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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000004.1:1144596..1146506- Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_1870-T1 ID=CAN33_1870-T1|Name=CAN33_1870-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1911bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000004.1:1144596..1146506- (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGAGTGTTCCGATGGAATCCAGAGACCTTGCAGAGATTCTCAACTCCCC
TGCCTATGATTACGGACAAGATGTGGAGAAGAAGAAGAATTTAGATGATA
CACCCCCTGAAGACGAAGATCCATTTGGAAATGAAGAGTTTGCGGAGGTA
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GCATTCCTCAGCATTGTGGCGGCAACCATGGCCACGATGATTGCGGTCGG
CGTGGAGTACAAAGGCCACATTCCCCTTGCTGTGACTACCCATCTCAGTT
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GCCCTGACTTGTCACACTCTGTTTAATCTAACCAACTTTACGACAATCAA
CAGTGGGCCATGCGTCCTTCTTCGGGTTCATCTCAGAGATGGACAAGCCA
CGAGAATTCACCAAGTCCATATCAGTGCTCCAAGTAATTGACACTTCACT
ATACATTGCCAGCGCAGTGGTCATATACCGCTACGTTGGCGCGGACGTTC
AATCCCCTGCCTTAGGCTCTGCGGGGCCTCTAGGAAAGAAAATCGCCTAC
GGACTGGCTATTCCAACGGTATGTCACTTACCATAGTCAACTATCGTTTG
GAACGACTGCTGACCTATTATCCCAGGTCCTTATTGCTGGGATTGTCAAT
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CTTTATAGATGGGTTCCCTGCTATCTTCTGGTTTACCTTGAACAAGGGCC
AGTGGTTCGCATCAAGCAGAAAAATATTTCTAACCTTGTCCAACACGTTC
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TCTTGTCGCTAATTATCTTTCCAGTGCGGTCTCGGGTTATACGTGTCTGG
TGATGCGATCAGCAAGGATAGTGGTAGTGGAGTTTGGACGTGTGCCAACA
ATGCTGTTTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000004.1:1144596..1146506- >CAN33_1870-T1 ID=CAN33_1870-T1|Name=CAN33_1870-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=12231bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000004.1:1144596..1146506- (Aspergillus niger FDAARGOS_311) TGCGGTCTCGGGTTATACGTGTCTGGTGATGCGATCAGCAAGGATAGTGG TAGTGGAGTTTGGACGTGTGCCAACAATGCTGTTTGAATGGGTTCCCTGC TATCTTCTGGTTTACCTTGAACAAGGGCCAGTGGTTCGCATCAAGCAGAA AAATATTTCTAACCTTGTCCAACACGTTCATTCTAGCCATGGCAATCACC CTTACTGCACTTTTTGGCTGCTGGTTCGCTTGTCCTTATTGCTGGGATTG TCAATGGTCATGTAGCCAGCAAGTACGTGTACGTGCGTGTTTTCCGCGGC ACAAACCACATGCATGAACGGACTCTGCTCTCCATCGGGTCATGGGTCGC TATTGGATTGATTTCCTGGGTAGTTGCCTGGGTAATCGCAGAGTCAATTC CAGTCTTCAACAACCTTCTGAGTCTAATTTGGGCCATGCGTCCTTCTTCG GGTTCATCTCAGAGATGGACAAGCCACGAGAATTCACCAAGTCCATATCA GTGCTCCAAGTAATTGACACTTCACTATACATTGCCAGCGCAGTGGTCAT ATACCGCTACGTTGGCGCGGACGTTCAATCCCCTGCCTTAGGCTCTGCGG GGCCTCTAGGAAAGAAAATCGCCTACGGACTGGCTATTCCAACGCATTCC TCAGCATTGTGGCGGCAACCATGGCCACGATGATTGCGGTCGGCGTGGAG TACAAAGGCCACATTCCCCTTGCTGTGACTACCCATCTCAGTTTCAACGA AGAATTCCTAGCAGTCAGCAATCTGTTTTTCGCCTATGGGCTCTTATTAT ACTAATTGGAATCTCTGGTATATCATGGTATACTGCCTACATTCTCTGCC AATTCAAGTTACGATACCCCCAGGTCCATAGCATGGGAGATGCGGGTGAG ATTATCATGGGACGATTTGGACGTGAACTGCTTGGTATTGGGCAGCTGTT GTTCCTTATATTCGTCATGGCCAGTCACGTATTGACCTTCACGGTCCTTA TGAATACGATTACCGAACACGGTACCTGCACAATCGTGTTTGGTGTCATT GCATTGATTGTCAGTTGTGTTGGTGCCCTACCACGCACCATGGACAAGGT ATATTGGATGTCGATCGCATTGATGGTTGCAGAGAATGTTTCCATCGGAA TTCTATCTCTTCCATCCGCCTTTGCAACGCTGGGCTTTGTCCCATGAGTG TTCCGATGGAATCCAGAGACCTTGCAGAGATTCTCAACTCCCCTGCCTAT GATTACGGACAAGATGTGGAGAAGAAGAAGAATTTAGATGATACACCCCC TGAAGACGAAGATCCATTTGGAAATGAAGAGTTTGCGGAGGTAAAATATC GAACGATGGTGCGGTCTCGGGTTATACGTGTCTGGTGATGCGATCAGCAA GGATAGTGGTAGTGGAGTTTGGACGTGTGCCAACAATGCTGTTTGAATGG GTTCCCTGCTATCTTCTGGTTTACCTTGAACAAGGGCCAGTGGTTCGCAT CAAGCAGAAAAATATTTCTAACCTTGTCCAACACGTTCATTCTAGCCATG GCAATCACCCTTACTGCACTTTTTGGCTGCTGGTTCGCTTGTCCTTATTG CTGGGATTGTCAATGGTCATGTAGCCAGCAAGTACGTGTACGTGCGTGTT TTCCGCGGCACAAACCACATGCATGAACGGACTCTGCTCTCCATCGGGTC ATGGGTCGCTATTGGATTGATTTCCTGGGTAGTTGCCTGGGTAATCGCAG AGTCAATTCCAGTCTTCAACAACCTTCTGAGTCTAATTTGGGCCATGCGT CCTTCTTCGGGTTCATCTCAGAGATGGACAAGCCACGAGAATTCACCAAG TCCATATCAGTGCTCCAAGTAATTGACACTTCACTATACATTGCCAGCGC AGTGGTCATATACCGCTACGTTGGCGCGGACGTTCAATCCCCTGCCTTAG GCTCTGCGGGGCCTCTAGGAAAGAAAATCGCCTACGGACTGGCTATTCCA ACGCATTCCTCAGCATTGTGGCGGCAACCATGGCCACGATGATTGCGGTC GGCGTGGAGTACAAAGGCCACATTCCCCTTGCTGTGACTACCCATCTCAG TTTCAACGAAGAATTCCTAGCAGTCAGCAATCTGTTTTTCGCCTATGGGC TCTTATTATACTAATTGGAATCTCTGGTATATCATGGTATACTGCCTACA TTCTCTGCCAATTCAAGTTACGATACCCCCAGGTCCATAGCATGGGAGAT GCGGGTGAGATTATCATGGGACGATTTGGACGTGAACTGCTTGGTATTGG GCAGCTGTTGTTCCTTATATTCGTCATGGCCAGTCACGTATTGACCTTCA CGGTCCTTATGAATACGATTACCGAACACGGTACCTGCACAATCGTGTTT GGTGTCATTGCATTGATTGTCAGTTGTGTTGGTGCCCTACCACGCACCAT GGACAAGGTATATTGGATGTCGATCGCATTGATGGTTGCAGAGAATGTTT CCATCGGAATTCTATCTCTTCCATCCGCCTTTGCAACGCTGGGCTTTGTC CCATGAGTGTTCCGATGGAATCCAGAGACCTTGCAGAGATTCTCAACTCC CCTGCCTATGATTACGGACAAGATGTGGAGAAGAAGAAGAATTTAGATGA TACACCCCCTGAAGACGAAGATCCATTTGGAAATGAAGAGTTTGCGGAGG TAAAATATCGAACGATGGTGCGGTCTCGGGTTATACGTGTCTGGTGATGC GATCAGCAAGGATAGTGGTAGTGGAGTTTGGACGTGTGCCAACAATGCTG TTTGAATGGGTTCCCTGCTATCTTCTGGTTTACCTTGAACAAGGGCCAGT GGTTCGCATCAAGCAGAAAAATATTTCTAACCTTGTCCAACACGTTCATT CTAGCCATGGCAATCACCCTTACTGCACTTTTTGGCTGCTGGTTCGCTTG TCCTTATTGCTGGGATTGTCAATGGTCATGTAGCCAGCAAGTACGTGTAC GTGCGTGTTTTCCGCGGCACAAACCACATGCATGAACGGACTCTGCTCTC CATCGGGTCATGGGTCGCTATTGGATTGATTTCCTGGGTAGTTGCCTGGG TAATCGCAGAGTCAATTCCAGTCTTCAACAACCTTCTGAGTCTAATTTGG GCCATGCGTCCTTCTTCGGGTTCATCTCAGAGATGGACAAGCCACGAGAA TTCACCAAGTCCATATCAGTGCTCCAAGTAATTGACACTTCACTATACAT TGCCAGCGCAGTGGTCATATACCGCTACGTTGGCGCGGACGTTCAATCCC CTGCCTTAGGCTCTGCGGGGCCTCTAGGAAAGAAAATCGCCTACGGACTG GCTATTCCAACGCATTCCTCAGCATTGTGGCGGCAACCATGGCCACGATG ATTGCGGTCGGCGTGGAGTACAAAGGCCACATTCCCCTTGCTGTGACTAC CCATCTCAGTTTCAACGAAGAATTCCTAGCAGTCAGCAATCTGTTTTTCG 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CCAAGTAATTGACACTTCACTATACATTGCCAGCGCAGTGGTCATATACC GCTACGTTGGCGCGGACGTTCAATCCCCTGCCTTAGGCTCTGCGGGGCCT CTAGGAAAGAAAATCGCCTACGGACTGGCTATTCCAACGCATTCCTCAGC ATTGTGGCGGCAACCATGGCCACGATGATTGCGGTCGGCGTGGAGTACAA AGGCCACATTCCCCTTGCTGTGACTACCCATCTCAGTTTCAACGAAGAAT TCCTAGCAGTCAGCAATCTGTTTTTCGCCTATGGGCTCTTATTATACTAA TTGGAATCTCTGGTATATCATGGTATACTGCCTACATTCTCTGCCAATTC AAGTTACGATACCCCCAGGTCCATAGCATGGGAGATGCGGGTGAGATTAT CATGGGACGATTTGGACGTGAACTGCTTGGTATTGGGCAGCTGTTGTTCC TTATATTCGTCATGGCCAGTCACGTATTGACCTTCACGGTCCTTATGAAT ACGATTACCGAACACGGTACCTGCACAATCGTGTTTGGTGTCATTGCATT GATTGTCAGTTGTGTTGGTGCCCTACCACGCACCATGGACAAGGTATATT GGATGTCGATCGCATTGATGGTTGCAGAGAATGTTTCCATCGGAATTCTA TCTCTTCCATCCGCCTTTGCAACGCTGGGCTTTGTCCCATGAGTGTTCCG ATGGAATCCAGAGACCTTGCAGAGATTCTCAACTCCCCTGCCTATGATTA CGGACAAGATGTGGAGAAGAAGAAGAATTTAGATGATACACCCCCTGAAG ACGAAGATCCATTTGGAAATGAAGAGTTTGCGGAGGTAAAATATCGAACG ATGGTGCGGTCTCGGGTTATACGTGTCTGGTGATGCGATCAGCAAGGATA GTGGTAGTGGAGTTTGGACGTGTGCCAACAATGCTGTTTGAATGGGTTCC 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Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| Note | EggNog:ENOG41 |
| DBxref | InterPro:IPR013057 |
| DBxref | PFAM:PF01490 |
| Product | Transmembrane amino acid transporter protein family protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| NKJJ01000004.1 | supercontig | NKJJ01000004.1:1144596..1146506 - |
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