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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An15:155508..157342+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_009209-T1 ID=CBS51388_009209-T1|Name=CBS51388_009209-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1835bp|location=Sequence derived from alignment at An15:155508..157342+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGAAGGTAAGGGCTTCCTGCCACCTTGCGTCTTGCTCGCTTCCCAAGC
TTCTCACTCCCCCTCCCCCCTCCGTTACCCCCCTCAACGCCCACCTTCAC
AACTTGGCTAACATCTTATTTTTCCATCATCTAGAGGAAGTTGCTGCTCT
CGTCATTGACAATGGGTATGTTACTTTGGGTTCTCGATGATTTTGGCGAT
GGATTCGTCCTGCTTGTTGTGGTTTCTCGCCAGCTCCAGGGGAGATGGTG
CAAAACATACGTCCCCTTTTGGGGCTTGGTCGCGATGATGAACTTGAATG
GGATTCTCGCGGGCGTTGCTCTATTACTCCCTCTGGCGCTTATGGAAAGA
AACTAGGACAGCTCGATCGATTGGCACGCGAGGCTGTAGTCTGCTCGATT
ATACTGACTTCTGTGTTCTCAGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCC
GGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCGTAAGTCAACCCCCTCCTCATA
TCCGCTGTGCTGGATATCCTTCCTCCTGGCTTGATGGGTTCTTCCCACTC
TTCATAGCAATTGCCACCCATTGCGTCCTTGCGCTGGGTTGCTAGCTTAT
GTGGGGGCGGTGAATTACCCGTCATGTTAGCACCGGTTCGAATAGTCAAC
TAACTTGCGGTACAGCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGGTAA
AGCTCCCCTTTGTTTCCCCCAAGTTGGCCTGTTAGGCTGGGTGATCGGTT
TTATCTAATGCCGCCCGCAGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTC
CTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGAT
ACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATC
TGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCC
CGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGA
TGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCC
ATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGT
TCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTT
TCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTG
ACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCAC
TACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACG
TCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGC
CTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAA
CGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTC
TGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGT
GATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGGTATGTTT
TTTCCTCGGCCCCTTGATGAACACGGAGTGGCCTGATCACTAACCCACCT
CTAGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGA
AGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCT
CCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTC
CCTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGA
GCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An15:155508..157342+ >CBS51388_009209-T1 ID=CBS51388_009209-T1|Name=CBS51388_009209-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=6768bp|location=Sequence derived from alignment at An15:155508..157342+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGGAAGAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGTTCGGGTATGTG
CAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCCCTCCA
TTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAG
GACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCT
CAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGA
AGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAG
CACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGA
GAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACG
TCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGT
ATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGA
GGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTG
ACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTC
TCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTG
CTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCT
CCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATC
GGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCT
GGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGA
AGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGTCT
GGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGAT
CACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCG
AGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCC
ACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCC
CTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAATGGAAGAGGAAGTTGCTGCTC
TCGTCATTGACAATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGAC
GATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCA
TGGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGG
CACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGT
GTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTA
CAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAG
CCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTC
GAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTC
CCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACG
GTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCC
ATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAA
GATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAA
TTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAG
CAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGA
GCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTC
CTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATC
CACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAA
GGATCTGTACGGCAACATTGTCATGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCG
GTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCC
ATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGAT
CGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCT
CCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGC
TTCTAAATGGAAGAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGTTCGGG
TATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCC
CCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTATCATGATTGGTATGGGT
CAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCT
CACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACA
TGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCT
GAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAA
CCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCT
TCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACC
ACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCAT
CTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTG
GTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTAC
ACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAA
GCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCC
AGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATC
ACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAG
CGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCA
TCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTC
ATGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAA
GGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTC
CTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCC
CTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAG
CGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAATGGAAGAGGAAGTTG
CTGCTCTCGTCATTGACAATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCC
GGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCG
TCACCATGGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTG
ATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAG
CACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACAC
CTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGA
CCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATC
GTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGT
CCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTG
GTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCC
CACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCT
CATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGC
GTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGAC
TTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTC
CTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCC
GTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGT
GGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGT
CCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGTCTGGTGGTACTACCATGT
ACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCT
TCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGT
CTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCCACCTTCCAGCAGATGT
GGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGC
AAGTGCTTCTAAATGGAAGAGGAAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGG
TTCGGGTATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCG
TCTTCCCCTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGTATCATGATTGGT
ATGGGTCAGAAGGACTCCTACGTCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGG
TATCCTCACCCTCAGATACCCCATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGG
ATGACATGGAGAAGATCTGGCACCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTC
GCTCCTGAGGAGCACCCCGTCCTCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAA
GTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCC
CCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGT
CGTACCACCGGTATCGTTCTGGACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGT
CCCCATCTACGAGGGTTTCGCCCTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACA
TGGCTGGTCGTGACCTGACGGATTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGT
GGTTACACTTTCTCCACTACCGCTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAA
GGAGAAGCTCTGCTACGTCGCTCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCG
CTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGAGAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAG
GTCATCACCATCGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGC
TCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAGAGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCA
ACTCCATCATGAAGTGTGATGTTGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAAC
ATTGTCATGTCTGGTGGTACTACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTAT
GCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCA
TTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTG
GCCTCCCTGTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGA
CGAGAGCGGTCCCTCGATCGTCCACCGCAAGTGCTTCTAAATGGAAGAGG
AAGTTGCTGCTCTCGTCATTGACAATGGTTCGGGTATGTGCAAGGCCGGT
TTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGTGCCGTCTTCCCCTCCATTGTCGGTCG
TCCCCGTCACCATGGTATCATGATTGGTATGGGTCAGAAGGACTCCTACG
TCGGTGATGAGGCACAGTCCAAGCGTGGTATCCTCACCCTCAGATACCCC
ATTGAGCACGGTGTCGTCACGAACTGGGATGACATGGAGAAGATCTGGCA
CCACACCTTCTACAATGAACTCCGTGTCGCTCCTGAGGAGCACCCCGTCC
TCTTGACCGAAGCCCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACC
CAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCCCCCGCCTTCTACGTCTCCATCCA
GGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCCGGTCGTACCACCGGTATCGTTCTGG
ACTCTGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCC
CTTCCCCACGCCATCTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGACCTGACGGA
TTACCTCATGAAGATCCTGGCCGAGCGTGGTTACACTTTCTCCACTACCG
CTGAGCGTGAAATTGTCCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTCGCT
CTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACCGCTTCCCAGAGCTCCAGCCTCGA
GAAGTCCTACGAGCTTCCCGACGGTCAGGTCATCACCATCGGCAACGAGC
GTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTGTTCGCTCCTAGCGTCCTGGGTCTGGAG
AGCGGTGGTATCCACGAGACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGTGATGT
TGATGTCCGTAAGGATCTGTACGGCAACATTGTCATGTCTGGTGGTACTA
CCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGTATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTT
GCTCCTTCTTCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCCGAGCGCAAGTA
CTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCCCTGTCCACCTTCCAGC
AGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCGATCGTC
CACCGCAAGTGCTTCTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| DBxref | InterPro:IPR043129 |
| DBxref | InterPro:IPR020902 |
| DBxref | InterPro:IPR004001 |
| DBxref | InterPro:IPR004000 |
| DBxref | PFAM:PF00022 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An15 | supercontig | An15:155508..157342 + |
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