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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An09:645332..647111- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_006102-T1 ID=CBS51388_006102-T1|Name=CBS51388_006102-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1780bp|location=Sequence derived from alignment at An09:645332..647111- (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCCCTGGCCGT
CTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGATCGTGAGC
CTCCCTCGCCGCTATCCCCGATCTAGTCATCGGAATCACATGCTAATTTG
AACGTCCAGAGGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAA
GACCTCTTCACCGCGACCAAGAACAATTCAACCATGCAAGCCTTGGTTAC
ATCCGTTTATGAGTTAGGTTCGTTGCAACGCCCCTCCTGAGTTACAATGC
GCGCGCCCCCCCAATTCTAACGCGTCTCGTCGCATAGGTTGTCTTGTGGG
TGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGACAAGACTGGACGTAAATGGATGA
TCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATTATTGGTGTCGTCATCCAGGTTACC
TCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGCAGTTCTTCATTGGTCGTGTCAT
CACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACCTCGACTATCCCGACCTACCAGG
CCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGGTCTGCTCATCTGTATTGAGGGT
GGTATCATCGCCATCGGAACTGCGATTGCCTACTGGATTGACTATGGTGC
CCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGGCGTTTCCCCATTGCCTTCCAGA
TCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGGCATGTGGTTCCTTCCCGACTCT
CCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCGTCCAGGAGGGTGAGTACGTGCT
TGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCATGACCACGAGACCCAGCTCCAGA
AGCAGCTGGTCATTGATTCCATTAGAGCGTAAGTTTGCCGGATAATACCT
GGATAACGCGTGGCACCAGATGCTAACAGTTCTGTGCAGTTCGAACGCCG
CTGGCAAGGATGTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAG
CACTTCCGTCGTATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACT
CGGTGGTTGCAACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACT
CCCTTCACGAGACTGAGAACTTCTCCCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATG
ATTGTCTACGCTATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGAT
CGGTCGTCGCAAGCTCTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCA
TGGTTATCACCTTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACCGCCAAG
GGTGCTGTCTTCGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTG
GTTGCCTCTGCCCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCC
GTGCCAAGGCCAACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTC
CTGATTGTCATGATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTAC
TTACCTGTTCTTCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGT
TCTTCTACCCCGAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATC
TTCGCCAAGGGTTACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGA
GCTGCCCAAGCTCACCGACGACGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACG
GCTTCGGAGGTGCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCG
GGCTCCAACAGCGCCCGCGAGTCGGAGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An09:645332..647111- >CBS51388_006102-T1 ID=CBS51388_006102-T1|Name=CBS51388_006102-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=6336bp|location=Sequence derived from alignment at An09:645332..647111- (Aspergillus niger CBS 513.88)
TTCGAACGCCGCTGGCAAGGATGTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTG
GCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGTATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATC
TTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCT
GCTCCAGGACTCCCTTCACGAGACTGAGAACTTCTCCCTGGTCATTGGTG
GTGTCAACATGATTGTCTACGCTATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTC
ATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAAGCTCTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCA
GTGCATTGCCATGGTTATCACCTTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGG
AGACCGCCAAGGGTGCTGTCTTCGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTC
GGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCCCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCC
CATCAAGACCCGTGCCAAGGCCAACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGC
TCTTCAACTTCCTGATTGTCATGATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATC
GGCTGGGGTACTTACCTGTTCTTCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCC
CTTCATCTGGTTCTTCTACCCCGAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGA
TCGATATCATCTTCGCCAAGGGTTACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGC
GCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCTCACCGACGACGAAGTCGAGCAGAAGGC
CATGGAGTACGGCTTCGGAGGTGCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCG
CCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGCGCCCGCGAGTCGGAGTAAGTTGTCTTG
TGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGACAAGACTGGACGTAAATGG
ATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATTATTGGTGTCGTCATCCAGGT
TACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGCAGTTCTTCATTGGTCGTG
TCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACCTCGACTATCCCGACCTAC
CAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGGTCTGCTCATCTGTATTGA
GGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTGCGATTGCCTACTGGATTGACTATG
GTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGGCGTTTCCCCATTGCCTTC
CAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGGCATGTGGTTCCTTCCCGA
CTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCGTCCAGGAGGGTGAGTACG
TGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCATGACCACGAGACCCAGCTC
CAGAAGCAGCTGGTCATTGATTCCATTAGAGCAGGGTGTCATGTCCGGTA
TTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCTTCACCGCGACCAAGAACAAT
TCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTTTATGAGTTAGATGGCGCCGA
CCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCCCTGGCCGTCTCGACGATT
GCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGATCTTCGAACGCCGCTGGC
AAGGATGTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTT
CCGTCGTATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTG
GTTGCAACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTT
CACGAGACTGAGAACTTCTCCCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGT
CTACGCTATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTC
GTCGCAAGCTCTTCCTGGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTT
ATCACCTTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCAGGAGACCGCCAAGGGTGC
TGTCTTCGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGC
CTCTGCCCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCC
AAGGCCAACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGAT
TGTCATGATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACC
TGTTCTTCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTC
TACCCCGAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGC
CAAGGGTTACACCGAGAACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGC
CCAAGCTCACCGACGACGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTC
GGAGGTGCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTC
CAACAGCGCCCGCGAGTCGGAGTAAGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGC
TCTCTTCTTCGGTGACAAGACTGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTG
CCATTGTCATGATTATTGGTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGA
CACATCCCGCTTCTGCAGTTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGG
TAACGGCATGAACACCTCGACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCA
AGACCAGCAACCGTGGTCTGCTCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCC
ATCGGAACTGCGATTGCCTACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAA
CAAGGACCTGGTGTGGCGTTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTC
TCATCATCATCGTCGGCATGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTC
ATCTCCAAGGACCGCGTCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGG
TGGCTGGGAGATCCATGACCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCA
TTGATTCCATTAGAGCAGGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGC
TTTCGAAGACCTCTTCACCGCGACCAAGAACAATTCAACCATGCAAGCCT
TGGTTACATCCGTTTATGAGTTAGATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTC
GGGCAGGAAACTGTCCCTGGCCGTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCT
TGCTGTTCGGTTATGATCTTCGAACGCCGCTGGCAAGGATGTCGGATACC
GTGACCTTCTCACTGGTGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGTATGGTTATC
GGTTCCTCCTCGCAGATCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAACGCTGTCAT
CTACTATCTCCCTGTGCTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAGACTGAGAACT
TCTCCCTGGTCATTGGTGGTGTCAACATGATTGTCTACGCTATCTTTGCC
ACTTTCTCCTGGTTCTTCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAAGCTCTTCCT
GGGTGGATCTTTCCTTCAGTGCATTGCCATGGTTATCACCTTTGCCTGTT
TGATCCCTGGTGACCAGGAGACCGCCAAGGGTGCTGTCTTCGGTCTGTTC
CTCTACATGGCCGCTTTCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCCCTGGTTGTA
CCCTGCTGAGCTGTCCCCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCCAACGCTGTCT
CGACCTGCAGCAACTGGCTCTTCAACTTCCTGATTGTCATGATCACCCCC
GTCATGGTCTCCCACATCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCTTCGCCGTCCT
CAACGGCCTGTTCATCCCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCCGAGACCGCCA
ACCGCAGTCTGGAGGAGATCGATATCATCTTCGCCAAGGGTTACACCGAG
AACATCAGCTACGTGCGCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCTCACCGACGA
CGAAGTCGAGCAGAAGGCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGTGCCAGCGACG
AGGAGAAGGTCACCACCGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGCGCCCGCGAG
TCGGAGTAAGTTGTCTTGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGAC
AAGACTGGACGTAAATGGATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATTAT
TGGTGTCGTCATCCAGGTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGC
AGTTCTTCATTGGTCGTGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACC
TCGACTATCCCGACCTACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGG
TCTGCTCATCTGTATTGAGGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTGCGATTG
CCTACTGGATTGACTATGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGG
CGTTTCCCCATTGCCTTCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGG
CATGTGGTTCCTTCCCGACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCG
TCCAGGAGGGTGAGTACGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCAT
GACCACGAGACCCAGCTCCAGAAGCAGCTGGTCATTGATTCCATTAGAGC
AGGGTGTCATGTCCGGTATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCTTC
ACCGCGACCAAGAACAATTCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTTTA
TGAGTTAGATGGCGCCGACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCC
CTGGCCGTCTCGACGATTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGA
TCTTCGAACGCCGCTGGCAAGGATGTCGGATACCGTGACCTTCTCACTGG
TGGCCGCTCCCAGCACTTCCGTCGTATGGTTATCGGTTCCTCCTCGCAGA
TCTTCCAGCAACTCGGTGGTTGCAACGCTGTCATCTACTATCTCCCTGTG
CTGCTCCAGGACTCCCTTCACGAGACTGAGAACTTCTCCCTGGTCATTGG
TGGTGTCAACATGATTGTCTACGCTATCTTTGCCACTTTCTCCTGGTTCT
TCATTGAAAAGATCGGTCGTCGCAAGCTCTTCCTGGGTGGATCTTTCCTT
CAGTGCATTGCCATGGTTATCACCTTTGCCTGTTTGATCCCTGGTGACCA
GGAGACCGCCAAGGGTGCTGTCTTCGGTCTGTTCCTCTACATGGCCGCTT
TCGGTGCCGCTTGGTTGCCTCTGCCCTGGTTGTACCCTGCTGAGCTGTCC
CCCATCAAGACCCGTGCCAAGGCCAACGCTGTCTCGACCTGCAGCAACTG
GCTCTTCAACTTCCTGATTGTCATGATCACCCCCGTCATGGTCTCCCACA
TCGGCTGGGGTACTTACCTGTTCTTCGCCGTCCTCAACGGCCTGTTCATC
CCCTTCATCTGGTTCTTCTACCCCGAGACCGCCAACCGCAGTCTGGAGGA
GATCGATATCATCTTCGCCAAGGGTTACACCGAGAACATCAGCTACGTGC
GCGCTGCCCACGAGCTGCCCAAGCTCACCGACGACGAAGTCGAGCAGAAG
GCCATGGAGTACGGCTTCGGAGGTGCCAGCGACGAGGAGAAGGTCACCAC
CGCCGAGGTCTCGGGCTCCAACAGCGCCCGCGAGTCGGAGTAAGTTGTCT
TGTGGGTGCCATGTTCGCTCTCTTCTTCGGTGACAAGACTGGACGTAAAT
GGATGATCTTCTCGGGTGCCATTGTCATGATTATTGGTGTCGTCATCCAG
GTTACCTCGTATGCCGGACACATCCCGCTTCTGCAGTTCTTCATTGGTCG
TGTCATCACCGGTATCGGTAACGGCATGAACACCTCGACTATCCCGACCT
ACCAGGCCGAGTGCTCCAAGACCAGCAACCGTGGTCTGCTCATCTGTATT
GAGGGTGGTATCATCGCCATCGGAACTGCGATTGCCTACTGGATTGACTA
TGGTGCCCACTTCGGTAACAAGGACCTGGTGTGGCGTTTCCCCATTGCCT
TCCAGATCTTCTTTGGTCTCATCATCATCGTCGGCATGTGGTTCCTTCCC
GACTCTCCCCGTTACCTCATCTCCAAGGACCGCGTCCAGGAGGGTGAGTA
CGTGCTTGCTGCCTTGGGTGGCTGGGAGATCCATGACCACGAGACCCAGC
TCCAGAAGCAGCTGGTCATTGATTCCATTAGAGCAGGGTGTCATGTCCGG
TATTATCAGCGATACCGCTTTCGAAGACCTCTTCACCGCGACCAAGAACA
ATTCAACCATGCAAGCCTTGGTTACATCCGTTTATGAGTTAGATGGCGCC
GACCTACGCTGGCCTGTCGGGCAGGAAACTGTCCCTGGCCGTCTCGACGA
TTGCGACGATGGGTTTCTTGCTGTTCGGTTATGATC back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016021 | integral component of membrane |
| GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR036259 |
| DBxref | InterPro:IPR020846 |
| DBxref | InterPro:IPR005829 |
| DBxref | InterPro:IPR005828 |
| DBxref | InterPro:IPR003663 |
| DBxref | PFAM:PF00083 |
| DBxref | PFAM:PF07690 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An09 | supercontig | An09:645332..647111 - |
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