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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An16:1530161..1531931- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_010311-T1 ID=CBS51388_010311-T1|Name=CBS51388_010311-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1771bp|location=Sequence derived from alignment at An16:1530161..1531931- (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCATGGTGTC
CGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTCAAGTGTA
TGTGATGTTTGTCCGAGTTTCGTTGTACCACTCTAACAGAAGTAGGGGTT
GGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCACCCT
GGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGAGAA
ACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTGACT
CCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCTGAA
GTCGGTATGTTATCGCTCATGCCCCTGATATTGTTGGTCGTTGCAACACT
AACTGGTTACATAGACTGTCGAATTCGTTACCAACAGCGGTGCCTACGCT
GTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTGTAAGTGGATACAGTTGGATG
AGAAAGGTGGCATATGATGGCTAACAGCCTGCAGTGATGGAAGCATCATT
ACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAATT
TGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAGTGAGTAGACCTTTTACT
ATACCATTTATACAAAGAGATAACTAATGGAAACAGACAACGAGTACCAT
GACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCAGGCTGCTATCAACGG
TATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACATCTTCGTCGAGGGTAACG
CCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAACGACAACCTGTCTGGC
CTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGATGCACCAGTACCTTGA
CTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGCC
AGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCAG
GGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGGC
TGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTTG
GTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGAACCTACATGTACTCT
CTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTACCTGCCCATCCTCGA
GAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCT
CCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGAG
CAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTTC
CTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCA
AGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCCACCTCCAGCGCTGTCGCT
GCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCCGTCGCCCCTACTTC
TTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTTACGTTCCCACCACCACTG
CTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTGCTGCTAGCAGCAGC
GGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCCCTCGGCTACCAACTCTGC
TGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTATCAACTGGACCGGCC
CTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCCAGAACGACTACTAC
TACCAGTGCGTTGCTGAGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An16:1530161..1531931- >CBS51388_010311-T1 ID=CBS51388_010311-T1|Name=CBS51388_010311-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=7770bp|location=Sequence derived from alignment at An16:1530161..1531931- (Aspergillus niger CBS 513.88)
ACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAACCAG
GCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACATCTT
CGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTACAACG
ACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGAGATG
CACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTGTCAG
CTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTGAAGA
CCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAACTCC
GTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGAACTC
CGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGGGGAA
CCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCACCTAC
CTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCTCCAG
CTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACCACCA
CTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGATTGCC
TCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTCTCAG
CAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCCACCT
CCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCCTGCC
GTCGCCCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTTACGT
TCCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGCGCTG
CTGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCCCTCG
GCTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTGGTAT
CAACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAGGTCC
AGAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGATGGAAGCATCAT
TACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACCGAAT
TTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGTCGAATTCGTTAC
CAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGTTTGG
GTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCGGCAC
CCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTCCTGA
GAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCGTTTG
ACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTGACCT
GAAGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCCAGCA
TGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGGCTTC
AAGTACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACCTCAA
CCAGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAGTACA
TCTTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTACCTAC
AACGACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCTATGA
GATGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACCTGTG
TCAGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTGGCTG
AAGACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCGTCAA
CTCCGTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCCGAGA
ACTCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTGGTGG
GGAACCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACTCCAC
CTACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCCGCCT
CCAGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTCCACC
ACCACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTGAGAT
TGCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACTACTC
TCAGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAGCGCC
ACCTCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCACCCC
TGCCGTCGCCCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCCGTTT
ACGTTCCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTCCAGC
GCTGCTGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGGGTCC
CTCGGCTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGCGGTG
GTATCAACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTGCAAG
GTCCAGAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGATGGAAGCA
TCATTACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGCTACC
GAATTTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGTCGAATTCG
TTACCAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGGACGT
TTGGGTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTCCCCG
GCACCCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCAGGTC
CTGAGAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGGAGCG
TTTGACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTCTCTG
ACCTGAAGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGCCGCC
AGCATGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACTCTGG
CTTCAAGTACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTGGACC
TCAACCAGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCACCCAG
TACATCTTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGACTAC
CTACAACGACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATCATCT
ATGAGATGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGAGACC
TGTGTCAGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCGAGTG
GCTGAAGACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGTGGCG
TCAACTCCGTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACATGTCC
GAGAACTCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTCCCTG
GTGGGGAACCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCCTACT
CCACCTACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGCTTCC
GCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTGCTTC
CACCACCACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAGGTTG
AGATTGCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCAGACT
ACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGTCCAG
CGCCACCTCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCCACCA
CCCCTGCCGTCGCCCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCACTTCC
GTTTACGTTCCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTAGCTC
CAGCGCTGCTGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCACAGG
GTCCCTCGGCTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCAGTGC
GGTGGTATCAACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACACCTG
CAAGGTCCAGAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGATGGA
AGCATCATTACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACGTCGC
TACCGAATTTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGTCGAA
TTCGTTACCAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACTACGG
ACGTTTGGGTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGCCCTC
CCCGGCACCCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGATCCA
GGTCCTGAGAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTCATGG
AGCGTTTGACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTACCTC
TCTGACCTGAAGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTTCTGC
CGCCAGCATGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGTGACT
CTGGCTTCAAGTACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGTTCTG
GACCTCAACCAGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCACCAC
CCAGTACATCTTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGACTGGA
CTACCTACAACGACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAAGATC
ATCTATGAGATGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTTCCGA
GACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCCACCG
AGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGCCGGT
GGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGTACAT
GTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCCGGTC
CCTGGTGGGGAACCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCACCGCC
TACTCCACCTACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTGATGC
TTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCCACTG
CTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCACCCAG
GTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCAGCCA
GACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAGCTGT
CCAGCGCCACCTCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGTTGCC
ACCACCCCTGCCGTCGCCCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTTACCAC
TTCCGTTTACGTTCCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAGGTTA
GCTCCAGCGCTGCTGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGACCCA
CAGGGTCCCTCGGCTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACTACCA
GTGCGGTGGTATCAACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCCTACA
CCTGCAAGGTCCAGAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTAATGA
TGGAAGCATCATTACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAGAACG
TCGCTACCGAATTTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAACTGT
CGAATTCGTTACCAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCACAACT
ACGGACGTTTGGGTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCTCCGC
CCTCCCCGGCACCCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCCAAGA
TCCAGGTCCTGAGAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTTCCTC
ATGGAGCGTTTGACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGACTTA
CCTCTCTGACCTGAAGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCGGCTT
CTGCCGCCAGCATGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAAGCGT
GACTCTGGCTTCAAGTACAACGAGTACCATGACATGGAGCAGTCCCTGGT
TCTGGACCTCAACCAGGCTGCTATCAACGGTATCCGTGCCGCTGGTGCCA
CCACCCAGTACATCTTCGTCGAGGGTAACGCCTACACCGGTGCCTGGGAC
TGGACTACCTACAACGACAACCTGTCTGGCCTGACCGACAGCGAGGACAA
GATCATCTATGAGATGCACCAGTACCTTGACTCCGACAGCTCCGGTACTT
CCGAGACCTGTGTCAGCTCCACGATCGGCCAGGAGCGCCTCGAGAAGGCC
ACCGAGTGGCTGAAGACCAACAACAAGCAGGGTATCGTCGGTGAATTCGC
CGGTGGCGTCAACTCCGTGTGTGAGGAGGCTGTCGAGGGTATGCTCGCGT
ACATGTCCGAGAACTCCGACGTCTGGGTTGGTGCTTCCTGGTGGTCTGCC
GGTCCCTGGTGGGGAACCTACATGTACTCTCTGGAGCCTACCGATGGCAC
CGCCTACTCCACCTACCTGCCCATCCTCGAGAAGTACTTCCCTAGCGGTG
ATGCTTCCGCCTCCAGCTCGGCCTCTGTCTCCGTTGCTGCTGCTACCTCC
ACTGCTTCCACCACCACTGCCGCTTTTGAGCAGACCACCACCCCCGCCAC
CCAGGTTGAGATTGCCTCTTCCTCTTCTTCCTCTTCGGCCAACGCCGCCA
GCCAGACTACTCTCAGCAAGGTCAAGTCCAAGTCCAAGTCCCCTTGCAAG
CTGTCCAGCGCCACCTCCAGCGCTGTCGCTGCCACCACCCCTGTTGTTGT
TGCCACCACCCCTGCCGTCGCCCCTACTTCTTCCAGCGTCGCTTTCGTTA
CCACTTCCGTTTACGTTCCCACCACCACTGCTGCCGTTGCCCCCAGCCAG
GTTAGCTCCAGCGCTGCTGCTAGCAGCAGCGGTGTCGTCGGTGTCAGCGA
CCCACAGGGTCCCTCGGCTACCAACTCTGCTGGTGAGGTGAACCAGTACT
ACCAGTGCGGTGGTATCAACTGGACCGGCCCTACCGTCTGTGCCAGCCCC
TACACCTGCAAGGTCCAGAACGACTACTACTACCAGTGCGTTGCTGAGTA
ATGATGGAAGCATCATTACTTCCACCTCCGACTTCAAGACCTGGTGGAAG
AACGTCGCTACCGAATTTGCCGACAACGACAAGGTCATCTTCGATACCAA
CTGTCGAATTCGTTACCAACAGCGGTGCCTACGCTGTCCTTGACCCCCAC
AACTACGGACGTTTGGGTTGGTACTAGTGAATCCGGCGCTGAATTCGGCT
CCGCCCTCCCCGGCACCCTGGGAACCGACTACACCTGGCCCGAGACCTCC
AAGATCCAGGTCCTGAGAAACAAGGGCATGAACATCTTCCGTATTCCCTT
CCTCATGGAGCGTTTGACTCCCGATGGCTTGACCAGCTCTTTCGCTTCGA
CTTACCTCTCTGACCTGAAGTCGATGAGAATTAGCAACTTGATCGTTGCG
GCTTCTGCCGCCAGCATGGTGTCCGCTCTCCCCAGCCGCCAGATGAAGAA
GCGTGACTCTGGCTTCAAGT back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0005576 | extracellular region |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0005975 | carbohydrate metabolic process |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0004553 | hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds |
| GO:0030248 | cellulose binding |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-18) |
| Note | CAZy:GH5 |
| Note | CAZy:GH5_5 |
| DBxref | InterPro:IPR017853 |
| DBxref | InterPro:IPR035971 |
| DBxref | InterPro:IPR001547 |
| DBxref | InterPro:IPR000254 |
| DBxref | PFAM:PF00150 |
| DBxref | PFAM:PF00734 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An16 | supercontig | An16:1530161..1531931 - |
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