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Sequences
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at NKJJ01000022.1:2426262..2428263+ Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >CAN33_46055-T1 ID=CAN33_46055-T1|Name=CAN33_46055-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=mRNA|length=2002bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000022.1:2426262..2428263+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGCGTGAGATCGTATGTTTGCCCTCCCCGTCCCTCGTCCGTCAGGAGAC
GCGTCGTTGGTTGGCATCTCTTTTGCTCGGGACCCCACCGGTTCTTCGAC
CAACTCATTCTTGTGCTAACTGCATGTCTTCTTCGCTTCATAGGTTCACC
TCCAAACCGGCCAGTGTGTAAGTGCCAATATATGCTTCGGATGATTGCCC
CCAAGGGTCTTGATTGGTGTTTGGTGGACTAAACAATATATCATGGTGGT
TAGGGTAACCAAATTGGTGCTGCTTTCTGGTACGTATACAACTGCCATTG
GATTGGGGATGGAACATCGTCTCTTAGGCTATCTCAGCTTGAGTTCAGAT
GTTGTCCATTAGGTACATGCTATCGGTCTAAGAACACGTCTAACAATTCA
ACAGGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCCGGTGTGTAA
GTGCAACTTTTTCACACCTCTCAATTGGTCAACAATGGGCAAAGGGTTGG
GTCTTCTGACACGCAGGATAGTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGG
AGCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGTGAGATCCATCGGACCTTGGCTT
TTTCACGACAATATCATCAATGTCCTAATCACTTCAGCAGGCTAGCGGTA
ACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATG
GACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTT
CGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACA
CTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCCGTGAG
GCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGG
TGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGTG
AGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCC
AAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCA
CCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGTAT
GATTCCAGACCCAGCACAAGTGAGAAGAAGATTGGTGCTCGAGAACTAAC
GAATTGGCCAATCTAGGCTCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGC
TCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATG
TCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCT
TCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCA
TGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCC
GTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGAT
GGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCT
TGTGAGTTTTCCTACTGCATCGATTGCACAATATGCCAGCTAACAGGTAT
CTAGCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAAC
ATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACAT
CCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCA
CCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGT
GATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACAC
TGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGA
ACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAG
GGTGAGGAGGAATAGTAAGTCCACCCAAGAACCTATTGTTTCTGTTTTGG
TTCTAACCAATTCTACAGCGTCGAGGAGGAGCCCCTTGAGGCTGAGGAGT
AA back to topCoding sequence (CDS) from alignment at NKJJ01000022.1:2426262..2428263+ >CAN33_46055-T1 ID=CAN33_46055-T1|Name=CAN33_46055-T1|organism=Aspergillus niger FDAARGOS_311|type=CDS|length=10920bp|location=Sequence derived from alignment at NKJJ01000022.1:2426262..2428263+ (Aspergillus niger FDAARGOS_311) ATGCGTGAGATCGTATGTTTGCCCTCCCCGTCCCTCGTCCGTCAGGAGAC GCGTCGTTGGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGCAGACCATCTCTGGCG AGCACGGCCTTGACGGCTCCGGTGTTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAG CTGGAGCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATGT TCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCC GTGCCGGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGC CAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGC CGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTT GCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACC GGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCC CGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCG ACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCACCAGCTCGTT GAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGCTCTGTACGACAT CTGCATGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACC ACCTGGTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCT GGTCAGCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTT CCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCG GCGCCTACTCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATG TTCGATCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTA CCTCACCTGCTCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTG AGGATCAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAG TGGATCCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGG TCTCAAGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGC TGTTCAAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCT TTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGA GGCTGAGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGG ACGCCTCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATACGTCGAGGAGGAGCCCCTT GAGGCTGAGGAGTAAATGCGTGAGATCGTATGTTTGCCCTCCCCGTCCCT CGTCCGTCAGGAGACGCGTCGTTGGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGC AGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCCGGTGTTTACAATGGC ACCTCCGACCTCCAGCTGGAGCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGCTAG CGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTA CCATGGACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGAC AACTTCGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCA CTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCC GTGAGGCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCC CTCGGTGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGAT CCGTGAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCT CCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCC GTCCACCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGA GGCTCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTT ACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACT TGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGT CAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTC CTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAG TTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTT CCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCT CCATGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAG ACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTC CATTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCA CCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATG TTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGA GATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGT ACCAGCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATACGTC GAGGAGGAGCCCCTTGAGGCTGAGGAGTAAATGCGTGAGATCGTATGTTT GCCCTCCCCGTCCCTCGTCCGTCAGGAGACGCGTCGTTGGTTCACCTCCA AACCGGCCAGTGTGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCC GGTGTTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGGAGCGCATGAACGTCTA CTTCAACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCG ACCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAG CTCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAA CTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTG TCGACGTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTC CAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCT CCTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCT TCTCCGTTGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTAC AACGCCACTCTCTCCGTCCACCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTT CTGTATCGACAACGAGGCTCTGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGC TCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATG TCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCT TCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCA TGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCC GTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGAT GGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCT TCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATC CAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCA GACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCT TCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGAT CAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGG TGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACG ACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAGGGT GAGGAGGAATACGTCGAGGAGGAGCCCCTTGAGGCTGAGGAGTAAATGCG TGAGATCGTATGTTTGCCCTCCCCGTCCCTCGTCCGTCAGGAGACGCGTC GTTGGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGCAGACCATCTCTGGCGAGCAC GGCCTTGACGGCTCCGGTGTTTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGGA GCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATGTTCCTC GTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCC GGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTC CGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGT TGGTCGACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGAC TGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGC CGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACC GTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACC GTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCACCAGCTCGTTGAGCA CTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGCTCTGTACGACATCTGCA TGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGGTGACCTGAACCACCTG GTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCCTCCGTTTCCCTGGTCA GCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACATGGTTCCCTTCCCTC GTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTGACCAGCCGCGGCGCC TACTCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGACCCAGCAGATGTTCGA TCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGCCGCTACCTCA CCTGCTCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGAT CAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACCTACTTCGTCGAGTGGAT CCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCATTCCTCCCCGTGGTCTCA AGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCTCCATCCAGGAGCTGTTC AAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTCCGTCGCAAGGCTTTCTT GCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGATGGAGTTCACTGAGGCTG AGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACCAGCAGTACCAGGACGCC TCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATACGTCGAGGAGGAGCCCCTTGAGGC TGAGGAGTAAATGCGTGAGATCGTATGTTTGCCCTCCCCGTCCCTCGTCC GTCAGGAGACGCGTCGTTGGTTCACCTCCAAACCGGCCAGTGTGCAGACC ATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCCGGTGTTTACAATGGCACCTC CGACCTCCAGCTGGAGCGCATGAACGTCTACTTCAACGAGGCTAGCGGTA ACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTCGAGCCCGGTACCATG GACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGCTCTTCCGCCCCGACAACTT CGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGGCCAAGGGTCACTACA CTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGACGTTGTCCGCCGTGAG GCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGG TGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGTG AGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTTCCCTCCCCC AAGGTCTCCGACACCGTTGTTGAGCCTTACAACGCCACTCTCTCCGTCCA CCAGCTCGTTGAGCACTCCGACGAGACCTTCTGTATCGACAACGAGGCTC TGTACGACATCTGCATGCGCACCCTCAAGCTCTCCAACCCCTCTTACGGT GACCTGAACCACCTGGTCTCTGCCGTCATGTCCGGTGTGACCACTTGCCT CCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGACCTTCGCAAGCTGGCTGTCAACA TGGTTCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGCTTCGCTCCTCTG ACCAGCCGCGGCGCCTACTCCTTCCGTGCCGTCTCCGTTCCCGAGTTGAC CCAGCAGATGTTCGATCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCA ACGGCCGCTACCTCACCTGCTCCGCCATCTTCCGTGGACGTGTCTCCATG AAGGAGGTTGAGGATCAGATGCGCAACATCCAGAGCAAGAACCAGACCTA CTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCCAGACCGCCCTGTGCTCCATTC CTCCCCGTGGTCTCAAGATGTCCTCCACCTTCATCGGTAACTCCACCTCC ATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGATCAGTTCACTGCTATGTTCCG TCGCAAGGCTTTCTTGCACTGGTACACTGGTGAGGGTATGGACGAGATGG AGTTCACTGAGGCTGAGAGCAACATGAACGACCTGGTCTCCGAGTACCAG CAGTACCAGGACGCCTCGATCTCCGAGGGTGAGGAGGAATACGTCGAGGA GGAGCCCCTTGAGGCTGAGGAGTAAATGCGTGAGATCGTATGTTTGCCCT CCCCGTCCCTCGTCCGTCAGGAGACGCGTCGTTGGTTCACCTCCAAACCG GCCAGTGTGCAGACCATCTCTGGCGAGCACGGCCTTGACGGCTCCGGTGT TTACAATGGCACCTCCGACCTCCAGCTGGAGCGCATGAACGTCTACTTCA ACGAGGCTAGCGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCCGTCCTCGTCGACCTC GAGCCCGGTACCATGGACGCCGTCCGTGCCGGTCCTTTCGGCCAGCTCTT CCGCCCCGACAACTTCGTCTTCGGCCAGTCCGGTGCTGGTAACAACTGGG CCAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTTGTCGAC GTTGTCCGCCGTGAGGCCGAGGCTTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGAT CACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCCGGTATGGGTACCCTCCTGA 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Annotated Terms
The following terms have been associated with this mRNA:
Vocabulary: Cellular Component
| Term | Definition |
| GO:0005874 | microtubule |
Vocabulary: Molecular Function
| Term | Definition |
| GO:0003924 | GTPase activity |
| GO:0005525 | GTP binding |
| GO:0005200 | structural constituent of cytoskeleton |
Vocabulary: Biological Process
| Term | Definition |
| GO:0007017 | microtubule-based process |
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
Properties
| Property Name | Value |
| DBxref | InterPro:IPR008280 |
| DBxref | InterPro:IPR017975 |
| DBxref | InterPro:IPR036525 |
| DBxref | InterPro:IPR037103 |
| DBxref | InterPro:IPR023123 |
| DBxref | InterPro:IPR018316 |
| DBxref | InterPro:IPR003008 |
| DBxref | InterPro:IPR000217 |
| DBxref | InterPro:IPR002453 |
| DBxref | PFAM:PF03953 |
| DBxref | PFAM:PF00091 |
| Product | Tubulin beta chain |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| NKJJ01000022.1 | supercontig | NKJJ01000022.1:2426262..2428263 + |
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