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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000004.1:599256..600656+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_1080-T1 ID=CAN33_1080-T1|Name=CAN33_1080-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1401bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000004.1:599256..600656+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGAAGTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGGTGTC
TGCTCAGCACCACCACCAGCACCGCCATCACCACAAGCGCTCCCCCGACA
CCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGAC
GGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGATGGTGTCGCCAAGGGTAC
TTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCTGCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTT
CGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTCCAG
GCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGTCGCCGTCAACAAGCACTCGAGCAGCTC
CAGCTCCAGCTCCAGCAGCACCAAGACCAGCAGCTCGTACGCCGCTGCCT
CCTCCAGCTCCTCCGCCAGCAGCTCTAGCAGCAGCTCCTCCTCTGCCACC
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CTCTGAATATGGTGCCGTTGCCCTCGACTACCTTGGCCTTGGTGGTTGGT
CCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGATACCATCGTT
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CTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCCCAGTGGCCCAGCACCCAGGGTTCTA
CCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCTCCACCTT
ACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTGGAGGTGT
CCACGTCCAGAACACCATGAGCGAGGAGGTCGCTGTTTGCCGTACCGACT
ACCCTGGTAAGCATTGAACTTCTCTTCCGACAGGTGGGTCCAAACAAAGA
TATTAACTCTGTCTGCAGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTC
GCTGCCAACAGCGAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTA
CTACAAGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAACCCCA
AGGGTGTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCTCTCCT
ATCGGTAACTGGGCCCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAA
GTGGCTTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCTTGACT
TCAACGTGAAGATCGAGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAG
GACGGTACCTTCTACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGT
AAGTGCCCTTGCGTTTGTTTTTGGCTGGGACTTTTCGCTGATCATCATCT
CCTCTCCAGGTTGAGGTTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACTA
A back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000004.1:599256..600656+ >CAN33_1080-T1 ID=CAN33_1080-T1|Name=CAN33_1080-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=5475bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000004.1:599256..600656+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGAAGTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGCGCTC CCCCGACACCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCG TTCTCGACGGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGATGGTGTCGCC AAGGGTACTTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCTGCGAATGTTTGCCAGTC CTCCTCTTCGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTT CCGTCCAGGCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTT GACTGCGACACCTTCCCCTCTGAATATGGTGCCGTTGCCCTCGACTACCT TGGCCTTGGTGGTTGGTCCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGA TTGTCGATACCATCGTTACCGGTGTTACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGA GCCATGTGCTCCTATGCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCCCAGTGGCC CAGCACCCAGGGTTCTACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGA ACGGCAAGCTCCACCTTACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATT GAGGGTGTTGGAGGTGTCCACGTCCAGAACACCATGAGCGAGGAGGTCGC TGTTTGCCGTACCGACTACCCTGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCG CTGTCGCTGCCAACAGCGAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCC ACCTACTACAAGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAA CCCCAAGGGTGTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCT CTCCTATCGGTAACTGGGCCCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGAT GGCAAGTGGCTTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCT TGACTTCAACGTGAAGATCGAGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGT ACGAGGACGGTACCTTCTACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGC ACTGTTGAGGTTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACTAAATGAA GTTCAATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGCGCTCCCCCG ACACCGAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTC GACGGCAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGATGGTGTCGCCAAGGG TACTTTGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCTGCGAATGTTTGCCAGTCCTCCT CTTCGACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTC CAGGCTGCTGCTGAGTTCATCGAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTG CGACACCTTCCCCTCTGAATATGGTGCCGTTGCCCTCGACTACCTTGGCC TTGGTGGTTGGTCCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTC GATACCATCGTTACCGGTGTTACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCAT GTGCTCCTATGCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCCCAGTGGCCCAGCA CCCAGGGTTCTACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGC AAGCTCCACCTTACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGG TGTTGGAGGTGTCCACGTCCAGAACACCATGAGCGAGGAGGTCGCTGTTT GCCGTACCGACTACCCTGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTC GCTGCCAACAGCGAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTA CTACAAGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAACCCCA AGGGTGTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCTCTCCT ATCGGTAACTGGGCCCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAA GTGGCTTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCTTGACT TCAACGTGAAGATCGAGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAG GACGGTACCTTCTACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGT TGAGGTTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACTAAATGAAGTTCA ATACTGTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGCGCTCCCCCGACACC GAGGTCGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGACGG CAAGGTCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGATGGTGTCGCCAAGGGTACTT TGAAGTTCTCTGGCAACGTGCCTGCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTTCG ACTGTGTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTCCAGGC TGCTGCTGAGTTCATCGAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTGCGACA CCTTCCCCTCTGAATATGGTGCCGTTGCCCTCGACTACCTTGGCCTTGGT GGTTGGTCCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGATAC CATCGTTACCGGTGTTACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCATGTGCT CCTATGCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCCCAGTGGCCCAGCACCCAG GGTTCTACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCT CCACCTTACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTG GAGGTGTCCACGTCCAGAACACCATGAGCGAGGAGGTCGCTGTTTGCCGT ACCGACTACCCTGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTCGCTGC CAACAGCGAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTACTACA AGTGGGAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAACCCCAAGGGT GTTTCCACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCTCTCCTATCGG TAACTGGGCCCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAAGTGGC TTTCTCTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCTTGACTTCAAC GTGAAGATCGAGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAGGACGG TACCTTCTACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGTTGAGG TTCTCTCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACTAAATGAAGTTCAATACT GTCGCCCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGCGCTCCCCCGACACCGAGGT CGTCACGGTGCCCGGCCCTACCGTCACCACCTTCGTTCTCGACGGCAAGG TCATTACCTTCGAGGAGGCCTGCGATGGTGTCGCCAAGGGTACTTTGAAG TTCTCTGGCAACGTGCCTGCGAATGTTTGCCAGTCCTCCTCTTCGACTGT GTCTTCGAGCACCACCAGCCCGACTCCCACGGCTTCCGTCCAGGCTGCTG CTGAGTTCATCGAGGAGTTCCCCGATGGCGAGCTTGACTGCGACACCTTC CCCTCTGAATATGGTGCCGTTGCCCTCGACTACCTTGGCCTTGGTGGTTG GTCCGGTATCCAGTACGTGACCATCGTCGACGAGATTGTCGATACCATCG TTACCGGTGTTACCGGCGACTCCTGCATTTCCGGAGCCATGTGCTCCTAT GCCTGCCCTGCCGGATACCAGAAGTCCCAGTGGCCCAGCACCCAGGGTTC TACCGGCCAGTCCGTTGGTGGTATTGAGTGCAAGAACGGCAAGCTCCACC TTACCAACAAGTCTCTGTCCAAGAAGCTTTGCATTGAGGGTGTTGGAGGT GTCCACGTCCAGAACACCATGAGCGAGGAGGTCGCTGTTTGCCGTACCGA CTACCCTGGTACCGAATCCGAGACCATCCCTCTCGCTGTCGCTGCCAACA GCGAACTTCACCCCCTGACTTGCCCCAACGGCGCCACCTACTACAAGTGG GAGAACCAGACCACTTCCGCTCAGTACTATGTTAACCCCAAGGGTGTTTC CACCGAGACTGGTTGCCAGTGGGGTAACGGCAGCTCTCCTATCGGTAACT GGGCCCCTATCAACCTTGGTGTCGGTTACAACGATGGCAAGTGGCTTTCT CTGTTCCAGAACAGCCCTACCACCACCACCAAGCTTGACTTCAACGTGAA GATCGAGGGTGACAACCTCAGCGGTTCTTGCAAGTACGAGGACGGTACCT TCTACTCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGTTGAGGTTCTC TCCGGTTCCGCCACCTATGTCTTCTACTAAATGAAGTTCAATACTGTCGC CCTCACCCTGGCTACCGCCGGCATGCGCTCCCCCGACACCGAGGTCGTCA 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TCCGAGTCTGGCTCCAACGACTCCGGTTGCACTGTTGAGGTTCTCTCCGG TTCCGCCACCTATGTCTTCTACTAA back to top
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | CAZy:GH132 |
| DBxref | InterPro:IPR005556 |
| DBxref | PFAM:PF03856 |
| Product | Beta-glucosidase (SUN family) family protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| NKJJ01000004.1 | supercontig | NKJJ01000004.1:599256..600656 + |
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