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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000002.1:327115..328952+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_22330-T1 ID=CAN33_22330-T1|Name=CAN33_22330-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=1838bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000002.1:327115..328952+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGG
TGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCG
ATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGAT
GGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGTATCAC
CGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCA
TCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATC
TGGTATGTATCTGACACCGCTGCACCGTTATCTCTGCTAACAATGCATGG
CTGTACAGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCC
CATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCT
CCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTGTATGTCGGTCCCATAAT
GCCTGCTGCTGCATGCGGTGCTAATCATTTAGGCTCCTCCAACCAAGCGT
GGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGAT
CATGTTCTAGTAAGTCCTTATCCATCATCAGCTACCATGTCACATCTCAC
ACGTGATGTAGCGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGC
CTTCCGGATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCC
TGGGTATGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGAC
CGATGGGAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGA
CCCGAGCTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGT
GCGAGTTTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAG
CCCAACATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTC
TCAGTTGACTGGAATGAACGTCATGAGTAAGTTTCTTTCGAGCCTGTATA
GGTAGTCAGCAATGCTAACCGGTTCACTTCTAGTGTACTACATCACCTAC
GTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCCTCCAG
TATCCAGTACGTGATCAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGTGTGGG
GTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCCCTCTTCATG
ATGATCTGGATGTACATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGTCATCC
CGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTCATCC
ACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCC
TCATACGCCATCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACT
CTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCA
ACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTC
AACATCCAGTGGAAGGTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCAT
GTTCTTGCACATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGG
AAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGT
ACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGA
GGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCC
ACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTGA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000002.1:327115..328952+ >CAN33_22330-T1 ID=CAN33_22330-T1|Name=CAN33_22330-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=8115bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000002.1:327115..328952+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311)
ATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGG
TGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCG
ATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGAT
GGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGTATCAC
CGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCA
TCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATC
TGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCCCATGCT
GATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTC
AGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTGCTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGT
GTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGATCATGTT
CTACGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGA
TTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTATG
ATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGACCGATGGGA
GGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGACCCGAGCT
CTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGTGCGAGTTT
GAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAGCCCAACAT
GCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGA
CTGGAATGAACGTCATGATGTACTACATCACCTACGTCTTTGCCATGGCC
GGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCCTCCAGTATCCAGTACGTGAT
CAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGTGTGGGGTGATCAGTGGGGCC
GTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCCCTCTTCATGATGATCTGGATGTAC
ATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGTCATCCCGCGCCGCCCGGCGG
TCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTCATCCACGGCGCGCCCAGCA
AGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCCTCATACGCCATCTCC
TTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGT
GCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCAACTGGGCCTTCAACT
TCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTCAACATCCAGTGGAAG
GTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCATGTTCTTGCACATTTT
CTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCA
TCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGTACTCCCGCCTGGAAG
ACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGAGGAGGTTGGCTTTGA
AGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCCACCAGGAGGTCACGG
CTACTCCGGATAAGATTGCTTGAATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATT
GCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTC
GATGTCGGCCATCATCGAGACCGATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGG
CTCCTGTCACTTACGATGATGATGGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGC
GCGAGTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTT
GGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTG
CCATTCAGATCGGTTCCATCATCTGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGT
GCCTCCCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCT
GAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTG
CTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATT
ACCTGGGGTATCCTGATCATGTTCTACGTCTCCTATGGATGCAGCTTCAT
CAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTG
CCGTGCTATTGTTCCTGGGTATGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGG
CTGGCACGCAAGGACCGATGGGAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGT
CCACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAG
AGATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTAC
CTCGAGCTGTTCAAGCCCAACATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTT
CGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGACTGGAATGAACGTCATGATGTACTACA
TCACCTACGTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATC
TCCTCCAGTATCCAGTACGTGATCAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCT
GGTGTGGGGTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCCC
TCTTCATGATGATCTGGATGTACATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTAC
GGTCATCCCGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTG
GGTCATCCACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCT
TCGTAGCCTCATACGCCATCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCG
CCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCAC
TTCAGCCAACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGG
CATTTGTCAACATCCAGTGGAAGGTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGT
ACTGCCATGTTCTTGCACATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAA
GACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGT
ACATCGGTACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCA
CACATTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCA
GACTATCCACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTGAATGG
CTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGT
CTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCGATGC
CTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGATGGCA
AGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGTATCACCGCC
TCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCATCTC
GGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATCTGGT
GCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCCCATGCTGATC
GTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGT
GCCAGTGTATATTTCGGAGATTGCTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCG
TCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGATCATGTTCTAC
GTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGATTCC
CTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTATGATGC
TCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGACCGATGGGAGGAG
TGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCC
CTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGC
GCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAGCCCAACATGCTT
AACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGACTGG
AATGAACGTCATGATGTACTACATCACCTACGTCTTTGCCATGGCCGGCT
TGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCCTCCAGTATCCAGTACGTGATCAAC
GTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGTGTGGGGTGATCAGTGGGGCCGTCG
CCCGACCTTCTTGATCGGTTCCCTCTTCATGATGATCTGGATGTACATTA
ATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGTCATCCCGCGCCGCCCGGCGGTCTC
AACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTCATCCACGGCGCGCCCAGCAAGGC
TGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCCTCATACGCCATCTCCTTCG
GCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGC
GGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCAACTGGGCCTTCAACTTCGC
CCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTCAACATCCAGTGGAAGGTCT
ACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCATGTTCTTGCACATTTTCTTC
TTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTT
CACTGATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGTACTCCCGCCTGGAAGACAA
AGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGAT
GAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCCACCAGGAGGTCACGGCTAC
TCCGGATAAGATTGCTTGAATGGCTATCGGCAATCTTTACTTCATTGCGG
CCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGTTCGGTTTCGATATCTCGTCGATG
TCGGCCATCATCGAGACCGATGCCTATCTCTGTTACTTCAACCAGGCTCC
TGTCACTTACGATGATGATGGCAAGAGGGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGA
GTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCATGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGC
TCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGACAGGCTTGGTCGTCGTACTGCCAT
TCAGATCGGTTCCATCATCTGGTGCATTGGATCCATCATTGTCTGTGCCT
CCCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCGGTCGTATCATCAACGGTCTGAGT
GTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCAGTGTATATTTCGGAGATTGCTCC
TCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGGTCTGCAACAATGGGCTATTACCT
GGGGTATCCTGATCATGTTCTACGTCTCCTATGGATGCAGCTTCATCAAG
GGTACGGCGGCCTTCCGGATTCCCTGGGGTCTGCAGATGATCCCTGCCGT
GCTATTGTTCCTGGGTATGATGCTCCTGCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGG
CACGCAAGGACCGATGGGAGGAGTGCCACGCTGTTTTGACCCTCGTCCAC
GGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCCCTTTGTGCAGCGTGAATATGAAGAGAT
CAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGCGCCAAAACGCGGATGTCTCCTACCTCG
AGCTGTTCAAGCCCAACATGCTTAACCGTACCCATGTGGGTGTTTTCGTT
CAGATCTGGTCTCAGTTGACTGGAATGAACGTCATGATGTACTACATCAC
CTACGTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAAAGGTAACAACAACTTGATCTCCT
CCAGTATCCAGTACGTGATCAACGTGTGCATGACTGTGCCGGCTCTGGTG
TGGGGTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCGACCTTCTTGATCGGTTCCCTCTT
CATGATGATCTGGATGTACATTAATGCTGGTCTGATGGCCAGCTACGGTC
ATCCCGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACAACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTC
ATCCACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTCATTGCCAGTACCTACCTCTTCGT
AGCCTCATACGCCATCTCCTTCGGCCCCGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGG
AACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCAAGGCTACCGCCCTCTGCACTTCA
GCCAACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTCAGCTATTTTGTCCCCCCGGCATT
TGTCAACATCCAGTGGAAGGTCTACATCCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTG
CCATGTTCTTGCACATTTTCTTCTTCTTTCCCGAGACCACGGGTAAGACC
CTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTTCACTGATCCCAATGGTATTCCGTACAT
CGGTACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAACGAGTACTCGCGCGGTGCACACA
TTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGAAGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACT
ATCCACCAGGAGGTCACGGCTACTCCGGATAAGATTGCTTGAATGGCTAT
CGGCAATCTTTACTTCATTGCGGCCATCGCCGTCGTCGGCGGTGGTCTGT
TCGGTTTCGATATCTCGTCGATGTCGGCCATCATCGAGACCGATGCCTAT
CTCTGTTACTTCAACCAGGCTCCTGTCACTTACGATGATGATGGCAAGAG
GGTCTGTCAGGGCCCCAGCGCGAGTGTGCAGGGTGGTATCACCGCCTCCA
TGGCTGGTGGTTCCTGGTTGGGCTCGTTGATCTCGGGTTTCATCTCGGAC
AGGCTTGGTCGTCGTACTGCCATTCAGATCGGTTCCATCATCTGGTGCAT
TGGATCCATCATTGTCTGTGCCTCCCAGAACATTCCCATGCTGATCGTCG
GTCGTATCATCAACGGTCTGAGTGTGGGTATCTGCTCCGCTCAGGTGCCA
GTGTATATTTCGGAGATTGCTCCTCCAACCAAGCGTGGTCGTGTCGTCGG
TCTGCAACAATGGGCTATTACCTGGGGTATCCTGATCATGTTCTACGTCT
CCTATGGATGCAGCTTCATCAAGGGTACGGCGGCCTTCCGGATTCCCTGG
GGTCTGCAGATGATCCCTGCCGTGCTATTGTTCCTGGGTATGATGCTCCT
GCCTGAGTCACCCCGCTGGCTGGCACGCAAGGACCGATGGGAGGAGTGCC
ACGCTGTTTTGACCCTCGTCCACGGTCAGGGAGACCCGAGCTCTCCCTTT
GTGCAGCGTGAATATGAAGAGATCAAGAGCATGTGCGAGTTTGAGCGCCA
AAACGCGGATGTCTCCTACCTCGAGCTGTTCAAGCCCAACATGCTTAACC
GTACCCATGTGGGTGTTTTCGTTCAGATCTGGTCTCAGTTGACTGGAATG
AACGTCATGATGTACTACATCACCTACGTCTTTGCCATGGCCGGCTTGAA
AGGTAACAACAACTTGATCTCCTCCAGTATCCAGTACGTGATCAACGTGT
GCATGACTGTGCCGGCTCTGGTGTGGGGTGATCAGTGGGGCCGTCGCCCG
ACCTTCTTGATCGGTTCCCTCTTCATGATGATCTGGATGTACATTAATGC
TGGTCTGATGGCCAGCTACGGTCATCCCGCGCCGCCCGGCGGTCTCAACA
ACGTGGAAGCCGAGTCCTGGGTCATCCACGGCGCGCCCAGCAAGGCTGTC
ATTGCCAGTACCTACCTCTTCGTAGCCTCATACGCCATCTCCTTCGGCCC
CGCCAGCTGGGTGTACCCGCCGGAACTCTTCCCTCTGCGTGTGCGCGGCA
AGGCTACCGCCCTCTGCACTTCAGCCAACTGGGCCTTCAACTTCGCCCTC
AGCTATTTTGTCCCCCCGGCATTTGTCAACATCCAGTGGAAGGTCTACAT
CCTCTTCGGTGTCTTCTGTACTGCCATGTTCTTGCACATTTTCTTCTTCT
TTCCCGAGACCACGGGTAAGACCCTGGAAGAGGTCGAGGCCATCTTCACT
GATCCCAATGGTATTCCGTACATCGGTACTCCCGCCTGGAAGACAAAGAA
CGAGTACTCGCGCGGTGCACACATTGAGGAGGTTGGCTTTGAAGATGAGA
AGAAGGTTGCTGGTGGGCAGACTATCCACCAGGAGGTCACGGCTACTCCG
GATAAGATTGCTTGA back to top
Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
|---|
| GO:0016021 | integral component of membrane |
| GO:0016020 | membrane |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
|---|
| GO:0022857 | transmembrane transporter activity |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
|---|
| GO:0055085 | transmembrane transport |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Note | EggNog:ENOG41 |
| DBxref | InterPro:IPR036259 |
| DBxref | InterPro:IPR020846 |
| DBxref | InterPro:IPR005829 |
| DBxref | InterPro:IPR005828 |
| DBxref | InterPro:IPR003663 |
| DBxref | PFAM:PF00083 |
| DBxref | PFAM:PF07690 |
| Product | MFS transporter sugar porter (SP) family protein |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| NKJJ01000002.1 | supercontig | NKJJ01000002.1:327115..328952 + |
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