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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An11:139058..141245- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_006548-T1 ID=CBS51388_006548-T1|Name=CBS51388_006548-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=2188bp|location=Sequence derived from alignment at An11:139058..141245- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGCCTACCTCTGCTCCCCTCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAA
CGACAACATCACCCGCTTCGACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCA
GCAACGCCCTCTTCCACAACAAGACGAGATGCTTCGTATAGTAAGTGGCG
GCCTGTAGCCGTGCTCAATTGTTCTGGCTGACAATCTGCCACAGTGGTAT
GCAGCCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGACTTCGACTTCATCTGCAAGC
GTTCCACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATCTACACCTTCGGTGGTCAGTTC
GTGAGCAAGATGTATGGTAAACCAGATCCCTTCTCTTGAATTGAGATACT
GATACAATTATAGGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCCTCCCCGTCTAC
CAGGACGTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTTGACACCGTTGT
CAACTTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCATGGAGCTGATGG
AGTGCCCCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGGGTGTCCCCGAG
AGAGTAAGTTCTGCTTCTGAGACACACCATGCTGCTCTCCGCTAACAGCA
GAACAGCGCGCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCAC
CATCATCGGACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGA
TTGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTAC
CGCAAGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGA
ACTCAACAACATCATCTCTCAGACCACCGACGGTGTCTACGAGGGTGTTG
CCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTC
CGCTACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGT
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TCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTC
AAGACTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCT
CGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGTGAGGCCGGTATCTTCG
TTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGAC
GACCAGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCC
TAAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTA
AGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTT
CTCTACGCCGGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTAT
CGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGCCGCCTCCCTGCCTACG
CCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCT
GCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGA
CTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCATCGGTTCTCGTTTCG
GTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCAAGGCCTTCGACAAG
GGCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACACCATGCGCAAGGAGAACAAGCT
GAGTAAGTGAACCCTCATTTGTACCTGAAAAGTTGAACAGCTTTAACTGA
CTATGCACAGTCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCC
CGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCA
GCACCAAGCTGCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCC
AAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCCGTCTGCTT
CGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGG
ACTACATGAAGATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCC
ATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGCACTGGTCT
GTACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGA
AGGGTGGCTCCGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An11:139058..141245- >CBS51388_006548-T1 ID=CBS51388_006548-T1|Name=CBS51388_006548-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=9855bp|location=Sequence derived from alignment at An11:139058..141245- (Aspergillus niger CBS 513.88) TCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCCCGCAACAACCCCGATCTCCGT GTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAAGCACTTCCCCAGCACCAAGCT GCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTGTGACCACCTCCAAGAAGGACA ACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTTGCCGTCTGCTTCGTTGACCTG ATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGAGGAGGTTGAGGACTACATGAA GATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCCTTGGTCGTTCCATTGGTCTCA TTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTCCGCACTGGTCTGTACAGACAC CCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCCCGCCCTCCAGAAGGGTGGCTC CGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAACGCGCACGTGAGATCATGGTCA AGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATCGGACCTGCTACCGTTGGTGGT ATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAA CATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCAAGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCA AGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTCAACAACATCATCTCTCAGACCACC GACGGTGTCTACGAGGGTGTTGCCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCAC CACTTTCATCGACCACCTGCTCCGCTACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGA TCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATC GAGGCCGTCAAGAACGGCACCATCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCAT CGGTACCTGCGCTAGCATGTTCAAGACTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTG GTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCC ATGCGTGAGGCCGGTATCTTCGTTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCA GACCCTCAAGGAGGTCTACGACGACCAGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGC CCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCT CAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTAAGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTC CGACGACCGTGGCCAGGAGCTTCTCTACGCCGGTATGCCCATCTCTGATG TCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTC CGCCGCCGCCTCCCTGCCTACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCAT GCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCA TCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTC CTGACCATCGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGA GTTCACCAAGGCCTTCGACAAGGGCATGAGCCCCCGTGACTTCGTTGACA CCATGCGCAAGGAGAACAAGCTGAGTACTGGGGTACCAGCGAGACTCTCC TCCCCGTCTACCAGGACGTCTCCAAGGCCATGGCCAAGCACCCTGACGTT GACACCGTTGTCAACTTCGCCTCTTCCCGTTCCGTCTACAGCTCCACCAT GGAGCTGATGGAGTGCCCCCAGATCCGTTCCATTGCCATCATTGCTGAGG GTGTCCCCGAGAGATGGTATGCAGCCCCGGGCTGTCCAGGGTATGCTTGA CTTCGACTTCATCTGCAAGCGTTCCACTCCCTCCGTCGCCGGTATCATCT ACACCTTCGGTGGTCAGTTCGTGAGCAAGATATGCCTACCTCTGCTCCCC TCGTCAACACCGCCAATGGCGCCTCCGCCAACGACAACATCACCCGCTTC GACCCCCCCAGCCGTGTGCGCTCTCCTCTCAGCAACGCCCTCTTCCACAA CAAGACGAGATGCTTCGTATATCCCCGGTATCGGTCACCGTGTCAAGTCC CGCAACAACCCCGATCTCCGTGTCGAGCTCGTCAAGGAGTTCGCCAAGAA GCACTTCCCCAGCACCAAGCTGCTCGACTACGCCATTGCTGTCGAGACTG TGACCACCTCCAAGAAGGACAACCTCATCCTCAACGTCGACGGTTGTGTT GCCGTCTGCTTCGTTGACCTGATGCGCAACTGCGGTGCCTTCTCTTCCGA GGAGGTTGAGGACTACATGAAGATGGGTGTCCTCAACGGTCTCTTCGTCC TTGGTCGTTCCATTGGTCTCATTGCCCACTACCTCGACCAGAAGAGACTC CGCACTGGTCTGTACAGACACCCCTGGGATGACATCACCTACCTTCTCCC CGCCCTCCAGAAGGGTGGCTCCGAGGGTCGTGTCGAGGTCAGCGTCTAAC GCGCACGTGAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATC GGACCTGCTACCGTTGGTGGTATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAA CACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCAAGG 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CGGTGCCTTCAAGATTGGTAACACTGGTGGTATGATGGACAACATTGTTG CCTCCAAGCTCTACCGCAAGGGTTCCGTCGGTTACGTCTCCAAGTCCGGT GGTATGTCCAACGAACTCAACAACATCATCTCTCAGACCACCGACGGTGT CTACGAGGGTGTTGCCATTGGTGGTGACCGTTACCCCGGCACCACTTTCA TCGACCACCTGCTCCGCTACCAGGCTGAGCCCGAGTGCAAGATCCTGGTT CTGCTGGGTGAGGTCGGTGGTGTTGAGGAGTACCGCGTCATCGAGGCCGT CAAGAACGGCACCATCACCAAGCCCATCGTCGCCTGGGCCATCGGTACCT GCGCTAGCATGTTCAAGACTGAGGTTCAGTTCGGTCACGCTGGTGCCTCT GCCAACTCCGACCTCGAGACCGCTGTTGCCAAGAACAAGGCCATGCGTGA GGCCGGTATCTTCGTTCCCGAGACCTTCGAGGACCTTCCCCAGACCCTCA AGGAGGTCTACGACGACCAGGTCAAGAAGGGTATCGTCAAGCCCCAGCCT GAGCCTGTCGTCCCTAAGATCCCCATCGACTACTCCTGGGCTCAGGAGCT GGGTCTCGTCCGTAAGCCCGCTGCTTTCATCTCTACCATCTCCGACGACC GTGGCCAGGAGCTTCTCTACGCCGGTATGCCCATCTCTGATGTCTTCCGT GAGGACATTGGTATCGGTGGTGTCATGTCTCTTCTGTGGTTCCGCCGCCG CCTCCCTGCCTACGCCAGCAAGTTCCTGGAGATGGTTCTCATGCTTACTG CTGACCACGGTCCTGCCGTGTCTGGTGCCATGAACACCATCATCACCACC CGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCTCGTCTCTGGTCTCCTGACCAT CGGTTCTCGTTTCGGTGGTGCCCTGGATGGCGCTGCTGAGGAGTTCACCA 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GAGATCATGGTCAAGGCCAAGGAGAAGGGCATCACCATCATCGGACCTGC TACCGTTGGTGGTATCAAGCCCGGTGCCTTCAAGATTGGTAACACTGGTG GTATGATGGACAACATTGTTGCCTCCAAGCTCTACCGCAAGGGTTCCGTC GGTTACGTCTCCAAGTCCGGTGGTATGTCCAACGAACTCAACAACATCAT CTCTCAGACCACCGACGGTGTCTACGAGGGTGTTGCCATTGGTGGTGACC GTTACCCCGGCACCACTTTCATCGACCACCTGCTCCGCTACCAGGCTGAG CCCGAGTGCAAGATCCTGGTTCTGCTGGGTGAGGTCGGTGGTGTTGAGGA GTACCGCGTCATCGAGGCCGTCAAGAACGGCACCATCACCAAGCCCATCG TCGCCTGGGCCATCGGTACCTGCGCTAGCATGTTCAAGACTGAGGTTCAG TTCGGTCACGCTGGTGCCTCTGCCAACTCCGACCTCGAGACCGCTGTTGC CAAGAACAAGGCCATGCGTGAGGCCGGTATCTTCGTTCCCGAGACCTTCG AGGACCTTCCCCAGACCCTCAAGGAGGTCTACGACGACCAGGTCAAGAAG GGTATCGTCAAGCCCCAGCCTGAGCCTGTCGTCCCTAAGATCCCCATCGA CTACTCCTGGGCTCAGGAGCTGGGTCTCGTCCGTAAGCCCGCTGCTTTCA TCTCTACCATCTCCGACGACCGTGGCCAGGAGCTTCTCTACGCCGGTATG CCCATCTCTGATGTCTTCCGTGAGGACATTGGTATCGGTGGTGTCATGTC TCTTCTGTGGTTCCGCCGCCGCCTCCCTGCCTACGCCAGCAAGTTCCTGG AGATGGTTCTCATGCTTACTGCTGACCACGGTCCTGCCGTGTCTGGTGCC ATGAACACCATCATCACCACCCGTGCCGGCAAGGACTTGATCAGCGCTCT 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003824 | catalytic activity |
GO:0046912 | transferase activity, transferring acyl groups, acyl groups converted into alkyl on transfer |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
Property Name | Value |
DBxref | InterPro:IPR036291 |
DBxref | InterPro:IPR036969 |
DBxref | InterPro:IPR033847 |
DBxref | InterPro:IPR017440 |
DBxref | InterPro:IPR017866 |
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DBxref | InterPro:IPR005811 |
DBxref | InterPro:IPR016102 |
DBxref | InterPro:IPR002020 |
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DBxref | PFAM:PF00549 |
DBxref | PFAM:PF02629 |
DBxref | PFAM:PF00285 |
Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
An11 | supercontig | An11:139058..141245 - |
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