCACCGTCT
GCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTATCACCGGCAACACCACCACGGGAGAG
TACGGTGCGTACAGCATGTGCAACACCAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCT
GAACGCCTACTACGAGGAGCAGAAGTCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCT
GTGACTTTGCTGGCTCGGCTACCACCACTTCGACGACTTCTCCTACCGGT
ACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTGTTGGCACCGCTGGTACGGGTACTGT
CTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACCAGCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCG
GTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGGTGTGCCTGGGTACATGACCTACACT
GCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGGTTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTT
GTCCGGTACTGGAATGATTCTTTTGTAGATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTG
TAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACGTGGCTGTCGCCTCTGTCCCAGCCATC
GTCATTAAGGGATCCAAATTCTTCTACGAGAACAACGGCACGGAATTCTT
CATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCCCCCCTATGATGGCACTGGCACGACGA
CCTCCGCTGGCACGGTCGATTTCGTCGATCCCCTTGCCAACGAGACCATC
TGCAAGCGGGATCTGCCCTACCTGCAGGAGCTCAACACCAACGTGGTCCG
TGTTTACGATGTTGACCCGGACGCGGACCACAGCACCTGCATGAACCTGC
TGGCCGACGCCGGCATCTACGTGCTGGCGGACCTGTCCTCAGCGGACTAC
TCCATCGACAGCAGCGACCCGGAGTGGAACCTGGAGTTGTACGACTACTA
CGCCAGTGTGGTCGACTCGCTGGCCAACTACACCAACACTCTGGGTTTCT
TCGCGGGTAACGAGAACTCCAACAGTGTCAACACCACCGGTGCCAGTGCC
TACGTCAAGGCCGCCGTGCGTGACATGAAGGCCTACATAAAGTCCAAGAA
CTACCGCAGCATCGGTGTCGGTTACTCCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCC
GTACCGACCTCGTTGACTACTTCAACTGCGGTGACTCGGACGATTCCGTC
GACTTCTTCGGTGACAACGTCTACGAGTGGTGCGGTGACTCCAGCTACAC
TGAGTCCGGTTACAATGTCATGACCGAGGATCTGAGCAACCTGTCCATCC
CTTACTTCTTCTCCGAGTACGGTTGTATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTC
AGCAACGTCCCCGTCATGTACGGTCCTAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGG
TGGTATTGTCTACGAGTACTTCCAGGATGCCAACGACTACGGTCTGGTCA
CCATCTCCGACGGCTCCGTCAGCACCCTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCC
GAGGAGATCAACAGCGTCAGCCCCACCGGAACCAACAGCGCCAGCTACAC
CCCCACCAACACCGTCGCGCGGTCCTGCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGG
AAGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGGCCCCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGC
ATGGAAGAGACCCTCACCTGCGTCGTGAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAA
GTACGCCGACCTGTACAGCACCGTCTGCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTA
TCACCGGCAACACCACCACGGGAGAGTACGGTGCGTACAGCATGTGCAAC
ACCAAGCAGATGCTCAACTGGGCCCTGAACGCCTACTACGAGGAGCAGAA
GTCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGCCTGTGACTTTGCTGGCTCGGCTACCA
CCACTTCGACGACTTCTCCTACCGGTACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCT
GTTGGCACCGCTGGTACGGGTACTGTCTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCAC
CAGCACTGGCGACTCCAGCAGCAGCGGTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTG
GTGTGCCTGGGTACATGACCTACACTGCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTG
GTTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTGTTGTCCGGTACTGGAATGATTCTTTT
GTAGATGAAGCTCGCCGCCTCTGCTGTAGCGGCGGCTGCCCTCGTCGACG
TGGCTGTCGCCTCTGTCCCAGCCATCGTCATTAAGGGATCCAAATTCTTC
TACGAGAACAACGGCACGGAATTCTTCATCCGTGGTGTGGCCTACCAGCC
CCCCTATGATGGCACTGGCACGACGACCTCCGCTGGCACGGTCGATTTCG
TCGATCCCCTTGCCAACGAGACCATCTGCAAGCGGGATCTGCCCTACCTG
CAGGAGCTCAACACCAACGTGGTCCGTGTTTACGATGTTGACCCGGACGC
GGACCACAGCACCTGCATGAACCTGCTGGCCGACGCCGGCATCTACGTGC
TGGCGGACCTGTCCTCAGCGGACTACTCCATCGACAGCAGCGACCCGGAG
TGGAACCTGGAGTTGTACGACTACTACGCCAGTGTGGTCGACTCGCTGGC
CAACTACACCAACACTCTGGGTTTCTTCGCGGGTAACGAGAACTCCAACA
GTGTCAACACCACCGGTGCCAGTGCCTACGTCAAGGCCGCCGTGCGTGAC
ATGAAGGCCTACATAAAGTCCAAGAACTACCGCAGCATCGGTGTCGGTTA
CTCCGCCGCTGATGTCTCGGAGATCCGTACCGACCTCGTTGACTACTTCA
ACTGCGGTGACTCGGACGATTCCGTCGACTTCTTCGGTGACAACGTCTAC
GAGTGGTGCGGTGACTCCAGCTACACTGAGTCCGGTTACAATGTCATGAC
CGAGGATCTGAGCAACCTGTCCATCCCTTACTTCTTCTCCGAGTACGGTT
GTATCACCGTCCAGCCCCGTTCCTTCAGCAACGTCCCCGTCATGTACGGT
CCTAAGATGGATGGCTGGCTCGCCGGTGGTATTGTCTACGAGTACTTCCA
GGATGCCAACGACTACGGTCTGGTCACCATCTCCGACGGCTCCGTCAGCA
CCCTGACCGGCTTCTCCTCCTACTCCGAGGAGATCAACAGCGTCAGCCCC
ACCGGAACCAACAGCGCCAGCTACACCCCCACCAACACCGTCGCGCGGTC
CTGCCCGACCGTCGGCTCCAGCTGGGAAGCCGCCAGCGCCTTGCCCCCGG
CCCCCAACTCGGAACTCTGCTCCTGCATGGAAGAGACCCTCACCTGCGTC
GTGAAGGACAGCGTCTCCTCCAAAAAGTACGCCGACCTGTACAGCACCGT
CTGCGGATACGGCGTGTGCGCGGGTATCACCGGCAACACCACCACGGGAG
AGTACGGTGCGTACAGCATGTGCAACACCAAGCAGATGCTCAACTGGGCC
CTGAACGCCTACTACGAGGAGCAGAAGTCGGCGGGCAACGGTGCCTCGGC
CTGTGACTTTGCTGGCTCGGCTACCACCACTTCGACGACTTCTCCTACCG
GTACTTGCTCTTCTCTGCTCAAGGCTGTTGGCACCGCTGGTACGGGTACT
GTCTCGTTGTCTGCGGCTGCTGGCACCAGCACTGGCGACTCCAGCAGCAG
CGGTAGCTCCGAGAGTAGCTCCGCTGGTGTGCCTGGGTACATGACCTACA
CTGCTACCCTGGGTCTGGGTCAGTTGGTTGCGTTTGTTGCTGTCGGTGTG
TTGTCCGGTACTGGAATGATTCTTTTGTAG back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-19) |
| Note | CAZy:CBM43 |
| Note | CAZy:GH72 |
| DBxref | InterPro:IPR017853 |
| DBxref | InterPro:IPR004886 |
| DBxref | InterPro:IPR012946 |
| DBxref | PFAM:PF07983 |
| DBxref | PFAM:PF03198 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An09 | supercontig | An09:139204..141056 + |
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