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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An14:1057913..1059269- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_008922-T1 ID=CBS51388_008922-T1|Name=CBS51388_008922-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1357bp|location=Sequence derived from alignment at An14:1057913..1059269- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGAAGTACTCTACTATCTTCAGCGCTGCTGCCGCTGTTTTCGCTGGTTC
CGCCGCTGCAGTCGGCGTGTCCGGCTCTGCTGAGGGTTTCGCCGAGGGCG
TCACCGGTGGCGGTGATGCCACCCCCGTCTACCCCGACACTATCGATGAG
CTGGTCTCTTACCTTGGAGACGATGAGGCCCGCGTCATTGTCCTGACCAA
GACCTTCGACTTCACCGACAGCGAAGGTACCACCACTGGCACTGGTTGCG
CTCCCTGGGGTACCGCTTCCGCCTGCCAGGTTGCTATTGACCAGGACGAC
TGGTGCGAGAACTACGAGCCCGATGCTCCCTCTATCAGCGTTGAATAGTA
TGTCCTTGGGGATTGTCACCCGTTTCGATCTTGTATCTAACTTGGATAGC
TACAACGCTGGTGTCCTCGGTATCACCGTCACCTCCAACAAGTCCCTCAT
CGGTGAGGGCTCCTCTGGTGCAATCAAGGGCAAGGGTCTCCGTATTGTCA
GCGGTGCTGAGAACATCATCATCCAGTAGGTTATGCTCGGTGTCATTAGG
AATTTGCTCTCTAACGAAATCAGGAACATCGCGGTTACCGACATCAACCC
CAAGTACGTCTGGGGTGGTGATGCTATTACTCTTGATGACTGCGACCTGG
TCTGGATCGACCATGTTACTGTACGTCTTCATCTTATTCAACTCTACATT
ATATTTCAAGAGCATTGAGTTAACATATGACAGACCGCCCGCATCGGTCG
CCAGCACTACGTCCTTGGAACCAGCGCCGACAACCGCGTCTCTCTCACCA
ACAACTACATTGACGGTGTCTCCGACTACTCCGCCACCTGCGATGGCTAC
CACTACTGGGGCATCTACCTCGATGGTGACGCCGACTTGGTCACCATGAA
GGGCAACTACATCTACCACACCTCCGGCCGTAGCCCCAAGGTCCAGGACA
ACACTCTCCTCCACTGTGTAAGTTGCCTTTTCTCTGCTGGCCGCTTCCGA
CCTGACTAATCATTGTTGCAGGTCAACAACTACTTCTACGACATCTCCGG
CCACGCTTTTGAGATCGGTGAGGGTGGCTACGTCCTGGCTGAGGGCAACG
TTTTCCAGAACGTCGACACCGTCCTTGAGACCTACGAGGGCGCGGCCTTC
ACCGTCCCCTCCACCACCGCCGGTGAAGTCTGCTCCACCTACCTTGGCCG
TGACTGTGTCATCAACGGCTTCGGCTCCTCCGGCACTTTCTCCGAGGACA
GCACCTCTTTCCTCTCCGACTTCGAGGGCAAGAACATTGCCTCTGCTTCC
GCTTACACCTCTGTTGCCTCTAGCGTTGTTGCTAACGCCGGTCAGGGCAA
CCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An14:1057913..1059269- >CBS51388_008922-T1 ID=CBS51388_008922-T1|Name=CBS51388_008922-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=5700bp|location=Sequence derived from alignment at An14:1057913..1059269- (Aspergillus niger CBS 513.88) GTCAACAACTACTTCTACGACATCTCCGGCCACGCTTTTGAGATCGGTGA GGGTGGCTACGTCCTGGCTGAGGGCAACGTTTTCCAGAACGTCGACACCG TCCTTGAGACCTACGAGGGCGCGGCCTTCACCGTCCCCTCCACCACCGCC GGTGAAGTCTGCTCCACCTACCTTGGCCGTGACTGTGTCATCAACGGCTT CGGCTCCTCCGGCACTTTCTCCGAGGACAGCACCTCTTTCCTCTCCGACT TCGAGGGCAAGAACATTGCCTCTGCTTCCGCTTACACCTCTGTTGCCTCT AGCGTTGTTGCTAACGCCGGTCAGGGCAACCTGTAAACCGCCCGCATCGG TCGCCAGCACTACGTCCTTGGAACCAGCGCCGACAACCGCGTCTCTCTCA CCAACAACTACATTGACGGTGTCTCCGACTACTCCGCCACCTGCGATGGC TACCACTACTGGGGCATCTACCTCGATGGTGACGCCGACTTGGTCACCAT GAAGGGCAACTACATCTACCACACCTCCGGCCGTAGCCCCAAGGTCCAGG ACAACACTCTCCTCCACTGTGAACATCGCGGTTACCGACATCAACCCCAA GTACGTCTGGGGTGGTGATGCTATTACTCTTGATGACTGCGACCTGGTCT GGATCGACCATGTTACTCTACAACGCTGGTGTCCTCGGTATCACCGTCAC CTCCAACAAGTCCCTCATCGGTGAGGGCTCCTCTGGTGCAATCAAGGGCA AGGGTCTCCGTATTGTCAGCGGTGCTGAGAACATCATCATCCAATGAAGT ACTCTACTATCTTCAGCGCTGCTGCCGCTGTTTTCGCTGGTTCCGCCGCT GCAGTCGGCGTGTCCGGCTCTGCTGAGGGTTTCGCCGAGGGCGTCACCGG TGGCGGTGATGCCACCCCCGTCTACCCCGACACTATCGATGAGCTGGTCT CTTACCTTGGAGACGATGAGGCCCGCGTCATTGTCCTGACCAAGACCTTC GACTTCACCGACAGCGAAGGTACCACCACTGGCACTGGTTGCGCTCCCTG GGGTACCGCTTCCGCCTGCCAGGTTGCTATTGACCAGGACGACTGGTGCG AGAACTACGAGCCCGATGCTCCCTCTATCAGCGTTGAATAGTCAACAACT ACTTCTACGACATCTCCGGCCACGCTTTTGAGATCGGTGAGGGTGGCTAC GTCCTGGCTGAGGGCAACGTTTTCCAGAACGTCGACACCGTCCTTGAGAC CTACGAGGGCGCGGCCTTCACCGTCCCCTCCACCACCGCCGGTGAAGTCT GCTCCACCTACCTTGGCCGTGACTGTGTCATCAACGGCTTCGGCTCCTCC GGCACTTTCTCCGAGGACAGCACCTCTTTCCTCTCCGACTTCGAGGGCAA GAACATTGCCTCTGCTTCCGCTTACACCTCTGTTGCCTCTAGCGTTGTTG CTAACGCCGGTCAGGGCAACCTGTAAACCGCCCGCATCGGTCGCCAGCAC TACGTCCTTGGAACCAGCGCCGACAACCGCGTCTCTCTCACCAACAACTA CATTGACGGTGTCTCCGACTACTCCGCCACCTGCGATGGCTACCACTACT GGGGCATCTACCTCGATGGTGACGCCGACTTGGTCACCATGAAGGGCAAC TACATCTACCACACCTCCGGCCGTAGCCCCAAGGTCCAGGACAACACTCT CCTCCACTGTGAACATCGCGGTTACCGACATCAACCCCAAGTACGTCTGG GGTGGTGATGCTATTACTCTTGATGACTGCGACCTGGTCTGGATCGACCA TGTTACTCTACAACGCTGGTGTCCTCGGTATCACCGTCACCTCCAACAAG TCCCTCATCGGTGAGGGCTCCTCTGGTGCAATCAAGGGCAAGGGTCTCCG TATTGTCAGCGGTGCTGAGAACATCATCATCCAATGAAGTACTCTACTAT CTTCAGCGCTGCTGCCGCTGTTTTCGCTGGTTCCGCCGCTGCAGTCGGCG TGTCCGGCTCTGCTGAGGGTTTCGCCGAGGGCGTCACCGGTGGCGGTGAT GCCACCCCCGTCTACCCCGACACTATCGATGAGCTGGTCTCTTACCTTGG AGACGATGAGGCCCGCGTCATTGTCCTGACCAAGACCTTCGACTTCACCG ACAGCGAAGGTACCACCACTGGCACTGGTTGCGCTCCCTGGGGTACCGCT TCCGCCTGCCAGGTTGCTATTGACCAGGACGACTGGTGCGAGAACTACGA GCCCGATGCTCCCTCTATCAGCGTTGAATAGTCAACAACTACTTCTACGA CATCTCCGGCCACGCTTTTGAGATCGGTGAGGGTGGCTACGTCCTGGCTG AGGGCAACGTTTTCCAGAACGTCGACACCGTCCTTGAGACCTACGAGGGC GCGGCCTTCACCGTCCCCTCCACCACCGCCGGTGAAGTCTGCTCCACCTA CCTTGGCCGTGACTGTGTCATCAACGGCTTCGGCTCCTCCGGCACTTTCT CCGAGGACAGCACCTCTTTCCTCTCCGACTTCGAGGGCAAGAACATTGCC TCTGCTTCCGCTTACACCTCTGTTGCCTCTAGCGTTGTTGCTAACGCCGG TCAGGGCAACCTGTAAACCGCCCGCATCGGTCGCCAGCACTACGTCCTTG GAACCAGCGCCGACAACCGCGTCTCTCTCACCAACAACTACATTGACGGT GTCTCCGACTACTCCGCCACCTGCGATGGCTACCACTACTGGGGCATCTA CCTCGATGGTGACGCCGACTTGGTCACCATGAAGGGCAACTACATCTACC ACACCTCCGGCCGTAGCCCCAAGGTCCAGGACAACACTCTCCTCCACTGT GAACATCGCGGTTACCGACATCAACCCCAAGTACGTCTGGGGTGGTGATG CTATTACTCTTGATGACTGCGACCTGGTCTGGATCGACCATGTTACTCTA CAACGCTGGTGTCCTCGGTATCACCGTCACCTCCAACAAGTCCCTCATCG GTGAGGGCTCCTCTGGTGCAATCAAGGGCAAGGGTCTCCGTATTGTCAGC GGTGCTGAGAACATCATCATCCAATGAAGTACTCTACTATCTTCAGCGCT GCTGCCGCTGTTTTCGCTGGTTCCGCCGCTGCAGTCGGCGTGTCCGGCTC TGCTGAGGGTTTCGCCGAGGGCGTCACCGGTGGCGGTGATGCCACCCCCG TCTACCCCGACACTATCGATGAGCTGGTCTCTTACCTTGGAGACGATGAG GCCCGCGTCATTGTCCTGACCAAGACCTTCGACTTCACCGACAGCGAAGG TACCACCACTGGCACTGGTTGCGCTCCCTGGGGTACCGCTTCCGCCTGCC AGGTTGCTATTGACCAGGACGACTGGTGCGAGAACTACGAGCCCGATGCT CCCTCTATCAGCGTTGAATAGTCAACAACTACTTCTACGACATCTCCGGC CACGCTTTTGAGATCGGTGAGGGTGGCTACGTCCTGGCTGAGGGCAACGT TTTCCAGAACGTCGACACCGTCCTTGAGACCTACGAGGGCGCGGCCTTCA CCGTCCCCTCCACCACCGCCGGTGAAGTCTGCTCCACCTACCTTGGCCGT GACTGTGTCATCAACGGCTTCGGCTCCTCCGGCACTTTCTCCGAGGACAG CACCTCTTTCCTCTCCGACTTCGAGGGCAAGAACATTGCCTCTGCTTCCG CTTACACCTCTGTTGCCTCTAGCGTTGTTGCTAACGCCGGTCAGGGCAAC CTGTAAACCGCCCGCATCGGTCGCCAGCACTACGTCCTTGGAACCAGCGC CGACAACCGCGTCTCTCTCACCAACAACTACATTGACGGTGTCTCCGACT ACTCCGCCACCTGCGATGGCTACCACTACTGGGGCATCTACCTCGATGGT GACGCCGACTTGGTCACCATGAAGGGCAACTACATCTACCACACCTCCGG CCGTAGCCCCAAGGTCCAGGACAACACTCTCCTCCACTGTGAACATCGCG GTTACCGACATCAACCCCAAGTACGTCTGGGGTGGTGATGCTATTACTCT TGATGACTGCGACCTGGTCTGGATCGACCATGTTACTCTACAACGCTGGT GTCCTCGGTATCACCGTCACCTCCAACAAGTCCCTCATCGGTGAGGGCTC CTCTGGTGCAATCAAGGGCAAGGGTCTCCGTATTGTCAGCGGTGCTGAGA ACATCATCATCCAATGAAGTACTCTACTATCTTCAGCGCTGCTGCCGCTG TTTTCGCTGGTTCCGCCGCTGCAGTCGGCGTGTCCGGCTCTGCTGAGGGT TTCGCCGAGGGCGTCACCGGTGGCGGTGATGCCACCCCCGTCTACCCCGA CACTATCGATGAGCTGGTCTCTTACCTTGGAGACGATGAGGCCCGCGTCA TTGTCCTGACCAAGACCTTCGACTTCACCGACAGCGAAGGTACCACCACT 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TTCCGCCGCTGCAGTCGGCGTGTCCGGCTCTGCTGAGGGTTTCGCCGAGG GCGTCACCGGTGGCGGTGATGCCACCCCCGTCTACCCCGACACTATCGAT GAGCTGGTCTCTTACCTTGGAGACGATGAGGCCCGCGTCATTGTCCTGAC CAAGACCTTCGACTTCACCGACAGCGAAGGTACCACCACTGGCACTGGTT GCGCTCCCTGGGGTACCGCTTCCGCCTGCCAGGTTGCTATTGACCAGGAC GACTGGTGCGAGAACTACGAGCCCGATGCTCCCTCTATCAGCGTTGAATA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | SECRETED:SignalP(1-20) |
| Note | CAZy:PL1 |
| Note | CAZy:PL1_4 |
| DBxref | InterPro:IPR011050 |
| DBxref | InterPro:IPR012334 |
| DBxref | InterPro:IPR002022 |
| DBxref | PFAM:PF00544 |
| DBxref | PFAM:PF13229 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| An14 | supercontig | An14:1057913..1059269 - |
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