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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An16:1125648..1129194- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_010184-T1 ID=CBS51388_010184-T1|Name=CBS51388_010184-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=3547bp|location=Sequence derived from alignment at An16:1125648..1129194- (Aspergillus niger CBS 513.88) ATGGTTCTCGCTACTCGTTGCGGGCAGGCTACGTCCGCCCTCCTGCGTCA
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TCGCCAGCGGACTCGTCAAGCCCGGCAGCAAATTGGTCGATGTCAAGAAG
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CGACTATTCCGGTAAGTTGGACGAGTCGCTGAAACCTTGACTTTCCCATC
ATGAATCCCCTGCTCCTTTACCTGATGGTTCGCGATCAATTGAGCGATTC
CTACATGGAATAAAGACGGGAACCCGGGATTACTAGGTCAAGGCTTTTCT
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GGTTACCCCCGAGTATGTCACCTATGTCATTGAGCGGGAGAGACCCGATG
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CAGCATCAAGACCCTGGAGACCAGTGAGGACCGTGATCTTTTCTCCAAGG
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CCGTTCTGCCTACGCCCTGGGTGGTCTGGGTTCCGGTTTCGCTGCCAACC
CCGAGGAGCTGAAGAACTTGTCCTCCCGCTCTCTGACCCTTTCTCCCCAG
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TTGACCCTCTTGGTATCCACACTGGTGACAGTATCGTCGTTGCTCCCAGT
CAGACCCTGTCTGATGAGGAGTACCACATGCTCCGTACCGCTGCTATCAA
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TCTCGTTCCTCGGCTCTGGCCTCCAAGGCCACTGGTTACCCCCTGGCTTA
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CCGTTACCAAGACCACTACTGCCAACTTCGAGCCCAGTCTGGACTACATC
GTTACCAAGATTCCCCGGTGGGATTTGAGCAAGTTCCAGCATGTCAACCG
CGACATTGGCAGTGCCATGAAGTCTGTCGGTGAAGTCATGGCTATTGGCC
GTACTTTCGAGGAGTCTTTCCAGAAGGCTATCCGTCAGGTTGACCCCCGC
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GAACCCCACCGACCGCCGCTGGTTGGCTGTTGGCCAGGCTATGCTCCACG
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CATCGGCAGCCTCTTTGGCCTCCAGAAGGAGATCCTGCTGAAGGCCAAGA
AGCTTGGTTTCTCCGACAAGCAGATCTCTCAGCTCGTTGGCGCCTCTGAG
GACGATGTTCGCGCCCGCCGTAAGTCCTTCGGTATCAGGCCCTGGGTTAA
GAAGATCGACACCCTCGCTGCCGAGTTCCCTGCTGACACCAACTACCTCT
ACACCACCTACAACGCTACCTCCCACGATGTTAGCTTCGACGACCACGGT
GTCATCATTCTGGGAAGCGGTGTCTACCGTATTGGAAGCTCCGTCGAGTT
CGACTGGTGTGCTGTCAACGCTACTCTCTCCCTGCGCAACATGGGCAAGA
AGACTGTCATGATCAACTACAACCCTGAGACCTACTCCACTGACTTCGAT
ACTGCTGACAAGCTCTACTTCGAAGAACTCAGCTACGAGCGTGTCATGGA
TATCTACGAGCTTGAGAGCGCCAGCGGTGTTGTCGTCTCTGTCGGTGGTC
AGCTTCCTCAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNGTCGTCATCACCAAGTTCATTGAGGGTGCCCAGGAGAT
TGACGTTGACGCTGTCGCTTCCAACGGCAAGCTTCTGCTCCACGCCGTCA
GTGAGCACGTTGAGCCTGCTGGTGTGCACTCCGGTGATGCCACTCTCGTC
CTCCCCCCTGCCAACCTCGAGGAGTCTGTCATGAGCCGCGTTAAGGAGAT
TGCTGAGAAGGTTGCCAAGGCCTGGAACATCACCGGTCCCTTCAACATGC
AGATCATCAAGGCTGACCTCGAGGGTGCTGAGCCTGAGCTGAAGGTCATT
GAGTGCAACCTTCGTGCCTCCCGCTCCTTCCCCTTCGTCAGTAAGGTCCT
GGGTACCAACTTCATCGATGTTGCTACCAAGGCTCTGGTCGGCCGTGACG
TCCCTGAGCCCGTCGATCTCATGAGTGTCAAGCGCGACTACCTTGCCACT
AAGGTTCCCCAGTTCAGCTGGACCCGTCTTGCTGGTGCCGATCCTTTCCT
CGGTGTCGAGATGGCCAGTACTGGCGAGATTGCCTGCTTCGGTAAGGATG
TTGTTGAGGCCTACTGGGCTTCCCTGCAGGCTACCATGAACTTCCGTTGC
CCTGAGGCTGGTGAAGGTATCCTGCTCGGCGGTGATATCACCAACCCTGC
CCTGGCCCAGATTGTCGAGTACCTCAAGCCCCTCGACTTCAAGTTCTTCG
CTGCTAGCCCCGCTGTCAAGGAGCACCTCGAGGCTGCTACCAAGGTTCCC
GTGCAGGTCATTGAGTTCCCCAAGCAGGACAAGCGTGCTCTGCGTGAAGT
CTTCCAGAAGTACAACATCCGTGGTACCTTCAACCTTGCCAAGACCCGTG
GCAAGTCTCTCCTCGATGAGGACTATGTCATGAGACGTAACGCCGTCGAC
TTCGGCGTTCCTCTCTTCATGGAGACCAAGGTATGCAAATTACCCCCTCT
TCCTCCCTGTTTGCCCTGTTGCTAACTGTTCCTTTCTAGACTGCTCTCCT
CTTCGCCCAGGCCATGAGCGAGAAGATGCCCCGTGCCGATGGCATTCCTT
CCGAGGTCCGCACCTGGTCCGACTTCACCGGCGGCAAGCTGCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An16:1125648..1129194- >CBS51388_010184-T1 ID=CBS51388_010184-T1|Name=CBS51388_010184-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=12708bp|location=Sequence derived from alignment at An16:1125648..1129194- (Aspergillus niger CBS 513.88) ACTGCTCTCCTCTTCGCCCAGGCCATGAGCGAGAAGATGCCCCGTGCCGA TGGCATTCCTTCCGAGGTCCGCACCTGGTCCGACTTCACCGGCGGCAAGC TGCTGTAATTCATTGAGGGTGCCCAGGAGATTGACGTTGACGCTGTCGCT TCCAACGGCAAGCTTCTGCTCCACGCCGTCAGTGAGCACGTTGAGCCTGC TGGTGTGCACTCCGGTGATGCCACTCTCGTCCTCCCCCCTGCCAACCTCG AGGAGTCTGTCATGAGCCGCGTTAAGGAGATTGCTGAGAAGGTTGCCAAG GCCTGGAACATCACCGGTCCCTTCAACATGCAGATCATCAAGGCTGACCT CGAGGGTGCTGAGCCTGAGCTGAAGGTCATTGAGTGCAACCTTCGTGCCT CCCGCTCCTTCCCCTTCGTCAGTAAGGTCCTGGGTACCAACTTCATCGAT GTTGCTACCAAGGCTCTGGTCGGCCGTGACGTCCCTGAGCCCGTCGATCT CATGAGTGTCAAGCGCGACTACCTTGCCACTAAGGTTCCCCAGTTCAGCT GGACCCGTCTTGCTGGTGCCGATCCTTTCCTCGGTGTCGAGATGGCCAGT 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CAGATGAACCGCATGGGTATCTTCGAGCGCTACGGTGTCCGCGTTCTGGG AACCAGCATCAAGACCCTGGAGACCAGTGAGGACCGTGATCTTTTCTCCA AGGCCCTCAACGAGATCAACATCCCCATCGCCGAATCCATTGCGGTCAGC ACCGTCGACGAGGCCCTGAAGGCTGCTGAGACCGTTGGATACCCTATCAT CGTCCGTTCTGCCTACGCCCTGGGTGGTCTGGGTTCCGGTTTCGCTGCCA ACCCCGAGGAGCTGAAGAACTTGTCCTCCCGCTCTCTGACCCTTTCTCCC CAGATTCTGGTCGAGAAGTCTCTCCGTGGCTGGAAGGAAGTCGAATATGA GGTTGTCCGCGATGCTGACAACAACTGCATCACTGTTTGCAACATGGAGA ACTTTGACCCTCTTGGTATCCACACTGGTGACAGTATCGTCGTTGCTCCC AGTCAGACCCTGTCTGATGAGGAGTACCACATGCTCCGTACCGCTGCTAT CAAGATTGTTCGCCACTTGGGTGTCGTCGGTGAATGTAACGTCCAGTACG CTCTGCAGCCCGATGGCCTTGACTACCGTGTCATTGAGGTCAACGCTCGT CTCTCTCGTTCCTCGGCTCTGGCCTCCAAGGCCACTGGTTACCCCCTGGC TTACACTGCTGCGAAGATCGGTCTGGGACACACCCTCCCCGAGCTTCCCA ACGCCGTTACCAAGACCACTACTGCCAACTTCGAGCCCAGTCTGGACTAC ATCGTTACCAAGATTCCCCGGTGGGATTTGAGCAAGTTCCAGCATGTCAA CCGCGACATTGGCAGTGCCATGAAGTCTGTCGGTGAAGTCATGGCTATTG GCCGTACTTTCGAGGAGTCTTTCCAGAAGGCTATCCGTCAGGTTGACCCC CGCTTCGTTGGCTTCCAGGGTGACCACTTCGAGAACCTCGACGAAGTCCT 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0046872 | metal ion binding |
| GO:0005524 | ATP binding |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0006807 | nitrogen compound metabolic process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR016185 |
| DBxref | InterPro:IPR011761 |
| DBxref | InterPro:IPR006275 |
| DBxref | InterPro:IPR036914 |
| DBxref | InterPro:IPR036897 |
| DBxref | InterPro:IPR005479 |
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| DBxref | InterPro:IPR005483 |
| DBxref | PFAM:PF07478 |
| DBxref | PFAM:PF02787 |
| DBxref | PFAM:PF02786 |
| DBxref | PFAM:PF02222 |
| Product | argininosuccinate lyase |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| An16 | supercontig | An16:1125648..1129194 - |
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