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The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An09:904461..907538- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_006192-T1 ID=CBS51388_006192-T1|Name=CBS51388_006192-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=3078bp|location=Sequence derived from alignment at An09:904461..907538- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGGCCTACCAAGGCACTGGTAATCACTCGCCTCCCGGCTACGATGACGG
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TCGAGCCAAACGGGCCCATTCACAGGTCCCTTTGATGACCCTCAGCAGCG
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ATGCTGCCGATGCGGGTTATCATGATCCTTACAGTGCAGGTGGCTCGGTT
TACTCTGCACAGTCTGGAGAGAACCCCGCGACTGCCTTTGGCGTCCCCGG
CCGCGTTGCTTCGCCCTATGCTCGTAGCGAGACCTCGTCAACAGAGGCTT
GGCGCCAGAGACAGGCTCCTGGAGGTGCTGGTAGTGGTGGCGGCGGTGGC
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GAGTGTTGACTACCCAGTGCCTAGTGCTATTCAAAATGCAATCCAGGCAA
AGTATAGGAACGACCTGGAGGGCGGAAGCGAAGAATTCACACACATGCGT
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ATTGCCTTGGTATAGACACCGCAGCCACATGTGATCCTAACGAGTTCACC
CTTCATAATGGCTATAACCTTCGTCCTGCCATGTACAACAGACACACCGA
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CTGCCTGGTGTTTGATGGTATTGATCCCTGTGACAAGGATGTGCTGGATG
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ACATGTGGAATGTGCTAACAGCTGATAGTTCGAATACACGACGCAATTAT
CCGTTACCCCCAACCAGCAGCTCATTCGCCCGACAGATGACGGTCCCAGC
ACACTACCTCCTGTTCAGATGATGTTCTGTTTGAAGCAGAAGAACAGCAA
GAAGATCAACTCTCATAGATGGCTTTTCAACGCTTTCGGCCGTATCCTGA
ACCCCGAGGTCTGCATTCTTCTCGATGCTGGTACCAAGCCTGGTCACAAG
TCACTCTTGGCCCTGTGGGAGGCCTTCTACAACGACAAGGACCTCGGAGG
TGCTTGTGGTGAAATTCACGCCATGTTGGGTAAGGGTTGGAGAAACCTAA
TCAACCCTCTCGTTGCCGCCCAGAACTTCGAATATAAAATCAGTAACATC
CTCGACAAGCCGTTGGAGAGTTCCTTCGGCTATGTCAGTGTGTTGCCTGG
TGCTTTCTCAGCATACCGATTCCGTGCCATCATGGGCCGCCCACTGGAGC
AGTATTTCCATGGTGATCATACGCTCTCCAAACAGCTGGGCAAGAAGGGT
ATCGAGGGAATGAACATTTTCAAGAAGAACATGTTCTTGGCCGAGGACCG
TATCTTGTGTTTCGAGCTGGTTGCTAAGGCTGGCTCAAAATGGCATTTGT
CATACGTTAAAGCCTCAAAGGGTGAAACTGACGTGCCTGAAGGTGCTGCT
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TCATTCGAATGTTCTTCCTTCATATTCAGATGTTGTACAACACTTTCTCG
ACTATACTTACATGGTTCTCTCTGGGTATGTTTCGCGGTCCTTTTCGACT
ATAGCATAAACTTGAGAGCTTTTACTGACTTTCGGCAACCAGCATCCTAT
TGGCTTACAACATCGGTCATTATGGACCTGGTCGGTACTCCTAGCGCTAG
CAACGGTCACACAGGTTTCCCCTTTGGCAAAACGGCAACTCCCATCGTCA
ACACGATTGTCAAATATGCCTACCTTGGTTTCCTGCTCCTCCAGTTCATT
CTCGCTTTGGGTAACCGCCCGAAAGGTTCCCGTTTCTCGTACCTGGCATC
CTTCGTTGTCTTCGGTATCATTCAGCTCTACGTTGTCGTCGATGCACTAT
ACCTGGTAGTCCGCGCTTTCAGTGGCAGTGCTCCGATGGACTTTGATACC
ACGCACGGTGTTGGTGCGTTCCTTGGTTCGTTCTTCGGGTCGACAGGTGC
CGGTATCATTATCATTGCGCTTGCTGCCACTTTCGGTCTCTACTTCGTGG
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TACATGGCCGTGCAGTCTTCTTACATCAACATTCTGAACGTCTATGCCTT
CAGCAACTGGCACGATGTGTCTTGGGGTACCAAGGGTTCTGATAAGGCGG
ATGCTCTTCCCTCCGCGAAGACTACCAAGGAAGGGGGCAAGGAGACCGTC
ATTGAGGAAATTGACAAGCCCCAGGCCGATATTGACAGCCAATTTGAAGC
TACGGTGAAGCGTGCTTTGACACCATATGTGGCTCCCGTGGAGAAGGATG
AGAAGAGTTTGGATGACTCGTACAAGAGCTTCCGTACGAGATTGGTGACG
TTCTGGATCTTCAGTAACGCTCTAATGGCTGTTTGCATCACCAGCGATGG
TGTGGATAAGTTTGGCTTCACAGTACGTATATCCCCTACACCAAACGAAG
TCTTGATTCCCAAAAAGACAAAACTAACGGCTTGGTCCAGAACTCTGCCA
CCGATCGTACGTCACGCTTCTTCCAGGCCCTACTGTGGTCAAACGCCGTT
GTTGCGCTTTTCCGCTTCATCGGAGCCTGCTGGTTCCTGGGTAAGACCGG
TGTGATGTGTTGCTTTGCCCGCCGCTAG back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An09:904461..907538- >CBS51388_006192-T1 ID=CBS51388_006192-T1|Name=CBS51388_006192-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=16470bp|location=Sequence derived from alignment at An09:904461..907538- (Aspergillus niger CBS 513.88) AACTCTGCCACCGATCGTACGTCACGCTTCTTCCAGGCCCTACTGTGGTC AAACGCCGTTGTTGCGCTTTTCCGCTTCATCGGAGCCTGCTGGTTCCTGG GTAAGACCGGTGTGATGTGTTGCTTTGCCCGCCGCTAGCATCCTATTGGC TTACAACATCGGTCATTATGGACCTGGTCGGTACTCCTAGCGCTAGCAAC GGTCACACAGGTTTCCCCTTTGGCAAAACGGCAACTCCCATCGTCAACAC GATTGTCAAATATGCCTACCTTGGTTTCCTGCTCCTCCAGTTCATTCTCG CTTTGGGTAACCGCCCGAAAGGTTCCCGTTTCTCGTACCTGGCATCCTTC GTTGTCTTCGGTATCATTCAGCTCTACGTTGTCGTCGATGCACTATACCT GGTAGTCCGCGCTTTCAGTGGCAGTGCTCCGATGGACTTTGATACCACGC ACGGTGTTGGTGCGTTCCTTGGTTCGTTCTTCGGGTCGACAGGTGCCGGT ATCATTATCATTGCGCTTGCTGCCACTTTCGGTCTCTACTTCGTGGCTTC GTTCATGTACATGGACCCTTGGCACATGTTCACCTCGTTCCCTCAGTACA TGGCCGTGCAGTCTTCTTACATCAACATTCTGAACGTCTATGCCTTCAGC AACTGGCACGATGTGTCTTGGGGTACCAAGGGTTCTGATAAGGCGGATGC TCTTCCCTCCGCGAAGACTACCAAGGAAGGGGGCAAGGAGACCGTCATTG AGGAAATTGACAAGCCCCAGGCCGATATTGACAGCCAATTTGAAGCTACG GTGAAGCGTGCTTTGACACCATATGTGGCTCCCGTGGAGAAGGATGAGAA GAGTTTGGATGACTCGTACAAGAGCTTCCGTACGAGATTGGTGACGTTCT GGATCTTCAGTAACGCTCTAATGGCTGTTTGCATCACCAGCGATGGTGTG GATAAGTTTGGCTTCACATTCGAATACACGACGCAATTATCCGTTACCCC CAACCAGCAGCTCATTCGCCCGACAGATGACGGTCCCAGCACACTACCTC CTGTTCAGATGATGTTCTGTTTGAAGCAGAAGAACAGCAAGAAGATCAAC TCTCATAGATGGCTTTTCAACGCTTTCGGCCGTATCCTGAACCCCGAGGT CTGCATTCTTCTCGATGCTGGTACCAAGCCTGGTCACAAGTCACTCTTGG CCCTGTGGGAGGCCTTCTACAACGACAAGGACCTCGGAGGTGCTTGTGGT GAAATTCACGCCATGTTGGGTAAGGGTTGGAGAAACCTAATCAACCCTCT CGTTGCCGCCCAGAACTTCGAATATAAAATCAGTAACATCCTCGACAAGC CGTTGGAGAGTTCCTTCGGCTATGTCAGTGTGTTGCCTGGTGCTTTCTCA GCATACCGATTCCGTGCCATCATGGGCCGCCCACTGGAGCAGTATTTCCA TGGTGATCATACGCTCTCCAAACAGCTGGGCAAGAAGGGTATCGAGGGAA TGAACATTTTCAAGAAGAACATGTTCTTGGCCGAGGACCGTATCTTGTGT TTCGAGCTGGTTGCTAAGGCTGGCTCAAAATGGCATTTGTCATACGTTAA 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CAGTCCTGAGTGTTGACTACCCAGTGCCTAGTGCTATTCAAAATGCAATC CAGGCAAAGTATAGGAACGACCTGGAGGGCGGAAGCGAAGAATTCACACA CATGCGTTATGGCCTACCAAGGCACTGGTAATCACTCGCCTCCCGGCTAC GATGACGGTGGGCATCGGCTTCAGGATCTACCAGCCGGCAACAACAACTC TGCCACCGATCGTACGTCACGCTTCTTCCAGGCCCTACTGTGGTCAAACG CCGTTGTTGCGCTTTTCCGCTTCATCGGAGCCTGCTGGTTCCTGGGTAAG ACCGGTGTGATGTGTTGCTTTGCCCGCCGCTAGCATCCTATTGGCTTACA ACATCGGTCATTATGGACCTGGTCGGTACTCCTAGCGCTAGCAACGGTCA CACAGGTTTCCCCTTTGGCAAAACGGCAACTCCCATCGTCAACACGATTG TCAAATATGCCTACCTTGGTTTCCTGCTCCTCCAGTTCATTCTCGCTTTG GGTAACCGCCCGAAAGGTTCCCGTTTCTCGTACCTGGCATCCTTCGTTGT CTTCGGTATCATTCAGCTCTACGTTGTCGTCGATGCACTATACCTGGTAG TCCGCGCTTTCAGTGGCAGTGCTCCGATGGACTTTGATACCACGCACGGT GTTGGTGCGTTCCTTGGTTCGTTCTTCGGGTCGACAGGTGCCGGTATCAT TATCATTGCGCTTGCTGCCACTTTCGGTCTCTACTTCGTGGCTTCGTTCA TGTACATGGACCCTTGGCACATGTTCACCTCGTTCCCTCAGTACATGGCC GTGCAGTCTTCTTACATCAACATTCTGAACGTCTATGCCTTCAGCAACTG GCACGATGTGTCTTGGGGTACCAAGGGTTCTGATAAGGCGGATGCTCTTC CCTCCGCGAAGACTACCAAGGAAGGGGGCAAGGAGACCGTCATTGAGGAA ATTGACAAGCCCCAGGCCGATATTGACAGCCAATTTGAAGCTACGGTGAA GCGTGCTTTGACACCATATGTGGCTCCCGTGGAGAAGGATGAGAAGAGTT TGGATGACTCGTACAAGAGCTTCCGTACGAGATTGGTGACGTTCTGGATC TTCAGTAACGCTCTAATGGCTGTTTGCATCACCAGCGATGGTGTGGATAA GTTTGGCTTCACATTCGAATACACGACGCAATTATCCGTTACCCCCAACC AGCAGCTCATTCGCCCGACAGATGACGGTCCCAGCACACTACCTCCTGTT CAGATGATGTTCTGTTTGAAGCAGAAGAACAGCAAGAAGATCAACTCTCA TAGATGGCTTTTCAACGCTTTCGGCCGTATCCTGAACCCCGAGGTCTGCA TTCTTCTCGATGCTGGTACCAAGCCTGGTCACAAGTCACTCTTGGCCCTG TGGGAGGCCTTCTACAACGACAAGGACCTCGGAGGTGCTTGTGGTGAAAT TCACGCCATGTTGGGTAAGGGTTGGAGAAACCTAATCAACCCTCTCGTTG CCGCCCAGAACTTCGAATATAAAATCAGTAACATCCTCGACAAGCCGTTG GAGAGTTCCTTCGGCTATGTCAGTGTGTTGCCTGGTGCTTTCTCAGCATA CCGATTCCGTGCCATCATGGGCCGCCCACTGGAGCAGTATTTCCATGGTG ATCATACGCTCTCCAAACAGCTGGGCAAGAAGGGTATCGAGGGAATGAAC ATTTTCAAGAAGAACATGTTCTTGGCCGAGGACCGTATCTTGTGTTTCGA GCTGGTTGCTAAGGCTGGCTCAAAATGGCATTTGTCATACGTTAAAGCCT CAAAGGGTGAAACTGACGTGCCTGAAGGTGCTGCTGAGTTCATCTCGCAG CGTCGTCGTTGGTTGAACGGATCCTTCGCAGCCGGTATCTATTCGCTCAT GCATTTCGGACGGATGTATAAGAGTGGCCACAACATCATTCGAATGTTCT TCCTTCATATTCAGATGTTGTACAACACTTTCTCGACTATACTTACATGG TTCTCTCTGGACACCGCAGCCACATGTGATCCTAACGAGTTCACCCTTCA TAATGGCTATAACCTTCGTCCTGCCATGTACAACAGACACACCGAGTTGT TGATTGCTATTACGTATTACAACGAAGATAAGACGCTTACAGCCCGTACG CTGCATGGTGTGATGCAAAACATTCGTGACATTGTGAACTTGAAGAAGTC TGAGTTCTGGAACAAGGGTGGGCCAGCCTGGCAGAAGATTGTGGTCTGCC TGGTGTTTGATGGTATTGATCCCTGTGACAAGGATGTGCTGGATGTCTTG GCCACCGTTGGTATTTACCAGGATGGTGTCATGAAGCGTGATGTTGATGG AAAGGAAACCGTTGCTCATATCTATGAAGAAGAAGCGTCTAGAGGACTGC TATCGAGCCAAACGGGCCCATTCACAGGTCCCTTTGATGACCCTCAGCAG CGCAATCTGTCCCCGGCTCGGCCCACCTCTGGATACAGCTTGACCGAGAC ATATGCTGCCGATGCGGGTTATCATGATCCTTACAGTGCAGGTGGCTCGG TTTACTCTGCACAGTCTGGAGAGAACCCCGCGACTGCCTTTGGCGTCCCC GGCCGCGTTGCTTCGCCCTATGCTCGTAGCGAGACCTCGTCAACAGAGGC TTGGCGCCAGAGACAGGCTCCTGGAGGTGCTGGTAGTGGTGGCGGCGGTG GCCTGCGCCGTTACGCCACCAGAAAGGTCAAGCTTGTGCAGGGCTCAGTC CTGAGTGTTGACTACCCAGTGCCTAGTGCTATTCAAAATGCAATCCAGGC AAAGTATAGGAACGACCTGGAGGGCGGAAGCGAAGAATTCACACACATGC GTTATGGCCTACCAAGGCACTGGTAATCACTCGCCTCCCGGCTACGATGA CGGTGGGCATCGGCTTCAGGATCTACCAGCCGGCAACAACAACTCTGCCA CCGATCGTACGTCACGCTTCTTCCAGGCCCTACTGTGGTCAAACGCCGTT GTTGCGCTTTTCCGCTTCATCGGAGCCTGCTGGTTCCTGGGTAAGACCGG TGTGATGTGTTGCTTTGCCCGCCGCTAGCATCCTATTGGCTTACAACATC GGTCATTATGGACCTGGTCGGTACTCCTAGCGCTAGCAACGGTCACACAG GTTTCCCCTTTGGCAAAACGGCAACTCCCATCGTCAACACGATTGTCAAA TATGCCTACCTTGGTTTCCTGCTCCTCCAGTTCATTCTCGCTTTGGGTAA CCGCCCGAAAGGTTCCCGTTTCTCGTACCTGGCATCCTTCGTTGTCTTCG GTATCATTCAGCTCTACGTTGTCGTCGATGCACTATACCTGGTAGTCCGC GCTTTCAGTGGCAGTGCTCCGATGGACTTTGATACCACGCACGGTGTTGG TGCGTTCCTTGGTTCGTTCTTCGGGTCGACAGGTGCCGGTATCATTATCA TTGCGCTTGCTGCCACTTTCGGTCTCTACTTCGTGGCTTCGTTCATGTAC ATGGACCCTTGGCACATGTTCACCTCGTTCCCTCAGTACATGGCCGTGCA GTCTTCTTACATCAACATTCTGAACGTCTATGCCTTCAGCAACTGGCACG ATGTGTCTTGGGGTACCAAGGGTTCTGATAAGGCGGATGCTCTTCCCTCC GCGAAGACTACCAAGGAAGGGGGCAAGGAGACCGTCATTGAGGAAATTGA CAAGCCCCAGGCCGATATTGACAGCCAATTTGAAGCTACGGTGAAGCGTG CTTTGACACCATATGTGGCTCCCGTGGAGAAGGATGAGAAGAGTTTGGAT 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TCTGGACACCGCAGCCACATGTGATCCTAACGAGTTCACCCTTCATAATG GCTATAACCTTCGTCCTGCCATGTACAACAGACACACCGAGTTGTTGATT GCTATTACGTATTACAACGAAGATAAGACGCTTACAGCCCGTACGCTGCA TGGTGTGATGCAAAACATTCGTGACATTGTGAACTTGAAGAAGTCTGAGT TCTGGAACAAGGGTGGGCCAGCCTGGCAGAAGATTGTGGTCTGCCTGGTG TTTGATGGTATTGATCCCTGTGACAAGGATGTGCTGGATGTCTTGGCCAC CGTTGGTATTTACCAGGATGGTGTCATGAAGCGTGATGTTGATGGAAAGG AAACCGTTGCTCATATCTATGAAGAAGAAGCGTCTAGAGGACTGCTATCG AGCCAAACGGGCCCATTCACAGGTCCCTTTGATGACCCTCAGCAGCGCAA TCTGTCCCCGGCTCGGCCCACCTCTGGATACAGCTTGACCGAGACATATG CTGCCGATGCGGGTTATCATGATCCTTACAGTGCAGGTGGCTCGGTTTAC TCTGCACAGTCTGGAGAGAACCCCGCGACTGCCTTTGGCGTCCCCGGCCG CGTTGCTTCGCCCTATGCTCGTAGCGAGACCTCGTCAACAGAGGCTTGGC GCCAGAGACAGGCTCCTGGAGGTGCTGGTAGTGGTGGCGGCGGTGGCCTG CGCCGTTACGCCACCAGAAAGGTCAAGCTTGTGCAGGGCTCAGTCCTGAG TGTTGACTACCCAGTGCCTAGTGCTATTCAAAATGCAATCCAGGCAAAGT ATAGGAACGACCTGGAGGGCGGAAGCGAAGAATTCACACACATGCGTTAT GGCCTACCAAGGCACTGGTAATCACTCGCCTCCCGGCTACGATGACGGTG GGCATCGGCTTCAGGATCTACCAGCCGGCAACAACAACTCTGCCACCGAT 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006031 | chitin biosynthetic process |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0004100 | chitin synthase activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
Note | CAZy:GT2_Chitin_synth_1 |
DBxref | InterPro:IPR029044 |
DBxref | InterPro:IPR004834 |
DBxref | InterPro:IPR013616 |
DBxref | PFAM:PF13632 |
DBxref | PFAM:PF08407 |
DBxref | PFAM:PF01644 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
An09 | supercontig | An09:904461..907538 - |
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