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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An12:2335596..2337591+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_008160-T1 ID=CBS51388_008160-T1|Name=CBS51388_008160-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1996bp|location=Sequence derived from alignment at An12:2335596..2337591+ (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGGCGTCCTATGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGT
AAACGGTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAACTTGGCTCTTGCACGTT
TGGGCAAGAAGCCTGTCTTGAAGGTATGTCCCCAGCCATTCAAAATTATG
CTGTGGGCTTAGGAAAATTGATGTTTTTCTTGTGCTCTTGCAGCGGAACT
TTGGTATCCTCTCGATCATCGGTCTCAGTTGTACCATTCTCGGCACATGG
GAGGGTATTTTATCGTAAGGCCATCTAGGATTATGAGAGTCCAGAATATT
GCAGCTGACAGAGACTAGGACGTTCACCATTCCCCTCGAAAAGTCGGTTA
TTCCATGTACAGCCCTTGATCGCACCATGGGTGTAGCTGACTGAACAAAT
AGTGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTATTTTTGCATGGACGGG
AACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCCGAAATGGCGTCCATGTAAGTTG
AAATCAAAAGATCCATTCCCTGGTGGTATACTGACCTGCCAAGGGCGCCG
ACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTGCCATGCTTGCGCCTTATAAGCA
TATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGTGCGCTCTTCCGTTCCCCTGTTA
CAGCAACCGTGTAATTTACTGATAATCACTGCAGGATGGTTGACCGTGAT
CGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCGTCCTACATGGCTGGCACTGAGA
TCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAACACCTTCAACTCTCAGCCCTAC
CAGGGTACCCTTCTAATGTGGGCGGTTGTGGTCGTGGCCCTCATTGTGAA
TATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGCCTGGAAACCCTCATCCTCATGA
TTCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCTCATCCCCATGACTTATATGTCC
GACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCAAGGACTTTACCAATGGCGGACA
CCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTCGTCGGTATGACCGGTTGTGTGT
TTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGTGCATGTAAGTTGCCATCATCAG
CAGAAAAGACAGTGTCTAACTCGTATAGATGGCCGAAGAAGTGAATCATG
CCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCTTCTCAGTGTTGCAATCAACGGC
ACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCACTCTCTTCTGCATGGGCAGTGT
TGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGCTACCCTTTCATGGAGATCTTCC
AGCAAGCAACCGGTTCAGTCGCAGGTGGATTGGGCTTGTCCTCCATCCTC
GTCATCGTCGGTATCTGCGCCGCCCTGGCCATGTTGACTGCCACCTCCCG
CCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGTGGTGTCCCTGGCTGGCGAGTCT
GGAGCCACGTATGTCCCGCCTATCTCTTACCCCATACTACAGAGAACATC
GCTAATATCAACACAGGTCTCCAATCGTACCTTCCTCCCCACTTACTCCA
TCCTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATCGGC
TCCGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCTCCATGGCTGTCTCGGGTCTGTA
CTCCTCCTATCTGATTGTGGCGGTTCTTCTTCTCTGGCGTCGCTGCACCG
GCGCTATCAACAACTACAACGCCAGCGACGACACCGTCGTCAATGTCCCC
GGCGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCCACGTCCCGGGCATCTGGGGTAT
TCTCATCAACACTTATGCGGTGATCTACATCGTTATCGTCATCTTCTTCA
GTTACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTCGGTAACAACGATGAACTACAGT
GTGGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTCTGGCTATTATCTATTATGTGGT
GAGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An12:2335596..2337591+ >CBS51388_008160-T1 ID=CBS51388_008160-T1|Name=CBS51388_008160-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=12792bp|location=Sequence derived from alignment at An12:2335596..2337591+ (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGGCGTCCTATGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGT AAACGGTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAACTTGGCTCTTGCACGTT TGGGCAAGAAGCCTGTCTTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATC GGTCTCAGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTTTATCGACGTT CACCATTCCCCTCGAAAATGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTA TTTTTGCATGGACGGGAACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCCGAAATG GCGTCCATGGCGCCGACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTGCCATGCT TGCGCCTTATAAGCATATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGATGGTTGA CCGTGATCGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCGTCCTACATGGCTGGC ACTGAGATCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAACACCTTCAACTCTCA GCCCTACCAGGGTACCCTTCTAATGTGGGCGGTTGTGGTCGTGGCCCTCA TTGTGAATATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGCCTGGAAACCCTCATC CTCATGATTCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCTCATCCCCATGACTTA TATGTCCGACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCAAGGACTTTACCAATG GCGGACACCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTCGTCGGTATGACCGGT TGTGTGTTTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGTGCATATGGCCGAAGA AGTGAATCATGCCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCTTCTCAGTGTTG CAATCAACGGCACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCACTCTCTTCTGC ATGGGCAGTGTTGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGCTACCCTTTCAT GGAGATCTTCCAGCAAGCAACCGGTTCAGTCGCAGGTGGATTGGGCTTGT CCTCCATCCTCGTCATCGTCGGTATCTGCGCCGCCCTGGCCATGTTGACT GCCACCTCCCGCCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGTGGTGTCCCTGG CTGGCGAGTCTGGAGCCACGTCTCCAATCGTACCTTCCTCCCCACTTACT CCATCCTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATC GGCTCCGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCTCCATGGCTGTCTCGGGTCT GTACTCCTCCTATCTGATTGTGGCGGTTCTTCTTCTCTGGCGTCGCTGCA CCGGCGCTATCAACAACTACAACGCCAGCGACGACACCGTCGTCAATGTC CCCGGCGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCCACGTCCCGGGCATCTGGGG TATTCTCATCAACACTTATGCGGTGATCTACATCGTTATCGTCATCTTCT TCAGTTACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTCGGTAACAACGATGAACTAC AGTGTGGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTCTGGCTATTATCTATTATGT GGTGAGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGAA TGGCGTCCTATGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGTA AACGGTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAACTTGGCTCTTGCACGTTT GGGCAAGAAGCCTGTCTTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATCG GTCTCAGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTTTATCGACGTTC ACCATTCCCCTCGAAAATGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTAT TTTTGCATGGACGGGAACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCCGAAATGG CGTCCATGGCGCCGACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTGCCATGCTT GCGCCTTATAAGCATATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGATGGTTGAC CGTGATCGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCGTCCTACATGGCTGGCA CTGAGATCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAACACCTTCAACTCTCAG CCCTACCAGGGTACCCTTCTAATGTGGGCGGTTGTGGTCGTGGCCCTCAT TGTGAATATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGCCTGGAAACCCTCATCC TCATGATTCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCTCATCCCCATGACTTAT ATGTCCGACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCAAGGACTTTACCAATGG CGGACACCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTCGTCGGTATGACCGGTT GTGTGTTTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGTGCATATGGCCGAAGAA GTGAATCATGCCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCTTCTCAGTGTTGC AATCAACGGCACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCACTCTCTTCTGCA TGGGCAGTGTTGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGCTACCCTTTCATG GAGATCTTCCAGCAAGCAACCGGTTCAGTCGCAGGTGGATTGGGCTTGTC CTCCATCCTCGTCATCGTCGGTATCTGCGCCGCCCTGGCCATGTTGACTG CCACCTCCCGCCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGTGGTGTCCCTGGC TGGCGAGTCTGGAGCCACGTCTCCAATCGTACCTTCCTCCCCACTTACTC CATCCTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATCG GCTCCGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCTCCATGGCTGTCTCGGGTCTG TACTCCTCCTATCTGATTGTGGCGGTTCTTCTTCTCTGGCGTCGCTGCAC CGGCGCTATCAACAACTACAACGCCAGCGACGACACCGTCGTCAATGTCC CCGGCGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCCACGTCCCGGGCATCTGGGGT ATTCTCATCAACACTTATGCGGTGATCTACATCGTTATCGTCATCTTCTT CAGTTACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTCGGTAACAACGATGAACTACA GTGTGGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTCTGGCTATTATCTATTATGTG GTGAGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGAAT GGCGTCCTATGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGTAA ACGGTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAACTTGGCTCTTGCACGTTTG GGCAAGAAGCCTGTCTTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATCGG TCTCAGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTTTATCGACGTTCA CCATTCCCCTCGAAAATGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTATT 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TGAATATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGCCTGGAAACCCTCATCCTC ATGATTCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCTCATCCCCATGACTTATAT GTCCGACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCAAGGACTTTACCAATGGCG GACACCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTCGTCGGTATGACCGGTTGT GTGTTTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGTGCATATGGCCGAAGAAGT GAATCATGCCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCTTCTCAGTGTTGCAA TCAACGGCACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCACTCTCTTCTGCATG GGCAGTGTTGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGCTACCCTTTCATGGA GATCTTCCAGCAAGCAACCGGTTCAGTCGCAGGTGGATTGGGCTTGTCCT CCATCCTCGTCATCGTCGGTATCTGCGCCGCCCTGGCCATGTTGACTGCC ACCTCCCGCCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGTGGTGTCCCTGGCTG GCGAGTCTGGAGCCACGTCTCCAATCGTACCTTCCTCCCCACTTACTCCA TCCTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATCGGC TCCGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCTCCATGGCTGTCTCGGGTCTGTA CTCCTCCTATCTGATTGTGGCGGTTCTTCTTCTCTGGCGTCGCTGCACCG GCGCTATCAACAACTACAACGCCAGCGACGACACCGTCGTCAATGTCCCC GGCGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCCACGTCCCGGGCATCTGGGGTAT TCTCATCAACACTTATGCGGTGATCTACATCGTTATCGTCATCTTCTTCA GTTACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTCGGTAACAACGATGAACTACAGT GTGGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTCTGGCTATTATCTATTATGTGGT GAGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGAATGG CGTCCTATGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGTAAAC GGTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAACTTGGCTCTTGCACGTTTGGG CAAGAAGCCTGTCTTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATCGGTC TCAGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTTTATCGACGTTCACC ATTCCCCTCGAAAATGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTATTTT TGCATGGACGGGAACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCCGAAATGGCGT CCATGGCGCCGACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTGCCATGCTTGCG CCTTATAAGCATATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGATGGTTGACCGT GATCGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCGTCCTACATGGCTGGCACTG AGATCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAACACCTTCAACTCTCAGCCC TACCAGGGTACCCTTCTAATGTGGGCGGTTGTGGTCGTGGCCCTCATTGT GAATATTATCGGAGGAAAGTTCCTGCCTCGCCTGGAAACCCTCATCCTCA TGATTCACATTCTGGGATACTTTGGTGTGCTCATCCCCATGACTTATATG TCCGACCACAAGTCGACCGAGGAGGTCTTCAAGGACTTTACCAATGGCGG ACACCTCTACACCGACGGTCTGTCCTTTTTCGTCGGTATGACCGGTTGTG TGTTTGCCTTTGCGGGCGGTGATGCTGCCGTGCATATGGCCGAAGAAGTG AATCATGCCACGGTCGTCATTCCCCGTGCCATTCTTCTCAGTGTTGCAAT CAACGGCACCTTGGGCTTCACCATGCTGATCGCCACTCTCTTCTGCATGG GCAGTGTTGATGCGGCCCTGGAGTCTCCCACAGGCTACCCTTTCATGGAG ATCTTCCAGCAAGCAACCGGTTCAGTCGCAGGTGGATTGGGCTTGTCCTC CATCCTCGTCATCGTCGGTATCTGCGCCGCCCTGGCCATGTTGACTGCCA CCTCCCGCCAGTTCTGGTCGTTTGCTCGCGACCGTGGTGTCCCTGGCTGG CGAGTCTGGAGCCACGTCTCCAATCGTACCTTCCTCCCCACTTACTCCAT CCTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATCGGCT CCGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCTCCATGGCTGTCTCGGGTCTGTAC TCCTCCTATCTGATTGTGGCGGTTCTTCTTCTCTGGCGTCGCTGCACCGG CGCTATCAACAACTACAACGCCAGCGACGACACCGTCGTCAATGTCCCCG GCGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCCACGTCCCGGGCATCTGGGGTATT CTCATCAACACTTATGCGGTGATCTACATCGTTATCGTCATCTTCTTCAG TTACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTCGGTAACAACGATGAACTACAGTG TGGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTCTGGCTATTATCTATTATGTGGTG AGGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGAATGGC GTCCTATGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGTAAACG GTACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAACTTGGCTCTTGCACGTTTGGGC AAGAAGCCTGTCTTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATCGGTCT CAGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTTTATCGACGTTCACCA 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CTCCTCACCATGACCGTTTGCTGTCTGCTCGGTCTGATTAACATCGGCTC CGCCGTCGCCCTCAACGACGTCGTCTCCATGGCTGTCTCGGGTCTGTACT CCTCCTATCTGATTGTGGCGGTTCTTCTTCTCTGGCGTCGCTGCACCGGC GCTATCAACAACTACAACGCCAGCGACGACACCGTCGTCAATGTCCCCGG CGCCAAGCTCATGTGGGGTCCGTTCCACGTCCCGGGCATCTGGGGTATTC TCATCAACACTTATGCGGTGATCTACATCGTTATCGTCATCTTCTTCAGT TACTGGCCCACCGAGTTGCCGGTGTCGGTAACAACGATGAACTACAGTGT GGTGGGTACGATGGGAGTCGTCATTCTGGCTATTATCTATTATGTGGTGA GGGCTCGTCATGTCTACACGGGTCCTGTTATTGAGATCTCGTGAATGGCG TCCTATGAATTGAAGAACCGAGCCAGCTCGGCCAACCGAGAGGTAAACGG TACCGACTCGGAAGATGCGCGTGATAACTTGGCTCTTGCACGTTTGGGCA AGAAGCCTGTCTTGAAGCGGAACTTTGGTATCCTCTCGATCATCGGTCTC AGTTGTACCATTCTCGGCACATGGGAGGGTATTTTATCGACGTTCACCAT TCCCCTCGAAAATGGTGGATCTGCTGGTGCGGTATACTCTTTTATTTTTG CATGGACGGGAACGGCCTGCTGTTTCGTGCTGTTGTCCGAAATGGCGTCC ATGGCGCCGACTTCCGGAGGCCAATATCACTGGTGTGCCATGCTTGCGCC TTATAAGCATATGAAGTTCCTAAGTTACATCACAGGATGGTTGACCGTGA TCGGATGGCAGGCCGCCTTCGCATCGTCGTCCTACATGGCTGGCACTGAG ATCCTGGGTGCCATTATCTTGGGCCGGAACACCTTCAACTCTCAGCCCTA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
| GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | antiSMASH:Cluster_12.7 |
| Note | SMCOG1038:phenylalanine-specific permease |
| DBxref | InterPro:IPR002293 |
| DBxref | PFAM:PF13520 |
| DBxref | PFAM:PF00324 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| An12 | supercontig | An12:2335596..2337591 + |
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