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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An16:431724..434365- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_009949-T1 ID=CBS51388_009949-T1|Name=CBS51388_009949-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=2642bp|location=Sequence derived from alignment at An16:431724..434365- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCA
CAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATGCTGTATGTTGCCTCTCCCA
TGCTGCTGTTGCTGCTGATCTACCTTTCACGTGGACCACTACTGACGGAT
GGTTGTGGTTGATGCAGGTCAATGTTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAA
TGTATGTCGGCAAATCAACGCCTCCGCTTGATGTCGATAAGAGACCGTCT
CTGGTACTAGGCCACACCAGGAAGTTGGTAGCTAATTAAGTCTGCACGCA
GTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTG
GCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTAAGTCATTGGTGCTTTGGGTTCATCCC
TGCTTCTACTCTGCAAGGCGGATATGTTTCTTGCTTTGATCGTGTCGGTA
GTAGGTGAGATCCTTCTGCTAACTCCTGTTTTCTCTAGGGTTGATCACGG
CTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGTTCTTGTCG
GCCTATCCTACGTAGGTGCTTCTGGTTGTGCTTCTTGGGCTTTGGACTAA
TTTGGCTAGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGGTGAGTATTCTT
GATTTATACTCCATGACTATTTCGGTACGGTGCTGACTATTCTTCCTCTA
CAGTTAGTAGGTTTTCCATAACCTGTTCGATATCACTTCCTTGCTGACGA
TAGATGAAAGTTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTAC
AGGATGGGCGAACGTGACTGGCTGGGTATGTGTACAAGACTTATTTGTGC
ATGCAGCTGCTAATTCTTACAGGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGTCTTC
TCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCGTAAGT
CCTTTGCTGGCTTTTAGACCCGAACACTTTACTCACAGCCCAACAGTCAT
ATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTACATCGCCTATAACGTT
ATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACTCCTTCCCAAGGTTAC
TAAGGGTGCCTGTAAGTAGAATTGTCCGTCTGGGGATATCGATCTAAAGC
TGACGTGTCTCTAGTTATCTGGTCCCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCA
TCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACTACAACTCTGGCGAGTGAGTA
ATGCCGTTAGCTGACTTCCATTGGACGTGTTGCTGACTCAATAGGTTCGT
CTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATGTAAGGCAGACCACACCCCTT
TCTGATCGGCCAATGCTAACATTTCTTAGGGCCTGATGGACTTGCTTGGC
TGCTCGGAGTATGTTTCACTACCTAAATTCTGTGTGAAGATTGTTACTCA
TACCATCTAGCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTGTAAGTC
TTCCGAGCTCTACTATGCATCCTGGTACTAACCGCTATAAGGACGGTGTC
GCGCACATGATCGAAGGTAAATCTGCCAAATACTACCGGCCTCGTCGCAT
ACTAAACATGCATAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATC
ATGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGAT
CGTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGG
CTACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGT
GCTATTTGCCTTCTCGTGTAAGTTGTTCCTAAGATTTCGGTCCGCATTTA
CTGACATGCTTAAGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCAC
GATCATGACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCG
GTCTCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTT
CCTCTGAATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTG
TATTTTCCTTGGCTCGTCAAGGTACGTAAACTACAAAAAGGCAATAATAC
ATCTTGCGGTATGCTAACCTTAACAGTGCATTCAACGCTATTGTATCTGC
ATCGGTGGTCATGCTTGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACT
GCATTCGCGGGCGGAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAAC
GTTGTGGGCTGGATTGCAAACTTGGTACGTCTCACTTGGTGACTACGCAT
GCACAGAATTCTTACATGTTTCCTGAATAGATCTCGCTAGCCTACGTTTC
TCTCACGACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACTGGAA
GCAACATGAGTAAGTTGTTTTTCATCCGGCATCCACTTTACGAAGTTGCT
AACGTGTCTACTCTAGACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCT
GGTGTCGATTTTCCAATGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGC
CGCGGATGGATGTAGATATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGC
GGAGAAGAAGTTGTGGTGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An16:431724..434365- >CBS51388_009949-T1 ID=CBS51388_009949-T1|Name=CBS51388_009949-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=27234bp|location=Sequence derived from alignment at An16:431724..434365- (Aspergillus niger CBS 513.88) ACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTGTCGATTTTCCAA TGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCGGATGGATGTAGA TATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAGAAGAAGTTGTGG TGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAAATCTCGCTAGCCTACGTTTCTCTC ACGACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACTGGAAGCAA CATGATGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGATAT AGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGATGC TACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAAAC TTGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATGACGA CCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCCCGCT TCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGAATGC TTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTCCTTG GCTCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCATGAT CGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATCGTTC TCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGCTACG CCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTGCTAT TTGCCTTCTCGTCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTGTAAG TCTTCCGAGCTCTACTATGCATCCTGGTACTAACCGCTATAAGGACGGTG TCGCGCACATGATCGAAGGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGGAGTT CGTCTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATTTATCTGGTCCCTTACCG GGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAACTAC AACTCTGGCGATCATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCATCTAC ATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCTCACT CCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTGTTGCCTTGACTGCAACTGGTGGT CTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATCCCTT TCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTACAGGATGGGCGAA CGTGACTGGCTGGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGGGTTGATC ACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGTTCTT GTCGGCCTATCCTACTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTCTCAG TCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTCAATGTTGGGTTT AGCGTTTGCCATTCTAAATATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGACGCCC AGTTGGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTCAATG CTACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTGTCGATTTTCC AATGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCGGATGGATGTA GATATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAGAAGAAGTTGT GGTGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAAATCTCGCTAGCCTACGTTTCTC TCACGACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACTGGAAGC AACATGATGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTGAT ATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAGAT GCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGCAA ACTTGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATGAC GACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCCCG CTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGAAT GCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTCCT TGGCTCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCATG ATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATCGT TCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGCTA CGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTGCT ATTTGCCTTCTCGTCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTGTA AGTCTTCCGAGCTCTACTATGCATCCTGGTACTAACCGCTATAAGGACGG 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GCAACATGATGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCTTG ATATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGAAG ATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATTGC AAACTTGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCATG ACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTCCC CGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCTGA ATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTTTC CTTGGCTCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGATCA TGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGATC GTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCGGC TACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGGTG CTATTTGCCTTCTCGTCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTTTG TAAGTCTTCCGAGCTCTACTATGCATCCTGGTACTAACCGCTATAAGGAC GGTGTCGCGCACATGATCGAAGGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTCGG AGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATTTATCTGGTCCCTT ACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCCAA CTACAACTCTGGCGATCATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTCAT CTACATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGGCT CACTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTGTTGCCTTGACTGCAACTGG TGGTCTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCATC CCTTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTACAGGATGGG CGAACGTGACTGGCTGGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGGGTT GATCACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGAGT TCTTGTCGGCCTATCCTACTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATCTC TCAGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTCAATGTTGG GTTTAGCGTTTGCCATTCTAAATATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATGAC GCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTCTC AATGCTACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTGTCGATT TTCCAATGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCGGATGGA TGTAGATATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAGAAGAAG TTGTGGTGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAAATCTCGCTAGCCTACGTT TCTCTCACGACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACTGG AAGCAACATGATGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATGCT TGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCGGA AGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGATT GCAAACTTGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGATCA TGACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTCTC CCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCTCT GAATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTATTT TCCTTGGCTCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAGAT CATGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCTGA TCGTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCGCG GCTACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCCGG TGCTATTTGCCTTCTCGTCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGCTT TGTAAGTCTTCCGAGCTCTACTATGCATCCTGGTACTAACCGCTATAAGG ACGGTGTCGCGCACATGATCGAAGGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGCTC GGAGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATTTATCTGGTCCC TTACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGCCC AACTACAACTCTGGCGATCATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCCTC ATCTACATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATGGG CTCACTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTGTTGCCTTGACTGCAACT GGTGGTCTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATGCA TCCCTTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTACAGGATG GGCGAACGTGACTGGCTGGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAGGG TTGATCACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCCGA GTTCTTGTCGGCCTATCCTACTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTATC TCTCAGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTCAATGTT GGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAATATGAAAGACTTTCGGGGAGATGATG ACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATTTC TCAATGCTACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTGTCGA TTTTCCAATGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCGGATG GATGTAGATATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAGAAGA AGTTGTGGTGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAAATCTCGCTAGCCTACG TTTCTCTCACGACCGTACTTTTCCTCTTCCCTCCTGACTATCCTGCAACT GGAAGCAACATGATGCATTCAACGCTATTGTATCTGCATCGGTGGTCATG CTTGATATAGCGTACGGCATCCCTATCGCAGTGAACTGCATTCGCGGGCG GAAGATGCTACCGGAGAGGTCCTTTGTTTTGCCCAACGTTGTGGGCTGGA TTGCAAACTTGCTTCCCTCTCGTGTGTGTTCTCTTTGCCGCTATCACGAT CATGACGACCAGTAGTCGTATGATCTACGCCTTTGCAAGAGATGGCGGTC TCCCCGCTTCTCCTTTCTTCAGCAAGGTGCACACCAAGCTTGAGGTTCCT CTGAATGCTTTGTACCTTACCAACATCCTCGTCATCATTTTCGGGTGTAT TTTCCTTGGCTCGTCAAGAAATTCCAAACCCCTCGGTGGTTGGGCCCAAG ATCATGATCGGTTGCGTCGGTATTGGAACCTTTACTGGCACAATCTTCCT GATCGTTCTCCTCTTTGTGGCTGGAAACATCTACGAAGATATCAACTCCG CGGCTACGCCTTTGCTGCAAATTTTCGTGAATGCAACGAAAAACAACGCC GGTGCTATTTGCCTTCTCGTCTCCTTCAAGGAGGACTGGGTCTCACAGGC TTTGTAAGTCTTCCGAGCTCTACTATGCATCCTGGTACTAACCGCTATAA GGACGGTGTCGCGCACATGATCGAAGGGCCTGATGGACTTGCTTGGCTGC TCGGAGTTCGTCTTCGGAGAATTCATCAACGAAACAGGATTTATCTGGTC CCTTACCGGGTTCACTATAATCTGCATCACCCTGCTGGCATGCTCGTCGC CCAACTACAACTCTGGCGATCATATGTGTCGCAACGCTGGCATCAGTTCC TCATCTACATCGCCTATAACGTTATTGCATTCCTCATCAATGCCTTCATG GGCTCACTCCTTCCCAAGGTTACTAAGGGTGCCTGTTGCCTTGACTGCAA CTGGTGGTCTTCTCGGAAGTGAATTGATCTTGGGTGTCATCTCGTTGATG CATCCCTTTCCTGGGAAAGATGGATGCCCCTTCTCTCGTGGATTACAGGA TGGGCGAACGTGACTGGCTGGTGCTGGTGGACAATACCATTGGGTTGCAG GGTTGATCACGGCTGGTGTCTGTAATCTTTGCATGTCGGCTTCCCTTGCC GAGTTCTTGTCGGCCTATCCTACTCATGGACCGCTCTGTCCGCCAGTTTA TCTCTCAGTCTGCCGTCTGGTGGCTGCGTTAGTGTCATCTGGGGTCAATG TTGGGTTTAGCGTTTGCCATTCTAAATATGAAAGACTTTCGGGGAGATGA TGACGCCCAGTTGGCGGCCATGGGCCACAAGGCCGAACTGAACCGCAATT TCTCAATGCTACTACTGTGTAGCCGTGTTTGGCATCGTTTTCCTGGTGTC GATTTTCCAATGGTTTGTGGACGGACGTAAGAACTTCACCGGGCCGCGGA TGGATGTAGATATCATCAGTGGCCAGGTAGCCCCCGGTGATGGCGGAGAA GAAGTTGTGGTGCCTAGCAACTTTCATGAGAAATAAATCTCGCTAGCCTA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
| GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR002293 |
| DBxref | PFAM:PF13520 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| An16 | supercontig | An16:431724..434365 - |
|