|
|
Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at An19:64874..66242+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CBS51388_011228-T1 ID=CBS51388_011228-T1|Name=CBS51388_011228-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=mRNA|length=1369bp|location=Sequence derived from alignment at An19:64874..66242+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTGTTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGC
CGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCA
CTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTG
GTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGAC
GTGAGTTTTGAATCCAAAGCAGAGAACGAATCGATTCCCGGCTGACCAGT
GTCCGAATTTGCCAGTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGA
CCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATC
AACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCAC
CGTCACCTAGTAAGTTGCCTTCTGAGGTAACCTCGAGTATAAGGGAAGAG
AAAATGCTGACAAGAGGATAGCAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCG
TCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAG
GGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGTA
TGCATCGTCCAGGACTACATACATTACTCCCATCGCAAACTAACCATGGA
ATTCCCACAGGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGG
GGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCA
CGTTACCGTAAGTCGCCATCCAGCATCATGATTTTCATCCTTCCACCACT
AATGAATGCTTCAGACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGT
ACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGA
GTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACC
TTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAG
ACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTA
CAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCG
GTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTC
CTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTC
CTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACG
GCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGC
GACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGC
TGGTCAGGGTAACCTGTAA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at An19:64874..66242+ >CBS51388_011228-T1 ID=CBS51388_011228-T1|Name=CBS51388_011228-T1|organism=Aspergillus niger CBS 513.88|type=CDS|length=5610bp|location=Sequence derived from alignment at An19:64874..66242+ (Aspergillus niger CBS 513.88)
ATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTGTTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGC
CGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCA
CTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTG
GTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGAC
TTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTC
CCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGG
TGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACAC
TGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTG
AGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGT
GTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGA
GTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCT
GGATTGACCACGTTACCACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTC
GGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGG
CGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGT
ACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTAC
AAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACAT
CTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCT
CCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACC
GTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGC
CTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCA
ACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGC
GGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAA
CGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTG
TTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCC
GTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTA
CCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCC
GTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACT
ACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCT
GGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCA
CCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAAC
TCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCG
TGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTG
CTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACC
CTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACGTTACCACTGCCCGCAT
TGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCA
TCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGAC
GGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCAC
CTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCC
AGGACAACACCTACCTCCACATCTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCG
GGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAA
CTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTG
CTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGC
CGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCAC
CACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTG
CCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAG
TACGCTGCTGCTCTCACGGCTGTTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGC
TGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTG
GTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCT
TACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGA
CTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGG
GTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACC
AACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGG
TGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTA
CCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCC
AACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGT
CTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTG
ACCACGTTACCACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACC
GACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTC
TGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTG
ACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACC
TCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTACAA
CAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTG
GCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTC
GAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTC
CACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCG
GTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGAC
ACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGG
TCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCTGCTGCTCTCACGGCTGTTGCCG
CCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGGTGTCTCCGGCACTCCCGTGGGT
TTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTGATGCTACCCCCGTCTACCCTAC
CACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTCGGTGATGACGAGGCCCGTGTCA
TTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCACTGACACTGAGGGCACTACCACG
ACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTGCCTCCGGCTGCCAGCTGGCCAT
CAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTACGAGCCCGATGCTCCCACCACCA
CCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACTCGGTATCACCGTCAACTCCAAC
AAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCGGTGTCATCAAGGGCCGTGGTCT
CCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATCATCATCCAGAACATTGCTGTCA
CCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGGTGGTGACGCCATCACCCTCGAC
GAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACGTTACCACTGCCCGCATTGGTCG
CCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCCGACAGCCGTGTCTCCATCACCA
ACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTACTCTGCTACTTGCGACGGCCAC
CACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCTCTAGCGACAAGGTCACCTTCAG
TGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGCCGTGCCCCCAAGGTCCAGGACA
ACACCTACCTCCACATCTACAACAACTACTGGGAGAACAACTCGGGCCAC
GCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACGTCCTCGCCGAGGGTAACTACTT
CTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACCGACACCTTCGAGGGTGCTCTCT
TCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTGCGAGTCCTACATTGGCCGTTCC
TGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACCTCACCGGCACCTCCACCACCGT
CCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTCCCCTCTGCTGATGCTGCCAGCA
CCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGGTAACCTGTAAATGAAGTACGCT
GCTGCTCTCACGGCTGTTGCCGCCCTCGCTGCCCGCGCCGCTGCTGTCGG
TGTCTCCGGCACTCCCGTGGGTTTCGCCTCCTCCGCCACTGGTGGTGGTG
ATGCTACCCCCGTCTACCCTACCACCACCGATGAGCTGGTCTCTTACCTC
GGTGATGACGAGGCCCGTGTCATTGTCCTGTCCAAGACTTTCGACTTCAC
TGACACTGAGGGCACTACCACGACCACCGGTTGCGCTCCCTGGGGTACTG
CCTCCGGCTGCCAGCTGGCCATCAACAAGGACGACTGGTGCACCAACTAC
GAGCCCGATGCTCCCACCACCACCGTCACCTACAACACTGCTGGTGAACT
CGGTATCACCGTCAACTCCAACAAGTCCTTGATCGGTGAGGGTACCAGCG
GTGTCATCAAGGGCCGTGGTCTCCGCATGGTCAGCGGTGTCTCCAACATC
ATCATCCAGAACATTGCTGTCACCGACATCAACCCCGAGTACGTCTGGGG
TGGTGACGCCATCACCCTCGACGAGGCTGACTTGGTCTGGATTGACCACG
TTACCACTGCCCGCATTGGTCGCCAGCACTACGTCCTCGGTACCGACGCC
GACAGCCGTGTCTCCATCACCAACAACTACATCAACGGCGAGTCTGACTA
CTCTGCTACTTGCGACGGCCACCACTACTGGAACGTGTACCTTGACGGCT
CTAGCGACAAGGTCACCTTCAGTGGCAACTACCTGTACAAGACCTCCGGC
CGTGCCCCCAAGGTCCAGGACAACACCTACCTCCACATCTACAACAACTA
CTGGGAGAACAACTCGGGCCACGCTTTCGAGATCGGCTCCGGTGGCTACG
TCCTCGCCGAGGGTAACTACTTCTCCAACGTCGACACCGTCCTCGAGACC
GACACCTTCGAGGGTGCTCTCTTCTCCTCTGACAGCGCCTCCTCCACCTG
CGAGTCCTACATTGGCCGTTCCTGCGTTGCCAACGTCAACGGCGGTGACC
TCACCGGCACCTCCACCACCGTCCTCTCCAACCTCAGCGGCGACACCCTC
CCCTCTGCTGATGCTGCCAGCACCAGCCCCGCCTCCAACGCTGGTCAGGG
TAACCTGTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | SECRETED:SignalP(1-19) |
| Note | CAZy:PL1 |
| Note | CAZy:PL1_4 |
| DBxref | InterPro:IPR011050 |
| DBxref | InterPro:IPR012334 |
| DBxref | InterPro:IPR002022 |
| DBxref | PFAM:PF00544 |
| Product | hypothetical protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| An19 | supercontig | An19:64874..66242 + |
|
